NGS_SNPAnalyzer: a desktop software supporting genome projects by identifying and visualizing sequence variations from next-generation sequencing data

Dong‑Jun Lee,Taesoo Kwon,Chang‑Kug Kim,Young‑Joo Seol,Dong‑Suk Park,Tae‑Ho Lee,Byung‑Ohg Ahn 한국유전학회 2020 Genes & Genomics Vol.42 No.11

Background Sequence variations such as single nucleotide polymorphisms are markers for genetic diseases and breeding. Therefore, identifying sequence variations is one of the main objectives of several genome projects. Although most genomeproject consortiums provide standard operation procedures for sequence variation detection methods, there may be differencesin the results because of human selection or error. Objective To standardize the procedure for sequence variation detection and help researchers who are not formally trainedin bioinformatics, we developed the NGS_SNPAnalyzer, a desktop software and fully automated graphical pipeline. Methods The NGS_SNPAnalyzer is implemented using JavaFX (version 1.8); therefore, it is not limited to any operatingsystem (OS). The tools employed in the NGS_SNPAnalyzer were compiled on Microsoft Windows (version 7, 10) andUbuntu Linux (version 16.04, 17.0.4). Results The NGS_SNPAnalyzer not only includes the functionalities for variant calling and annotation but also providesquality control, mapping, and filtering details to support all procedures from next-generation sequencing (NGS) data to variantvisualization. It can be executed using pre-set pipelines and options and customized via user-specified options. Additionally,the NGS_SNPAnalyzer provides a user-friendly graphical interface and can be installed on any OS that supports JAVA. Conclusions Although there are several pipelines and visualization tools available for NGS data analysis, we developedthe NGS_SNPAnalyzer to provide the user with an easy-to-use interface. The benchmark test results indicate that theNGS_SNPAnayzer achieves better performance than other open source tools.

연령증가에 따른 혈압요소들의 좌심실비대 및 관동맥질환과의 관련성

박재석,박창규,박미영,박재형,김용현,나진오,신성희,서순용,홍순준,박성미,임홍의,김응주,서홍석,오동주,노영무 대한순환기학회 2004 Korean Circulation Journal Vol.34 No.2

혈우병 소견을 가진 뇌출혈 환자 치험(治驗) 1례(例)

정인태,서병관,이현종,하지영,강미경,홍장무,백용현,박동석,최도영,Jung, In-tae,Seo, Byung-kwan,Lee, Hyun-jong,Ha, Ji-young,Kang, Mi-kyeong,Hong, Jang-moo,Baek, Yong-hyeon,Park, Dong-suk,Choi, Do-young 대한침구의학회 2003 대한침구의학회지 Vol.20 No.4

Objective : Hemophilia, a genetically determined disorder, is characterized by abnormality of the coagulation mechanism due to functional deficiency of a specific factor, namely VIII or IX. In this study, the effect of Dong-Si acupuncture therapy on the cerebral hemorrhage patient with hemophilia was evaluated. Methods : We treated him with acupuncture by stimulating Dong-Si acupuncture point(Yuk Wan) and assessed the effect by using manual dynamic evaluation of MRC(Medical Research Council) and Modified Barthel Index. Results : After treatment, the bleeding tendency was grossly reduced and bleeding lesion was absorbed gradually. And manual dynamic evaluation of the upper extremity increased from 4 grade to 5 grade. Conclusions : This result suggest that Dong-Si acupuncture therapy on the cerebral hemorrhage patient with hemophilia was effective. And futher studies are required to concretely prove the effectiveness of Dong-Si acupuncture therapy for treating hemorrhagic diseases.

