Draft genome sequence of lytic bacteriophage SA7 infecting Staphylococcus aureus isolates

김영주,이규민,한범구,김현일,안정근,김동혁,Kim, Youngju,Lee, Gyu Min,Taizhanova, Assiya,Han, Beom Ku,Kim, Hyunil,Ahn, Jeong Keun,Kim, Donghyuk The Microbiological Society of Korea 2018 미생물학회지 Vol.54 No.1

포도상구균(Staphylococcus aureus)은 그람양성이고 구형의 박테리아로 Firmicutes 문에 속하며, 피부나 호흡기 감염 그리고 식중독의 주요 감염원 중에 하나이다. 포도상구균을 감염시키는 박테리오파지는 포도상구균 감염에 효과적인 처방으로 쓰일 수 있다. 본 연구에서는 충청남도에 위치한 가축 농장의 오수에서 분리된 포도상구균 박테리오파지 SA7 균주의 유전체 초안을 분석하였다. 본 균주는 G + C 비율이 34.1%이며, 34,730 bp 로 구성된 dsDNA 를 지니고 있었다. 염색체에서 53 개의 단백질 코딩 유전자가 확인되었으며, 이 중 23 개의 유전자는 BLASTp 분석으로부터 기능을 가지고 있다고 추정되었다. 나머지는 가설 단백질 혹은 보존 단백질이었다. Staphylococcus aureus is a Gram-positive and a round-shaped bacterium of Firmicutes phylum, and is a common cause of skin infections, respiratory infections, and food poisoning. Bacteriophages infecting S. aureus can be an effective treatment for S. aureus infections. Here, the draft genomic sequence is announced for a lytic bacteriophage SA7 infecting S. aureus isolates. The bacteriophage SA7 was isolated from a sewage water sample near a livestock farm in Chungcheongnam-do, South Korea. SA7 has a genome of 34,730 bp and 34.1% G + C content. The genome has 53 protein-coding genes, 23 of which have predicted functions from BLASTp analysis, leaving the others conserved proteins with unknown function.

Draft genome sequence of lytic bacteriophage CF1 infecting Citrobacter freundii isolates

김영주,고세영,연영은,임재원,한범구,김현일,안정근,김동혁,Kim, Youngju,Ko, Seyoung,Yeon, Young Eun,Lim, Jaewon,Han, Beom Ku,Kim, Hyunil,Ahn, Jeong Keun,Kim, Donghyuk The Microbiological Society of Korea 2018 미생물학회지 Vol.54 No.1

본 연구에서는 돼지 축사 근처 하수 오물에서 분리된 그람 음성균이자 항생제 내성을 쉽게 획득하여 병원성을 띄는 균주인 Citrobacter freundii를 host로 하는 박테리오파지의 유전체 분석을 수행하였다. 본 박테리오파지는 G + C 비율이 42.65%이며, 50,339 bp로 구성된 유전체 DNA를 지니고 있었다. 이러한 유전체 DNA에서 89개의 단백질 코딩 유전자가 확인 되었으며, 이 중 55개의 유전자는 BLASTP 분석으로부터 기능을 가지고 있다고 추정되었다. 또한 RNA는 확인되지 않았다. Citrobacter freundii is a facultative anaerobic and a Gram-negative bacterium of Enterobacteriaceae family, and is an opportunistic pathogen. Bacteriophages infecting C. freundii can be an effective treatment for C. freundii infections. Here, the complete genomic sequence is announced for a lytic bacteriophage CF1 infecting C. freundii isolates.

Draft genome sequence of lytic bacteriophage CP3 infecting anaerobic bacterial pathogen Clostridium perfringens

김영주,고세영,연영은,한범구,김현일,오창식,김동혁,Kim, Youngju,Ko, Seyoung,Yeon, Young Eun,Le, Hoa Thi,Han, Beom Ku,Kim, Hyunil,Oh, Chang-Sik,Kim, Donghyuk The Microbiological Society of Korea 2018 미생물학회지 Vol.54 No.2

