Clostridium thermocellum 으로 부터 새로운 type Ⅱ 제한효소 Cth Ⅰ 분리

최강덕(K . D . Choi),김기태(Kitae Kim),유욱준(Ook Joon Yoo) 한국미생물생명공학회 1987 한국미생물·생명공학회지 Vol.15 No.5

한국 재래닭의 경제형질 개량을 위한 apoVLDL-Ⅱ 유전자의 유전자형 분석

정기철(K. C. Jung),이유주(Y. J. Lee),M. S. A. Bhuiyan,장병귀(B. K. Jang),최강덕(K. D. Choi),이준헌(J. H. Lee) 한국가금학회 2009 韓國家禽學會誌 Vol.35 No.4

한국 재래닭의 경제형질 개량을 위한 apoVLDL-II 유전자의 유전자형 분석

정기철,이유주,장병귀,최강덕,이준헌,Jung, K.C.,Lee, Y.J.,Bhuiyan, M.S.A.,Jang, B.K.,Choi, K.D.,Lee, J.H. 한국가금학회 2009 韓國家禽學會誌 Vol.35 No.4

The very low density apolipoprotein-II (apoVLDL-II) gene is closely related with the constitution of the lipoprotein in various tissues. The apoVLDL-II gene have main functions for reducing fat elements from tissues and muscles. Previous results indicated that the polymorphisms in apoVLDL-II gene were positively related with growth and body composition traits in chicken. In this study, we analyzed previously identified apoVLDL-II gene polymorphisms using the PCR-RFLP method and investigated allele and genotype frequencies in three chicken breeds. Data indicated that Korean native chicken and Korean Oge chicken have similar B and F gene frequencies, indicating that this marker can be used for the improvement of growth and body composition traits in those breeds and can be used as marker assisted selection with further verifications. 초저밀도 아포지단백(Very Low Density Apolipoprotein-II)은 조직의 지방단백질 분비 조성과 밀접한 관련이 있다고 알려진 유전자로서 최근 닭에서 성장 및 체구성과 매우 높은 연관이 있다고 알려져 있다. 본 연구는 닭의 3품종에서 PCR-RFLP 방법을 통해 apoVLDL-II 유전자의 유전자형을 분석하고 Broiler 형(B)과 Fayoumi 형(F)을 결정하였다. 각 품종간 유전자형 빈도는 한국 재래계에서 BB가 0.37, BF가 0.43, FF가 0.2로 검출되었고, 오계에서 BB가 0.2, BF가 0.6, FF가 0.2로 검출되었으며, 백색레그혼에서 BB가 0.16, BF가 0.84로 검출되었다. Broiler 형은 성장이나 체구성을 높이는 방향으로 작용한다는 기존의 보고를 바탕으로 본 연구에서 나타난 집단내 다양한 유전자형 분포는 재검증 작업을 거쳐 육종에 의해 이 형질들을 개량할 수 있음을 의미한다.

황갈색 재래닭의 간에서 성장 단계별 차등 발현 유전자 분석

이경연,유성란,정기철,장병귀,최강덕,이준헌,Lee, K.Y.,Yu, S.L.,Jung, K.C.,Jang, B.K.,Choi, K.D.,Lee, J.H. 한국가금학회 2007 韓國家禽學會誌 Vol.34 No.2

한국 재래닭에서 성장에 따른 유전자들의 발현 변화를 알아보고 성장 촉진, 대사 및 면역 관련 유전자를 발굴하기 위하여 주령별로 닭의 간에서 RNA를 추출하였으며 10개의 arbitrary ACPs를 이용하여 차등 발현되는 유전자를 조사하였다. 발현량에 현저한 차이를 보이는 5개의 유전자들이 선별되었으며, 이 중 3개의 유전자들은 BLAST search 결과 이미 기능이 알려진 FTH1, SAA와 HSP90B1으로 밝혀졌다. 그러나 2개의 유전자들은 닭의 genome sequence가 끝났음에도 불구하고 기능이 밝혀져 있지 않아 앞으로 이 유전자들의 기능에 대한 연구가 지속되어야 함을 의미한다. 본 연구에서 닭의 간에서 성장 단계별로 발현 차이를 보이는 유전자들은 앞으로 다른 유전자와 단백질들과의 관계를 통하여 닭의 성장 및 지방 대사를 이해하는데 도움을 줄 것으로 사료된다. The chicken liver has been involved in various biological functions including detoxification, glycogen storage and plasma protein synthesis. The aim of this study was to investigate differentially expressed genes in chicken liver in four different growing stages. Using 10 arbitrary Annealing Control Primers (ACPs), five differentially expressed genes have been identified. Based on the Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) search results, three of them were matched with previously known genes, and the other two were matched with unknown EST sequence and a hypothetical protein, respectively. In order to confirm the expression results, quantitative real-time PCR was also performed. The high similarities between the expression data using arbitrary ACPs and quantitative real-time PCR indicate that the identified genes are the real differentially expressed genes in different growing stages. The genes identified in this study can be used as valuable biomarkers in chicken with further investigation of the functions.

