Identification of Clinical Mold Isolates by Sequence Analysis of the Internal Transcribed Spacer Region, Ribosomal Large-Subunit D1/D2, and β-Tubulin

장자현,이장호,기창석,이남용 대한진단검사의학회 2012 Annals of Laboratory Medicine Vol.32 No.2

Background: The identification of molds in clinical laboratories is largely on the basis of phenotypic criteria, the classification of which can be subjective. Recently, molecular methods have been introduced for identification of pathogenic molds in clinical settings. Here, we employed comparative sequence analysis to identify molds. Methods: A total of 47 clinical mold isolates were used in this study, including Aspergillus and Trichophyton. All isolates were identified by phenotypic properties, such as growth rate, colony morphology, and reproductive structures. PCR and direct sequencing, targeting the internal transcribed spacer (ITS) region, the D1/D2 region of the 28S subunit, and the ß-tubulin gene, were performed using primers described previously. Comparative sequence analysis by using the GenBank database was performed with the basic local alignment search tool (BLAST) algorithm. Results: For Aspergillus, 56% and 67% of the isolates were identified to the species level by using ITS and ß-tubulin analysis, respectively. Only D1/D2 analysis was useful for Trichophyton identification, with 100% of isolates being identified to the species level. Performances of ITS and D1/D2 analyses were comparable for species-level identification of molds other than Aspergillus and Trichophyton. In contrast, the efficacy of ß-tubulin analysis was limited to genus identification because of the paucity of database information for this gene. Conclusions: The molecular methods employed in this study were valuable for mold identification, although the different loci used had variable usefulness, according to mold genus. Thus, a tailored approach is recommended when selecting amplification targets for molecular identification of molds.

Blood Chimerism in a Dizygotic Dichorionic Pregnancy

장자현,정혜영,김종화,박원순,김선희 대한진단검사의학회 2010 Annals of Laboratory Medicine Vol.30 No.5

Blood chimerism in twins is known to occur through the transfer of hematopoietic stem cells between the fetuses via a common placenta. We present a case of blood chimerism in a dizygotic dichorionic twin pregnancy. The female twin was delivered at 34 weeks of gestation, and the male twin was stillborn. Pathologic examination confirmed dichorionic diamniotic placentas. The karyotype of the female child was obtained using peripheral blood sample, and it revealed a mixture of 46,XX and 46,XY cells (chi 46,XY[13]/46,XX[7]). FISH analysis performed on the buccal cells by using CEP X/Y probe (Abbott Molecular Inc., USA) revealed 100% XX signals (nuc ish Xcen(DXZ1x2)[500]). Gross examination of the external genitalia and abdominal ultrasonography revealed no definitive abnormal findings in relation to sex differentiation. When XX/XY chimerism is present in blood lymphocytes,careful examination of external genitalia and reproductive organs and further studies are required to detect chimerism in non-hematopoetic tissues. This is a rare case of blood chimerism in dichorionic placentas, in contrast to those in monochorionic placentas. (Korean J Lab Med 2010;30:521-4)

P-29 : RV 6/12종과 RV 16종의 양성률 비교

진호현,박용원,장자현,조은해 대한임상병리사협회 2012 임상미생물검사학회 발표자료집 Vol.2012 No.-

배경: 바이러스는 현재까지 알려진 것 중에 가장 작은 생명체이며, 그 종만 나누더라도 수백~수천 개로 분리가 되는데, 우리나라에서 발견되는 호흡기 바이러스만 하더라도 해마다 늘어나고 있는 추세이다. 이를 검출하기 위한 검사방법 또한 다양하게 제시되고 있는데 그 중에서 현재 본원에서 검사하는 방법인 RV 6/12종과 RV 16종의 검출비교를 통해 검출 한계를 평가하고자 한다. 방법: 검체는 multiplex PCR 방법을 이용하는 호흡기 바이러스 6/12종 Seeplex® RV 6/12 ACEDetection 제품에서 양성으로 검출된 sample을 이용하여, TOCE™ 기술을 적용한 Anyplex™ II RV16 Detection과의 양성률 차이를 비교하였다. 결과: 호흡기 검체 76개 샘플에 대해서 AnyplexTMII RV 16 Detection와 Seeplex® RV 6/12 ACE Detection제품을 비교평가 한 결과 양성개수가 각각 56개, 35개로 AnyplexTMII RV 16 Detection이 높은 양성률을 보였고, AnyplexTMII RV 16 Detection에서는 21개 샘플에서 추가양성 검출결과를 보였다. 고찰: RV16에서의 전체적인 양성률 증가는 kit의 민감도의 향상에서 기인하는 것으로 생각된다. (RV12 100 copies/rxn vs RV16 10~50 copies/rxn) AnyplexTMII RV 16 Detection kit의 도입으로 인하여 바이러스 검출률의 향상 효과를 기대한다.

