HRTF(머리저달함수)의 샘플링률 변환에 따른 입체음향 플레이어

오재경,이동재,임철수,최범석,이원돈 호서대학교 반도체제조장비국산화연구센터 2001 반도체장비학술심포지움 Vol.2001 No.-

본 논문에서는 3D사운드 생성 기술 중 대표적인 방법인 원음에 HRTF(머리전달함수)를 콘볼루션(convolution하는 방식으로 음상정위 모듈을 구현하였으며 음장감을 부여하기 위하여 잔향(reverberation)효과를 추가하고 크로스토크 현상을 제거하기 위하여 트랜스오럴 필터를 추가하였다.본 논문에서는 sampling rate conversion을 사용하여 decimation과 interpolation을 수행하여 44.1KHz의 sampling rate로된 coefficient를 downsample하거나 upsample한 HRTR(머리전달함수)를 사용하여 콘볼루션(convolution)을 수행했다.본 논문에서는 3D사운드 생성과정에서 필요한 연산과정을 최소화하여 일반 PC의 computing power로도 sampling rate conversion된 데이터를 처리하여 줄 수 있는 알고리즘을 제시하고 구현하였다.

Rhinocerebral Mucormycosis 2예

오명돈,최강원,김병국,김재중,이홍규,김상윤 대한감염학회 1986 감염 Vol.18 No.2

Mucormycosis is an acute suppurative opportunistic mycosis that produce predominantly rhinocerebral disease in patient with diabetic ketoacidosis and immunosuppressed patient. We experienced two cases of rhinocerebral mucormycosis recently. The one occurred in patient with diabetic ketoacidosis and the other in acute leukemia. They showed nasal discharge, orbital cellulitis and proptosis. Their condition rapidly deteriorated. Biopsy from palate and sinus revealed broad, nonseptate, right-angled branching hyphae, a finding compatible with mucormycosis.

인간 면역부전 바이러스(HIV) 감염자 사이에서의 1기 및 2기 매독의 유행

장희창,조재현,박완범,이기덕,이창섭,김홍빈,오명돈,최강원 대한감염학회 2004 감염과 화학요법 Vol.36 No.6

목적 : 국내 HIV 감염자 사이에서 발생한 매독의 유행을 보고하고, 그 역학적 특성을 규명하고자 하였다. 재료 및 방법 : 1999년 7월부터 2003년 9월까지 서울대학교 병원에서 추적 관찰을 받아온 HIV 감염자를 대상으로 하여 1기 및 2기 매독의 발생을 조사하였다. 발생률을 정확히 구하기 위해 추적 관찰을 받은 모든 HIV 감염자의 인년을 6개월 간격으로 구하였다. 결과 : 51개월 동안, 465명의 HIV 감염자가 서울대학교 병원에서 추적 관찰을 받았다. 이중 38명이 1기 및 2기 매독으로 진단되었다. 1기 및 2기 매독의 발생률은 이기간 동안 100인년 당 4.1명이었다. 1999년 7월부터 2001년 12월 사이에는 발생자가 없었으나, 이후 발생률은 꾸준히 증가하여 2003년 9월에는 100인년 당 18.8명이 되었다. 1기 및 2기 매독의 발생률은 동성애자 및 양성애자에서 이성애자에서보다 4.3배 높았고, HAART로 치료를 받지 않은 환자에서 HAART로 치료를 받고 있던 환자에서 보다 10.9배 높았다. 결론 : 2002년부터 국내 HIV 감염자 사이에서 1기 및 2기 매독이 유행하기 시작하였고, 이러한 유행은 동성애자와 양성애자 및 HAART로 치료를 받고 있지 않던 사람 사이에서 발생하였다. Background : This study was performed to characterize the epidemiologic and clinical features of outbreak of syphilis among HIV sero-positive patients in Korea. Materials and Methods : A retrospective case review of patients diagnosed with primary and secondary syphilis from July 1999 to September 2003 was carried out at Seoul National University Hospital in Korea. To estimate the incidence, person-years (PYs) of all HIV sero-positive patients, who visited the hospital in the same period, were calculated every 6 months. Results : In a 51 month period, 465 HIV-positive patients were followed up at Seoul National University Hospital. 38 cases of primary and secondary syphilis were diagnosed. The incidence of primary and secondary syphilis was 4.1 per 100 PYs during the study period. There was no case from July 1999 to December 2001, and then the incidence rose until September 2003 from 5.5 per 100 PYs in 1999 to 18.8 per 100 PYs in 2003. The rate of primary and secondary syphilis was 4.3 times higher among homosexual and bisexual men than heterosexual men (95% CI 1.87 to 11.17), and 10.9 times higher among patients who did not receive HAART than patients who were receiving HAART (95% CI 5.47 to 21.79). Conclusion : The outbreak of primary and secondary syphilis among HIV-positive patients started in 2002 and has been escalating, especially among homosexual/bisexual men and in patients who did not receive HAART.

