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      • 국내 분리 다제내성 장티프스균의 Plasmid 및 ${\beta}$-lactamase의 특성에 관한 연구

        유정식,신영학,오경수,이점규,김기상,Yoo, Jung-Sik,Shin, Young-Hack,Oh, Kyung-Soo,Lee, Jeom-Kyu,Kim, Ki-Sang 대한미생물학회 1999 大韓微生物學會誌 Vol.34 No.5

        Eight strains of multidrug-resistant (MDR) Salmonella typhi were isolated from Kyonggi area during January-February, 1997. They were resistant to ampicillin, amoxicillin, carbenicillin, tetracycline, chloramphenicol, trimethoprim/sulfamethoxazole, trimethoprim. Eight strains had one plasmid respectively which size was approximately M.W 220 kb and showed same restriction pattern by endonuclease HindIII. The plasmid was similar to the plasmid in size that was related to multidrug resistant S. typhi isolated from southeast Asia. It were transferred by conjugation to recipient E. coli K-12 in frequency of $2.43{\times}10^4-1.73{\times}10^{-2}$ and transconjugant showed same drug-resistant pattern with donor cells. All of 8 strains produced ${\beta}$-lactamase that was assummed to TEM-l type by isoelectric focusing and PCR.

      • KCI등재SCOPUS

        돼지와 양돈장 및 농장 관계자 간에 발생하는 항생제 내성 유전자 전파 조사를 위한 플라스미드 염기서열 분석

        정유진 ( Yujin Jeong ),이선우 ( Sunwoo Lee ),유정식 ( Jung Sik Yoo ),이동훈 ( Dong-hun Lee ),운노타쯔 ( Tatsuya Unno ) 한국환경농학회 2023 한국환경농학회지 Vol.42 No.4

        Antibiotics either kill or inhibit the growth of bacteria. However, antibiotic-resistant bacteria are difficult to treat with antibiotics. Infections caused by such bacteria often lead to severe diseases. Antibiotic resistance genes (ARG) can be horizontally transmitted across different bacterial species, necessitating a comprehensive understanding of how ARGs spread across various environments. In this study, we analyzed the plasmid sequences of 33 extended-spectrum beta-lactamases (ESBL) producing Escherichia coli isolated from pigs, farms, and their owners. We conducted an antibiotic susceptibility test (AST) with aztreonam and seven other antibiotics, as well as whole genome sequencing (WGS) of the strains using MinION. Our results demonstrated that the plasmids that did not harbor ARGs were mostly nonconjugative, whereas the plasmids that harbored ARGs were conjugative. The arrangement of these ARGs exhibited a pattern of organization featuring a series of ARG cassettes, some of which were identical across the isolates collected from different sources. Therefore, this study suggests that the sets of ARG cassettes on plasmids were mostly shared between pigs and their owners. Hence, enhanced surveillance of ARG should be im- plemented in farm environments to proactively mitigate the risk of antibiotic-resistant bacterial infections.

      • KCI등재후보

        한국전통식품 김치로부터 분리한 유산균주의 항산화 활성

        김다영 ( Da-young Kim ),김홍석 ( Hong Seok Kim ),유정식 ( Jung Sik Yoo ),조윤아 ( Yoon Ah Cho ),김철현 ( Cheol-hyun Kim ) 한국낙농식품응용생물학회(구 한국유가공학회) 2020 Journal of Dairy Science and Biotechnology (JMSB) Vol.38 No.2

