Complete mitochondrial genome of the Antarctic silverfish,Pleuragramma antarcticum(Perciformes, Nototheniidae)

Lee, Jungeun,Lee, Hyoungseok,Lee, Jongkyu,Choi, Jungeun,Park, Hyun Informa UK (Taylor Francis) 2015 Mitochondrial DNA Vol.26 No.6

Analysis of transcription factor HY5 genomic binding sites revealed its hierarchical role in light regulation of development.

Lee, Jungeun,He, Kun,Stolc, Viktor,Lee, Horim,Figueroa, Pablo,Gao, Ying,Tongprasit, Waraporn,Zhao, Hongyu,Lee, Ilha,Deng, Xing Wang American Society of Plant Physiologists 2007 The Plant cell Vol.19 No.3

<P>The transcription factor LONG HYPOCOTYL5 (HY5) acts downstream of multiple families of the photoreceptors and promotes photomorphogenesis. Although it is well accepted that HY5 acts to regulate target gene expression, in vivo binding of HY5 to any of its target gene promoters has yet to be demonstrated. Here, we used a chromatin immunoprecipitation procedure to verify suspected in vivo HY5 binding sites. We demonstrated that in vivo association of HY5 with promoter targets is not altered under distinct light qualities or during light-to-dark transition. Coupled with DNA chip hybridization using a high-density 60-nucleotide oligomer microarray that contains one probe for every 500 nucleotides over the entire Arabidopsis thaliana genome, we mapped genome-wide in vivo HY5 binding sites. This analysis showed that HY5 binds preferentially to promoter regions in vivo and revealed >3000 chromosomal sites as putative HY5 binding targets. HY5 binding targets tend to be enriched in the early light-responsive genes and transcription factor genes. Our data thus support a model in which HY5 is a high hierarchical regulator of the transcriptional cascades for photomorphogenesis.</P>

국내 돼지에서 분리한 내인성 레트로 바이러스 gag 유전자의 분자 생물학적 특성 분석

이정은(Jungeun Lee),이동희(Donghee Lee),유재영(Jae-Young Yoo),김계웅(Gye-Woong Kim),박홍양(Hong-Yang Park),이훈택(Hoon-Taek Lee),김영봉(Young Bong Kim) 대한미생물학회 2006 Journal of Bacteriology and Virology Vol.36 No.3

한국판 수용인정척도의 타당화

이정은(Jungeun Lee),이미경(Mikyung Lee),현명호(Myoung-Ho Hyun),Alan E. Fruzzetti 대한스트레스학회 2012 스트레스硏究 Vol.20 No.3

본 연구는 파트너로부터 경험하는 심리적 폭력을 측정하기 위해 Fruzzetti가 미국에서 개발한 수용인정척도(validation and invalidation response scale, VIRS)의 신뢰도 및 타당도를 알아보고자 하였다. 참여자는 데이트 폭력경험이 있으며 대학교에 재학 중인 여학생 346명이었다. 먼저 확인적 요인분석을 실시한 결과 한국판 수용인정척도는 단일요인 척도로 확인되었고 문항내적 일치도(Cronbach α=.922) 역시 높은 것으로 나타났다. 또한 보편적으로 사용되고 있는 파트너폭력척도와 높은 상관을 보임으로써 수렴타당도가 검증되었다. 추가적으로 심리적 폭력 경험을 묻는 본 척도와 정서조절척도를 선형회귀분석한 결과 한국판수용인정척도는 정서조절곤란을 유의하게 예측하였고(R2=.05, F[1,319]=17.31, p<.000) 이성관계만족도와 선형회귀분석 결과 (R2=.29, F [1,313]=126.62, p<.000) 관계만족도를 유의하게 예측하였다. 따라서 수용인정척도는 개인이 이성관계에서 겪을 수 있는 심리적인 폭력을 측정하는 데 있어 신뢰롭고 타당한 척도임이 입증되었다. 추가적으로 데이트 폭력을 경험한 피해자에게 수용과 인정이라는 구성개념을 사용하여 치료와 연구에 적용하는 방법과 추후 연구에 대해 제언하였다. The purpose of the present study is to validate Validating and Invalidating Response Scale (VIRS, Lee et al., in progress) in Korea. College women (N=346) who have experienced an abusive relationship participated in this study and they completed the translated Validating and Invalidating Response Scale, Conflict Tactics Scale-II (CTS-II), the Psychological Maltreatment of Women Inventory-S (PMWI-S), and Relationship Satisfaction Inventory (RSI). The result of exploratory factor analysis (EFA) of K-VIRS suggested one factor structure. Data analysis showed: 1) high reliability of the VIRS (Cronbach’s α=.922); 2) appropriate levels of convergent validity, evidenced by moderate correlations with the CTS-II (r=?.457, p<.001), the PMWI-S (r=?.473, p<.001), and RSI (r=.537, p<.001). In addition, K-VIRS showed significant regression with the Korean version of the Difficulties in Emotion Regulation Scale (K-DERS, R2=.05, F (1,319)=17.31, p<.000) and RSI (R2=.29, F (1,313)=126.62, p<.000), indicating victims who have experienced dating violence experience difficulties regulating their emotions and low relationship satisfaction in the relationship. The treatment and research utility of using the construct of validation/invalidation with current and former victims individually and in couples will be discussed and further research establishing the incremental. (Korean J Str Res 2012;20:159∼167)

