KBUD: The Korea Brain UniGene Database

Jeon, Yeo-Jin,Oh, Jung-Hwa,Yang, Jin-Ok,Kim, Nam-Soon Korea Genome Organization 2005 Genomics & informatics Vol.3 No.3

Human brain EST data provide important clues for our understanding of the molecular biology associated with the function of the normal brain and the molecular pathophysiology with brain disorders. To systematically and efficiently study the function and disorders of the human brain, 45,773 human brain ESTs were collected from 27 human brain cDNA libraries, which were constructed from normal brains and brain disorders such as brain tumors, Parkinson's disease (PO) and epilepsy. An analysis of 45,773 human brain ESTs using our EST analysis pipeline resulted in 38,396 high-quality ESTs and 35,906 ESTs, which were coalesced into 8,246 unique gene clusters, showing a significant similarity to known genes in the human RefSeq, human mRNAs and UniGene database. In addition, among 8,246 gene clusters, 4,287 genes ($52\%$) were found to contain full-length cONA clones. To facilitate the extraction of useful information in collected these human brain ESTs, we developed a user-friendly interface system, the Korea Brain Unigene Database (KBUD). The KBUD web interface allows access to our human brain data through three major search modes, the BioCarta pathway, keywords and BLAST searches. Each result when viewed in KBUD offers comprehensive information concerning the analyzed human brain ESTs provided by our data as well as data linked to various other publiC databases. The user-friendly developed KBUD, the first world-wide web interface for human brain EST data with ESTs of human brain disorders as well as normal brains, will be a helpful system for developing a better understanding of the underlying mechanisms of the normal brain well as brain disorders. The KBUD system is freely accessible at http://kugi.kribb.re.kr/KU/cgi -bin/brain. pI.

HSAP: Human endogenous retroviruses Structure Analysis Program

Yeo-Jin Jeon,Tae-Hyung Kim,Dae-Soo Kim,Joo-Mi Yi,Heui-Soo Kim 한국생명과학회 2003 한국생명과학회 심포지움 Vol.39 No.-

Biological toxicity toward Zebrafish (Danio rerio) of Na- and K-TiO₂ photocatalytic systems during the decomposition of Bisphenol A /

Jeon, Min Kyu,Yeo, Min Kyeong,Choi, Hyung Joo,Kim, Jin Soo,Choung, Suk Jin,Kim, Jin Bae,Jeong, Dae Won,Kang, Mi Sook The Korean Society of Industrial and Engineering C 2007 Journal of industrial and engineering chemistry Vol.13 No.5

Sous-Vide 잡채의 앙념 배합 비율에 따른 한국과 중국 소비자 기호도

전여진(Yeo Jin Jeon),장진아(Jin A Jang),오지은(Ji Eun Oh),손경현(Kyung Hyun Sohn),조미숙(Mi Sook Cho) 한국식품영양과학회 2016 한국식품영양과학회지 Vol.45 No.11

