Complete genome sequence of Comamonas sp. NLF-7-7 isolated from biofilter of wastewater treatment plant

김동현,한국일,권해준,김미경,김영국,최두호,이근철,서민국,김한솔,이정숙,김종국,Kim, Dong-Hyun,Han, Kook-Il,Kwon, Hae Jun,Kim, Mi Gyeong,Kim, Young Guk,Choi, Doo Ho,Lee, Keun Chul,Suh, Min Kuk,Kim, Han Sol,Lee, Jung-Sook,Kim, Jong-Guk The Microbiological Society of Korea 2019 미생물학회지 Vol.55 No.3

본 연구에서는 폐수처리장의 바이오필터로부터 Comamonas sp. NLF-7-7 균주를 분리하고 유전체서열을 PacBio RS II와 Illumina HiSeqXten 플랫폼을 사용하여 분석하였다. 염색체의 크기는 3,333,437 bp로 G + C 구성 비율은 68.04%, 총 유전자수는 3,197개, rRNA는 9개 및 tRNA는 49개로 구성되었다. 본 유전체는 오염물질분해와 플록형성에 관여하는 황산화 경로 유전자(SoxY, SoxZ, SoxA 및 SoxB)와 플록형성 경로 유전자(EpsG, EpsE, EpsF, EpsG, EpsL 및 glycosyltransferase)를 포함하고 있다. 이러한 Comamonas sp. NLF-7-7 균주는 폐수를 정화하는데 활용될 수 있다. Comamonas sp. NLF-7-7 was isolated from biofilter of wastewater treatment plant. The whole-genome sequence of Comamonas sp. NLF-7-7 was analyzed using the PacBio RS II and Illumina HiSeqXten platform. The genome comprises a 3,333,437 bp chromosome with a G + C content of 68.04%, 3,197 total genes, 9 rRNA genes, and 49 tRNA genes. This genome contained pollutants degradation and floc forming genes such as sulfur oxidization pathway (SoxY, SoxZ, SoxA, and SoxB) and floc forming pathway (EpsG, EpsE, EpsF, EpsG, EpsL, and glycosyltransferase), respectively. The Comamonas sp. NLF-7-7 can be used to the purification of wastewater.

김연아 선수의 ``값진 준우승``: 2011세계피겨선수권대회 관련 보도의 서사구조와 이데올로기

김동현 ( Dong Hyun Kim ) 한국스포츠정책과학원(구 한국스포츠개발원) 2012 체육과학연구 Vol.23 No.1

This study looks into the narrative structure of newspaper media on ``precious winning of the second prize`` of Yuna Kim in the World Figure Championships 2011 and analyzes the socio-cultural ideology representation in it. Also, from the way how the media describe the sports celebrity, the study attempted to read the unique cultural pattern of medias to conserve the fame and marketability of sports celebrity, For the analysis, this study selected 82 news articles from 5 different newspapers right before and after the world Figure championships 2011, and derived the conclusion by using narrative analysis method. The narrative structure is divided into four states: ``waiting for return of queen``, ``the figure queen returns``, ``precious winning of the second prize`` and ``retake of crown through figure`` In each state, medias, in accordance with the narration through a reflection of her successful discourse on national identity, through the identification with the nation, through the nationalism sentiment, through her unconditional patriotism, actively gave an effort to maintain the fame and marketability of Yuna Kim. The chief topic of this research, Korean Figure Skater Kim Yuna`s ``precious winning of the second prize``, is resulted from the integration of her unconditional patriotism grounded on nationalism having an inseparable relationship with sports. 이 연구에서는 2011세계피겨선수권대회 김연아 선수의 ``값진 준우승``을 둘러싼 신문기사의 서사구조와 그 안에서 재현되는 사회적 가치체계 분석을 통해 미디어가 스포츠 명사를 묘사하는 방식을 살펴보고, 필요에 따라 스포츠 명사들의 유명세 및 상품성을 보존하고자 하는 미디어의 전개방식과 특징적인 문화적 패턴을 읽어 내고자 하였다. 이를 위해 5개의 신문사 가운데, 2011세계피겨선수권대회 전과 후에 김연아 선수와 관련된 82개의 신문기사를 분석대상으로 사용하였으며, 서사분석법을 이용하여 결론을 도출하였다. 서사구조는 ``여왕의 귀환을 기다림``, ``돌아온 피겨여왕``, ``값진 준우승``, ``피겨를 통한 여왕으로 재등극``의 네 가지 국면으로 분석하였으며, 각 국면에서의 미디어는 서사의 흐름에 따라, 때로는 그녀의 성공적 담론에 국가정체성을 중첩시키려는 시도를 통해, 때로는 국가와의 동일시를 통해, 때로는 민족주의적 정서를 통해, 때로는 그녀의 맹목적 애국심을 통해 그녀의 유명세 및 상품성을 유지하는데 적극적으로 작용하고 있음을 보여준다. 마지막으로 이 연구의 주요논제인 김연아 선수의 ``값진 준우승``은 스포츠와 불가분의 관계를 유지하고 있는 민족주의를 기반으로 한 그녀의 맹목적 애국심이 융합되어 나타난 결과라고 할 수 있다.

