Escherichia coli 에서 전사가 pBR322 DNA in Escherichia coli

김지현,박지수,구현숙 ( Ji Hyun Kim,Jisu Park,Hyeon Sook Koo ) 생화학분자생물학회 1993 BMB Reports Vol.26 No.8

The deoxyribonucleoprotein complex of plasmid pBR322 was isolated from Escherichia coli cells and was treated with micrococcal nuclease. Nuclease-resistant DNA fragments were obtained due to the binding of several histonelike proteins. The relative extents of protein binding on arbitrarily divided regions of pBR322 DNA were measured. The effects of transcripticn on the protein binding to each region of pBR322 DNA were analyzed.

건강을 위해 당신은 무엇을 하십니까?

김지현,곽성준,Kim, Ji-Hyeon,Gwak, Seong-Jun 한국건강관리협회 2005 건강소식 Vol.29 No.9

기가급 초고속 시퀀싱 시대의 도래

김지현,Kim, Ji-Hyeon 한국유전체학회 2006 유전체소식 Vol.6 No.3

한우에서 발생한 트리클로르폰 중독증 증례

김지현,이경현,정지열,이희,손준형,소병재,최은진,Kim, Ji-Hyeon,Lee, Kyunghyun,Jung, Ji-Youl,Yi, Hee,Sohn, Jun Hyung,So, ByungJae,Choi, Eun-Jin 대한수의학회 2018 大韓獸醫學會誌 Vol.58 No.3

Two 12-month-old cattle with anthelmintics containing trichlorfon the day before death presented to the Animal and Plant Quarantine Agency for diagnosis. In necropsy, they revealed enlargement of the spleens, redness of mucosa and serosa in stomachs and intestines, and friable kidneys. Histopathologically, hemorrhages in the spleens, omasums, abomasums, and intestines as well as renal tubular necrosis were observed. Trichlorfon was detected at above the lethal dose in the ruminal contents. Based on these findings, we diagnosed this case as death caused by trichlorfon poisoning.

알루미나/지르코니아 테이프 케스팅 슬러리의 분산과 레올로지에 미치는 용매혼합의 영향

김지현,양태영,이윤복,윤석영,박흥채,Kim, Ji-Hyeon,Yang, Tae-Yeong,Lee, Yun-Bok,Yun, Seok-Yeong,Park, Heung-Chae 한국재료학회 2001 한국재료학회지 Vol.11 No.6

Al$_2$O$_3$/ZrO$_2$ 비수성 현탁액의 분산과 레올로지에 미치는 methyl isobutyl ketone (MIBK) /ethanol (EtOH) 용매혼합의 영향을 침전밀도, 점도를 측정함으로써 조사하였다. 분산제 'Hypermer' KD-1이 첨가된 다량의 MIBK를 함유하는 용매 ($\geq$60vol%)에서 $Al_2$O$_3$와 ZrO$_2$ 입자의 침전밀도는 증가하였다. 80MIBK/20EtOH(vol%)에서 ball milling한 현탁액이 좁고 unimodal한 입자크기분포를 나타내었다. 모든 현탁액은 의가소성유동을 나타내었으나 shear thinning은 $Al_2$O$_3$/ZrO$_2$의 혼합비, MIBK/EtOH의 혼합비에 따라서 다소 다르게 거동하였다. 순수한 MIBK를 사용한 $Al_2$O$_3$(<300 s$^{-1}$ ) 및 ZrO$_2$(<3000 s$^{-1}$ ) 현탁액은 주어진 전단속도범위내에서 가장 강한 shear thinning을 나타내었다. 동일한 용매 (80MIBK/20EtOH, vol%)를 사용한 경우의 shear thinning은 $Al_2$O$_3$/ZrO$_2$의 혼합비에 거의 의존하지 않았다. The effects of methyl isobutyl ketone(MIBK)/ethanol(EtOH) solvent mixtures on the dispension, particle size distribution and rheology of $Al_2$O$_3$/ZrO$_2$ nonaqueous suspensions were investigated by measuring sedimentation density and viscosity. The sedimentation density of $Al_2$O$_3$ and ZrO$_2$ particles increased in MIBK-rich($\geq$60 vol%) solvents with 'Hypermer' KD-1 as a dispersant. The ball-milled suspensions in 80MIBK/20EtOH(vol%) solvent exhibited the narrow and unimodal particle size distribution. Although all Suspensions exhibited the Pseduo-Plastic flow(Shear thinning) the shear thinning behavior was somewhat different depending on the mixture ratio of $Al_2$O$_3$/ZrO$_2$ and MIBK/EtOH. Under a given shear rate( <300 s$^{-1}$ for $Al_2$O$_3$; <3000 s$^{-1}$ for ZrO$_2$) the strongest shear thinning appeared in the $Al_2$O$_3$ and ZrO$_2$ suspensions with pure MIBK solvent. The shear thinning was nearly independable on the mixture ratio of $Al_2$O$_3$/ZrO$_2$ in case of using the identical solvent(80MIBK/20EtOH, vol%).