Cystic Medullary Thyroid Carcinoma: A Case of Undergoing Endoscopic Thyroid Lobectomy

Dong Hae Chung,Jae Yeon Seok,Yoo Seung Chung1,Eun Mee Oh1,Jung Won Ryu1,Young Don Lee1 대한갑상선-내분비외과학회 2015 The Koreran journal of Endocrine Surgery Vol.15 No.1

On ultrasonography, medullary thyroid carcinoma (MTC) shows hypoechogenicity, an irregular margin, a predominantly solid composition, and microcalcifications, similar to those observed in papillary thyroid carcinoma (PTC). MTC presenting as a cystic lesion is rare, and endoscopic thyroidectomy can be performed for benign thyroid masses and early stage PTC, however it is inappropriate for MTC regardless of cystic change. The authors report a case of cystic MTC found after endoscopic thyroid lobectomy and provide a review of the literature on this topic.

국내 3개병원에서 분리된 메티실린 내성 황색포도상구균 균주간의 유전학적 연관성

백경란,김성민,송재훈,이혁,양지원,진정화,최강원,오명돈,배현주 대한감염학회 1997 감염 Vol.29 No.6

목적:본 연구는 병원감염의 주된 원인균인 MRSA의 병원 내 및 병원간의 전파양상을 파악하고, MRSA 균주 중 pathogen과 colonizer 간에 유전자형의 차이가 있는지 알아보고자 시행되었다. 방법:삼성의료원 중환자실에 1996년 1월에서 7월까지 입원한 26명의 환자로부터 분리되었던 MRSA 30균주와 서울대학교병원에서 1995년 9월에서 10월까지 37명의 환자로부터 분리되었던 MRSA 37균주, 그리고 단국대학교병원 신생아 중환자실에서 MRSA 감염증의 돌발적 발생에 연관되어 분리된 MRSA 균주 40주를 대상으로 하였다. 균주간의 상관성을 평가하기 위한 세균형별법으로 Pulsed field gel electrophoresis(PFGE, CHEF DR-II)를 이용하였고, 제한효소로 Smal I을 사용하였다. 결과:삼성의료원의 균주 30주 중 A 패턴이 10주(33.3%), B 패턴이 7주(23.3%)로 나타나, 주된 유행 균주가 있음을 확인하였다. 내과 중환자실에서 분리된 5 균주 중 4 주가 A패턴인 반면, 신생아 중환자실에서 분리된 9균주 중 4주가 B패턴에 속하여, 한병원내에서도 구역에 따라 유행균주가 다름을 알 수 있었다. 서울대학교병원 균주 중 23주(62.2%)가 동일한 A패턴으로 나타났고 단국대학교 병원 균쥬 중 27 균주(67.5%)가 B 패턴에 속하여, 세 병원의 MRSA 유행 균주 사이에 유전적 연관성이 있음을 시사하였다. Pahtogen과 colonizer간에 PFGE 패턴의 차이는, pathogen이 colonizer에 비해 유행균주에 많이 속하였으나 통계학적으로 유의한 차이가 없었다. 결론:PFGE를 이용한 세균형별법으로 분류한 MRSA 균주의 양상으로 볼 때, 한 병원 내에서 유행하는 MRSA 균주에는 소수의 주된 클론이 있었으며, 한 병원 내에서도 구역에 따라 유행균주는 서로 달랐다. 지역적으로 떨어져 있는 서울대학교병원과 단국대학교병원의 MRSA 유행균주는 삼성의료원의 유행균주 중 한 클론과 각각 일치하였다. 이 결과는 유행 MRSA 균주가 공동의 오염원에서 파급되어 지역적으로 다른 병원간에도 전파되고 있거나, 균주가 숙주의 요인에 의해 특정 MRSA 균주가 선택 분리되고 있을 가능성을 시사하였다. Background: Methicillin-resistant Staphylococcus aureus(MRSA) has become a major pathogen of nosocomial infection. In Korea, incidence of MRSA is alarmingly high up to 70-80% of total S. aureus strains isolated from teriary care hospitals. To investigate the mechanism of inra- and interhospital spread of MRSA, we evaluated the genetic relatedness of MRSA isolates recovered from 3 different hospitals in Korea. Methods:30 MRSA isolates obtained from Samsung Medical Center(SMC), 37 MRSA isolates from Seoul National University Hospital(SNUH) and 40 MRSA isolates from Dankook University Hospital(DUH) were classified into clonal types on the basis of pulsed field gel electrophoresis(PFGE). Results: Several PFGE patterns were predominant among the isolates from SMC(A-7/30[23.3%], B-6/30[20.0%], C-4/30[13.3%], G-3/30[10.0%]). The prevalent PFGE patterns were different between medical ICU(A-3/5[60.0%]) and newborn ICU(B-4/9[44.4%]0. The major clone of SMC. The major clone at DUH was PFGE type B, which was identical with another dominant clone of SMC. Although MRSA strains from SMC which caused clinical diseases belonged to major PFGE patterns more often than colonized strains, the association was not significant statistically. Conclusion: The presence of epidemic strains of MRSA suggests that epidemic MRSA clones may be originated from common sources and spread between different hospitals. Also, there may be virulence factors of stains or host factors, which could select specific strains.

골수구성 백혈병 환자에게 발생한 결핵성 림프절염

이창섭,송진수,최평균,조재현,방지환,박경화,박완범,김홍빈,김남중,윤성수,박선양,김병국,오명돈,최강원 대한감염학회 2006 감염과 화학요법 Vol.38 No.5

혈액질환 가운데 결핵 발생이 증가한다고 알려진 것은 호지킨 림프종을 포함한 림프증식성질환 그리고 모양세포성 백혈병 등이 있다. 또한 동종 골수이식을 받은 환자에서도 결핵은 증가한다고 알려져있다. Kaplan 등은 골수구성 백혈병 환자에서 결핵 발생이 증가한다고 보고하였다. 그러나 골수구성 백혈병 환자에서 결핵의 발생이 증가하는 이유에 대해서는 아직까지 정확하게 밝혀지지 않았다. 저자들이 2년 동안 후향적으로 조사한 180명의 성인 골수구성 백혈병 환자들 가운데 결핵이 발생한 환자는 4명이었고, 발생 부위는 모두 림프절이었다. 결핵은 골수구성 백혈병의 특정 아형에만 국한되어 발생하지 않았지만, 50%에서 FAB 분류에 의한 M4였다. 림프절이 종대된 골수구성 백혈병 환자에서 특히, 결핵의 유병율이 높은 나라에서는 결핵성 림프절염도 감별진단에 포함시켜야 한다. During the neutropenic phase, leukemia patients receiving chemotherapy are prone to bacterial and, fungal infections; occasionally mycobacterial, viral and protozoal organisms may also cause infections. Mycobacterium tuberculosis infection was reported very rarely in these patients. This report describes four patients with M. tuberculosis infection identified from 185 adult patients who were diagnosed myelogenous leukemia between January 2003, and December 2004. There was no patient with M. tuberculosis infection from 44 lymphoid leukemia and 11 acute biphenotypic leukemia patients. Sites of infection were all lymph nodes. Three among four patients were presented with lymphadenopathy at initial diagnosis of leukemia, and the other one presented with lymphadenopathy after induction chemotherapy. There was no patient presented with lymphadenopathy during the neutropenic phase. Tuberculous lymphadenitis was presented in a patient with three acute myelogenous leukemia (FAB class 2 M4, 1 M2) and a chronic myelogenous leukemia, accelerated phase. An acute myelogenous leukemia patient had a leukemic cell and tubercle bacilli in the same lymph node. Tuberculosis should also be included as a differential diagnosis in myelogenous leukemia patient with lymphadenopathy, especially in the countries in which the disease is endemic.

