국내에서 육성한 6개 벼 품종의 휜잎마름병 저항성 유전자 분석

육진아,최춘환,강희경,최재을 한국작물학회 2004 한국작물학회 학술발표대회 논문집 Vol.2004 No.-

Genetic identification of Sinomenium acutum based on chloroplast gene ndhF sequences

육진아,이혜원,고병섭 대한본초학회 2013 大韓本草學會誌 Vol.28 No.5

Objectives : This study was conducted to identify the original Sinomini Caulis et Rhizoma plant among Stephania tetrandra, Cocculus trilobus, and Aristolochiae fangchi to develop the genetic marker for Sinomini Caulis et Rhizoma. Methods : Sinomenium acutum was identified by the classification and identification committee of the National Center for Standardization of Herbal Medicines. The chloroplast ndhF gene was amplified. We performed sequences alignment analysis of Sinomenium acutum, Stephania tetrandra, C. trilobus, and A. fangchi using BioEdit program. The SFR markers designed were consisted of SF01, SR04, and SR05 primers. Results : Many variations of Sinomeni Caulis et Rhizoma are currently commercialized as herbal medicine. We compared the base sequences of the ndhF intergenic space of chloroplast DNA with Sinomenium acutum, Stephania tetrandra, C. trilobus, and A. fangchi. According to the results, it showed that the nucleotide variations were seen in 30 genes of four species. Phylogenetic analysis revealed that 4 species were classified into five groups based on an inter-group divergence in nucleotide sequence of 9%. We developed SFR marker nucleotides enough to authenticate respective species and confirmed its application on the band size at 419 base pair. These sequence differences at corresponding positions were available genetic markers to identity the Sinomeni Caulis et Rhizoma. Conclusions : Base on these results, the ndhF region was effective in distinguishing Sinomini Caulis et Rhizoma The SFR genetic marker was useful for identifying Sinomini Caulis et Rhizoma with other species.

Monitoring and Identification of Cynanchum wilfordii and Cynanchum auriculatum by Using Molecular Markers and Real-Time Polymerase Chain Reaction

육진아,이혜원,주영승,고병섭 한국응용생명화학회 2014 Applied Biological Chemistry (Appl Biol Chem) Vol.57 No.2

Cynanchum wilfordii (Asclepiadaceae) is widelydistributed throughout Korea, Japan, and China. Dried roots ofthis plant have been used as a tonic to promote renal function. Dueto the morphological similarities of the dried roots of this plant tothose of Cynanchum auriculatum, which is used as a substituteherbal medicine for C. wilfordii, distinguishing these two speciesis extremely difficult. The present study was conducted to developmolecular markers to distinguish C. wilfordii and C. auriculatumby using conventional polymerase chain reaction (PCR) and realtimePCR analyses. Comparative analysis based on the sequenceof the trnL-trnF intergenic spacer revealed 4 base-pair variations,and the inter-individual sequences of the 2 species separatelyshowed 100% homology. According to these results, the variationswere divided into 2 groups. The 2 species were further distinguishedusing a sequence-characterized amplified region marker developedbased on a randomly amplified polymorphic DNA-PCR product,and then a single nucleotide polymorphism marker was designedbased on the trnL-trnF intergenic spacer for more efficientdetection in real-time PCR. The results showed that speciesspecificmolecular markers might allow accurate discrimination ofC. wilfordii and C. auriculatum.

우리나라 6개 벼 품종의 흰잎마름병 저항성 유전자 분석

육진아,최재을,강희경,최춘환 한국식물병리학회 2004 식물병연구 Vol.10 No.1

The gene analysis of resistance in rice cultivars, Daeanbyeo, Hwasunchalbyeo, Daejinbyeo, Naepungbyeo, Hwajinbyeo and Surabyeo to strains of Xanthomonas oryzae pv. oryzae was studied. F1 plants and F2 populations from the crosses between six cultivars and near isogenic lines carrying the single bacterial blight(BB) resistance gene were analyzed using Korean and Japanese BB races. Daeanbyeo, Hwasunchalbyeo, Daejinbyeo, Naepungbyeo, Hwajinbyeo and Surabyeo are alleic with IRBB101 but are non-alleic with IRBB104 and IRBB105. The allelic tests indicated that Daeanbyeo, Hwasunchalbyeo, Daejinbyeo, Naepungbyeo, Hwajinbyeo and Surabyeo have the Xa1 gene for resistance.