3년간(1996~1998) 초등학생의 A군 연쇄구균 보균율과 혈청학적 분류에 관한 연구

김지현,김주예,강현호,차성호,이영희,Kim, Ji-Hyun,Kim, Ju-Ye,Kang, Hyeon-Ho,Cha, Sung-Ho,Lee, Young-Hee 대한소아감염학회 2000 Pediatric Infection and Vaccine Vol.7 No.1

목 적 : A군 연쇄상구균은 소아영역에서 상기도 감염의 중요한 원인이며, 부적절한 치료시 류마티열 및 급성 신사구체염을 유발시키는 중요한 세균이다. A군 연쇄상구균의 세포벽을 구성하고 있는 T단백질의 항원성 분류는 연쇄구균감염의 역학적 상황을 이해하는데 유용하다고 알려져 있다. 이에 저자들은, 지난 3년동안 우리나라 초등학생 연쇄구균 보균자에게서 분리된 A군 연쇄상구균의 T단백 분류를 통해 그 역학적 동태를 알고자 하였다. 방 법 : 1996년 3월부터 5월까지 울진, 서울, 오산, 군산의 정상 초등학생 1,192명을 대상으로 하였다. 울진에서는 1996년, 1997년, 1998년 3년동안 배양검사를 시행하였으며, 1996년 오산에서는 같은 초등학교에서 3회에 걸쳐 배양검사를 시행하였다. 대상 아동으로부터 소독된 면봉으로 편도와 인두를 세게 문질러 검체를 획득하여, 면양혈액한천배지에 접종 후 희석하여 37.2도에서 하룻밤 배양 후 얻은 베타용혈균을 Streptex를 이용하여 grouping하였으며, 분리된 A군 연쇄상구균의 T혈청형 분류를 시행하였다. 결 과 : 1996년 울진, 서울, 오산, 군산의 1,192명의 초등학생 중 15.0%인 179명에서 A군 연쇄상구균이 배양되었으며, 지역별 보균율은 울진 18.6%, 서울 2.7%, 오산 26.0%, 군산 12.3%였다. 1996년 보균자 179명중 T혈청형 분리율은 52.2%였으며, 지역별로는 울진 68.7%, 서울 83.3%, 오산 24.7%, 군산 83.8%였다. 1996년 지역별로 흔하게 분리된 T혈청형은, 울진에서는 NT, T1, T3순이었고, 서울은 T12, T25, 오산은 NT, T6, T28, 군산은 T25, T4, NT, T5순이었다. 울진의 연도별 보균율은 1996년 16.0%, 1997년 7.1%, 1998년 13.0%였으며, 분리된 T혈청형은 1996년에는 NT, T1, T3, T25순이었고, 1997년 NT, T1, T12, T25 순이었으며, 1998년에는 T12, NT, T4순이었다. 1996년 오산 지역에서 3회에 걸쳐 시행한 배양검사에서, 분리된 T혈청형은 1차에서는 NT가 대부분을 차지하였으나, 2차에서는 T6, T1, T4 순이었고, 2차에서와 같은 대상을 2주간격을 두고 시행한 3차에서는 T8/25, T12, T1순이었다. 같은 학생을 대상으로 2주간격으로 시행한 배양검사에서 1차에서 23명의 소아에서 양성이 나왔으며, 2차에서는 27명에서 양성이 나왔으며, 이중 1, 2차에서 모두 양성이 나온 사람은 16명이었다. 이 16명중 T혈청형이 1, 2차에서 동일하게 나온 사람은 4명(25.0%)이었다. 결 론 : 배양된 균의 세포막 단백질의 분석을 통해 연쇄구균의 혈청학적 타입을 분석 및 이 균과 관련된 역학을 파악하는 것이 궁극적으로 질병을 예방하고 치료할 수 있는 근본이 될 것으로 사료되며, 향후 주기적으로 병원균에 대한 역학적 검사가 시행되어야 할 것이다. Purpose : The accuracy of bacteriologic diagnosis of beta-hemolytic streptococcal pharyngotonsillitis depends on the degree of carrier rate in that area where the throat swabs are obtained and the evaluation of serological T typing as