Identification of SNPs in Highly Variable Lysozyme Gene in Korean Native Chicken Populations

라세둘,강보석,임희경,최강덕,이준헌,Hoque, M.R.,Kang, B.S.,Lim, H.K.,Choi, K.D.,Lee, J.H. Institute of Agricultural Science 2010 Korean Journal of Agricultural Science Vol.37 No.3

닭의 진화를 이해하기 위하여 변이가 많다고 알려진 LYZ 유전자의 엑손과 인트론에 존재하는 단일염기다형이 본 연구를 통해 확인되었다. 2개의 한국 재래실용계에서 총 24개체의 DNA 샘플이 본 연구에서 이용되었으며 단일염기 다형의 확인을 위하여 3개체의 샘플을 혼합하여 염기서열 분석을 실시하였다. 적색야계와의 비교를 통하여 두 한국 재래실용계는 18개의 염기서열변이를 확인할 수 있었으며 한국 재래실용계 간에는 15개의 염기서열 변이를 확인할 수 있었다. 총 33개의 변이 중 두 개의 삽입변이(21 bp와 4 bp)가 확인되었다. 한편, 2번째 엑손의 1426 bp 위치에 존재하는 단일염기 다형(p.Ala49Val)은 아미노산의 변이를 나타내는 미스센스 돌연변이로 확인되었다. 이 돌연변이는 이 lysozyme 효소의 촉매작용을 하는 위치에 놓여 있어 효소의 활성과 밀접한 관계가 있을 것으로 추정된다. 본 연구에서 밝혀진 LYZ 유전자의 변이는 이 유전자의 기능뿐 아니라 한국 재래실용계 집단의 구조를 이해하는데 기초자료로 이용될 것으로 사료된다. Single nucleotide polymorphisms (SNPs) in chicken lysozyme (LYZ) gene were investigated in this study. The identification of SNPs in both exon and intron in LYZ gene has led to understanding of evolution for the domestic chicken populations. A total of 24 samples from two Korean native commercial chicken populations (CCPs) were used for the initial identification of SNPs by mixing three DNA samples for sequencing experiments. By comparing with red jungle fowl (RJF), two commercial chicken populations have 18 common polymorphisms. Between two commercial chicken populations, 15 polymorphisms were identified. Of the 33 polymorphisms identified, two indels (21 and 4 bp) were found. Whereas, only one polymorphism in exon 2 at the bp position 1426 was a non-synonymous substitution (p.Ala49Val), indicating the amino acid changes. The identified non-synonymous substitution (p.Ala49Val) is located close to the catalytic sites of the enzyme, which might affect its activity. In our investigation, the polymorphisms in LYZ gene can provide broad ideas for the variation of Korean native chicken populations from the ancestor of chicken breeds as well as the some biological functions of the LYZ gene.

DNA 지문을 이용한 한국오골계의 유전 분석

이성진(S . J . Lee),황규춘(K . C . Hwang),최강덕(K . D . Choi),이학교(H . K . Lee),신영수(Y . S . Shin),한재용(J . Y . Han) 한국축산학회 1995 한국축산학회지 Vol.37 No.3

This study was performed to analyze genetic characteristics of Korean Native Ogol Chickens compared with various breeds of chickens including Korean Native Yellow Chickens, White Leghorns and Rhode Island Reds. For DIVA fingerprinting, we collected blood samples from each of 10 individuals per breeds and obtained the genomic DNA. The genomic DNA samples were digested with restriction enzymes(Hinf I, Hcre III. etc.) and hybridized with various probes(Jeffreys` probes 33.15, 33.6, and M13) after Southern transfer. Probe 33.1 gave only a few unresolvable bands, however, probe 33.6 and M l3 detected a large number of bands and was thought to be the desirable probes for the analysis of genetic characteristics for various breeds of chickens. The use of pooled DNA enabled us to significantly reduce the number of DNA samples for estimation of genetic relationships among breeds. Furthermore, the results of DFP prepared from pooled DNA were similar to those of DFP prepared from individual DNA. In this analysis, KNOC was estimated to be a highly inbred line (band sharing $gt; 0.69), and to be closest in genetic distance to KNYC than any other bred.