국내 다기관에서 조사한 지역사회획득 메티실린내성 황색포도알균의 빈도와 임상적 특성

송진수,최평균,송경호,조재현,김성한,방지환,이창섭,박경화,박경운,신수,최희정,김의석,김동민,이미숙,박완범,김남중,오명돈,김의종,김홍빈,최강원 대한감염학회 2006 감염과 화학요법 Vol.38 No.6

목적 : 최근 전세계적으로 지역사회획득 메티실린내성 황색포도알균(community-associated methicillin-resistant Staphylococcus aureus, CA-MRSA)의 보고가 증가하고 있다. 하지만, 우리나라에서는 CA-MRSA 감염증에 대한 증례보고만 있을 뿐 아직까지 체계적인 연구결과가 없는 실정이다. 저자들은 국내에서 CA-MRSA의 빈도, 감염증의 임상적 양상, 분리된 균주의 항균제내성 양상을 조사하였다. 재료 및 방법 : 2005년 1월부터 2005년 6월까지 7개 병원에서 MRSA가 분리된 환자의 명단을 파악한 후 의무기록지와 건강보험심사평가원의 자료를 검토하였다. 외래나 응급실에서 혹은 입원 후 72시간 이내에 균주가 분리되고 MRSA 획득과 관련된 위험인자가 없는 경우 CA-MRSA로 정의하였으며, 분리된 균주의 임상적 의미에 따라 원인병원체(pathogen), 집락화(colonizer), 미결정(undetermined)으로 분류하였다. Penicillin과 oxacillin을 제외하고 3개 이상의 다른 계열 항균제에 내성이면 다제내성으로 정의하였다. 결과 : 연구기간동안 총 3,251주의 황색포도알균이 분리되었으며, 이 중 MRSA는 1,900주(58.4%)였다. MRSA 가운데 CA-MRSA는 114주(6.0%) 였으며, 이들이 분리된 부위는 귀(62주), 비뇨기계(14주), 피부 및 연부조직(11주), 호흡기계(10주), 혈액(3주) 등이었다. CA-MRSA 균주 가운데 집락균은 22주, 원인병원체는 22주였으며, 나머지 균주에 대해서는 그 임상적 의미를 결정할 수 없었다. 항균제 감수성 검사를 시행한 73균주 중 47주(64.4%)는 다제내성이었다. CA-MRSA 감염증 22예 중 피부 및 연부조직 감염(9예)과 중이염/외이도염(9예)이 가장 흔하였다. 침습적 감염증(invasive infection)은 4명(원발성 균혈증 3예, 감염성 관절염 1예)에서 확인되었지만, CA-MRSA 감염증으로 사망한 환자는 없었다. 결론 : 병원내 감염증에서는 MRSA가 심각한 문제이지만, 아직까지 지역사회 감염증에서 CA-MRSA는 흔하지 않았다. Background : Methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) infection has emerged in patients who do not have the established risk factors. In Korea, little is known about the epidemiology and clinical features of community-associated MRSA (CA-MRSA). Material and Methods : Clinical microbiology laboratory databases of 7 hospitals were reviewed to identify the patients from whom MRSA was isolated during the period of January to July 2005. Only one isolate per patient was enrolled. In order to identify the risk factors of MRSA acquisition, the medical records and the Health Insurance Review Agency databases were reviewed. CA-MRSA was defined as MRSA isolated from patient without established risk factors. We analyzed patient demographics, underlying medical conditions, characteristics of infection, and antimicrobial susceptibility profiles. Results : Of total 3,251 S. aureus isolates, 1900 (58.4%) were MRSAs. Of the MRSA isolates, 114 (6.0%) were CA-MRSA. Of 114 CA-MRSA isolates, 22 (19.3%) were colonizers, 22 (19.3%) were pathogens, and the clinical significance of remaining 70 (61.4%) could not be determined. Median age of the 22 patients with CA-MRSA disease was 47 years. Nine patients had skin and soft tissue infections, 9 ear infections, 3 bacteremia, 1 septic arthritis. Seven patients had underlying medical disease. None died of the CA-MRSA infections. Of the 73 isolates of CA-MRSA, 47 (64.4%) were resistant to more than 3 classes of antibiotics besides β-lactams. Conclusion : Although MRSA is highly prevalent among hospital-associated S. aureus infection, CA-MRSA infections are not common.