급격히 성장하고 있는 중국의 외식시장을 겨냥한 한식 외식상품의 개발 및 진출 가능성을 알아보기 위해 sous-vide잡채의 양념 배합 비율에 대한 한국과 중국 소비자의 기호도를 조사하였다. 잡채 시료는 각 재료를 개별 조리한 후 최종단계에서 혼합하는 전통적인 방법 대신 모든 재료를 한꺼번에 진공포장한 후 저온 조리하는 sous-vide 조리법을 적용하여 외식 상품으로 개발하였다. Sous-vide 잡채에 대한 소비자 기호도 조사는 한국인 119명과 중국인 136명을 대상으로 각각 서울과 북경에서 실시하였다. 소비자 기호도조사는 sous-vide 잡채 양념의 간장·설탕, 샐러드유의 배합비를 달리하여 간장·설탕 혼합물의 비율을 저(8%), 중(13%), 고(18%) 3개 수준으로, 샐러드유의 비율을 무(0%), 중(12%), 고(24%) 3개 수준으로 첨가하여 제조한 9개의 잡채시료에 대하여 전반적, 외관, 향미, 짠맛, 단맛, 기름진 맛의 기호도와 구매의향을 알아보았다. 잡채에 대한 소비자조사에서 한국인의 경우 전반적, 외관, 향미, 짠맛, 단맛 기호도 및 구매의향은 샐러드유의 양과 관계없이 간장·설탕 혼합물을 중·고비율로 첨가한 군에서 유의적으로 높은 경향을 보였다(P<0.001). 기름진 맛의 기호도는 간장·설탕 혼합물을 중·고비율, 기름을 무·중비율로 첨가한 군에서 유의적으로 높은 경향을 나타냈다(P<0.001). 중국인의 경우 전반적 기호도, 향미 기호도와 구매의향은 간장·설탕 혼합물이 고비율, 샐러드유가 중·고비율로 첨가된 군에서 유의적으로 높게 나타났다(P<0.001). 짠맛과 단맛 기호도에서는 모두 샐러드유의 양과 관계없이, 짠맛 기호도는 간장·설탕 혼합물을 고비율로 첨가한 군, 단맛 기호도는 간장·설탕 혼합물을 중·고비율로 첨가한 군에서 유의적으로 높게 나타났다(P<0.001). 기름진 맛 기호도는 간장·설탕 혼합물의 비율과 관계없이 샐러드유를 무・중비율로 첨가한 군이 유의적으로 높게 나타났다(P<0.01). 외관 기호도에서는 모든 시료 간에 유의적인 차이가 나타나지 않았다. 대체로 한국인과 중국인 모두 샐러드유량과 관계없이 간장·설탕 혼합물을 중·고비율로 첨가한 군을 선호하는 것으로 나타났다. 특히 한국인은 간장·설탕 혼합물을 저비율로 첨가한 군을 일관적으로 가장 좋아하지 않는다고 답했으며, 중국인은 한국인보다 간장·설탕 혼합물 저·고비율 첨가군을 더 선호하였다. 반면 샐러드유의 첨가비율은 간장・설탕의 첨가비율에 비하여 양 국가소비자의 기호도에 크게 영향을 주지 않는 것으로 나타났다. 본 연구에서는 한국인과 중국인의 한식과 잡채에 대한 인식을 조사하고, 선호하는 잡채 양념의 간장·설탕 및 샐러드유의 양을 찾아내었다. 이 결과를 통해 한식 외식 상품으로서의 잡채 개발을 위한 방향의 제시와 중국시장 진출 가능성을 확인하였다. 본 연구 결과는 한식의 중국 현지화를 위한 외식 상품 개발 시 기초자료로 활용될 수 있을 것으로 생각한다. This study aimed to investigate preferences for sous-vide cooked jabchae between Korean and Chinese consumers according to sauce mixing proportion. To commercialize sous-vide cooked jabchae and localize it for overseas circumstances in the Korean and Chinese markets, consumers’ subjective preferences for sous-vide cooked jabchae were investigated especially in 119 Korean consumers (55 males and 64 females) and 136 Chinese consumers (70 males and 66 females). For jabchae samples, this study set up three different mixture rates of soy sauce and sugar, 8% (LSS), 13% (MSS), and 18% (HSS), and three different salad oil rates, 0% (LO), 12% (MO), and 24% (HO), to propose nine kinds of samples. As a result of consumer preferences, for Koreans, MSS and HSS regardless of oil content were significantly high in overall, appearance, saltiness, sweetness preferences, and purchase intention (P<0.001). In addition, for oiliness preference, LSS, MSS, LO, and MO were significantly high (P<0.001). For Chinese, HSS, MO, and HO were significantly high in overall, flavor preference, and purchase intention (P<0.001). For saltiness and sweetness preference, regardless of oil content, saltiness preference was significantly high in HSS and sweetness in MSS and HSS (P<0.001). For oiliness preference, regardless of content of soy sauce and sugar mixture, LO and MO were significantly higher, and for appearance preference, there was no significant difference among all samples (P<0.01). In general, both Korean and Chinese tended to prefer MS and HO, irrespective of oil content. Especially for Koreans, LSS was the least favorite sample in almost all preference questionnaires. For Chinese, preference scores for LSS and HSS were higher than for Koreans. On the other hand, oil content did not have much effect on consumer preference as compared with contents of soy sauce and sugar mixture.