Novel Cell Immobilization Method Using Wettable Surface of Carrier

Doo-Hoon Lee,Hee-Hoon Yoon,Hyun Kim,Ji-Hyun Lee,Kwang-Woong Lee,Suk-Koo Lee,Sung-Koo Kim,Jung-Keug Park,Jungeun Choi,Young-Jin Kim 한국생물공학회 2005 한국생물공학회 학술대회 Vol.2005 No.4

Supervised learning에 기반한 돼지 발성음 분류에 관한 연구

민경진(KyoungJin Min),이혁재(HyeokJae Lee),황현진(HyunJin Hwang),이상엽(SangYeob Lee),이강휘(KangHwi Lee),문상호(SangHo Moon),이정은(JungEun Lee),이정환(Jeong Whan Lee) 대한전기학회 2021 전기학회논문지 Vol.70 No.5

This study categorizes the current situation of the pig as supervised learning through the analysis of the pig’s sound. Audio data were obtained from video data obtained by recording at a barn. Speech data was preprocessed to extract features in the time domain and frequency domain, and formants and MFCC were extracted in the frequency domain. Decision Tree, K-Nearest Neighbors, and Support Vector Machine were used for classification, and linear and RBF kernels were used for SVM. The experiment was conducted two times: classifying using features used in Praat and MDVP, which are speech analysis programs, and classifying using MFCC used in speech recognition. After classification, k-fold verification was performed. As a result of the experiment, it can be seen that there is a difference in classification according to the characteristics of using the same voice, and in the case of a situation in which the sound is unified, such as ‘cough,’ the judgment of any classifier is clear. However, in other situations, it is considered necessary to consider the characteristics of pigs by further observing their socialization behavior.

'聖德大王神鐘'의 음향특성에 관한 통계적 패턴분석

박석윤,구본초,김태호,박봉서,송인호,심규복,여영선,윤영재,이동욱,이문희,이인선,이재성,이정은,이창진,인민호,임양호,장영주,장혜경,최규선 충남대학교 기초과학연구소 2003 忠南科學硏究誌 Vol.30 No.1