임상교정 교육용 멀티미디어 데이터베이스 웹서버 구축에 관한 연구

박재우,이종기,장영일,남동석,김명기,양원식,김태우,백승학 대한치과교정학회 2000 대한치과교정학회지 Vol.30 No.2

본 연구는 인터넷상의 가상공간에 다양한 자료로 구성된 환자 증례를 통해, 교정을 배우고자 하는 임상의나 학생들의 교육에 필요한 멀티미디어 데이터베이스를 구축하기 위한 것이다. 이러한 시스템을 구현하기 위해서는 이미지 자료의 처리, computer network를 통한 빠른 정보처리 기능, 진단 분석법의 개발, 데이터베이스의 구축 기술, 데이터베이스와 인터넷과의 연계, 증례를 통한 교육방법론과 같은 기술적 문제점들이 있다. 진단과 치료계획을 위한 분석은 모델 분석과 두부방사선 사진분석으로 나누어 제공하였다. 모델분석법은 arch length discrepancy와 Bolton tooth ratio를 환자 정보란에 제공하였다. 두부방사선 사진분석은 초진란에 제공하였다. Cephalometric analysis ver 2.0과 Power Ceph pro 3.3.5를 이용하여 Tweed, Steiner, Jarabak분석법 등을 제공하였으나, 본문에서는 주로 Kim's analysis와 몇 가지 계측치를 추가하여 설명하였고, 나머지는 tracing란에서 제시하였다. 또한 치료 종료 후나 보정란에서 치료 전, 후의 두부방사선 사진을 중첩해서 보여줌으로써 치료에 의한 효과를 직접 볼 수 있도록 하였다. The Objective of this research was to construct the multimedia database system that was necessary for the education of the practitioners and the students. To establish this system, there were technical problems as follows : 1) The processing of the images, 2) The rapid processing of the information with the computer network, 3) The development of diagnosis tools, 4) The technique to establish the database system, 5) The link between the database system and the internet, and 6) The method to educate through many cases. The analysis for diagnosis and treatment planning were provided as two parts : model analysis and cephalometric analysis. As a model analysis, arch length discrepancy and Bolton tooth ratio were provided for the part of patient information. Cephalometric analyses were provided in the part of initial diagnosis. The Cephalometric analysis ver 2.0 and the PowerCeph pro 3.3.5 were used to show Tweed, Steiner and Jarabak analysis. In the main part, Kim's analysis and some measurements were added. In the post-treatment or retention part, we show the superimposition of the cephalometrics with which you can find the effectiveness of the various orthodontic treatment. The address of this home page is "http://damis.snu.ac.kr/orthodontics"

공장 업무자동화를 위한 분산처리 시스템의 개발

박두순,공용해,오동익,정종석,오은숙 호서대학교 반도체제조장비국산화연구센터 2000 학술대회 자료집 Vol.2000 No.1

(주)한길은 콘크리트 2차 가공 업체로서, 주로 벤치플륨, 맨홀, 수로관, PC암거박스 등을 생산하고 있는 중소기업이다. 이 업체는 제품의 특수성과 생산 시설의 규모로 인하여 납품 계약 후에 미리 적정량을 생산하여 재고로 보유하면서 제품을 적기에 납품해야 한다. 그러나 현재 입고, 재고, 출고 관리 등의 업무전산화가 이루어져 있지 않을 뿐만 아니라 생산, 저장, 관리가 동일한 장소와 더불어 지역적으로 분리된 곳에서 이루어지고 있어 정보관리에 많은 어려움을 겪고 있다. 이에 본 연구에서는 근거리 네트워크와 전화접속 네트워크를 혼합한 하이브리드 형태의 분산 환경 시스템을 구축하여 경제적으로 가장 최적인 네트워크 솔루션을 제공하고, 이를 바탕으로 하는 입고, 재고, 출고 관리 시스템과 기본적인 회계 등의 전산 업무를 개발하여 업체의 생산성 및 경쟁력 향상을 도모하고자 한다.