        본 연구의 목적은 한국 전통 음식 김치에서 분리한 유산균의 특성을 연구하기 위해 형태학적, 생화학적 특성을 조사하였다. 한국의 전통 발효 식품에서 젖산균을 확인하기 위해 분리된 균주의 그람염색을 수행한 후 Macrogen에서 16S rRNA 분석 결과, DKGF9(Lactobacillus plantarum), DKGF1(Lactobacillus paracasei ), DKGF8(Lactobacillus casei ), DK207(Lactobacillus casei ), DK211(Lactobacillus casei )이 확인되었다. 우리는 한국의 전통 발효 식품인 김치에서 분리된 5가지 LAB의 기본 생물학적 활성에 대한 실험을 수행했다. 37℃, 55℃, 65℃, 75℃에서 각각 5분, 15분 5균주의 내열성 확인 결과, 상업 균주인 Lactobacillus acidophilus LA-5의 내열성과 유사하거나 더 높음을 보여주었다. 장내부착능에서는 선발균주 모두 상용균주와 비교했을 때 10<sup>7</sup> CFU/mL 이상으로 우수한 결합능을 보여주었고, KCTC(한국생명공학연구원 생물자원센터)에서 분양받은 Escherichia coli KCTC1682, Salmonella enterica KCTC2054, Bacillus cereus KCTC3624 3종을 활용한 항균활성 결과, 모든 균주는 상업용 균주인 L. acidophilus LA-5와 비교하여 유사하거나 더 높은 항균 활성을 나타냈다. 단백질분해능력 실험에서, 5개의 균주는 clear-zone의 직경이 24시간에서 72시간으로 갈수록 점차 증가하고, L. paracasei DKGF1이 가장 큰 직경을 갖고 있어 단백질분해능력이 가장 우수한 것으로 나타났다. 5개의 균주로부터 선택된 3개의 균주는 ABTS, DPPH, FRAP, Hydroxyl radical scanenging 활성을 포함하여 다양한 항산화활성 효과를 나타냈다. 결과적으로, 5가지 균주 중에서 우수한 기능성을 갖는 L. paracasei DKGF1이 잠재적인 프로바이오틱스 활성을 나타내며, 건강 관련 제품의 개발에 유용한 균주라고 판단된다. The purpose of this study was to investigate the probiotic properties of lactic acid bacteria (LAB) isolated from a Korean traditional food kimchi. Gram staining was performed by Macrogen (Macrogen, Inc.) for identification of the LAB. Five strains of LAB were identified, including DKGF9 (Lactobacillus plantarum), DKGF1 (L. paracasei ), DKGF8 (L. casei ), DK207 (L. casei ), and DK211 (L. casei ). The biological activities of the isolated strains were assessed. The results showed that heat resistance of the strains was similar to or higher than the commercial strain L. acidophilus LA-5. Indirect testing of the ability of the strains to attach to the mucin layer revealed that DKGF9, DKGF1, and DKGF8 have high binding affinities for the mucous layer. All strains showed antimicrobial activity similar to or higher than the commercial strain LA-5. In proteolysis experiments, the diameters of proteolysis zones of the five strains increased in the period of 24-72 h, with DKGF1 exhibiting the largest zone diameter. Three strains were selected based on their antioxidant activities. Among the five isolated strains, L. paracasei DKGF1 showed potential probiotic activity, and thus, it may be useful for the development of health-promoting products.

      • SCOPUSKCI등재

        위유암종에 의해 유발된 위십이지장중첩증 1 예

        손주익(Ju Ik Son),이준희(Jun Hee Lee),이상인(Sang In Lee),정준표(Jun Pyo Lee),송기섭(Kee Sup Song),박진아(Jin A Park),최성우(Sung Woo Choi),이정일(Jung Il Lee),이관식(Kwan Sik Lee),유정식(Jeong Sik Yoo),최승호(Seung Ho Choi),박찬일(Chan 대한소화기학회 2001 대한소화기학회지 Vol.38 No.4

        Gastroduodenal intussusception is a rare condition caused by the prolapse of a gastric tumor and subsequent invagination of the gastric wall into the duodenum. The lead point of the intussusception is usually a benign gastric tumor such as adenoma, lipoma, and leiomyoma. Only a small number was attributed to gastric carcinoma, giant solitary gastric heterotopia, Menetrier's disease, and Peutz-Jeghers syndrome. In Korea, only two cases of gastroduodenal intussusception caused by adenoma and by leiomyoma have been reported. We experienced a case of gastroduodenal intussusception caused by gastric carcinoid tumor in a 76-year-old woman. Interestingly, she had been diagnosed as having gastric carcinoid tumor metastasized to the liver 5 years and 3 months before this gastroduodenal intussusception occurred. This rare clinical setting of gastroduodenal intussusception by a rare cause is reported with a review of the literature. (Korean J Gastroenterol 2001;38:288-291)