'神鐘'이라는 호칭에 걸맞은 '聖德大王神鐘'의 특징 가운데 이미 알려진 다음과 같은 기존 연구 결과들을 더욱 주목할 필요가 있다. 첫째, 종의 성분에서 구리(78-84%)와 주석(11.21-15.51%)의 비율이 절묘하게 이루어져서 '韓國梵鐘'의 '천년의 소리'를 지니고 있는 것으로 보이며, 구리와 주석뿐만 아니라 납과 아연과 철과 니켈성분도 나타나며, 또한 종체의 상부와 중부 및 하부에서 각기 성분비율이 다르다. 둘째, '聖德大王神鐘'은 다른 '韓國梵鐘'들에서는 볼 수 없는 유황성분이 미량이지만(0.22%) 존재한다. 셋째, 종의 구조상 주조과정에서의 불가피한 불균일성과 표면의 조각과 문양 및 덤쇠와 같은 인위적인 요인들에 의한 미소 비대칭성을 보인다. '韓國梵鐘'의 음향특징 가운데 하나인 '맥놀이'(pulsating phenomenon)는 비대칭성으로 인한 비습한 진동수 2개가 조화 진동해 합성된 진동의 진폭이 주기적으로 변하는 현상이라고 추측되고 있다. 넷째. '韓國梵鐘'의 전형적 특징 가운데 하나인 音管이 종의 상부에 부착되어 있으며, 音管 상부와 하부의 직경에 차이가 있다. 이 音管은 높은 음 및 騷音의 음향조절 및 필터역할을 한다고 알려져 왔다. 다섯째, 종체의 하부 밑으로는 鳴洞을 설치하게 되어 있다. 鳴洞은 공명진동을 일으키는 것으로 추정된다. 본고에서는 세계적으로 유일한 '한국종' (Korean Bell)으로 불리는 '韓國梵鐘'의 전형적 특징을 잘 드러내고 있는 '聖德大王神鐘'의 음향적 신비를 통계적 패턴분석으로 접근해 보았다. '聖德大王神鐘'의 음향적 신비를 발견해 보고자. 음향신호를 ASCII코드로 변환하였으며, 추출을(samping ratio)이 22,050H2인 음향신호 시계열 자료를 리샘플링(resampling)하여 1.000Hz의 시계열 자료로 변환하여, 음향 신호의 통계적 패턴을 분석하였다. 비교적 짧은 시간(10여초)의 음향신호이지만. 음향패턴이 시간 경과에 따라 점차 다양하게 변화하고 있다. 그러므로 음향패턴에 따라 제1구간에서 제6구간까지 여섯 단계로 분류하여, 단계별 시계열자료의 定常性을 점검하고 '聖德大王神鐘'의 신비한 음향적 특징을 통계적 패턴으로 접근한 결과를 각 구간별로 요약해 보면 다음과 같다. 첫째, 제1區間打聲은 여타의 區間音과는 음향패턴이 현저히 다를 뿐만 아니라, 진폭이 크고 불규칙적인 騷音으로 판별되어 음향신호로 볼 수가 없으므로, 분석 대상에서 제외시키는 것이 타당한 것으로 보인다. 둘째, '神鐘'의 제2區間 기본 主淸音(Ⅰ음, Ⅱ음)은 극히 짧은 순간음이지만, 이후의 區間에서만 나타나는 派生音(Ⅲ음. Ⅳ음)에 비해 상대적으로 낮은 음이면서도 騷音이 거의 개입되지 않은 밝은 淸音으로서, '神鐘'의 신비한 音특성 즉 장중하고 영롱하면서도 고요한 음파 패턴을 가장 잘 드러내고 있다. 셋째, 제3區間音은 한 마디로 말하기가 쉽지 않으며, 조금은 복잡한 음향패턴변화를 보인다. 즉 제2區間 기본음향인 主音(Ⅰ음, Ⅱ음)이 지속적으로 나타날 뿐만 아니라, 기본 主音(Ⅰ음, Ⅱ음)이 派生音(Ⅲ음, Ⅳ음)을 생성해 내고 있는 것으로 보인다. 따라서 생성과정에서 미세한 騷音들이 개입되어 있으나, 필터역할을 한다고 알려져 있는 音管으로 騷音이 처리되어, 제3區間에서 騷音들이 점차 제거되어 시나브로 사라져 가는 것을 발견할 수가 있다. 넷째. 제4區間淸音은 기본 主淸音(I음, Ⅱ음)과 派生淸音(Ⅲ음, Ⅳ음)으로 구성되어 있다. 즉, 네 가지 淸音(I음, Ⅱ음, Ⅲ음, Ⅳ음)만이 자리잡게 되는데, 騷音의 필터역할을 한다고 알려져 있는 音管의 騷音 시나브로 제거기능이 제3區間에서 이어 제4區間에서도 작동된 결과 깨끗한 네 가지 淸音(I음, Ⅱ음, Ⅲ음, Ⅳ음) 음향신호가 초반부에 나타나고 있다. 또한 높은 음의 음향조절 역할을 한다고 알려져 있는 音管의 기능이 지속적으로 발휘되어, 제4區間에서 두 번째 높은 고주파 派生淸音인 Ⅲ음이 점차로 감소하면서 시나브로 사라져간다. '神鐘'의 장엄하면서도 영롱한 소리에는 어린아이의 울음소리와 유사한 고주파가 작지만 조화롭게 혼합되어 있어서, 다른 '韓國梵鐘'들보다 상대적으로 높은 음파의 특징이 발견되고 있다. 