KISE-기초학력검사(KISE-BAAT)개발연구

박경숙,김계옥,송영준,정동영,정인숙 국립특수교육원 2004 연구보고서 Vol.- No.12

본 연구는 학교 학습 특히. 국어와 수학에서 부진을 나타내는 아동을 선별 또는 진단하고, 이들이 부진을 나타내는 영역과 수준을 파악하여 이들의 교육계획 수립과 적용에 필요한 정보를 제공할 수 있는 개인용 기초학력 검사(Korea Institute for Special Education-Basic Academic Achievement Tests KISE-BAAT)의 개발을 위해 기초학력의 개념과 기초학력의 구성요인 등을 탐색하여 KISE-BAAT의 구성모형을 개발한 다음, 그 모형을 토대로 검사문항의 성취기준을 설정하고, 그에 따라 제7차 교육과정의 내용을 토대로 범교과적으로 통용할 수 있는 KISE-BAAT의 검사문항을 개발하였다. 본 연구는 유ㆍ초ㆍ중ㆍ고등학교 및 대학교의 학생 1,499명을 대상으로 KISE-BAAT의 예비검사를 실시하고, 그 결과를 토대로 검사문항의 변별도와 양호도 등을 분석하여 최종 검사문항을 선정하였다. 그리고 본 연구는 KISE-BAAT의 표준화를 위해 전국의 유치원, 초등학교와 중학교에 재학중인 5~l4세의 아동 5,977명을 대상으로 검사를 실시하여 규준의 작성 및 해석에 필요한 기초 통계를 산출하였으며, 신뢰도와 타당도를 검증하였다. 본 연구의 결과를 요약하면 다음과 같다. 첫째, 본 연구는 학력을 기초학력 과 심화학력으로 구성 된다고 가정 하여 심화학력에 의 한 학업성취를 제외한 학업성취를 기초학력으로 규정하고, 만 5세부터 14세까지 아동의 기초학력을 측정하는 개인용 기초학력검사인 KISE-BAAT를 개발하였다. KISE-BAAT는 KISE-BAAT(읽기), KISE-BAAT(쓰기), KISE-BAAT(수학)의 3개 검사로 구성되는 복합심리검사(battery)로서 각각의 소검사는 가형과 나형 2종의 동형검사로 구성되어 교육 프로그램의 사전ㆍ사후효과, 일반화 및 전이효과 측정을 용이하게 하며, 백분위수ㆍ환산점수ㆍ학력지수 학년규준의 제시로 아동의 기초학력의 지체 여부와 정도에 대한 진단과 더불어 교육계획의 수립ㆍ시행 및 평가에 활용할 수 있도록 하였다. 따라서 KISE-BAAT는 학교학습의 도구가 되는 읽기ㆍ쓰기ㆍ수학의 기초학력을 종합적으로 측정할 수 있으며, 결과를 다양하게 분석할 수 있는 개인용 기초학력검사라 할 수 있다. 둘째, KISE-BAAT의 신뢰도를 검증한 결과, 동형검사 신뢰도계수는 KISE-BAAT(읽기) 가형과 나형 .82, KISE-BAAT(쓰기) 가형과 나형 .69, KISE-BAAT(수학) 가형과 나형 .89로 나타났고, 반분신뢰도 계수는 KISE-BAAT(읽기) 가형 .93, 나형 .92, KISE-BAAT(쓰기) 가형 .91, 나형 .94, KISE-BAAT(수학) 가형과 나형 모두 .98로 나타났으며, 문항반응이론 신뢰도 계수는 KISE-BAAT(읽기) 가형과 나형 모두 .90, KISE-BAAT(쓰기) 가형 .99, 나형 .96, KISE-BAAT(수학) 가형 .97,나형 .99로 나타났다. 그리고 측정의 표준오차는 KISE-BAAT(읽기) 가형 .76, 나형 .85, KISE-BAAT(쓰기) 가형 .90, 나형 .92, KISE-BAAT(수학) 가형 2.11, 나형 2.32로 나타났으며, 재검사 신뢰도 계수는 KISE-BAAT(읽기) 가형 과 나형 모두 .96, KISE-BAAT(쓰기) 가형 .95, 나형 .96, KISE-BAAT(수학) 가형과 나형 모두 .98로 나타났으며, 문항의 내적 일치도 계수도 KISE-BAAT(읽기) 가형과 나형 모두 .98, KISE-BAAT(쓰기) 가형과 나형도 모두 .98, KISE-BAAT(수학) 가형과 나형 모두 .99로 나타났다. 따라서 KISE-BAAT의 KISE-BAAT(읽기), KISE-BAAT(쓰기), KISE-BAAT(수학) 가형과 나형은 모두 측정학적으로 아동의 기초학력을 측정하는데 있어 일관된 수치와 정보를 제공해 주는 도구라 할 수 있다. 셋째, KISE-BAAT의 타당도를 검증한 결과, KISE-BAAT(읽기) 가형ㆍ나형과 KEDI-기초학습기능점사 읽기Ⅱ의 상관계수는 각각 .50, .56, KISE-BAAT(쓰기) 가형ㆍ나형과 KEDI-기초학습기능검사 읽기Ⅰ의 상관계수는 각각 .68, .67, KEDI -기초학습기능검사 쓰기와 상관계수는 각각 .51, .68, KISE-BAAT(수학) 가형ㆍ나형과 KEDI-기초학습기능검사 셈하기의 상관계수는 각각 .70, .75로 나타났다. KISE-BAAT와 KEDI-기초학습기능검사는 매우 다른 영역과 내용으로 구성되어 있고, 서로 다른 개념을 기초로 제작된 것이나 두 검사간의 상관계수는 비교적 양호한 상태라 할 수 있다. 