an epidemiologic marker is important to understand epidemiology of streptococcal infection. The purpose of this study is to know the carrier rates of group A streptococcus in normal children form four different areas and to find out the epidemiologic characteristic in distribution of the serotypes for 3 years. Method : Throat swabs were obtained from the tonsillar fossa of normal school children in four different areas(Uljin, Seoul, Osan, Kunsan) from March to May 1996, in Uljin in April 1997, and in Uljin in April 1998. The samples were plated on a 5% sheep blood agar plate and incubated overnight at $37^{\circ}C$ before examination for the presence of beta-hemolytic colonies. All isolated beta-hemolytic streptococcus were grouped and serotyped by T agglutination. Results : The carrier rate of beta-hemolytic streptococci and group A streptococci in 1996 were 27.6%, 18.6% at Uljin; 16.4%, 2.7% at Seoul; 33.0%, 26.0% at Osan; 20.0%, 12.3% at Kunsan, respectively. Among 1,192 normal school children from 4 different areas, we obtained 179 strains of group A streptococci. Fifty two percent of the strains were typable by T agglutination in 1996. Common T-type in 1996 were NT, T1, T3, T2 at Uljin; T12, T25 at Seoul; NT, T6, T28 at Osan; T25, T4, NT, T5 at Kunsan, in decreasing order, respectively. At Uljin, T1, T3, T25 accounted for 69% of strains in 1996, T1, T12, T25 accounted for 70% in 1997, and T12, T4 accounted for 88% in 1998. Conclusion : Higher carrier rates were found in Uljin and Osan, where there are a lower population density with scanty of medical facilities compared with another areas. We supposed that low carrier rates is likely to be related to antibiotic abuse or some epidemiologic factor. The periodic and seasonal serotyping analysis is important in monitoring and understanding the epidemiologic patterns of group A streptococci.