모체 혈액을 이용한 태아 유핵 적혈구 분리기법에 따른 산전 유전진단

전여진 ( Yeo Jin Jeon ),권경훈 ( Kyung Hun Kwon ),황효성 ( Hyo Sung Hwang ),이소현 ( So Hyun Lee ),방명걸 ( Myung Geol Pang ),안정자 ( Jung Ja Ann ),전선희 ( Sun Hee Chun ),김영주 ( Young Ju Kim ) 대한산부인과학회 2007 Obstetrics & Gynecology Science Vol.50 No.6

목적: 태아 유핵 적혈구의 분리를 하여 FISH에 의해 산전 태아의 성과 염색체 이수성을 확인하기 위해 본 연구를 시행하였다. 연구방법: 말초혈액샘플은 임신 11주에서 24주 사이의 37명의 여성으로부터 수집되었다. 모체혈액으로부터 double density gradient와 magnetic activating cell sorting방법을 시행한 후 Kleihaur-Betke 염색을 통해 태아 유핵 적혈구를 형태학적으로 관찰하였다. K-B positive한 유핵 적혈구에 CEP X와 CEP Y probe를 이용한 FISH를 시행하여 유핵 적혈구의 성별 확인을 통해서 태아 기원 유무를 확인하였다. 결과: 10 ml의 혈액에서 분리한 K-B positive한 유핵 적혈구는 평균 17.3 (±17.2)개였으며, 최대 54개의 유핵 적혈구가 관찰되었다. 이 중 양수검사를 확인한 총 18명의 산모에서 분리한 유핵 적혈구의 67.3%에서 CEP Y probe의 signal을 확인하였다. 결론: 우리는 분리된 태아 유핵 적혈구를 이용해서 FISH 기법을 통해 태아 성별을 판정할 수 있을 뿐만 아니라 태아의 염색체의 이수성을 진단하는데 있어서의 활용 가능성을 확인할 수 있었다. 분리한 유핵 적혈구 중 모체 기원의 유핵적혈구가 포함되어 있어서 추후 이를 선별해 내는 방법에 대한 연구가 필요할 것으로 사료된다. Objective: To identify prenatal fetal sex and chromosomal aneuploidies by FISH using isolation of fetal nucleated RBCs. Methods: peripheral blood samples was collected from 37 women between 11 and 24 weeks of gestation. we tried to enrich nucleated RBCs morphologically by Kleihaur-Betke staining after double gradient centrifugation and magnetic activating cell sorting (MACS) from maternal blood. Fluorescence in situ hybridization (FISH) analyses with CEP X and CEP Y probes for K-B positive nucleated RBCs were performed to detect whether fetal cells were existed among nucleated RBCs by observation of sex chromosomes. Results: The average number of K-B positive nucleated RBCs separated from 10ml of maternal blood was 17.3 (±17.2) and the maximum number of nucleated RBCs was 54. We observed FISH signals in nucleated RBCs separated from 18 pregnant women, and Y probe signals were observed in 67.3% of nucleated RBCs separated from 10 pregnant women. Conclusion: We confirmed that separated nucleated fetal RBCs can be used to identify fetal sex and chromosomal aneuploidies by FISH. Since nucleated RBCs from maternal origin were not excluded, further studies are needed to overcome this limitation.

성인 남성의 대사증후군 예방을 위한 적정 체력수준

문여진 ( Yeo Jin Moon ),제혜미 ( Hae Mi Jee ),김광준 ( Kwang Jun Kim ),정진욱 ( Jin Wook Chung ),전병환 ( Byeong Hwan Jeon ) 한국스포츠정책과학원(구 한국스포츠개발원) 2012 체육과학연구 Vol.23 No.1