그리고 구인 타당도의 한 측면을 나타내는 KISE-BAAT 검사영역 상호간 상관계수는 전체적으로 KISE-BAAT(읽기) 가형이 .23에서 .93을, 나형이 .19에서 .91을 범위로 하고 있으며, KISE-BAAT(쓰기) 가형이 .70에서 .95를, 나형이 .73에서 .95을 범위로 하고 있고, KISE-BAAT(수학) 가형이 .81에서 .94를, 나형이 .83에서 .94를 범위로 하고 있다. 따라서 KISE-BAAT는 개발의 과정에서부터 이루어진 내용 타당도의 확보를 위한 노력 등으로 기초학력을 측정하는데 타당한 도구라 할 수 있다. 따라서 본 연구에서 개발한 KISE-BAAT는 아동들의 읽기ㆍ쓰기ㆍ수학 기초학력을 측정하는 신뢰롭고 타당한 개인용 기초학력검사라 할 수 있다. 그러나 KISE-BAAT는 연구 수행상의 제한점과 함께 앞으로 활용의 과정에서 나타나는 문제점을 계속 수정 보완해야 한다. 뿐만 아니라 KISE-BAAT는 문항 편파성 분석 (item bias analysis)과 일반화 가능도 분석에 대한 연구와 더 폭넓은 타당도 분석을 위해 사고력 검사나 다른 학력검사와 공인타당도 분석 등을 연구해야 한다. 그래야만 KISE-BAAT는 아동의 기초학력을 진단 평가하는데 더욱 유용하고 정교한 검사로 발전해 갈 수 있을 것이다. The purpose of this study is to develop a basic academic achievement test battery, KISE-BAAT(Korea Institute for Special Education-Basic Academic Achievement Tests) which provides information about a student's achievement and performance in reading, writing and math. In order to develop the test battery the concept and construct of basic academic achievement were investigated. Subsequently the framework of the test battery was developed, the achievement standards of test items were established and test items were developed based on the current seventh national curriculum. The item tryout of KISE-BAAT was administered to 1,499 students in grades K, 2, 5, 8, 12 and in college. Item difficulty and discrimination data were obtained. Items were selected by reviewing all data available. The national standardization was administered to 5,977 students in grades K through 9. Data obtained from the standardization test used to develop national norms for the test and reliability and validity of the test. The results of the study is as follows. First, KISE-BAAT, a test battery for an individual, consists of three tests of reading, writing and math. Each test has Form A and Form B. KISE-BAAT is used to assess the achievement of an individual student of age 5 through 14. The data can be used for general instruction, remedial instruction and evaluation of an educational program. Second, Several methods were used to estimate the reliability of KISE-BAAT. Alternate-form reliability coefficient of KISE-BAAT(Reading) is .82, KISE-BAAT(writing) .69, KISE-BAAT(Math) .89. As for Split-half Reliability coefficient