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정호열,박수준,박선희,Jung, H.Y.,Park, S.J.,Park, S.H. 한국전자통신연구원 2005 전자통신동향분석 Vol.20 No.5
현재 우리나라에서 가장 주목받고 있는 분야가 IT와 BT일 것이다. IT는 워낙 언론매체에 많이 노출되어 어떤 것을 말하고 어떤 분야가 있다는 것을 많은 사람들이 잘 알고 있는 실정이나, BT 관련해서는 단순히 시험관을 연상하는 사람이나 줄기세포 연구 정도로 알고 있는 사람들이 많을 것이다. 현재의 BT 분야는 예전의 소규모 실험을 벗어나 대규모의 실험 수행이 가능한 시스템이 구축되었는데, 이러한 대규모 실험 결과를 분석하기 위한 정보학적인 방법의 도입이 필수적인 시대가 되었다. 그래서, 이런 접근방법을 통상 IT와 BT의 융합기술이다라고 이야기한다. 바이오 정보 기술이란 이런 대규모의 생물학적 데이터를 시스템적으로 분석하여 정보를 추출하는 제반 기술이라고 이야기 할 수 있다. 일반적으로 많이 알려진 용어로는 생물정보학(바이오인포매틱스)혹은 계산생물학이 있다. 더 넓은 의미에서 이야기 할 때는 이러한 정보 추출을 위한 분석 과정뿐만 아니라, 생물학 관련 데이터베이스 구축 및 서비스 부분도 포함해서 이야기하고 있다.
이동훈,정호열,김민호,임명은,김대희,한영웅,김영원,최재훈,김승환,Lee, D.H.,Jung, H.Y.,Kim, M.H.,Lim, M.E.,Kim, D.H.,Han, Y.W.,Lee, Y.W.,Choi, J.H.,Kim, S.H. 한국전자통신연구원 2016 전자통신동향분석 Vol.31 No.4
구글 딥마인드 알파고와 이세돌 선수와의 바둑대결 후 인공지능의 활용처로 의료분야가 거론되면서 임상의사결정지원시스템(Clinical Decision Support System: CDSS)이 최근 주목받고 있다. 기본적으로 CDSS는 환자 진료에 있어 예방, 진단, 치료, 처방 그리고 예후의 각 단계에서 임상의의 의사결정을 도와주는 시스템을 말한다. 본고에서는 CDSS의 국내외 도입 및 시장현황과 관련 기술현황을 검토하여 의료현장에서 CDSS의 활용이 활성화되기 위한 방안을 도출하고자 한다.
한영웅,정호열,박수준,Y.W. Han,H.Y. Jung,S.J. Park 한국전자통신연구원 2023 전자통신동향분석 Vol.38 No.3
The value of living a long and healthy life without suffering has increased owing to aging populations, transition to welfare societies, and global interest in health deriving from the novel coronavirus disease pandemic. New drug development has gained attention as both a tool to improve the quality of life and high-value market, with blockbuster drugs potentially generating over 10 billion dollars in annual revenue. However, for newly discovered substances to be used as drugs, various properties must be verified over a long period in a time-consuming and costly process. Recently, the development of artificial intelligence technologies, such as deep and reinforcement learning, has led to significant changes in drug development by enabling the effective identification of drug candidates that satisfy desired properties. We explore and discuss trends in artificial intelligence for de novo drug design.
cDNA 마이크로어레이 데이터의 분석과 관리 시스템 : cMAMS
김상배(S.B Kim),김효미(H.M Kim),이은정(E.j. Lee),김영진(Y.J Kim),박정선(J.S Park),박윤주(Y.J Park),정호열(H.Y Jung),고인송(I.S. Koh) 한국정보과학회 2004 한국정보과학회 학술발표논문집 Vol.31 No.1B
마이크로어레이 기술은 근래에 개발된 신기술로써 동시에 수천-수만 개의 유전자 발현을 측정할 수 있어 다양한 생물학적 연구에 이용되고 있다. 여러 단계의 실험 과정과 이를 통해 얻은 다량의 데이터를 처리하기 위해서는 이를 효율적으로 관리, 저장, 분석할 수 있는 통합 정보 관리 시스템을 필요로 한다. 현재 외국에서는 몇몇 관리시스템이 개발되어 있고, 국내에서도 WEMA 등이 있지만 아직 데이터 관리부분에 기능이 치우쳐 있다. 따라서 우리는 복잡한 자료구조를 가지는 마이크로어레이의 실험 정보와 각 단계별 처리 정보 등을 사용자의 관점에서 효과적이고 체계적으로 관리할 수 있고, 데이터 정규화 및 다양한 통계적 분석 기능을 갖춰 불필요한 시간과 비용을 줄임으로써 마이크로어레이 연구에 도움을 주고자 통합 분석관리 시스템 cMAMS (cDNA Microarray Analysis and Management System)를 개발하였다. 웹 기반으로 구현된 cMAMS는 데이터를 저장, 관리하는 부분과 데이터를 분석하는 부분, 그리고 모든 관련 정보가 저장되는 데이터베이스 부분으로 구성되어 있다. 데이터관리부분에서는 WEMA의 계층적 데이터구조를 도입해 관리의 효율성을 높이고 시스템의 이용자를 시스템운영자, 프로젝트관리자, 일반사용자로 구분하여 데이터 접근을 제한함으로써 보안성을 높였다. 통계처리 언어 R로 구현된 데이터분석 부분은 7 단계의 다양한 분석(전처리, 정규화, 가시화, 군집분석, 판별분석, 특이적 발현 유전자 선별, 마이크로어레이 간의 상관분석)이 가능하도록 구현하였고, 분석결과는 데이터베이스에 저장되어 추후에 검토 및 연구자간의 공유가 가능하도록 하였다. 데이터베이스는 실험정보가 저장된 데이터베이스, 분석결과가 저장된 데이터베이스, 그리고 유전자 정보 탐색을 위한 데이터베이스로 분류해 데이터를 효율적으로 관리할 수 있게 하였다. 본 시스템은 LINUX를 운영체계로 하고 데이터베이스는 MYSQL로 하여 JSP, Perl, 통계처리 언어인 R로 구현되었다.
Seed를 이용한 마이크로어레이 데이터 클러스터링과 유전자 온톨로지를 이용한 클러스터의 해석
강은미(Eunmi Kang),신미영(Miyoung Shin),정호열(H.Y. Jung),박선희(S.H. Park),조환규(H.G. Cho) 한국정보과학회 2004 한국정보과학회 학술발표논문집 Vol.31 No.1B
마이크로어레이 칩 실험을 통하여 대량으로 생산되는 유전자 발현 데이터는 여러 가지 클러스터링 방법을 적용하여 분석할 수 있으며, 생성된 클러스터들 또한 여러 가지 방법으로 해석 할 수 있다. 본 논문에서는 기존의 클러스터링 방법들을 응용한 seed 클러스터링 방법을 제안하고, 생물학적 온톨로지인 Gene Ontology를 기반으로 클러스터를 해석한다. 본 논문에서는 효과적인 유전자 현 데이터 클러스터링 방법과 생물학적 지식을 바탕으로 클러스터를 해석, 평가하는 방법을 보여준다.