기상반응법에 의한 질화티타늄 제조

김동현,김동현,김동현,원창환,Kim, Dong-Hyeon,Kim, Dong-Hyeon,Kim, Dong-Hyeon,Won, Chang-Hwan 한국재료학회 1997 한국재료학회지 Vol.7 No.12

TiN은 기상반응법으로 티타늄판과 질소가스의 질화반응에 의해 제조되었다. $\delta$-TiN은 약 1100-140$0^{\circ}C$의 온도 범위에서만 형성되는데 반해, 110$0^{\circ}C$이하의 온도에서는 $\varepsilon$-TiN 상도 관찰할 수 있었다. $\delta$-TiN의 미소정도값은 3000$\pm$300kg/m$m^2$였고, 격자상수는 0.4226$\mu\textrm{m}$였다. 가스의 유동속도가 0.7$\ell$/min의 속도이하에서는 확산과정에 의해 지배됨을 알 수 있었다. 활성화에너지가 110$0^{\circ}C$이상에서는 67.6Kcal/mol이었고 110$0^{\circ}C$이상에서는 13.9Kcal/mol이었던 것으로 보아 반응메커니즘이 110$0^{\circ}C$를 기점으로 변한다는 것을 명백히 관찰할 수 있었다. 그리고 증착속도가 확산과정에 의해 지배되는 영역에서 TiN의 증착속도는 전체 유량의 제곱근에 비례하였다.

슬러지 폐기물을 활용한 반도체급 균일한 콜로이달 실리카 나노입자의 제조 및 CMP 응용

김동현,김지원,제갈석,김민정,김하영,김민상,김상춘,박선영,윤창민,Kim, Dong Hyun,Kim, Jiwon,Jekal, Suk,Kim, Min Jeong,Kim, Ha-Yeong,Kim, Min Sang,Kim, Sang-Chun,Park, Seon-Young,Yoon, Chang-Min 유기성자원학회 2022 유기물자원화 Vol.30 No.3

This study suggests the effective recycling method of sludge waste from various industrial fields to synthesize uniform colloidal silica nanoparticles. In detail, polymers are removed from the sludge waste to attain sludge-extracted silica (s-SiO₂) micron-sized particles, and ammonia assisted sonication is applied to s-SiO₂, which has effectively extracted the silanol precursor. The nano-sized silica (n-SiO₂) particles are successfully synthesized by a typical sol-gel method using silanol precursor. Also, the yield amounts of n-SiO₂ are determined by the function of s-SiO₂ etching time. Finally, n-SiO₂-based slurry is synthesized for the practical CMP application. As a result, rough-surfaced semiconductor chip is successfully polished by the n-SiO₂-based slurry to exhibit the mirror-like clean surface. In this regard, sludge wastes are successfully prepared as valuable semicondutor grade materials.

Long-range multiple-input-multiple-output underwater communication in deep water

김동현,김대환,김재수,한주영,Kim, Donghyeon,Kim, Daehwan,Kim, J.S.,Hahn, Joo Young The Acoustical Society of Korea 2021 韓國音響學會誌 Vol.40 No.5

Long-range communication in deep waters must overcome the low data rate due to limited bandwidth. This paper presents the performance of Multiple-Input-Multiple-Output (MIMO) system to increase the data rate. In MIMO system, communication performance is degraded by crosstalk between users and an adaptive passive Time Reversal Processing (TRP) is widely used to eliminate this. In October 2018, long-range underwater acoustic communication experiment was conducted in deep water (1,000 m ~) off the east of Pohang, South Korea. During the experiment, a vertical line array was utilized and communication signals modulated by binary phase shift keying and quadrature phase shift keying with a symbol rate of 512 sps were transmitted. To generate MIMO communication signals, received signals from ranges of 26 km and 30 km is synthesized. Compared to the conventional passive TRP, the adaptive passive TRP eliminates the crosstalk between users and achieves error-free performance with an increase of output signal-to-noise ratio. Therefore, two users separated by 4 km in range achieves an aggregate data rate of 1,024 symbols/s.