추백리가 감염된 닭의 간에서 발현이 증가하는 APOA1 단백질의 확인

정기철,이유주,유성란,이준헌,장병귀,구용범,소현경,최강덕,Jung K. C.,Lee Y. J.,Yu S. L.,Lee J. H.,Jang B. K.,Koo Y. B.,So H. K.,Choi K. D. 한국가금학회 2005 韓國家禽學會誌 Vol.32 No.1

가금 추백리와 밀접한 관계가 있는 단백질을 동정하기 위하여 인위적으로 추백리를 유도한 개체와 정상인 개체의 간에서 단백질을 추출하였으며, 2차원 전기영동(2DE)과 mass spectrometry(MS)를 이용하여 차등 발현되는 단백질을 조사하였다. 총 300여개의 단백질 spot들이 관찰되었으며, 이중 발현양에 현저한 차이를 보이는 spot을 MALDI-TOF MS와 protein database search를 통해 분석한 결과, 가금 APOAI (Apolipoprotein A1)으로 확인되었다. 추백리가 감염된 닭의 간에서 APOA1 단백질의 증가는 손상된 혈관의 재생과 밀접한 관계가 있으며 추백리의 감염 여부를 나타내 주는 Bio-marker로서 활용될 수 있을 것으로 사료된다. The aim of this study was to investigate differentially expressed proteins between normal chicken liver and chicken liver inffeted by Salmonella pullorum. 2-dimensional electrophoresis (2DE) and mass spectrometry (MS) were used to identify the proteins. More than 300 protein spots were detected on silver stained 2DE gels using pH 3$\~$10 gradients. The most outstanding protein spot was further analyzed by MALDI-TOF MS and protein database using the Mascot search engine. The protein was finally identified as APOAI (Apolipoprotein AI). Based on the known function of the APOAI, this gene acts protective action against the accumulation of platelet thrombin at the site of vascular damage for the pullorum disease. Therefore APOAI protein, identified in this study, can be a valuable biomarker in relation to the pullorum disease in chicken.

배반엽성세포를 이용한 카이메라 닭 ( 화이트레그혼 ↔ 오골계 ) 생산

서동삼(D . S . Seo),홍영호(Y . H . Hong),최강덕(K . D . Choi),양무희(M . H . Yang),신영수(Y . S . Shin),한재용(J . Y . Han) 한국축산학회 1995 한국축산학회지 Vol.37 No.1

The chicken embryo contains 30,000 to 60,000 cells at development stage X, the blastodermal cells at this stage are believed to he pluripotent and subsequently contribute to melanocytes derived from the neural crest, to erythrocytes and to germ cells. In this study, blastodermal cells were isolated from stage X embryos of Korean Native Ogol Chicken (KNOC). The isolated blastodemial cells were transfected with liposome and dispersed by pipetting. A 2㎕ volume of cell suspension was microinjected into the subgerminal cavity of recipient embryos at an equivalent stage of development of the donor and recipient. Of the 332 White Leghorn embryos that were injected with KNOC blastodermal cells, three unhitched embryos were phenotypically chimeric with respect to feather color and one embryo hatched. This technique may be useful in development of a transgenic chicken production system.

겨우살이의 급여가 육계의 생산성 및 혈액 특성에 미치는 영향

김지혁,김동욱,강근호,장병귀,유동조,나재천,김상호,이덕수,서옥석,최강덕,김성권,이규호,Kim, J.H.,Kim, D.W.,Kang, K.H.,Jang, B.G.,Yu, D.J.,Na, J.C.,Kim, S.H.,Lee, D.S.,Suh, O.S.,Choi, K.D.,Kim, S.K.,Lee, K.H. 한국가금학회 2007 韓國家禽學會誌 Vol.34 No.2