of each alternate form of KISE-BAAT(Reading) shows .93 and .92. In KISE-BAAT(writing) .91 and .94 are presented. In KISE-BAAT(Math) .98 in common. Item response theory reliability coefficient of each alternate form of KISE-BAAT(Reading) are .98 in common. In KISE-BAAT(writing) .90 and .92 are presented. In KISE-BAAT(Math) .97 and .99 are presented. The standard error of measurement of each alternate form of KISE-BAAT(Reading) is .76 and .85, for KISE-BAAT(writing) .90 and .92 and for KISE-BAAT(Math) 2.11 and 2.32. Test-retest reliability coefficient of each alternate form of KISE-BAAT(Reading) are .96 in common. In KISE-BAAT(writing) .95 and .96 are presented. In KISE-BAAT(Math) .98 is presented in common. Third, the criterion-related validity of KISE-BAAT in terms of the relationship with KEDI-Basic Academic Ability Test was examined. The validity coefficient of each alternate form of KISE-BAAT(Reading) and Reading II of KEDI-Basic Academic Ability Test showed .50 and .56 repectively. The validity coefficient of each alternate form of KISE-BAAT(Writing) and Reading I of KEDI-Basic Academic Ability Test showed .68 and .67 respectively. Reading I of KEDI-Basic Academic Ability Test was matched to KISE-BAAT(Writing) since it has features of writing ability. The validity coefficient of each alternate form of KISE-BAAT(Reading) and Writing of KEDI-Basic Academic Ability Test showed .51 and .68. The validity coefficient of each alternate form of KISE-BAAT(Math) and Computing of KEDI-Basic Academic Ability Test showed .70 and .75. As for intercorrelation coefficents between subtests KISE-BAAT(Reading) range form .23 to .93. In KISE-BAAT(Writing) from .70 to .96 and in KISE-BAAT(Math) from .81 to .94. Based on all the data mentioned above KISE-BAAT can be said a reliable and valid test battery which assess students' ability in reading, writing and math. However, KISE-BAAT should be modified and complemented in order to compensate its own limitations. Future research on item bias analysis and generalizability needs to be done. Criterion-related validity to examine the relationship with other psychological tests or achievement tests also should be done to validate KISE-BAAT further. Case studies and suggestions from test users will also contribute to improve KISE-BAAT.