Clostridium perfringens는 그람 양성, 막대 모양, 혐기성, 포자 형성을 하는 병원균으로서 Clostridiaceae과에 속한다. C. perfringens는 인간의 장관과 척추동물 내에서 식중독을 포함하는 질병을 유발한다. 높은 특이성으로 목표 세균을 죽이는 박테리오파지는 병원세균을 제어하는 방법들 중 하나로 여겨져 왔다. 본 연구에서는 C. perfringens를 감염시킬 수 있는 박테리오 파지 CP3의 유전체 염기서열 초안을 보고한다. 본 박테리오파지의 G + C 비율은 34.0%이며, 52,068 bp로 구성된 유전체 DNA를 지니고 있었다. 이 유전체는 74개의 단백질 유전자를 포함하고 있었으며, RNA는 확인되지 않았다. Clostridium perfringens is a Gram-positive, rod-shaped, anaerobic, spore-forming pathogenic bacterium, which belongs to the Clostridiaceae family. C. perfringens causes diseases including food poisoning in vertebrates and intestinal tract of humans. Bacteriophages that can kill target bacteria specifically have been considered as one of control methods for bacterial pathogens. Here, we report a draft genome sequence of the bacteriophage CP3 effective to C. perfringens. The phage genome comprises 52,068 bp with a G + C content of 34.0%. The draft genome has 74 protein-coding genes, 29 of which have predicted functions from BLASTp analysis. Others are conserved proteins with unknown functions. No RNAs were found in the genome.

Draft genome sequence of lytic bacteriophage KP1 infecting bacterial pathogen Klebsiella pneumoniae

김영주,방인아,연영은,박준영,한범구,김현일,김동혁,Kim, Youngju,Bang, Ina,Yeon, Young Eun,Park, Joon Young,Han, Beom Ku,Kim, Hyunil,Kim, Donghyuk The Microbiological Society of Korea 2018 미생물학회지 Vol.54 No.2

Klebsiella pneumoniae is a Gram-negative, rod-shape bacterium causing disease in human and animal lungs. K. pneumoniae has been often found to gain antimicrobial resistance, thus it has been difficult to treat K. pneumoniae infection with antibiotics. For such infection, bacteriophage can provide an alternative approach for pathogenic bacterial infection with antimicrobial resistance, because of its sensitivity and specificity to the host bacteria. Bacteriophage KP1 was isolated in sewage and showed specific infectivity to K. pneumoniae. Here, we report the draft genome sequence of Klebsiella pneumoniae phage KP1. The draft genome of KP1 is 167,989 bp long, and the G + C content is 39.6%. The genome has 295 predicted ORFs and 14 tRNA genes. In addition, it encodes various enzymes which involve in lysis of the host cell such as lysozyme and holin. Klebsiella pneumoniae는 그람 음성균에 속하고 막대 형태를 가지며 인간이나 동물의 폐에 감염하여 병을 일으키는 균이다. K. pneumoniae는 흔히 항생제 내성을 나타내는데 이로 인해 항생제를 통한 치료가 어려워지게 된다. 이런 상황에서 숙주 균에 특이적이고 민감하게 반응하는 박테리오파지는 항생제 내성균의 치료에 대한 대체적인 접근법으로 제안될 수 있다. 박테리오파지 KP1은 하수처리장에서 분리되었으며 K. pneumoniae에 대해 특정적인 감염성이 있다. 본 연구에서는 Klebsiella pneumoniae 박테리오파지 KP1의 유전체 초안 분석을 수행하였다. KP1의 유전체 초안은 167,989 bp의 길이, 39.6%의 G + C 비율로 구성되어있다. 295개의 예측된 ORF들과 14개의 tRNA 유전자를 가지고 있다. 또한 이들은 lysozyme, 그리고 holin과 같은 다양한 세포 용해 관련 효소들을 포함하고 있다.

T-스티프너로 보강된 CFT 기둥-H형강보 접합부의 내진성능

김영주,채영석,신경재,오영석,문태섭,Kim, YoungJu,Chae, Young Suk,Shin, Kyung Jae,Oh, Young Suk,Moon, Tae Sup 한국강구조학회 2003 韓國鋼構造學會 論文集 Vol.15 No.6