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육진아(육육) 한국여성민우회 2014 함께가는 여성 Vol.217 No.-

RAPD를 이용한 고려인삼 육성계통의 유전적 다양성 분석

김진희,육진아,차선경,김현호,성봉재,김선익,최재을 한국약용작물학회 2003 한국약용작물학회지 Vol.11 No.2

본 연구는 금산농업기술센터 인삼연구실에서 순계선발법으로 육성 중인 인삼 계통과 인삼연초연구원에서 육성한 품종을 RAPD 방법으로 계통 내의 변이와 육성계통의 순도를 검정하여 인삼의 순계선발법으로 활용하기 위한 기초자료를 얻기 위해 실시하여 얻은 결과를 요약하면 다음과 같다. 1. 10개 계통으로부터 각각 4~5개 개체를 임의로 수확한 49개체의 DNA를 48개의 primer를 사용하여 PCR한 결과 최소한 1개의 계통 내에서 RAPD다형성을 나타내는 4개의 primer OPA 19, OPM 11, URP 3 및 UBC 98을 선발하였다. 그중 Primer OPA 19, OPM 11 및 UBC 98은 각각 6계통, 7계통 및 1계통 내에서 개체간의 차이를 보이는 band가 증폭되었다. 2. 육성품종 천풍의 DNA를 OPA 19를 사용하여 증폭한 결과 약 1,800bp 크기의 band에서 개체간의 차이를 보였고, OPM 11을 사용하여 증폭한 경우에는 약 730bp 및 850bp 크기의 두 band에서 개체간의 차이를 나타냈으며, 육성품종 연풍은 OPM 11을 사용하여 증폭한 결과 약 730bp 크기의 band에서 개체간의 차이를 보였다. 3. 이와 같이 인삼육성계통내의 개체 간에 RAPD 다형성이 나타나는 이유는 영년작물인 인삼이 타가수정 되면 유전적으로 고정이 되는데 필요한 기간이 길어지기 때문이라고 설명할 수 있다. This experiment was conducted to evaluate the diversity and purity of the Korean ginseng (Panax gjnseng) lines developed by the pure line selection using RAPD markers. Four primer (OPA 19, OPM 11, URP 3 and UBC 98) out of the 48 primer tested produced band which showed within-line polymorphisms at least in one line. Within-line polymorphisms were detected in six lines by OPA 19, in four lines by URP 03, in five lines by OPM 11, and in one line by UBC 98 respectively. Five plants obtained from the commercial cultivar 'Cheonpung' were differentiated using the primers OPA 19 and OPM 11. Five plants obtained from the 'Yeonpung were differentiated using the primer OPM 11. Detection of within-line RAPD polymorphisms might be attributed to the fact that cross pollination appear in P. gjnseng and a long period of three to four years required to reach the reproductive stage thereby delay the process to homozygosity.

RAPD 방법을 이용한 국내 수집 인삼 (Panax ginseng C. A. Meyer)의 다양성 분석

서상덕,육진아,차선경,김현호,성봉재,김선익,최재을 韓國藥用作物學會 2003 한국약용작물학회지 Vol.11 No.5

본 연구는 고려인삼 재래종의 유전적 차이를 RAPD marker로 평가하였다. 재래종은 우리나라 주요 인삼재배 단지인 괴산, 금산, 남원, 포천, 양주, 연천, 영주로부터 수집한 인삼에서 10개체를 임의 선발하여 사용하였다. 9개 지역의 90개체를 대상으로 RAPD분석을 한 결과 48개의 primer 중 OPA 7, OPA 13, URP 2, URP 3, UBC 3의 5개 primer가 재현성이 있고 재래종 내 개체간에도 다형성인 band를 보였다. 재래종 집단간보다 재래종 내에서 유전적 다양성이 낮았다. 재래종 집단 간 또는 재래종 집단내의 유전적 차이가 있다는 것은 이 집단들이 헤테로라는 것을 의미한다. 이러한 결과는 우리나라에서 재배중인 고려 인삼은 유전 자원의 혼합으로 헤테로라는 것을 암시한다. 선발된 5개의 primer를 이용하여 90개체를 집괴분석한 결과 국내 재래종 인삼은 5개군으로 그리고 3개의 아군으로 구분되었다. 국내 재래종 인삼은 유전적 변이가 크므로 인삼 육종을 위한 재료로 이용될 수 있을 것이다. Genetic differences among nine land races of Korean ginseng (Panax ginseng C. A. Meyer) were examined using RAPD markers. Land races of Korean ginseng were collected from nine regions in Korea: Cheongwon, Guesan, Geumsan, Namwon, Pochun, Yangju, Yeoncheon, Yeongju. Out of 48 RAPD primers tested, 5 primers (OPA 7, OPA 13, URP 2, URP 3 and UBC 3) produced remarkable bands which showing polymorphisms among evaluated collections. Lower levels of genetic diversity were in detected same land races than among other land races. Genetic differences within and among land races indicate heterogeneity. These results indicate that cultivated ginseng in Korea is heterogeneous. Genetic similarity matrices of RAPD profiles were generated via coefficients of variation and the data were processed by the cluster analysis (UPGMA). When 90 collections were evaluated using selected 5 primers, those were clustered to 5 and 3 subgroups. These differences in genetic variation between land races of Korean ginseng implied the potential source for further breeding of Korean ginseng.