돼지의 UCP3 유전자의 단일염기서열 변이와 경제형질과의 연관성 분석

Jae-Don Oh(오재돈),Kun-Woo Lee(오건우),Il-Jung Jung(정일정),Gwang-Joo Jeon(전광주),Hak-Kyo Lee(이학교),Hong-Sik Kong(공홍식) 한국생명과학회 2011 생명과학회지 Vol.21 No.1

Uncoupling protein (UCP) 3 유전자는 갈색지방세포의 미토콘드리아 내막에 존재하며 탈공역 산소(uncoupling oxygen)를 통해 ATP를 생산하는 것으로 알려져 있다. 이는 세포 내의 과다 에너지를 열로 발산시키는 기능을 하고 있다. 본 연구는 돼지의 UCP 3 유전자 내 missense mutation의 유전자형을 조사하고 경제형질과의 연관성을 분석하기 위하여 실시하였다. 돼지의 UCP3 유전자의 염기서열 분석을 통해 1405 bp 지역에서(accession number: AY739704) G염기가 A염기로 치환되는 변이를 확인하였다. 확인된 변이지역은 G가 A로 치환됨으로 인해 150번째 아미노산 서열이 glycine (GGG)에서 arginine (AGG)으로 바뀌는 missense mutation임을 확인하였다. 각 유전자형의 빈도는 0.164(GG), 0.587(GR) 그리고 0.249(RR)로 확인되었으며, 각 대립유전자의 빈도는 0.458(G)과 0.542(R)로 확인되었다. 돼지 UCP3의 G150R 유전자형과 경제형질 간의 연관성을 분석한 결과 등지방두께에 있어 유의적인 연관성이 검출되고 일당증체량과 90 kg 도달일령에서는 유의적인 값이 검출되지 않았다. Uncoupling protein (UCP) 3 has a number of proposed roles in the regulation of fatty acid metabolism. A number of polymorphisms in the human UCP3 gene have been identified, and the correlation with obesity related phenotypes evaluated. The objective of this study was to identify SNP in porcine UCP3 gene and to investigate the effect of the SNP on economic traits. The sequencing analysis method was used to identify nucleotide polymorphisms at position 1405 bp (Genebank accession No : AY739704) in porcine UCP3 gene. The SNP (G150R), located in the exon 3, changed the amino acid to glycine (GGG) from arginine (AGG). This G150R showed three genotypes - GG, GR and RR - by digestion with the restriction enzyme Sma Ⅰ using the PCR-RFLP method. The G150R showed significant effects only on back fat (P<0.05). Animals with the genotype GG had significantly higher back fat thickness (1.358 ㎝) than animals with the genotype GR (1.288 ㎝, P<0.05) and RR (1.286 ㎝, P<0.05). However, the genotypes had no significant association with ADG and days to 90㎏. According to results of this study, a G allele of the G150R was found to have a significant effect on back fat thickness. It will be possible to use SNP markers on selected pigs to improve backfat thickness, an important economic trait.