본 연구는 한국산 참나무 겨우살이를 육계에 급여하였을 때 생산성 및 혈액 특성에 미치는 영향을 구명하기 위해 실시하였다. 1일령 Ross 수평아리를 4처리 4반복, 반복당 30수씩 총 480수를 공시하였고, 실험 설계는 무항생제 사료, 항생제 첨가 사료, 겨우살이 0.5% 및 1.0% 처리구로 나누어 총 49일간 사육하였다. 실험 전 기간 처리구간에 사료 섭취량과 일당 증체량에 있어서는 유의차가 없었다. 실험 종료시 공장의 길이에 있어서 겨우살이 1.0% 처리구가 다른 처리구에 비해 증가하는 경향이나 유의하게 증가하였다(P<0.05). 실험 35일째, 맹장내 살모넬라 균수는 겨우살이를 급여함으로써 유의하게 감소하였다(P<0.05). 겨우살이 처리구에서는 대조구(+)에 비해 림프구와 단핵구의 수가 증가하는 경향 또는 유의하게 증가하였다(P<0.05). 따라서, 겨우살이의 사료 내 첨가급여는 육계에서 생산성 및 혈액 성상에 아무런 부정적인 영향을 미치지 않아 항생제 대체 물질로서의 이용 가능성이 있을 것으로 사료된다. The objectives of this study were to examine the effects of Korean mistletoe (KM) on performance and blood characteristics in broiler chickens. A total of four hundred eighty, 1-d-old male broiler chicks (Ross) were divided into 4 groups with 4 replicates of 30 birds each. The treatments were NC (antibiotics-free diet), PC (NC diet added antibiotics), 0.5% KM (NC diet added 0.5% of KM) and 1.0% KM (NC diet added 1.0% of KM), and the birds were raised for 49 days. There were no significant differences in feed intake and body weight gain among treatments. On d 49, the relative length of jejunum in 1.0% KM tended to be increased or significantly (P<0.05) increased compare to those of other groups. On d 35, the colony forming unit of Salmonella spp. of ceca significantly (P<0.05) decreased by feeding KM. The counts of lymphocyte of KM significantly (P<0.05) increased compare to those of the PC.

Identification of SNPs in Highly Variable Lysozyme Gene in Korean Native Chicken Populations

M. R. Hoque(라세둘),B. S. Kang(강보석),H. K. Lim(임희경),K. D. Choi(최강덕),J. H. Lee(이준헌) 충남대학교 농업과학연구소 2010 농업과학연구 Vol.37 No.3

닭의 진화를 이해하기 위하여 변이가 많다고 알려진 LYZ 유전자의 엑손과 인트론에 존재하는 단일염기다형이 본 연구를 통해 확인되었다. 2개의 한국 재래실용계에서 총 24개체의 DNA 샘플이 본 연구에서 이용되었으며 단일염기 다형의 확인을 위하여 3개체의 샘플을 혼합하여 염기서열분석을 실시하였다. 적색야계와의 비교를 통하여 두 한국재래실용계는 18개의 염기서열변이를 확인할 수 있었으며 한국 재래실용계 간에는 15개의 염기서열 변이를 확인할 수 있었다. 총 33개의 변이 중 두 개의 삽입변이(21 bp와 4 bp)가 확인되었다. 한편, 2번째 엑손의 1426 bp 위치에 존재하는 단일염기 다형(p.Ala49Val)은 아미노산의 변이를 나타내는 미스센스 돌연변이로 확인되었다. 이 돌연변이는 이 lysozyme 효소의 촉매작용을 하는 위치에 놓여 있어 효소의 활성과 밀접한 관계가 있을 것으로 추정된다. 본 연구에서 밝혀진 LYZ 유전자의 변이는 이 유전자의 기능뿐 아니라 한국 재래실용계 집단의 구조를 이해하는데 기초자료로 이용될 것으로 사료된다. Single nucleotide polymorphisms (SNPs) in chicken lysozyme (LYZ) gene were investigated in this study. The identification of SNPs in both exon and intron in LYZ gene has led to understanding of evolution for the domestic chicken populations. A total of 24 samples from two Korean native commercial chicken populations (CCPs) were used for the initial identification of SNPs by mixing three DNA samples for sequencing experiments. By comparing with red jungle fowl (RJF), two commercial chicken populations have 18 common polymorphisms. Between two commercial chicken populations, 15 polymorphisms were identified. Of the 33 polymorphisms identified, two indels (21 and 4 bp) were found. Whereas, only one polymorphism in exon 2 at the bp position 1426 was a non-synonymous substitution (p.Ala49Val), indicating the amino acid changes. The identified non-synonymous substitution (p.Ala49Val) is located close to the catalytic sites of the enzyme, which might affect its activity. In our investigation, the polymorphisms in LYZ gene can provide broad ideas for the variation of Korean native chicken populations from the ancestor of chicken breeds as well as the some biological functions of the LYZ gene.