꿈과 희망을 전달하는 이야기할머니를 꿈꾸며...

김지현,Kim, Ji-Hyeon 한국도서관협회 2004 圖協會報 Vol.45 No.7

이글은 우리 협회가 지난 3월 29일(금)부터 6월 25(금)일까지 15주간 진행한 제1기 이야기(스토리텔링) 전문교육과정에서 수강생들이 과제로 제출했던 발표문 중 한편을 싣은 것이다.

SPECT/CT의 획득시간 증감에 따른 방사능농도 추정치의 변화

김지현,이주영,손현수,박훈희,Kim, Ji-Hyeon,Lee, Jooyoung,Son, Hyeon-Soo,Park, Hoon-Hee 대한핵의학기술학회 2021 핵의학 기술 Vol.25 No.2

Purpose SPECT/CT was noted for its excellent correction method and qualitative functions based on fusion images in the early stages of dissemination, and interest in and utilization of quantitative functions has been increasing with the recent introduction of companion diagnostic therapy(Theranostics). Unlike PET/CT, various conditions like the type of collimator and detector rotation are a challenging factor for image acquisition and reconstruction methods at absolute quantification of SPECT/CT. Therefore, in this study, We want to find out the effect on the radioactivity concentration estimate by the increase or decrease of the total acquisition time according to the number of projections and the acquisition time per projection among SPECT/CT imaging conditions. Materials and Methods After filling the 9,293 ml cylindrical phantom with sterile water and diluting 99mTc 91.76 MBq, the standard image was taken with a total acquisition time of 600 sec (10 sec/frame × 120 frames, matrix size 128 × 128) and also volume sensitivity and the calibration factor was verified. Based on the standard image, the comparative images were obtained by increasing or decreasing the total acquisition time. namely 60 (-90%), 150 (-75%), 300 (-50%), 450 (-25%), 900 (+50%), and 1200 (+100%) sec. For each image detail, the acquisition time(sec/frame) per projection was set to 1.0, 2.5, 5.0, 7.5, 15.0 and 20.0 sec (fixed number of projections: 120 frame) and the number of projection images was set to 12, 30, 60, 90, 180 and 240 frames(fixed time per projection:10 sec). Based on the coefficients measured through the volume of interest in each acquired image, the percentage of variation about the contrast to noise ratio (CNR) was determined as a qualitative assessment, and the quantitative assessment was conducted through the percentage of variation of the radioactivity concentration estimate. At this time, the relationship between the radioactivity concentration estimate (cps/ml) and the actual radioactivity concentration (Bq/ml) was compared and analyzed using the recovery coefficient (RC_Recovery Coefficients) as an indicator. Results The results [CNR, radioactivity Concentration, RC] by the change in the number of projections for each increase or decrease rate (-90%, -75%, -50%, -25%, +50%, +100%) of total acquisition time are as follows. [-89.5%, +3.90%, 1.04] at -90%, [-77.9%, +2.71%, 1.03] at -75%, [-55.6%, +1.85%, 1.02] at -50%, [-33.6%, +1.37%, 1.01] at -25%, [-33.7%, +0.71%, 1.01] at +50%, [+93.2%, +0.32%, 1.00] at +100%. and also The results [CNR, radioactivity Concentration, RC] by the acquisition time change for each increase or decrease rate (-90%, -75%, -50%, -25%, +50%, +100%) of