아마도 '神鐘'이라는 명칭보다 '에밀레종'이라는 애칭이 생긴 까닭이, 바로 이 상대적으로 높은 고주파 派生淸音(Ⅲ음, Ⅳ음) 때문이 아닌가 생각된다. 다섯째. 제5區間淸音은 제4區間淸音과 큰 차이는 아니지만 약간의 차이가 있다. 제5區間에서는 초반부에 3개의 淸픔(I음, Ⅱ음, Ⅳ음)이 나타난다. 그러나 점차 세 가지 淸音(I음, Ⅱ음, Ⅳ음) 중에서 가장 높은 派生淸音인 Ⅳ음마저 시나브로 사라져간다. 높은 音의 음향조절 역할을 한다고 알려져 있는 音管의 지속적인 기능에 기인한 것이다. 여섯째. '神鐘'의 제6區間主淸音은 派生淸音(Ⅲ음, Ⅳ음)은 다 사라지고 최종적으로 남게되는 기본 主淸音(I음, Ⅱ음)이다. 따라서 제6區間主淸音은 제2區間 기본 主淸音과 동일한 낮은 주파수의 主淸音(I음, Ⅱ음)이다. 그러나 제6區間主淸音은 제2區間 기본 主淸音(I음, Ⅱ음)에 비해 진폭이 상대적으로 크게 나타나고 지속시간도 훨씬 길게 나타나는, 신비하고도 절묘한 '聖德大王神鐘'의 음향적 신비의 근원이라 할 수 있는 본질적 淸音의 음향패턴을 보인다. 이러한 현상은 종체의 하부 밑에 설치한 鳴洞이 공명진동을 지속적으로 확대재생산하여 일어난 결과이다. 따라서 주석(11.21-15.51%)의 절묘한 비율, 각기 다른 종체의 상부와 중부 및 하부의 성분비율로 인한 종의 구조상의 불균일성, 종체 표면의 조각이나 문양 및 덤쇠와 같은 인위적인 요인들에 의한 미소 비대칭성, 그리고 音管의 騷音 필터기능과 높은 음향조절기능 및 鳴洞의 공명진동기능이 종합적으로 작용하여, 비로소 아름답고도 신비한 제6區間主淸音을 창출해내고 지속적 힘찬 맥놀이의 에너지가 된다. 즉 제6區間主淸音이 출현한 후에야 비로소, ‘韓國梵鐘'의 특징인 비교적 일정한 시간격인 약 2.5초(2-3초) 간격으로 지속되는 主淸音의 힘찬 '맥놀이' (pulsating phenomenon)가 시작되며, 이러한 '神鐘'의 신비한 '맥놀이현상'도 이후 오랜 시간 지속된다. 또한 '神鐘'의 기본 네 음파(I음, Ⅱ음, Ⅲ음, Ⅳ음)의 frequency를 살펴보면. 네 음파마다 변화패턴과 변화의 폭은 조금씩 다르나 매우 짧은 시간에 frequency의 미세한 변화가 지속적으로 나타나는 바. 이러한 frequency의 지속적 미세한 변화가 힘찬 '맥놀이'(pulsating phenomenon)를 유발하여 오랜 여운으로 들리게 되는 것이다. 이처럼 6단계별 다양한 음향적 패턴변화로 인해 '聖德大王神鐘'의 신비로운 종소리가 우리의 심금을 울려주고 있음을 통계적 패턴분석을 통해 접근하였다. Recently the crack of 'King Seongdeok Bell' is issued. The secret of 'King Seongdeok Bell' sounds have not been clarified completely, and though tried to make the duplicate several times, anyone could never imitate. The pipe lines and resonator (vibrational hoops) are features of Korean bell. The pipe lines make low frequency, the original sound, remain the inside of the bell and high frequency emit itself to reduce white noise. The vibration hoops make the original sound translate stable sounds and tune it to spread at a distance. The purpose of this study is to analyze sound waves of the bell. using time series analysis with data translated into ASCⅡ code. Six steps are easier to be identified by ACF and periodogram, and a vibration is showed in ACF and data with excluding white noise is showed in periodogram.