전세계적으로 비만 인구의 증가와 함께 대사증후군 유병률이 증가하는 추세에 있으며, 우리나라에서도 이러한 양상이 급격하게 나타나고 있다. 이 연구에서는 성인남성 5,525명을 대상으로 조사한 결과 대사증후군 유병률이 18.2%로 나타났다. 이러한 대사증후군 유병률 추이를 감소시키고 예방하기 위해 이번 연구에서는 첫째, 비질환자와 대사증후군 질환자에서 결과적으로 체력수준에서 차이가 나타나는지를 심폐지구력, 근력, 유 연성, 순발력, 균형감각의 하위요소로 구분하여 비교하고, 둘째, 체력수준의 차이가 발행한다면 대사증후군을 예방하기 위한 체력의 적정수준 (cut- off)을 하위요소별로 산출하여, 대사증후군 유병률을 낮추기 위한 운동 프로그램의 기준을 제공하고자 하였다, 그 결과에 따르면 대사증후군 집단에서 심폐지구력, 유연성, 하지 순발력, 민첩성 (각각p<001)이 유의하게 낮은 것으로 나타났고, 근력(p<01)은 유의하게 높은 수준으로 나타났다, 이와 유사하게, 연령대별로는40~50대에서 비질환자 집단의 심폐지구력, 유연성, 하지 순발력, 균형감각(각각p<001)과 민첩성(p<01)이 모두 우수하게 나타난 반면, 근력(p<01)은 대사증후군 집단이 우수하게 나타나서 체력의 대사증후군에 대한영향력은40~50대에서 가장 의미있는 것으로 사료된다. 대사증후 군 유병률 예방을 위한 연령별 적정 체력수준을 제시하기 위해 ROC 곡선으로 하위요소별 적정체력 수준을 연령별로 산출한 결과에 따르면, 20~30대 청장년층의 심폐지구력 28.6ml/kg/min, 근력 42kg, 유연성 12cm, 하지 순발력 42cm, 민첩성 357sec, 균형감각 18sec의 적정수준이 산출되었고, 40~50대 중년층에서는 심폐지구력 27.gml/kg/min, 근력 39kg, 유연성 lcm, 하지 순발력 36cm, 민첩성 369sec, 균형감각 8sec로 나타났으며, 60~70대 노년층에서는 심폐지구력 VO2max 23.7ml/kg/min, 근력 27kg, 유연성-7cm, 하지 순발력 33cm, 민첩성 40lsec, 균형감각 8sec로 나타났다. 이 연구를 통해 산출한 적정수준의 체력수준은 연령별 운동프로그램을 작성하는데 필요한 운동 강도, 운동 시간 등의 운동량을 결정하는데 있어 중요한 기준이 될 수 있다. 이를 바탕으로 설계된 운동프로그램의 운동부하로 규칙적인 운동을 실시하면, 대사 증후군의 위험으로부터 안전한 건강상태가 유지될 수 있을 것으로 사료된다. There has been shown the rapid increase in the prevalence of metabolic syndrome along with obesity not only in worldwide but in nationwide. The prevalence rate of metabolic syndrome within adults male (n=5,525) in this study, was 18.2%. To prevent such steep increases of metabolic syndrome, we examined that, at first, the differences on fitness factors (cardiorespiratory fitness (VO2max), grip strength, flexibility, hindlimb power (vertical jump), agility, balance) between normal and metabolic syndrome group. As the first result, the level of VO2max, flexibility, vertical jump, balance were significantly low in metabolic syndrome group (p <.001), and agility (p <.001), grip strength (p <.01) were shown significant differences, For the comparison between each age groups, middle aged group (40-50s) showed significant difference by metabolic syndrome hi each fitness factors. It means that fitness level has critical impact on the prevalence of metabolic syndrome in middle aged group. As the second result, the cut-off values to prevent the incidence of metabolic syndrome were calculated by ROC curve. In youth group (20-30s) the associated cut-off values of the VO2max and grip strength and flexibility arid hindlimb power(vertical jump) and agility and balance as 28.6m1/kg/min and 42kg and 12cm arid 42cm and 357sec and l8sec respectively. In middle age group the associated cut-off values of the VO2 arid grip strength and flexibility and hindlimb power (vertical jump) and agility and balance as 27.9m1/kg/min and 39kg arid 1cm and 36cm and 369sec and 8sec respectively. In old age group (60-70s) the associated cut-off values of the VO2max and grip strength and flexibility and hiridlimb power (vertical jump) and agility and balance as 23.7m1/kg/miri and 27kg and-7cm and 33cm and 40lsec and 8sec respectively. These cut-off values would provide the optimal ranges for the age-specific exercise program to prevent metabolic syndrome. The exercise programs based on the values are expected to maintain healthy status from such chronic disease.

Hole Extraction Layers of in-situ Synthesized Metal NPs onto Graphene Sheets in Polymer Solar Cells

Ye-Jin Jeon,Jun-Seok Yeo,Sehyun Lee,Yen-Sook Jung,Kyeongil Hwang,Youn-Jung Heo,Jueng-Eun Kim,Jin-Mun Yun,Dong-Yu Kim 한국고분자학회 2016 한국고분자학회 학술대회 연구논문 초록집 Vol.41 No.2

Genome-wide identification of chemosensitive single nucleotide polymorphism markers in gastric cancer.