일반연제(포스터) : P-39 ; HBV DNA Real-time PCR 정량 검사의 낮은 정량값에 대한 Linearity & Precision 평가

진호현,박용원,장자현 대한임상병리사협회 2013 임상미생물검사학회 발표자료집 Vol.2013 No.-

배경: B형간염바이러스(hepatitis B virus, HBV)는 세계적인 공중보건학적 문제로 약 20억 인구가 감염되어 있으며, 감염된 환자 중 약 3억 5천만 명에서 만성 B형간염, 간경변증, 간세포암 등진행성 간질환을 앓고 있다. 이에 많은 검사실에서 HBV 정량에 대한 검사를 하고 있으며, 다양한 방법이 제시되고 있다. 그 중 가장 최근에 나온 정량검사법으로 HBV DNA Real-time PCR 정량 검사가 있으며 측정범위가 넓어서 정확한 바이러스 수치 검사가 가능하다. 본 연구에서는 낮은 정량값에 대해 계대희석 후 계산하였을 때 linearity와 precision이 검증되는지 평가 해보았다. 방법: 장비는 Roche COBAS Ampliprep/Taqman, 시약은 HBV Test, v.2.0을 사용하였다. 실험은 2가지의 방법으로 진행하였다. 첫 번째 방법은 예상 농도가 50~60 IU/mL이 될 수 있는 검체 8개를 선별하여 pooling한 후, 세 번 계대 희석하였다. 각 농도당 5번 반복검사를 수행하여 linearity와 precision을 검증하였다. 두 번째 방법은 농도가 10 IU/mL~20 IU/mL, 20 IU/mL~30 IU/mL이 되도록 pooling 후, 1/2로 희석하여 5번 반복 검사를 수행하여 신뢰성을 검증하였다. 결과: Linearity 결과는 5번 반복한 값의 평균값과 pooling한 검체의 origin 값 (56.2 IU/mL)을 초기 농도로 한 예측 값을 비교하여 R 2 = 0.9824을 얻었다. Precision은 농도 당 5번 반복한 값의CV (%)와 SD in log 값으로 산출하였다. 고찰: 저농도 검체로 HBV DNA Real-time PCR 정량 검사를 수행하여 R 2이 1에 가까운 linearity를 보이는 것을 검증하였다. Precision은 CV값이 평균 23%, SD in log 값이 평균 0.10 data을 얻었다. 그러나 저농도 검체 1/2 희석 검사 시 신뢰성 검증은 CV값이 23.3%, SD in log 값이 0.10data을 얻었으나, ≒ 20 IU/mL 대의 결과는 pooling 후 희석 단계에서 충분히 mixing 되지 않은 것으로 추정되어 CV와 SD in log 값이 소폭 증가되는 것을 보였다. 이는 저농도 희석 후에도 정량 값을 얻는다는 것이기는 하나, 이를 토대로 실제 검사실에서는 더 많은 검사를 진행하여 보다 정확한 기준을 만드는 것이 추천된다.

포스터(유전) 7 : FISH PML/RARA positive 통계 및 variant translocation case보고

강유선,장자현 대한임상병리사협회 2014 임상혈액검사학회 발표자료집 Vol.16 No.1

포스터(유전) 27 : 말초혈액 염색체 검사 상 Tetrasomy 12p mosaicism이 관찰되어 FISH법으로 확인된 1예

강유선,장자현 대한임상병리사협회 2014 임상혈액검사학회 발표자료집 Vol.16 No.1

Positional Hemiseesaw Nystagmus in Ataxia with Oculomotor Apraxia Type 2 due to a Novel Senataxin Gene Mutation: A New Phenotype

김성희,장자현,김지수 대한평형의학회 2020 Research in Vestibular Science Vol.19 No.1

Ataxia with ocular motor apraxia type 2 (AOA2) is an autosomal recessive disorder that is characterized by adolescent-onset gait ataxia, peripheral neuropathy, ocular apraxia, and cerebellar atrophy. A 19-year-old male with AOA2 from a novel SETX mutation showed distinct oculomotor abnormalities that included spontaneous and gaze-induced downbeat nystagmus, impaired smooth pursuit, and reversed catch-up saccades during horizontal head impulse tests, as well as peripheral neuropathy involving the lower extremities and mild slowing of frontal processing. He also showed positional hemiseesaw nystagmus in the supine and straight head-hanging positions. Positional hemiseesaw nystagmus is a new manifestation of hereditary cerebellar ataxia and may be explained by a gravity-dependent position-induced error in estimating the tilt in the roll plane due to dysfunction of the tilt-estimator circuit.

JAK2 V617F and MPL W515L/K Mutations in Korean Patients with Essential Thrombocythemia

김희정,장자현,유은형,김희진,기창석,김종원,김선희 대한진단검사의학회 2010 Annals of Laboratory Medicine Vol.30 No.5

JAK2 V617F and MPL W515L/K mutations have been reported in approximately 50% and 5% of the patients with essential thrombocythemia (ET), respectively. We investigated the frequency of MPL W515L/K mutations in a series of consecutive patients with ET and post-essential thrombocythemia myelofibrosis (post-ET MF). The study subjects were 63 patients diagnosed either with ET (N=59) or post-ET MF (N=4) at our institution between June 2006 and February 2010. Among them, 35 (55.6%) had the JAK2 V617F mutation. MPL W515L/K mutations were detected by direct sequencing analyses of exon 10, and 2 patients were found to harbor the following MPL mutations: W515L in 1 patient with ET and W515K in 1 patient with post-ET MF. Neither of the patients had the JAK2 V617F mutation. The frequencies of the MPL W515L/K and JAK2 V617F-negative mutations in our subjects with ET/post-ET MF were 3.2% (2/63) and 7.1% (2/28), respectively. This is the first study to report the frequency of JAK2 V617F and MPL W515L/K mutations in Korean patients with ET/post-ET MF. (Korean J Lab Med 2010;30:474-6)

포스터(혈액) 12 : 사일열말라리아의 첫 사례보고

김은주,장자현 대한임상병리사협회 2013 임상혈액검사학회 발표자료집 Vol.15 No.1

Identification of Compound Heterozygous EYS Variants in a Korean Patient with Retinitis Pigmentosa

김형태,장자현,강경은,기창석,정혜원 대한진단검사의학회 2018 Laboratory Medicine Online Vol.8 No.2