      • KCI등재후보

        병·의원에서 분리한 메티실린 내성 황색포도알균에서 SCCmec 유형과 Aminoglycoside 변형효소 유전자의 분포

        정영희,김광욱,차정옥,이경민,유재일,유정식,김봉수,노영주,윤혜령,이영선 대한감염학회 2008 감염과 화학요법 Vol.40 No.1

        목적 : 대부분의 AME 효소 유전자는 transposon이나 plasmid 상태로 전달되며 staphylococcal chromosomal cassette mec (SCCmec) 내에도 삽입되어 있다. 최근 MRSA의 SCCmec 유형에 따라 다양한 내성유전자를 가지는 것으로 보고되고 있다. 따라서 1, 2차 의료기관에서 분리된 황색포도알균의 항생제 내성률을 조사하고 MRSA에서 SCCmec type에 따른 AME 효소 유전자의 분포를 확인하였다. 재료 및 방법 : 2004년 1, 2차 의료기관에서 분리된 황색포도알균 640주를 대상으로 methicillin의 내성유전자 mecA와 AME 효소 유전자 aac(6')-aph(2"), aph(3')-IIIa, ant(4')-Ia 등을 multiplex PCR 방법을 이용하여 확인하였다. 항생제 감수성 시험과 MIC 값은 한천배지 희석법으로 확인하였고 SCCmec type도 결정하였다. 결과 : 640주의 황색포도알균 중 MRSA을은 39.7%였으며 MRSA 분리주 모두 mecA 유전자가 검출되었다. Aminoglycoside 중 kanamycin, tobramycin에 대한 내성률은 98.1%이었고, gentamicin 68.7%, amikacin 30.8%, netilomicin 2.8%이었으며 vancomycm에는 모두 감수성이었다. Oxacillin MIC_50과 MIC_90은 각각 128 ug/mL, 256 ug/mL이었으며 254주의 MRSA 중 214주를 선별하여 AME 효소 유전자를 확인한 결과 aph(3')-IIIa 13.1%, aad(6')-aph(2") 77.1%, ant(4)-Ia 53.3%이었으며 SCCmec type에 따라서는 type II, type III, type IV가 각각 50.9%, 16.4%, 32.7%였다. SCCmec type에 따른 AME 효소 유전자의 분포는 SCCmec type II에서는 aac(6')-aph(2")와 aac(6')-aph(2")/ant(4')-Ia가 각각 49.5%, 36.7%에서 검출되었고 type III에서는 aph(3')-IIIa/aac(6')-aph(2")가 60%, aac(6')-aph(2")가 31.4%, type IV에서는 aac(6')-aph(2")/ant(4')-Ia와 ant(4')-Ia가 각각 41.4%, 50%로 나타났다. 결론 : 1, 2차 의료기관에서 분리한 황색포도알균 분리주의 메티실린 내성률은 39.7%이었다. MRSA 분리주 중 SCCmec type II와 III에서는 aac(6')-aph(2")가, SCCmec type IV에서는 ant(4')-Ia가 90% 이상 검출되어 SCCmec type과 AME 효소 유전자 분포와는 연관성이 있는 것으로 나타났다. Background : Many genes encoding aminoglycoside modifying enzymes (AMEs) on transposon or plasmid were transferred from one strain to another strain and inserted into a staphylococcal chromosomal cassette mec (SCCmec). There are very diverse subtypes in SCCmec type to the insertion of resistant genes. Therefore, we researched the resistance rates of antibiotics and distribution of AME genes according to SCCmec type in MRSA strains. Materials and Methods : We isolated 640 Staphylococcus aureus from non-tertiary hospitals in 2004, detected mecA, aac(6')-aph(2"), aph(3')-llla, and ant(4')-la using the multiplex PCR method, tested antibacterial susceptibility disk diffusion and minimal inhibitory concentration, and determined SCCmec type. Results : Of 640 S. aureus isolates, MRSA rate was 39.7% and all MRSA isolates carried mecA gene. Among 214 MRSA selected, aminoglycoside-resistant rates were 98.1% in kanamycin and tobramycin, 68.7% in gentamicin, 30.8% in amikacin, and 2.8% in netilmicin. The detection rates for aac(6')-aph(2"), aph(3')-llla, and ant(4')-la were 77.1%, 13.1%, and 53.3%, respectively. Also, SCCmec type was 50.9% in SCCmec type II, 16.4% in type Ill, and 32.7% in type IV. The genes encoding AMEs were distributed aac(6')-aph(2") (49.5%) and aac(6')-aph(2")/ant(4')-la (36.7%) in SCCmec type II, aph(3')-llla/aaac(6')-aph(2") (60%) and aac(6')-aph(2") (31.4%) in type III, and aac(6')-aph(2")/ant(4')-la (41.4%) and ant(4')-la (50%) in type IV. Conclusion : 39.7% of S. aureus isolated from non-tertiary hospitals was resistant to methicillin. More than 90% of MRSA isolates were detected aac(6')-aph(2") in SCCmec type II and Ill, and ant(4')-la in type IV. With these results, the genes encoding AMEs may be closed related to SCCmec type.