total acquisition time are as follows. [-89.3%, -3.55%, 0.96] at - 90%, [-73.4%, -0.17%, 1.00] at -75%, [-49.6%, -0.34%, 1.00] at -50%, [-24.9%, 0.03%, 1.00] at -25%, [+49.3%, -0.04%, 1.00] at +50%, [+99.0%, +0.11%, 1.00] at +100%. Conclusion In SPECT/CT, the total coefficient obtained according to the increase or decrease of the total acquisition time and the resulting image quality (CNR) showed a pattern that changed proportionally. On the other hand, quantitative evaluations through absolute quantification showed a change of less than 5% (-3.55 to +3.90%) under all experimental conditions, maintaining quantitative accuracy (RC 0.96 to 1.04). Considering the reduction of the total acquisition time rather than the increasing of the image acquiring time, The reduction in total acquisition time is applicable to quantitative analysis without significant loss and is judged to be clinically effective. This study shows that when increasing or decreasing of total acquisition time, changes in acquisition time per projection have fewer fluctuations that occur in qualitative and quantitative condition changes than the change in the number of projections under the same scanning time conditions. SPECT/CT는 보급 초기에 뛰어난 보정방법과 융합영상을 기반으로 한 정성적 기능이 주목받았고, 최근 동반진단치료(Theranostics)등의 도입으로 그 정량적 기능에 대한 관심과 활용이 증가되는 추세이다. PET/CT와 달리 SPECT/CT의 절대 정량화는 조준기의 종류, 검출기 회전과 같은 조건들이 영상획득과 재구성 방법 등에 까다로운 요소로 작용하고 있다. 따라서 본 연구에서는 SPECT/CT 촬영조건 중 투영상수와 투영상당 획득시간에 따른 총 획득시간(검사시간)의 증·감이 방사능농도 추정치에 미치는 영향을 알아보고자 한다. 부피 9,293 ml의 원통형 팬텀에 멸균수를 가득 채운 후 99mTcO4- 91.76 MBq를 희석하여 총 획득시간 600 sec(10 sec/frame × 120 frames, matrix size 128 × 128)의 조건으로 기준영상을 촬영하였고, 체적감도와 교정인자를 확인하였다. 기준영상을 중심으로 총 획득시간을 60(-90%), 150(-75%), 300(-50%), 450(-25%), 900(+50%), 1200(+100%) sec/frame으로 증·감시켜 비교영상을 획득하였고, 각 영상별 세부조건은 투영상당 획득시간(sec/frame)을 1.0, 2.5, 5.0, 7.5, 15.0, 20.0 sec/frame(투영상수 120frames 고정)로, 투영상수를 12, 30, 60, 90, 180, 240 frames(투영상당 획득시간 10 sec/frame 고정)로 설정하였다. 획득된 각 영상에서 관심체적을 통하여 측정한 계수를 바탕으로 정성적 평가로서 CNR(Contrast to Noise Ratio)의 변동률(%)을 확인하였고, 방사능농도 추정치의 변동률(%)을 통해서는 정량적 평가를 시행하였다. 이때 방사능농도 추정치(cps/ml)와 실제 방사능농도(Bq/ml)의 관계는 회복계수(RC_Recovery Coefficients)를 지표로 비교·분석하였다. 투영상수 변화에 따른 결과[CNR 변동률(%), 방사능농도 추정치 변동률(%), RC]는 총 획득시간 증감률(%) -90%에서 [-89.5%, +3.90%, 1.04], -75%에서 [-77.9%, +2.71%, 1.03], -50%에서 [-55.6%, +1.85%, 1.02], -25%에서 [-33.6%, +1.37%, 1.01], +50%에서 [+33.7%, +0.71%, 1.01], +100%에서 [+93.2%, +0.32%, 1.00]이었으며, 투영상당 획득시간 변화에 따른 결과는 총 획득시간 증감률(%)-90%에서 [-89.3%, -3.55%, 0.96], -75%에서 [-73.4%, -0.17%, 1.00], -50%에서 [-49.6%, -0.34%, 1.00], -25%에서 [-24.9%, 0.03%, 1.00], +50%에서 [+49.3%, -0.04%, 1.00], +100%에서 [+99.0%, +0.11%, 1.00]이었다. SPECT/CT에서 총 획득시간의 증·감에 따라 획득된 총 계수와 그에 따른 영상품질(CNR)은 비례하여 변화하는 양상을 보였지만, 절대 정량화를 통한 정량적 평가에서는 모든 실험조건에서 5% 미만(-3.55에서 +3.90%)의 변화를 보여 큰 영향을 받지 않고 정량적 정확성(RC 0.96에서 1.04)을 유지하였다. 검사시간의 증가보다는 단축을 우선하여 고려하였을 때 총 획득시간 감소는 정성적 기능에 있어서 기존에도 배제할 수 없었던 사항이지만 정량적 기능은 큰 손실 없이 적용 가능하여 임상적으로 실효성이 있다고 판단된다. 다만 총 획득시간의 증·감 시 동일한 검사시간이라면 투영상수의 변경보다는 투영상당 획득시간의 변경이 정성적, 정량적으로 조건변화에 따른 변동 폭이 적은 것으로 나타났다.