토종닭 순계와 실용계의 유전적 특성 및 품종식별력 분석

Jae-Don Oh(오재돈),Kun-Woo Lee(이건우),Ok-Suk Seo(서옥석),Byung-Wook Cho(조병욱),Gwang-Joo Jeon(전광주),Hak-Kyo Lee(이학교),Hong-Sik Kong(공홍식) 한국생명과학회 2010 생명과학회지 Vol.20 No.7

본 연구는 토종닭 순계(적갈계통, 황갈계통), 토종닭 실용계와 오골계 및 외래품종(Hy-Line Brown: HB, White Leghorn: WL)을 대상으로 13종의 MS marker (ADL0309, ADL181, ADL190, ADL279, LEI0073, LEI0192, MCW083, MCW120, MCW153, MCW214, MCW217, MCW226, MCW322)을 활용하여 집단 및 품종간의 유전적 다양성을 분석 하였다. 13종의 MS marker 내에서 총 120개의 대립유전자를 확인 하였으며 평균 9.2개의 대립유전자를 보유한 것으로 나타났다. 관측된 이형질성, 기대되는 이형질성 및 PIC의 평균값은 각각 0.63, 0.72 그리고 0.678로 확인되었다. 가장 많은 평균대립유전자를 보유한 집단은 토종닭 실용계집단이 5.9로 확인 되었으며 기대되는 이형질성이 0.629로 비교적 높게 나타났다. 이는 토종닭 순계 집단을 이용한 3원 교잡을 통해 실용계집단을 생산하는 과정에서 기인한 것으로 추정된다. 집단 및 품종간의 유전적 유연관계를 분석한 결과 토종닭 순계집단 (R, Y)과 실용계집단(C)은 서로간에 가까운 유전적 거리를 유지하고 있는 것으로 확인되었다. 각 MS marker별 품종간의 이형접합률을 이용하여 각 개체들의 집단 내에서 품종을 식별 할 수 있는 확률인 누적품종식별력(CPD) 값을 계산한 결과 13종의 MS marker를 이용하여 개체의 품종을 구분할 수 있는 확률이 99.461%로 나타났다. To estimate the genetic characteristics and cumulative power of discrimination (CPD) within Korean native commercial chicken, we used a total of 395 genomic DNAs from six breeds population (Korean Native Red chicken: R, Korean Native Yellow chicken: Y, Korean native Commercial Chicken: C, Ogal chicken: S, Hy-Line Brown: H, White Leghorn: W). Genetic diversity indices including mean allele number among loci, unbiased heterozygosity (hi) within locus, effective number of alleles (Ne) and polymorphism information content (PIC) as well as the unbiased average heterozygosity (H) among loci in the populations were calculated using the generated allele frequencies by each marker. Frequencies of microsatellites markers were used to estimate heterozygosities and genetic distances. The nearest distance (0.119) was observed between the C and Y strains. The generated unbiased average heterozygosity among loci in each population was integrated to the global formula of CPD and the result demonstrated that the CPD within the six chicken populations was 99.461%.

Characterization of gene expression and genetic variation of horse ERBB receptor feedback inhibitor 1 in Thoroughbreds

Jae-Young Choi,장현준,박정웅,Jae-Don Oh,신동현,Nam Young Kim,Jin Hyeog Oh,Ki-Duk Song,조병욱 아세아·태평양축산학회 2018 Animal Bioscience Vol.31 No.3

Objective: This study aimed to test the expression patterns of ERBB receptor feedback inhibitor 1 (ERRFI1) before and after exercise and the association of non-synonymous single-nucleotide polymorphisms (nsSNPs) of horse ERRFI1 with racing traits in Thoroughbreds. Methods: We performed bioinformatics and gene expression analyses for horse ERRFI1. Transcription factor (TF) binding sites in the 5′-regulatory region of this gene were identified through a tool for prediction of TF-binding site (PROMO). A general linear model was used to detect the association between the nsSNP (LOC42830758 A to G) and race performance. Results: Quantitative polymerase chain reaction analysis showed that expression level of ERRFI1 after exercise was 1.6 times higher than that before exercise. Ten transcription factors were predicted from the ERRFI1 regulatory region. A novel nsSNP (LOC42830758 A to G) was found in ERRFI1, which was associated with three racing traits including average prize money, average racing index, and 3-year-old starts percentile ranking. Conclusion: Our analysis will be helpful as a basis for studying genes and SNPs that affect race performance in racehorses.