      • Salmonella typhi Salmonella typhimurium 및 Salmonella enteritidis의 항균제 감수성(1997)

        신영학,유정식,김기상,정동준,오경수,이점규,이상원,이근영,박미선,이복권,김호훈 대한화학요법학회 1998 대한화학요법학회지 Vol.16 No.3

        목적 : 국내에서 토착화 발생하여 공중보건학상 중요관리 대상 병원체인 장티푸스균과 최근 범세계적 유행추세를 보이고 있으며 우리나라에서도 급속히 증가추세를 보이고 있는 세균성 식중독의 원인균인 S. Enteritidis 및 S. Typhimurium을 대상으로 시험관내 항균제 감수성시험을 실시하여 항균제 내성양상을 파악하고자 하였다. 방법 : 1997년 1월부터 12월사이 전국 16개 시도 보건 환경 연구원 및 일부 종합병원으로부터 수집 동정한 장티푸스균 79주, S. Enteritidis 114주 및 S. Typhimurium 83주를 대상으로 미량 액체 희석 법으로 최소 발육 억제농도를 측정하고, break Point를 적용 내성양상을 분석하였다. 사용한 항균제는 β-lactam계 항균제로 ampicillin, amoxacillin, carbenicillin, cefoxitin, cephalothin, ceftriaxone, timentin(ticarcillin/clavulanic acid)을, aminoglycoside계로 streptomycin, amikacin, gentamicin, kanamycin을, quinolone계로 ciprofloxacin을 기타 tetracycline, nalidixic acid, chloramphenicol, trimethoprim, trim e th oprim/sulfamethoxazole등 총 17종 이었다. 결과 : 17종의 항균제중 1 종 이상의 항균제에 내성을 지니고 있는 균주가 장티푸스균 79주 중 15주 (19.0%), S. Enteritidis 114주중 14주(12.3%) 그리고 S. Typhimurium 83주 중 67주(80.7%) 였다. 시험에 공시된 살모넬라균종에 대해 전체적으로 tetracycline 및 페니린계의 항생제에 대한 내성균 검출빈도가 높았다. 다만 장티프스균의 경우 chloramphenicol 내성균주가 12주(15.2%) 검출되었으며, S. Typhimurium은 Streptomycin 내성 균주가 37주 (44.5%) 검출되어 높은 내성율을 보였다. 3균종 모두에서 ceftriaxone 및 ciprofloxacine 에 내성을 보이지 않았다. 다제내성 양성을 보면 장티프스균은 한가지 이상의 균제에 대해 내성을 나타낼 15주 중 10균주가 tetracycline, chloramphenicol, ampicillin, 및 trimethoprim등 4종 이상의 항균제에 대해 내성을 갖는 다제 내성 균주로 전체 내성균의 66.7%를 차치하였고 특히 9종의 항균제에 내성을 갖는 균이 3주, 8종의 항균제에 내성을 갖는 균이 5주나 검출되었다. S. Enteritidis균의 다계 내성 양상은 gentamycin을 비롯한 8종의 항균제에 내성을 지닌 균주가 1주 있었으며 4종이상의 항균제에 내성을 갖는 다제내성균이 6주로 내성균의 42.8%를 차지하였다. 주로 tetracycline과 페니실린계 항생제에 동시에 내성을 갖는 것으로 나타났다. S. Typhimurium의 다제내성양상은 tetracycline 및 streptomycin 등 2종의 항생제에 내성을 가진 형이 25주로 가장 많았으며, tetracycline 과 페니실린계 항생제에 동시에 내성을 나타내는 경우도 많았다. 또한 4종 이상의 항균제에 내성을 갖는 다제 내성균이 29주로 내성균의 43.3%를 차지했으며, S. Typhimurium DT104 주와 유사한 항균제 내성 양상을 나타내는 균주도 확인되었다. 결론 : 국내에서 분리된 장티푸스균, S. Enteritidis 및 S. Typhimurium 감수성 시험 결과 항균제 내성이 현재까지 일반적인 항균제에 국한되어 있으나 S. Typhimurium DT104주와 유사한 항균제 내성 양상을 보이는 균주가 확인되었고 과거에는 분리 보고가 흔하지 않았던 4종이상의 항균제에 내성을 지닌 장티푸스균이 다수 검출되었으므로 항균치료제 선택에 신중을 기함은 물론 내성균주 감시를 체계적이고 지속적으로 실시하여야 할 것으로 사료된다. Background : Salmonella Typhi, an endemic in Korea, S. Enteritidis and S. Typhimurium, major organisms of bacterial food poisoning, which have been responsible for numerous outbreak in the m7orld including Korea currently are important organisms to be in control. At this point, to understand current antimicrobial resistance of the three Salmonella serovars in Korea, we conducted in vitro susceptibility studies to 17 antimicrobial agents. Methods : We tested antimicrobial susceptibility by a microbroth dilution method. The target organisms are 79 isolates of S. Typhi, 114 isolates of S. Enteritidis, and 83 isolates of S. Typhimurium collected on January through December 1997 in Korea. Results : The resistance rates to one or more antimicrobial agents are 19.0%(15/79 isolates) for S. Typhi, 12.3% (14/114 isolates) for S. Enteritidis, and 80.7% (67/83 isolates) for S. Typhimurium. Grossly, the organisms' resistance rates to tetracycline and penicillins are higher than that of other agents with two exceptions : 15.2% to chloramphenicol (12/79 isolates) for S. Typhi and 44.6% to streptomycin (37/83 isolates) for S. Typhimurium. Multi-drug resistant (MDR) strains to four or more antimicrobial agents among the resistant organisms are quite high: 66.7% (10/15 isolates), 42.8% (6/14 isolates), and 43.3% (29/67 isolate) for S. Typhi, S. Enteritidis, and S. Typhimurim, respectively. Conclusion : From this investigatron, we found that the MDR strains of S. Typhi, S. Enteritidis, and S. Typhimurim have increased than previous studies. It implies that limitation of unnecessary use of drugs is very important. in order to maintain the efficacy of drugs.

