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- 저자 : 조화자 ( Wha Ja Cho ) (검색결과 6 건)
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이지연 ( Ji Yeon Lee ),조화자 ( Wha Ja Cho ),홍기성 ( Ki Sung Hong ),김계성 ( Kye Seong Kim ) 한국조직공학과 재생의학회 2004 조직공학과 재생의학 Vol.1 No.2
MicroRNAs (miRNAs) are family of small, non-coding RNAs that regulate gene expression in a sequence-specific manner. The two founding members of the miRNA family were originally identified in Caenorhbditis elegansas genes that were required for the timed regulation of developmental events. Since then, hundreds of miRNAs have been identified in almost all metazoan genomes, including worms, flies, plants and mammals. We identified expression of the miR-129b, miR-201, and miR-202 in various mouse tissues and development testis by Northern blot analysis. These three miRNAs have been registered in miRNA resistry as a testis specific miRNAs, however, only miR-129b was expressed in 2 weeks old mouse testis and also in spleen. miR-201 and miR-202 could not detected in not only testis but also other tissues.
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한국에서 분리된 전염성 조혈괴저바이러스의 N 단백질의 유전자 클로닝과 염기서열 분석
문창훈,김현주,박정민,조화자,차승주,윤원준,박정재,이은희,강호성,김한도,박정우,Mun, Chang-Hoon,Kim, Hyun-Ju,Park, Jeong-Min,Cho, Wha-Ja,Cha, Seung-Ju,Yoon, Won-Joon,Park, Jeong-Jae,Lee, Eun-Hee,Kang, Hoe-Sung,Kim, Han-Do,Park, Jeong-Wo 한국미생물학회 1998 미생물학회지 Vol.34 No.1
한국에서 분리된 전염성 조혈괴저바이러스(infectious hematopoietic necrosis virus, IHNV)인 IHNV-PRT의 nucleocapsid(N)를 암호화하고 있는 cDNA를 클로닝하여 분석하였다. N 유전자는 391개의 아미노산으로 구성된 42.3 kDa의 분자량을 가진 단백질을 암호화하는 1,176 bp 크기의 open reading frame을 가지고 있었다. N 단백질의 아미노산 서열을 다른 외국에서 분리한 IHNV들의 N과 비교한 결과 75-90% 정도의 유사성을 보였으나 다른 종의 fish rhabdovirus인 hirame rhabdovirus(HRV) 및 viral hemorrhagic septicemia virus(VHSV)와는 각각 43%와 38%의 유사성을 보였다. 그러나 아미노산 서열 214-265의 52개의 아미노산들은 모든 종의 fish rhabdovirus간에 매우 높은 유사성을 보여 주었다. We have cloned and analyzed cDNA coding for nucleocapsid protein N from infectious hematopoietic necrosis virus(IHNV), IHNV-PRT, which was isolated in Korea. The N gene had open reading frame of 1,176 bp that encoded a 391 amino acids with a molecular weight of 42.3 kDa. The deduced amino acid sequence of N protein was 75-90% identical to those of foreign isolates, IHNV, but was 43% and 38% identical to those of other species of fish rhabdovirus, hirame rhabdovirus(HRV) and viral hemorrahagic septicemia virus(VHSV), respectively. However, it revealed high levels of sequence identity between 214-265 amino acid sequences among all species of fish rhabdovirus.
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한국에서 분리된 전염성 조혈괴저바이러스의 M 단백질의 유전자 클로닝과 염기서열 분석
박정민,김현주,문창훈,조화자,차승주,윤원준,박정재,이은희,박명애,손상규,박정우,Park, Jeong-Min,Kim, Hyun-Ju,Mun, Chang-Hoon,Cho, Wha-Ja,Cha, Seung-Ju,Yoon, Won-Joon,Park, Jeoug-Jae,Lee, Eun-Hee,Park, Myoung-Ae,Sohn, Sang-Gyu,Park, Jeon 한국미생물학회 1998 미생물학회지 Vol.34 No.1
한국에서 분리된 전염성 조혈괴저바이러스(infectious hematopoietic necrosis virus, IHNV)인 IHNV-PRT의 특성을 규명하기 위하여 IHNV-PRT의 matrix 단백질인 M1 및 M2를 암호화하고 있는 cDNA를 클로닝하여 이들의 염기서열을 분석하였다. M1은 693 bp 크기의 open reading frame을 포함하였으며 이로부터 230개의 아미노산으로 구성된 25.9 kDa의 분자량을 가진 단백질이 합성될 수 있다. M2는 588 bp 크기의 open reading frame을 지니고 있으며 195개의 아미노산으로 구성된 21.9 kDa의 분자량을 지닌 단백질이 합성될 수 있다. IHNV-PRT의 M1과 M2의 아미노산 서열을 외국에서 분리된 IHNV들과 비교 분석한 결과 M1은 92-93%, M2는 97%의 상동성을 보였다. 이러한 사실은 IHNV의 M 단백질 유전자들은 IHNV의 strain에 관계없이 매우 보존되어 있음을 나타내준다. In order to identify the characteristics of a Korean isol ate of infectious hematopoietic necrosis virus(IHNV), IHNV-PRT, we have cloned and analyzed cDNAs coding for matrix protein M1 and M2 of the IHNV-PRT. The Ml gene contained 693 bp open reading frame and encoded a protein of 230 amino acids with a molecular weight of 25.9 kDa. The M2 gene had 588 bp open reading frame, encoding a protein of 195 amino acids with a molecular weight of 21.9 kDa. On the deduced amino-acid sequences, M1 and M2 of the IHNV-PRT were found to be 92-93% (M1) and 97% (M2) identical to those of foreign isolates of IHNV. These results indicate that M genes of the IHNV are highly conserved among different strains of IHNV.