The paper presented the seismic performance of T-stiffener moment connections for use in steel moment-resisting frames. The connections were strengthened by welding the vertical and horizontal clement of the T-stiffener to the beam flange and column f1ange. Finite clement analysis and experiments were conducted to determine the behavior of T-stiffener-reinforced connections. The results of the finite element analysis confirmed the effectiveness of the T-stiffener, whose horizontal element lengthened to mitigate local stress concentrations of the beam flange on the horizontal stiffener. Full-scale specimens were also tested cyclically to study hysteresis behavior. The main parameters used were the ratio of the T-stiffener to beam strength and the shape of the horizontal element. As the length of the horizontal element increased, the deformation capacity of the connections enhanced. Likewise, all specimens behaved according to the Ramberg-Osgood curve and showed stable hysteresis behavior. 이 논문은 모멘트 저항골조의 접합부에 이용하기 위한 T-스티프너로 보강된 접합부의 내진성능에 관해 나타냈다. 접합부는 보플랜지와 기둥플랜지에 T-스티프너의 수평 및 수직요소가 용접되어 보강되었다. T-스티프너 접합부의 거동을 명확히 파악하기 위해 유한요소해석과 실험이 수행되었다. 유한요소해석결과, T-스티프너의 수평요소의 길이가 길어짐에 따라 T-스티프너는 보플랜지와 수평요소사이의 응력집중을 줄이는데 효과적임을 나타냈다. 또한, 접합부의 이력 거동을 파악하기 위해 실대형 접합부 실험을 실시하였다. 주요 변수는 보에 대한 T-스티프너의 강도비와 수평요소의 형상이다. 수평요소의 길이가 길수록 접합부의 변형능력은 증가하였고, 모든 실험체는 방추형의 안정된 이력거동을 나타내었다.

재난구호 서비스 만족도와 재난지원금 형평성이 재난구호 성과 인식에 미치는 영향

김영주 ( Kate Youngju Kim ) 한국행정연구원 2019 韓國行政硏究 Vol.28 No.2

이 연구는 재난구호 서비스를 긴급구호, 생계구호, 보건의료구호로 구분하고 개별 재난구호 서비스 만족도가 인지된 재난구호 성과에 미치는 영향을 재난 피해자들의 인식조사 결과를 중심으로 탐색하였다. 이와 더불어 재난구호 성과 인식에 대한 재난지원금 배분 형평성의 영향력도 검정하였다. 재난유형(태풍, 호우, 화재, 지진)에 따른 재난구호 서비스 만족도와 재난구호 성과 인식의 집단 간 평균비교를 실시한 결과, 지진 피해자가 구호 서비스 만족도와 구호 성과를 가장 낮게 인식하는 것으로 나타났다. 이러한 분석 결과는 중앙 및 지방정부들이 과거 피해 사례에서 지적된 문제점을 지진 매뉴얼 또는 구호계획수립 지침 개정에 적극 반영하고 일선 구호기관들은 이를 실무현장에서 성실히 집행하기 위한 역량을 제고할 필요가 있음을 시사한다. 아울러 재난구호 서비스 만족도와 재난지원금 배분의 형평성이 재난구호 성과 인식에 미치는 영향을 파악하기 위해 다중회귀분석을 실시한 결과, 긴급구호 만족도, 보건의료구호 만족도, 재난지원금 배분 형평성이 재난구호 성과 인식을 향상시키는 것으로 나타났다. 통계분석 결과를 바탕으로, 구호업무 담당자는 현장에서 피해자들과 적극적으로 의사소통하고 이들의 요구를 친절하게 반영함으로써 서비스 질을 제고할 필요가 있으며, 공정한 지원금 배분을 위해 정부는 피해 규모 산정에 대한 보다 더 과학적인 기준을 마련하고 행위 주체의 전문성을 확보하여야 한다는 결론을 도출하였다. This study examines the effects of disaster-relief service satisfaction and equity in subsidy distribution on perception of disaster-relief performance. Categorizing disaster relief services into emergency relief, economic relief, and medical relief, this study tests key hypotheses based on ANOVA and multiple regression analysis by using survey data collected from Korean disaster victims. First, earthquake victims appear to perceive disaster relief performance less than those who survived from typhoon, flood, and fire. Second, satisfactions with emergency-relief and medical-relief services and equity in subsidy distribution are positively associated with perceived disaster relief performance. The findings suggest that central, local government and street-level relief agencies are required to update relief plans by learning from previous earthquake responses and to improve their competencies for earthquake relief. This study also emphasizes disaster relief agencies’ efforts responding to victims needs through active communications with victims, building more scientific criteria for damage assessment, and improving relevant professionalism.