      • 강원도 원주시 초등학생 Small Round Structured Virus (SRSV) 유행발생 보고

        고운영,신영학,유정식,지영미,김기순,윤재득 대한감염학회 2001 감염 Vol.33 No.3

        Small Round Structured Virus (SRSV) is a common cause of non-bacterial acute gastroenteritis in developed countries. In 30 June 1999, a large number of gastroenteritis cases occurred among elementary school children in Wonju province, who had attended the summer camp from 28 to 30 June 1999. We interviewed those students and performed both bacteriological and virological examinations. The reported cases occurred from 30 June, peaked on 1 July and decreased from 2 July, which suggested the point source outbreak pattern. The attack rate was 22.5% according to the clinical case definition which is defined as those who have more than two symptoms among; vomiting, abdominal pain and diarrhea. The most common symptom was diarrhea (48.0%), followed by abdominal pain (38.1%) and vomiting (17.1%). The duration of diarrhea was one to two days. Among the 352 stool examinations, all of the following organisms, Salmonella spp, Shigella app. and EHEC O157, were negative, and in virological examinations of 5 stool specimens for rotavirus, enterovirus, and SRSV, one specimen was positive for SRSV. Sequence analysis showed that detected SRSV was closely related to genogroup I. We concluded that SRSV might be the possible cause of this outbreak (Korean J Infect Dis 33:210∼213, 2001)