SPECT/CT 영상에서 에너지창 기반 산란보정과 CT 기반 산란보정 방법의 정량적 정확성 비교

김지현,손현수,이주영,박훈희,Kim, Ji-Hyeon,Son, Hyeon-Soo,Lee, Juyoung,Park, Hoon-Hee 대한핵의학기술학회 2015 핵의학 기술 Vol.19 No.2

SPECT영상에서 산란계수는 정량적 계수오차와 영상품질 저하의 요인이다. 이에 다양한 산란보정(Scatter Correction, SC)방법이 연구되어 왔으며, 본 연구에서는 기존의 에너지창(Energy Window, EW) 기반 SC(EWSC)와의 비교로 SPECT/CT에서 사용되는 CT 기반 SC(CTSC)의 정확성을 평가하고자 한다. 중앙에 열소막대(hot rod, 74.0 MBq)를 설정한 Triple line insert 팬텀의 내부에 산란계수의 영향이 없는 기준영상의 획득을 위하여 공기를 채운 후 SPECT /CT영상을 획득하였고, 같은 조건에서 산란계수의 영향을 유도하기 위하여 공기대신 물을 채운 후 SPECT/CT영상을 각각 별도로 획득하였다. 두 조건 모두 Astonish(iterative : 4, subset : 16) 재구성 방법과 CT감쇠보정을 공통 적용하였고, 물을 채운 영상에 비산란보정(NSC), EWSC, CTSC 3가지 유형의 산란보정방법을 사용하였다. EWSC를 위하여 주(=peak) 에너지창(140 keV, 20%) 이외에 보조 에너지창 9개를 추가 설정한 후 영상을 동시 획득하였고, EWSC의 종류는 DPW(dual photopeak window) 10%, DEW (dual energy window)20%, TEW(triple energy window)10%, TEW5.0%, TEW2.5% 5가지를 사용하였다. 일차(primary)계수의 변동이 없는 조건하에, 두 조건의 영상에 VOI를 그려 총계수를 측정한 후 총계수 중 산란계수의 비를 %SF(percent scatter fraction)로 구하고, 공기를 채운 영상을 기준으로 물을 채운 영상과의 계수차이를 %NMSE (per cent normalized mean-square error)로 평가하였다. 공기를 채운 영상을 기준으로 각 산란보정방법이 적용된 물을 채운 영상의 %SF는 NSC 37.44, DPW 27.41, DEW 21.84, TEW10% 19.60, TEW5% 17.02, TEW2.5% 14.68, CTSC 5.57로 CTSC에서 제거된 산란계수가 가장 많았으며, %NMSE는 NSC 35.80, DPW 14.28, DEW 7.81, TEW10% 5.94, TEW5% 4.21, TEW2.5% 2.96, CTSC 0.35로 CTSC에서 가장 낮게 나타났다. SPECT/CT영상에서 실험에 사용된 각 산란보정 방법의 적용은 산란계수의 영향으로 발생된 정량적 계수오차를 개선시킬 수 있었다. 특히, CTSC의 경우 기존의 EWSC방법들과 비교하여 가장 낮은 %NMSE (=0.35)를 보여 비교적 정확한 산란보정이 가능하였다. Purpose In SPECT image, scatter count is the cause of quantitative count error and image quality degradation. Thus, a wide range of scatter correction(SC) methods have been studied and this study is to evaluate the accuracy of CT based SC(CTSC) used in SPECT/CT as the comparison with existing energy window based SC(EWSC). Materials and Methods SPECT/CT images were obtained after filling air in order to acquire a reference image without the influence of scatter count inside the Triple line insert phantom setting hot rod(74.0 MBq) in the middle and each SPECT/CT image was obtained each separately after filling water instead of air in order to derive the influence of scatter count under the same conditions. In both conditions, Astonish(iterative : 4 subset : 16) reconstruction method and CT attenuation correction were commonly applied and three types of SC methods such as non-scatter correction(NSC), EWSC, CTSC were used in images filled with image. For EWSC, 9 sub-energy windows were set additionally in addition to main(=peak) energy window(140 keV, 20%) and then, images were acquired at the same time and five types of EWSC including DPW(dual photo-peak window)10%, DEW(dual energy window)20%, TEW(triple energy window)10%, TEW5.0%, TEW2.5% were used. Under the condition without fluctuations in primary count, total count was measured by drawing volume of interest (VOI) in the images of the two conditions and then, the ratio of scatter count of total counts was calculated as percent scatter fraction(%SF) and the count error with image filled with water was evaluated with percent normalized mean-square error(%NMSE) based on the image filled with air. Results Based on the image filled with air, %SF of images filled with water to which each SC method was applied is NSC 37.44, DPW 27.41, DEW 21.84, TEW10% 19.60, TEW5% 17.02, TEW2.5% 14.68, CTSC 5.57 and the most scattering counts were removed in CTSC and %NMSE is NSC 35.80, DPW 14.28, DEW 7.81, TEW10% 5.94, TEW5% 4.21, TEW2.5% 2.96, CTSC 0.35 and the error in CTSC was found to be the lowest. Conclusion In SPECT/CT images, the application of each scatter correction method used in the experiment could improve the quantitative count error caused by the influence of scatter count. In particular, CTSC showed the lowest %NMSE(=0.35) compared to existing EWSC methods, enabling relatively accurate scatter correction.

해외시장동향 - 독일 주류시장 동향

김지현,Kim, Ji-Hyeon 한국주류산업협회 2015 주류산업 Vol.35 No.2