표준 용매 벤젠의 Rayleigh 비의 온도 의존성

박일현,이종근,윤관한,조동환,민병길,방대석 金烏工科大學校 2000 論文集 Vol.21 No.-

The Rayleigh ratio of benzene is a very important physical constant with which the integrated scattered intensity of laser light scattering can be converted into the absolute value. In this study temperature dependence of Rayleigh ratio of this solvent has been investigated with two different methods in the temperature range of 25-75℃. It was found that in the direct measurement the non-linear behavior of its Rayleigh ratio were observed as increasing temperature even if the scattering volume correction was applied to the scattered intensity of benzene. However the result of indirect measurement based upon the invariance of molecular weight of standard polystyrene polymer for any polymer solution temperature showed us that its temperature dependence up to 75℃ could be expressed with the Benoit's linear equation rather than the non-linear one. It seems that the scattered intensity in direct method has more complicate contributions at the elevated temperature. Further research works are necessary in order to solve such discrepancy clearly.

체지방 측정기(Futrex-1000 body fat tester)로 측정한 소아의 체지방율에 관한 연구 : 학동기와 청소년기 아동을 대상으로

박상철,이동환,신상만,이상주,박준수,최석민,안재억 순천향대학교 1992 논문집 Vol.15 No.2

Using the infrared interactance(NIR method), the percentage body fat in 1,401 Korean children, aged 6-18years, was evaluated for normal and standard values. Correlation of percentage of body fat with age, weight, height, overweight(%), Kaup index and Rohrer index was also analyzed. The following results were obtained ; 1) In all the subject, weight and height showed standard growth(50-90 percentile) compared to growth data of korean children. 2) The percentage of body fat was decreased with increasing age and was measured higher in female than male. 3) The percentage of body fat was decreased with increasing height in both sex. 4) The percentage of body fat correlated negatively with age, heght, weight in both sex. In boys, the Rohrer index appeared to have a significant positive correlation with the percentage of body fat. (r=0.52454) In girls, the overweight(%) appeared to have a significant positive correlation with percentage of body fat. (r=0.56994) The Kaup index had no correlation with the percentage of body fat. This NIR method is safe, non-invasive, rapid, easy to use, and may be useful predict percentage of body fat, especially in the mass screening.

간경변증 환자에서 Escherichia coli 균혈증 합병 시 간기능 장애에 따른 C-reactive protein 생성 능력에의 영향

박완범,강철인,김동민,이기덕,장희창,김홍빈,오명돈,이효석,최강원 대한감염학회 2003 감염과 화학요법 Vol.35 No.5

목적 : C-reactive protein(CRP)은 간에서 생성되는 급성 반응물질이다. 하지만 간부전증 환자에서 CRP의 반응이 간기능에 따라 어느 정도 영향을 받는지는 별로 알려진 바가 없다. 본 연구에서는 간기능에 따른 CRP 생성 능력을 평가하고자 하였다. 방법 : E. coli 균혈증이 있는 간경변증 환자 30명을 대상으로 하였고 간기능은 균혈증이 발생하기 전 2개월 이내에 측정된 혈청 빌리루빈, 혈청 알부민, 프로트롬빈시간, Child-Pugh 점수로 평가하였다. 대조군 A는 간질환이 없으면서 E. coli 균혈증이 발생한 환자 30명으로 하였고 대조군 B는 간경변증이 있으면서 급성 감염의 증거가 없는 환자 30명으로 하였다. 환자군과 대조군 간에 CRP의 최대값을 비교하였다. 결과 : CRP의 최대값은 환자군에서 7.3±5.0㎎/dL, 대조군 A에서 17.9±8.3㎎/dL로 환자군에서 유의하게 낮았다.(P<0.001). 간경변증 환자에서 CRP의 생성은 Child-Pugh 점수에 비례하여 감소하였으나(P=0.004) Child=Pugh class C의 간기능을 가진 환자군에서도 대조군 B와 비교하여 의미있는 CRP의 생성을 보였다(5.3±3.2 vs. 0.5±0.4㎎/dL, P<0.001). 결론 : 간기능부전 환자에서 CRP 반응은 간기능 저하 정도에 따라 둔화되지만 심한 간기능 장애를 가진 환자에서도 CRP의 생성은 유지된다. Background : C-reactive protein (CRP) is an acute phase reactant produced in the liver. To assess the influence of liver dysfunction on the production of CRP, we evaluated CRP response to E. coli bacteremia in patients with or without liver cirrhosis (LC). Methods : 30 LC patients who developed spontaneous peritonitis with E. coli bacteremia were enrolled in the study. Baseline values of total bilirubin, serum albumin, and prothrombin time were obtained within 2 months prior to infection. Liver dysfunction was categorized according to the Child-Pugh score. 30 patients with E. coli bacteremia who had no underlying liver dysfunction were included as a control group. Matched-control of 30 LC patients without evidence of acute infection was also included. The peak CRP values were compared among the groups. Results : In the patients with E. coli bacteremia, the mean value of peak CRP was 7.3 (+/- 5.0) ㎎/dL in LC patients, 17.9 (+/- 8.3) mg/dL in patients without liver dysfunction (p<0.001). In the advanced LC patients with Child-Pugh class C, the level of CRP was 5.2 (+/- 3.3) ㎎/dL in patients with E. coli bacteremia, 0.5 (+/- 0.4) ㎎/dL in patients without acute infection (P<0.001). Child-Pugh score had correlation with decrease of CRP (linear regression test, P=0.004). Conclusion : CRP response during E. coli bacteremia was attenuated but maintained even in patients with advanced liver dysfunction.