새로운 계열의 선택적 COX-2 저해제: Luotonin A 동족체 및 그 질소 유도체

김동현,량경록,오준석,장영동,김진철,홍태균,황남경,정환기,김윤경,장현욱,Kim, Dong-Hyeon,Liang, Jing-Liu,Oh, Joon-Seok,Jahng, Yurng-Dong,Kim, Jin-Cheul,Hong, Tae-Gyun,Hwang, Nam-Kyung,Chung, Hwan-Ki,Kim, Yun-Kyung,Chang, Hyeun-Wook 대한약학회 2007 약학회지 Vol.51 No.5

A series of luotonin A homologues and their aza-analogues were prepared and evaluated their inhibitory activities on COX-1 and 2 as well as their selectivities on COX-2. The aza-analogue of dimethylene-bridged homologue of luotonin A, 3,3'-dimethylene-2-(1',8'-naphthyrid-2'-yl)-4(3H)-quinazolinone (2b), exhibited strongest inhibitory activity against COX-1 and COX-2 dependent phase of prostaglandin $D_2$ generation in mouse bone marrow-derived mast cells in a concentration-dependent manner with an $IC_{50}$ of 39.3 and $1.89{\mu}M$, respectively. Selectivity of 2b on COX-2 over COX-1 was 21 which implied 2b can be a potential lead for the development of selective COX-2 inhibitor.

Capsaicin 적용 후 손상된 흰쥐 척수내 c-fos와 HSP70의 발현

김동현,김석범,백수정,김진상,Kim, Dong-Hyun,Kim, Souk-Boum,Baek, Su-Jeong,Kim, Jin-Sang The Korean Society of Physical Therapy 2002 대한물리치료학회지 Vol.14 No.1

C-fos는 원종양유전자(proto-oncogene)인 v-fos의 세포 동족체로써, 성장인자나 신경전달 물질에 의해 수분 내에 다양한 형태의 세포에서 활성화된다. Fos단백질은 스트레스와 통증 과정의 신호전달기전에서 세포활동을 조절하는 3차전령으로 활동한다. 열충격 단백질(Heat shock protein : 이하 HSP)은 계통발생학적으로 초기 척추 동물에서부터 발현되며 생체방어체계의 중요한 인자로 세포가 고열, 외상, 허혈 등의 스트레스에 직면했을 때 발현이 증가하는 단백질로 알려져 있다. 본 연구에서는 캡사이신(capsaicin)으로 말초 신경병변을 유발시킨 후 통각신경활성의 지표로 이용되는 원종양 유전자인 c-fos의 발현과 열 또는 스트레스로 야기되는 손상에 대한 조직의 방어작용으로 발현되는 HSP 70의 발현을 동시에 관찰함으로서, 급성으로 유발된 말초 신경병변의 확인과 동시에 실험동물 체내에서 방어적인 역할을 밝히는 일환으로 이 실험을 실시하였다. 본 실험의 결과는 다음과 같다; 1. 척수 등쪽뿔 천층(Laminae I and II)에서 각각 c-fos와 HSP70을 항원으로 하는 면역조직화학적 방법으로 염색한 표본에서 0.9% NaCI 투여 2시간 후 c-fos와 HSP70의 양성을 나타내는 세포는 전혀 없음을 알 수 있었다. 2. 척수 등쪽뿔 천층에서 c-fos 단백질을 항원으로 하는 면역조직화학적 방법으로 염색한 표본에서 Capsaicin 투여 2시간 후 c-fos 단백질에 양성을 나타내는 세포가 많이 발현됨을 육안적 관찰로서 알 수 있었다. 3. 척수 등쪽뿔 천층에서 HSP70을 항원으로 하는 면역조직화확적 방법으로 염색한 표본에서 Capsaicin 투여 2시간 후 HSP7O의 양성을 나타내는 세포가 보통수준으로 발현됨을 육안적 관찰로서 알 수 있었다. 이 실험의 결과로 볼 때, 화학적인 신경병변 유발물질에 의한 손상을 방어하기 위해서 체내에는 내인성 물질이 형성될 것이라는 추측과 c-fos 가 다른 유전자의 발현을 유도한다는 점을 함께 고려 하였을때, Capsaicin에 의한 말초 신경병변에서 c-fos 발현이 많이 나타나는 것은 손상을 방어하는 물질의 생성에 관여하기 때문이며, 방어물질 중 이 실험에서 본 HSP70도 증가한 내인성 방어물질의 하나라고 할 수 있을 것이다.