rDNA 염기서열을 이용한 황금의 품질 오염 조사

채병찬,육진아,김영화,고병섭,이미영 한국작물학회 2006 한국작물학회 학술발표대회 논문집 Vol.2006 No.-

적변삼으로부터 분리한 내생세균의 동정 및 적변 유발

최재율,육진아,김진희,최춘환,천종식,김영준,이향범 韓國藥用作物學會 2005 한국약용작물학회지 Vol.13 No.1

적변삼은 인삼에서 흔히 볼 수 있으며, 농가에 커다란 경제적 손실을 주지만, 아직까지 주원인에 대해서는 밝혀지지 않았다. 본 연구는 적변삼의 발생원인을 밝히기 위하여 적변삼과 내생 세균과의 연관성을 검토하였다. 인삼의 내생 세균 밀도는 정상 인삼의 경우 0.96~1.5×102cfu/g fw에 불과하였으나 적변이 심한 경우는 0.37~5.1×107 cfu/g fw로 정상 인삼에 비하여 밀도가 매우 높았다. 적변삼에서 분리한 31개 균주는 적변정도의 차이는 있지만 적변을 유발하였다. 적변과 관련이 있는 세균은 대부분이 그람 음성균이었다. 적변을 유발하는 세균을 세균학적 특성과 16S rDNA의 염기서열 분석에 의해 동정한 결과 Agrobacterium tumefaciens, A. rhizogenes, Burkholderia phenazinium, Ensifer adharens, Lysobacter gummosus, Microbacterium Iuteolum, M. oxydans, Pseudomonas marginalis, P. veronii, Pseudomonas sp., Rhizobium leguminosarum, R. tropica, Rhodococcus erythropolis, Rh. globerulus, Variovorax paradoxus의 세균으로 동정되었다. 따라서 인삼적변의 발생은 내생세균의 침입 및 증식에 기인한 것으로 추정된다. While the rusty-colored root is common in ginsengs culture and, often results in a severe economic loss, the major factors have not been found. This study was focused on the determination of a potential relationship between rusty root and endophytic bacteria. The number of endophytes was 9.6 × 101~1.5 × 102 cfu/g fw in normal ginseng roots compared to 3.7 × 106~5.1 × 107 cfu/g fw in rusty ones. Of 31 isolates from rusty ginseng roots, twenty-four isolates repeatedly induced severe to moderate rust on root while seven isolates induced slight rust. The bacteria responsible for rusty ginseng roots were mainly Gram negative aerobic. Rust inducing bacteria were identified as Agrobacterium tumefaciens, A. rhizogenes, Burkholderia phenazinium, Ensifer adharens, Lysobacter gummosus, Microbacterium luteolum, M. oxydans, Pseudomonas marginalis, P. veronii, Pseudomonas sp., Rhizobium leguminosarum, R. tropica, Rhodococcus erythropolis, Rh. globerulus, Variovorax paradoxus on the basis of bacteriological characters and 16S rDNA sequences analysis. The results in this study strongly suggested that the rusty ginseng roots were produced by infection and growth of endophytic bacteria.

RAPD를 이용한 한국산 재래종 인삼 (Panax ginseng C. A. Meyer)의 다양성 분석

서상덕,육진아,차선경,김현호,성봉재,김선익,최재을 한국작물학회 2003 한국작물학회 학술발표대회 논문집 Vol.2003 No.-