신뢰할 수 있는 수행 환경을 활용한 DNN 보안에 관한 연구 동향

김영주 ( Youngju Kim ),강정환 ( Jeong-hwan Kang ),권동현 ( Dong-hyun Kwon ) 한국정보처리학회 2021 한국정보처리학회 학술대회논문집 Vol.28 No.1

심층 신경망 기술은 실시간 예측 서비스를 위한 다양한 응용 분야에 적용되고 있다. 그뿐만 아니라 최근에는 민감한 개인 정보나 중요 정보들도 이러한 심층 신경망 기술을 통해 처리되면서 보안에 관한 관심이 높아지고 있다. 본 논문에서는 이러한 심층 신경망의 보안을 위해 하드웨어 기반의 안전한 수행환경에서 심층 신경망을 수행함으로써 연산 과정을 보호하는 연구들과 안전한 수행환경 내에서도 효율적인 심층 신경망 처리 기술들을 살펴볼 것이다. 그리고 이러한 연구 동향을 토대로 앞으로의 심층 신경망 연산 보호 기술의 연구 방향에 대해 논하도록 하겠다.

철도 사물인터넷 (IoT)에서 RF기반 무선전력전송을 이용한 데이터 및 전력 송수신 방법

김영주(Youngju Kim),박성수(Sungsoo Park) 한국통신학회 2018 한국통신학회 학술대회논문집 Vol.2018 No.6

독립적 레일리 페이딩 채널에서 특성함수를 이용한 순방향 MC-CDMA의 정확한 비트 오류 성능 계산

김영주(Youngju Kim),김태영(Taeyoung Kim),홍대식(Daesik Hong) 한국통신학회 2003 한국통신학회 학술대회논문집 Vol.2003 No.7

기업지배구조 코드 운용 현황에 관한 비교 검토 : 영국과 일본의 기업지배구조코드를 중심으로

김영주(Kim, Youngju) 한국비교사법학회 2022 비교사법 Vol.29 No.1

지난 2018년 한국거래소는 기업지배구조 보고서 공시를 자율공시에서 단계적 의무공시 사항으로 전환하고, 지배구조 핵심지표 준수 현황을 필수적으로 제시하는 방향으로 유가증권시장 공시규정을 개정한 바 있다. 본 논문에서는 현행 공시제도의 비교 검토로서, 영국과 일본 양국의 기업지배구조코드 운용현황을 구체적으로 조사ㆍ검토해 보았다. 궁극적으로는 우리나라 기업공시의 규제 방향과 그 타당성 검증을 위해 구체적인 비교법적 참고자료의 제공에 본 논문의 연구적 동기를 두었다. 본 논문에서는 먼저 영국의 기업지배구조코드를 개관하고 그 적용상의 구조와 운용현황을 살펴보았다. 구체적으로는 Grant Thornton에서 2020년 발간한 영국 지배구조코드 현황 보고서에 근거하여 검토하였다. 같은 방식으로 일본의 기업지배구조코드를 개관한 후, 구조 및 적용현황을 살펴보았다. 나아가 도쿄증권거래소가 2021년 6월 발간한 기업지배구조백서를 이용하여 운용현황을 정리ㆍ분석하였다. 이후, 우리나라 한국거래소에서 시행 중인 기업지배구조보고서 공시제도를 살펴보며, 영국과 일본의 지배구조 운용현황 사례들이 우리 제도상 어떠한 의미와 시사를 주는지 생각해 보았다. In 2018, the Korea Exchange changed the disclosure of corporate governance reports from the voluntary disclosure to a mandatory disclosure. As a comparative legal review in the current situation where phased mandatory disclosure system is being implemented, this paper reviews the structural characteristics of UK and Japanese corporate governance codes by analyzing the current status of their implementations. The paper is to provide specific reference for comparative legal study to verify the regulatory direction and validity of corporate disclosure system in Korea. This paper studies (i) the structure and operation status of the UK corporate governance code and its applications. Specifically, it reviews the implementations of the UK codes by analyzing the report published in 2021 by Grant Thornton. In the same way, the paper studies (ii) the Japanese corporate governance code and its implementations. It reviews the structure and application status of the Japanese code and the white paper on corporate governance published by Tokyo Stock Exchange in June 2021. It also examines (iii) the corporate governance report disclosure system implemented by the Korea Exchange, and (iv) presents some implications to current Korean system in the light of the cases of UK and Japanese corporate governance codes and implementations.