      • 1996년 부산시에서 집단발생한 장티푸스 환자들로부터 분리한 Salmonella typhi의 PFGE양상, Phage형 및 항균제감수성

        박미선,강연호,유정식,신영학,이복권,김호훈 대한감염학회 1997 감염 Vol.29 No.3

        목적: 1996년 4월부터 6월사이 부산시 수영구에서 집단 발생한 장티푸스 환자로부터 분리된 장티푸스균 48주를 대상으로 phage형 시험 및 염색체 DNA를 제한효소로 처리 후 PFGE를 시행, 그 양상을 분석, 역학적 도구로서의 유용성을 검토하고 장티푸스 치료의 효율적 약제선택의 기초 자료로 제공하고자 항생제 감수성시험을 하였다. 방법: 항생제 감수성 시험은 장내세균 감수성 시험에 권장되고 있는 ampicillin외 14종의 항균제에 대하여 NCCLS 표준 디스크 확산법으로 수행하였다. phage형 시험은 영국 중앙 공중 보건 실험실(PHRL)에서 분양 받은 phage액을 사용하여 시험하였다. PFGE 시험은 장티푸스균 염색체 DNA를 제한효소 Spe Ⅰ으로 처리후 PFGE를 수행, 그 영동상을 관찰 분석하였다. 결과: 시험대상 장티푸스균 48주중 ampicillin의 14종의 항균제에 내성을 보인 균주는 없었다. phage형은 비분류주(untypable)가 44주였고 M1이 2주, 그리고 E1형이 2주였다. PFGE양상 분석결과 A group(47주) 및 B group(1주)의 2가지 group으로 분류되었으며 A group은 A1(42주), A2(1주), A3(3주) 및 A4(1주) 등 4가지 subgroup으로 분류되었다. A group의 각 subgroup사이의 유전적 유사도(F치)는 0.8-0.897으로 유사도가 높았으나 A group의 각 subgroup과 B group간의 F치는 0.20-0.258로 유전적 근연 관계가 낮았다. 결론: 1996년 4월부터 6월사이 부산시 수영구에서 집단 발생한 장티푸스 초발 환자는 장티푸스균이 분리된 환자를 대상으로 장티푸스균의 PFGE양상 분석 결과 발병일(1996년 4월 23일)이 가장 빠른 것으로 신고된 남성 환자로 추정되었다. 염색체 DNA를 Spe Ⅰ제한효소로 처리 PFGE를 수행, 그 양상을 분석하는 방법이 장티푸스 집단발생시 감염원 및 유행전파 경로 추적등 역학적 분석에 유용성이 큰 것으로 밝혀졌다. 본 실험에 사용된 장티푸스 분리균은 장내세균 약제 감수성 시험에 일반적으로 권장되고 있는 ampicillin외 14종의 항균제에 내성을 나타낸 균주는 검출되지 않았으나 항균제 남오용 및 해외로부터 약제 내성 장티푸스균의 유입으로 약제 내성 장티푸스 출현 감시에 능동적 대처가 요망된다. Background: During the period from April to June 1996, an outbreak of typhoid fever occurred in SuYoung-Ku, Pusan city. We performed the molecular epidemiological analysis and drug susceptibility test for 48 isolates of Salmonella typhi from the outbreak. Methods: Chromosomal DNA of S. typhi was digested with the restriction endonuclease Spe Ⅰ and the resulting restriction polymorphism was observed on pulsed field gel electrophoresis(PFGE). Phage typing was performed using Vi-phages, and antimicrobial susceptibility test was done by Disc diffusion method. Results: On phage typing, 2 isolates were M1 phage type, 2 E1 phage type and 44 untypable. The PFGE analysis on 14 to 16 chromosomal DNA restriction fragments ranged from 50Kb to 1000kb showed 2 different patterns of restriction fragments, divided into group A and B. Forty-seven isolates belonged to group A that were subgrouped into A1(42 strains), A2(1 strain), A3(3 strains), A4(1strain), and one strain was grouped into group B. in the F-value of genetic similarity of the epidemic S. typhi strains, there was low similarity(F value: 0.2-0.258) between group A strains and group B strains. However, the subgroup strains(A1-A4) showed high similarity(F value:0.8-0.897) each other. The drug susceptibility test showed susceptibility to ampicillin, carbenicillin, cephalothin, chloramphenicol, tobramycin, gentamycin, kanamycin, nalidixic acid, neomycin, polymyxin B, streptomycin, tetracycline, trime-thoprim-sulfamethoxazole, ciprofloxacin and norfloxacin. Conclusion: This study showed that phage typing and PFGE were very useful as a tool to investigate molecular analyses of epidemic S. typhi strains this study.

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