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Polymerase Chain Reaction ( PCR ) 을 이용한 Iridovirus 의 검색
김현주,박정민,도정완,차승주,조화자,문창훈,박정우,박명애,김수미,송상규,방종득 한국어병학회 1998 한국어병학회지 Vol.11 No.1
PCR을 사용하여 양식 해산어에 iridovirus 감염 여부를 신속히 진단하고자 하였다. 먼저 폐사를 유발하는 iridovirus의 genomic DNA를 pUC19 vector에 cloning한 후 이 clone들의 염기 서열을 GenBank의 염기 서열과 비교 분석하였다. 이들의 염기 서열을 기초로 하여 PCR primer를 제조한 후 PCR을 수행하였다. 정상적인 어류 세포에서는 DNA의 증폭이 일어나지 않았으나 iridovirus에 감염된 세포와 순수 분리된 iridovirus에서는 DNA의 증폭이 일어났다. 이로부터 짧은 시간 내에 폐사를 유발하는 iridovirus를 신속히 진단할 수 있음이 확인되었으며 이러한 PCR을 이용한 진단은 iridovirus의 감염을 확인할 수 있는 간단하고도 정확한 방법을 제공해준다. For rapid detection of iridovirus infection, a PCR-based diagnostic method was developed. The genomic DNA from mortality-associated iridovirus was cloned into pUC19 vector. The nucleotide sequences of these clones were compared with sequences of other genes from EMBL/GenBank databank. Based on the nucleotide sequences, PCR primers were prepared and used for PCR. The DNA amplification did not occur from the normal fish cells. In contrast, DNA was amplified from the iridovirus-infected fish cells and purified iridovirus. These results suggest that mortality-associated iridovirus can be detected from virus-infected cells within short time and this PCR-based diagnostic system provides a simple and accurate method for detecting the presence of iridovirus infection.
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한국 양식 넙치에성 분리된 Iridovirus 의 면역학적 특성 비교에 관한 연구
김현주,손상규,박정우,박정민,박명애,방종득,도정완,차승주,조화자,문창훈 한국어병학회 1998 한국어병학회지 Vol.11 No.1
우리 나라의 양식 해산어에서 분리된 종양을 유발하는 iridovirus가 폐사를 유발하는 iridovirus와 같은 종류인지를 확인하기 위하여 면역학적 특성을 비교하여 보았다. SDS-PAGE를 통하여 이들 바이러스의 구조단백질을 비교한 결과 종양을 유발하는 iridovirus와 폐사를 유발하는 iridovirus는 서로 다른 크기의 단백질을 소유하는 것으로 확인되었다. 종양을 유발하는 iridovirus에 대한 단일클론항체를 사용한 Western blotting실험을 통하여 구조 단백질의 항원성을 조사한 결과 종양을 유발하는 iridovirus 의 경우 분자량 150 kDa의 구조단백질이 면역 유도 특성이 있음이 확인되었다. 반면에 폐사를 유발하는 iridovirus는 종양을 유발하는 iridovirus에 대한 단일클론항체들과는 전혀 반응을 하지 않았다. 이 결과로부터 종양을 유발하는 iridovirus와 폐사를 유발하는 iridovirus의 구조단백질들은 서로 다른 항원성을 지님을 알 수 있었으며 이는 두 iridovirus들이 서로 다른 type일 가능성이 높음은 나타내고 있다. In order to determine whether the tumor-inducing iridoviruses and the mortality-associated iridoviruses from cultured marine fish in Korea belong to same type, we compared the immunological characteristics of these viruses. The electrophoretical pattern of structural proteins of the tumor-inducing was different from that of the mortality-associated iridoviruses. The antigenicity of structural proteins of these viruses were identified by Western blotting using two monoclonal antibodies against tumor-inducing iridovirus. Two monoclonal antibodies recognized a 150 kDa structural protein of tumor-inducing iridoviruses showed. However, the structural proteins of the mortality-associated iridoviruses did not react with these monoclonal antibodies. These results demonstrate that the antigenicity of the structural proteins of tumor-inducing iridovirus is different from that of mortality-associated iridovirus, indicating that these two iridoviruses belong to different types.
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