Potential Allelic Association of Microsatellite Markers on Bovine Chromosome 5 with Carcass Traits in Hanwoo (Korean cattle)

Jae-Don Oh(오재돈),Hong-Sik Kong(공홍식),Byung-Wook Cho(조병욱),Mi-Rang Lee(이미랑),Gwang-Joo Jeon(전광주),Hak-Kyo Lee(이학교) 한국생명과학회 2008 생명과학회지 Vol.18 No.9

본 연구는 한우의 5번 염색체 내에 존재하고 있는 10개의 microsatellite marker의 대립유전자 빈도를 이용하여 한우의 경제형질과의 연관성을 지닌 좌위를 탐색하기 위하여 실시하였다. 한우 326두를 대상으로 10개의 유전좌위를 분석한 결과 총 169개의 대립유전자가 검출되었다. 모든 유전좌위에서 다형성이 검출되었으며 각 유전좌위별 대립유전자의 수는 9에서 28개로 나타났으며 평균 16.9로 나타났다. 가장 높은 PIC 값을 가진 유전좌위는 DIK2400(0.908)이었으며 가장 낮은 유전좌위는 DIK2718 (0.603)으로 검출되었다. 관측된 이형접합도에서는 DIK1048 (0.655)가 가장 높게 나타났으며, DIK2400 (0.906)은 가장 낮은 것으로 검출되었다. 분석된 MS marker들의 대립유전자의 빈도를 이용하여 경제형질과의 연관성을 탐색하기 위하여 각 경제형질별 육종가를 대상으로 상위그룹과 하위그룹으로 나누어 Chi-square검정을 실시하였다. 분석결과 DIK2828의 239 대립유전자는 근내지방도에서 상위그룹과 하위그룹의 빈도차가 유의적인 차이를 보이는 것으로 나타났다. BMC1009의 279 대립유전자는 도체중과 등지방두께에서 유의적인 차이를 확인하였으며 285대립유전자는 도체중, 등지방두께 그리고 근내 지방도에서 유의적인 차이가 확인되었다. DIK4329의 200대립유전자는 등심단면적과 등지방두께에서 유의적인 차이가 확인되었다. 본 연구에서 유의적인 차이가 확인된 유전자좌위는 5번 염색체 내 20 (DK2828), 41 (BMC1009) 그리고 95 (DIK4329) cM로 나타났다. A total of 10 polymorphic microsatellite markers on bovine chromosome 5 were used for allelic association tests with phenotypic characteristics in Hanwoo. The data analyzed in this study were collected from 326 steers. Chi-square tests were performed to compare the frequencies of individual alleles between the high and the low breeding value groups. The following breeding values were analyzed for QTL effects. The frequency of allele 239 of DIK2828 showed a significant difference between the high and the low breeding value groups in the breeding value of marbling score (MSBV). The allele 279 of BMC1009 was found to show significant differences in allelic distribution for the breeding value of cold carcass weight (CWBV) and the breeding value of backfat thickness (BFBV) and allele 285 showed significant differences in allelic distribution for CWBV, BFBV, and MSBV. The allele 200 of DIK4329 showed significant differences in allelic distributions for the breeding values of longissimus muscle area (LMABV) and BFBV. In this study, we identified the QTL for carcass traits at around 20 (DIK2828), 41 (BMC1009) and 95 (DIK4329) cM in chromosome 5. The results provided a useful reference for further positional candidate gene research and marker-assisted selection for fat metabolism and carcass traits.