GaAIAs 레이저 조사가 흰쥐 창상부위 상피조직의 EGF 발현에 미치는 영향

김동현,백수정,배주한,김석범,권영실,김진상,Kim, Dong-Hyun,Baek, Su-Jeong,Bae, Ju-Han,Kim, Suk-Bum,Kwon, Young-Shil,Kim, Jin-Sang 대한물리치료학회 2001 대한물리치료학회지 Vol.13 No.3

This study was performed. using EGF, to observated the effect of GaAIAs laser on wound model induced designedly in lumbar region. The results of this study were as following: 1. In expression of EGF which used marker of wound healing, laser irradiating group made EGF to more induce significantly than laser non-irradiating group at 3 days. 2. EGF immunoreactivity in epidermis were increased markedly 3 days after wound, and increased gradually from 1 day to 2 days in wound which is laser irradiation. Therefore, EGF immunoreactivity which increased after wound with GaAIAs laser irradiation indicate that GaAIAs laser have wound healing effect. This study also can become a part of scientific evidence on electrotherapy through measuring quantitively effects of GaAIAs laser in wound

초등 과학영재 수업에서의 언어적 상호작용 사례 분석

김동현 ( Dong Hyun Kim ),김효남 ( Hyo Nam Kim ) 한국과학교육학회 2011 한국과학교육학회지 Vol.31 No.8

The purpose of this study was to analyze and extract the features of verbal interactions between teacher and science-gifted students in their classes. For the purpose of this study, authors observed 27 elementary science classes for the science gifted of three elementary teachers. To analyze the verbal interactions in the classes, the authors have adopted the theoretical background, which was based on Sinclair & Coulthard`s Initiative-Response- Feedback pattern. Verbal interactions in the classes were analyzed by Kim`s framework, which modified Jeong`s framework. IRF patterns were derived from the verbal interactions of science classes for the science gifted. As a result, authors obtained some important features in IRF pattern. The most commonly used IRF pattern was the teacher`s managerial question-student`s short answer pattern, which was due to the regional policy for the science gifted. The teacher`s delayed feedback as well as the teacher`s question was meaningful for student`s thinking ability. If elementary teachers consider the pattern, the strategy should be applied, which is depending on student levels and levels of contents. But three teachers did not show the characteristic verbal interaction regarded as a pattern strategy. In the future, inservice programs about verbal interaction are needed for the science gifted classes.

Comparison of Culture, Conventional and Real-time PCR Methods for Listeria monocytogenes in Foods

김동현,천정환,Hyunsook Kim,Hong-Seok Kim,Dasom Choi,Young-Ji Kim,Jin-Hyeok Yim,Jin-San Moon,Kun-Ho Seo 한국축산식품학회 2014 한국축산식품학회지 Vol.34 No.5

We compared standard culture methods as well as conventional PCR and real-time PCR for the detection of Listeriamonocytogenes (L. monocytogenes) in milk, cheese, fresh-cut vegetables, and raw beef that have different levels of back-ground microflora. No statistical differences were observed in sensitivity between the two selective media in all foods. Intotal, real-time PCR assay exhibited statistically excellent detection sensitivity (p<0.05) and was less time consuming andlaborious as compared with standard culture methods. Conventional culture methods showed poor performance in detectingL. monocytogenes in food with high levels of background microflora, generating numerous false negative results. While thedetection of L. monocytogenes in fresh cut vegetable by culture methods was hindered only by L. innocua, various back-ground microflora, such as L. innocua, L. welshimeri, L. grayi, and Enterococcus faecalis appeared on the two selectivemedia as presumptive positive colonies in raw beef indicating the necessity of improvement of current selective media. Itappears that real-time PCR is an effective and sensitive presumptive screening tool for L. monocytogenes in various typesof foods, especially foods samples with high levels of background microflora, thus complementing standard culture meth-odologies.