Effects of Market Diversity on Performance of Exporting Companies: An Inverted U-shaped Relationship

Jungeun Lee,Chang-Bong Kim,Dong-Jun Lee 한국무역학회 2020 Journal of Korea trade Vol.24 No.8

Purpose – The principle aim of this study is to further investigate the relationship between market diversity and export performance. We examine the benefits and costs of geographic market diversity regarding the number of countries exported to by firms on their export performance. Based on the financial risk reduction model and the entry costs model, we propose a way to incorporate the costs and benefits aspects of market diversity. Design/methodology – To empirically investigate our research question, the curvilinear relationship between market diversity and export performance, we built a secondary panel data set between 2015 and 2019, containing 17,863 observations of Korean exporting companies. A generalized least squares panel estimator with fixed effects was employed to test the hypothesis, and the statistical package, Stata 14, was used. Findings – Our main findings are as follows: As market diversity increases, export performance increases because exporters can diversify and reduce financial risks in export markets. However, the relationship between the two does not grow. As it peaks, the entry costs increase due to the high market diversity, thereby outweighing the benefits, leading, eventually to decrease in the export performance. Consequently, there is an inverted U-shaped relationship between market diversity and export performance. Originality/value – In the export and trade literature, the impact of market diversity on export performance has not been addressed yet, despite the importance of this subject. Many scholars have assumed a positive linear relationship between the two, considering only the decrease in market risks as the number of overseas markets increases, without examining the increase in the entry and management costs. Therefore, our study contributes by providing a new perspective for analyzing the characteristics and outcomes of market diversity.

Cloning and Expression of Carbon Monoxide Dehydrogenase from Citrobacter amalonaticus Y19

Jungeun LEE,Eunhee SEOL,Gurpreet KAUR,Sunghoon PARK 한국생물공학회 2011 한국생물공학회 학술대회 Vol.2011 No.10

Transcriptome sequencing of the Antarctic vascular plant Deschampsia antarctica Desv. under abiotic stress.

Lee, Jungeun,Noh, Eun Kyeung,Choi, Hyung-Seok,Shin, Seung Chul,Park, Hyun,Lee, Hyoungseok Springer-Verlag [etc.] 2013 Planta Vol.237 No.3

<P>Antarctic hairgrass (Deschampsia antarctica Desv.) is the only natural grass species in the maritime Antarctic. It has been studied as an extremophile that has successfully adapted to marginal land with the harshest environment for terrestrial plants. However, limited genetic research has focused on this species due to the lack of genomic resources. Here, we present the first de novo assembly of its transcriptome by massive parallel sequencing and its expression profile using D. antarctica grown under various stress conditions. Total sequence reads generated by pyrosequencing were assembled into 60,765 unigenes (28,177 contigs and 32,588 singletons). A total of 29,173 unique protein-coding genes were identified based on sequence similarities to known proteins. The combined results from all three stress conditions indicated differential expression of 3,110 genes. Quantitative reverse transcription polymerase chain reaction showed that several well-known stress-responsive genes encoding late embryogenesis abundant protein, dehydrin 1, and ice recrystallization inhibition protein were induced dramatically and that genes encoding U-box-domain-containing protein, electron transfer flavoprotein-ubiquinone, and F-box-containing protein were induced by abiotic stressors in a manner conserved with other plant species. We identified more than 2,000 simple sequence repeats that can be developed as functional molecular markers. This dataset is the most comprehensive transcriptome resource currently available for D. antarctica and is therefore expected to be an important foundation for future genetic studies of grasses and extremophiles.</P>