Ha, Ye Jin,Yoon, Sang Nam,Jeon, Yeo Jin,Cho, Dong Hyung,Roh, Seon Ae,Kim, Byung Sik,Kim, Hee Jin,Kim, Seon Young,Kim, Yong Sung,Kim, Jin Cheon Potamitis Press 2011 Anticancer research Vol.31 No.12

<P>A chemosensitive single nucleotide polymorphism (SNP) discovery schema is presented that utilizes (i) genome-wide SNP screening, with a human SNP array and an in vitro chemosensitivity assay, in 93 patients with gastric cancer (GC), and (ii) biological utility assessment using cell viability assays of transfected GC cells. Cytotoxicity analysis showed that most of the MKN1 and SNU638 clones transfected with the G allele of Deoxyribonuclease II beta (DNASE2B) rs3738573 were more sensitive to docetaxel than those with the C allele (p0.001-0.029) and most of the AGS and SNU638 clones transfected with the T allele of 5-hydroxytryptamine receptor IE (HTRIE) rs3828741 were more sensitive to paclitaxel than those with the C allele (p0.001-0.019). Our findings show that the two novel markers, DNASE2B rs3738573 and HTR1E rs3828741, have potential for improving the prediction of chemosensitivity of GC patients.</P>

Biological Toxicity Toward Zebrafish (Danio rerio) of Na- and K-TiO2 Photocatalytic Systems During the Decomposition of Bisphenol A

Min Kyu Jeon,Min Kyeong Yeo,Hyung Joo Choi,Jin Soo Kim,Suk Jin Choung,Jin Bae Kim,Dae Won Jeong,Mi Sook Kang 한국공업화학회 2007 Journal of Industrial and Engineering Chemistry Vol.13 No.5

The Biomarkers for Prediction of Significant Bleeding Complication during ECMO Support

( Jin Ho Jang ),( Hye Ju Yeo ),( Woo Hyun Cho ),( Taehwa Kim ),( Yun Seong Kim ),( Doosoo Jeon ),( Jin Ook Jang ),( Eunjeong Son ) 대한결핵 및 호흡기학회 2020 대한결핵 및 호흡기학회 추계학술대회 초록집 Vol.128 No.0

Background Bleeding is the main complication of extracorporeal membrane oxygenation (ECMO) support. Currently, the mechanism of bleeding during ECMO is not fully understood. In previous studies, we have shown that ECMO has an effect of reducing platelet activation in the early stages. This preliminary study aimed to find a biomarker and clinical parameters for predicting bleeding complications. Methods We prospectively collected blood samples from ECMO patients on day 1, 3 and 7 and analyzed their plasma beta-thromboglobulin (beta-TG), platelet factor 4 (PF4), tumor necrosis factor alpha (TNF-α), and interleukin 1 beta (IL-1b). We retrospectively reviewed patient medical records and analyzed correlations between platelet function and inflammatory markers and bleeding. Results Overall, 54 patients who received ECMO for acute respiratory failure were included and classified by presence of bleeding complication (the bleeding group (n=11) and the non-bleeding group (n=45)). The mean TNF-α concentration on day 1 (p=0.026) and day 3 (p=0.018) were significantly different between two groups, respectively. Among the clinical parameters, ECMO application for more than 2 weeks (p=0.002) were significantly related to bleeding complication (p=0.002). The ROC curve revealed that the mean TNF-α concentration on day 1 and day 3 after ECMO application fairly discriminated bleeding group and non-bleeding group with an AUC of 0.734 (95% CI 0.60-0.84, p=0.001) and 0.778 (95% CI 0.65-0.88, P<0.001), respectively. However, the factors associated with platelet activity did not show any significant difference between the two groups (Fig. 2). Conclusion The early serum level of TNF-α may play a role as a significant biomarker of bleeding complication during ECMO. The marker of platelet activity, such as beta-TG and PF4 were not significant predictor of bleeding during ECMO support. Further research aiming the crosstalk of TNF-α and coagulation cascades is warranted.