Clinical and Biochemical Diagnosis in Children with Leigh Syndrome

이선호,전미나,이현주,박대영,김세훈,이영목,Lee, Sun Ho,Jeon, Mina,Lee, Hyun Joo,Park, Dae Young,Kim, Se Hoon,Lee, Young-Mock The Korean Society of Inherited Metabolic Disease 2015 대한유전성대사질환학회지 Vol.15 No.2

Purpose: Deficits of the respiratory chain are reported to be the major cause of Leigh syndrome is said to be the underlying causes. The need for biochemical diagnosis to draw more accurate diagnosis or prognosis to support treatments is rapidly increasing. This study tried to analyze the aspects of clinical characteristics and biochemical diagnosis of mitochondrial respiratory chain complex (MRC) defect in Leigh syndrome, using methods of biochemical enzyme assay. Methods: We included total number of 47 patients who satisfied the clinical criteria of Leigh syndrome and confirmed by biochemical diagnosis. All those patients went through muscle biopsy to perform biochemical enzyme assay to analyze MRC enzyme in order to find the underlying cause of Leigh syndrome. Results: MRC I defect was seen in 23 (48.9%) cases taking the first place and MRC IV defect in 15 (31.9%) following it. There were 9 (19.2%) cases of combined MRC defect. Combined cases of type I and IV were detected in 7 (14.9%) patients while type I and V in 2 (4.3%). The onset age of symptom was less than 1 year old in 28 (59.6%). The most common early symptom, observed in 23 (48.9%), was delayed development, but there were other various neurological symptoms observed as well. In regard with the disease progression, 35 (74.5%) patients showed slowly progressive course, the one that progressed continuously but slowly over 2 years of period. As for Maximum motor development, 22 (46.8%) were bed-ridden state, most of them suffering serious delayed development. Patients showed various symptoms with different organs involved, though neuromuscular involvement was most prominent. Delayed development was seen in all cases. Multifocal lesion in brain MRI study was seen in 36 (76.6 %) cases, taking a greater percentage than 11 (23.4%) cases with single lesion. In MR spectroscopy study, the characteristic lactate peak of mitochondrial disease was identified in 20 (42.6%) patients. Conclusions: Further analysis of clinical and biochemical diagnosis on more extended group of patients with Leigh syndrome will enable us to improve diagnostic precision and to understand the natural course of mitochondrial disease.

마이크로어레이 자료분석에서 모수적 방법을 이용한 유전자군의 유의성 검정

이선호,이승규,이광현,Lee, Sun-Ho,Lee, Seung-Kyu,Lee, Kwang-Hyun 한국통계학회 2009 Communications for statistical applications and me Vol.16 No.3

마이크로어레이 기술은 수만 개 유전자의 발현 패턴을 동시에 관찰하는 것을 가능하게 하였고, 이들을 하나씩 검정하여 찾아낸 특이발현 현상을 보이는 유전자를 중심으로 질병의 진단, 치료법 정립과 신약 개발을 위한 기본 정보를 확립하였다. 그러나 개별 유전자분석의 여러 문제점이 발견되면서 유전자들을 생물학적 대사경로나 염색체 위치가 같은 것끼리 묶은 집단을 분석하여 질병의 발생이나 생존에 영향을 미치는 집단을 찾는 방법이 제시되었다. 이러한 유전자 집단의 유의성에 대한 연구는 2002년에 MIT에서 비롯되어 GSEA, SAM-GS와 중심극한 정리의 개념을 이용한 모수적 방법인 PAGE 등이 사용되고 있다. 본 논문에서는 이들 통계량의 구조적 한계를 극복하고 계산이 간단한 새로운 모수적 방법을 제안하고 자료 분석을 통하여 효율성을 보였다. The development of microarray technology makes possible to analyse many thousands of genes simultaneously. While it is important to test each gene whether it shows changes in expression associated with a phenotype, human diseases are thought to occur through the interactions of multiple genes within a same functional cafe-gory. Recent research interests aims to directly test the behavior of sets of functionally related genes, instead of focusing on single genes. Gene set enrichment analysis(GSEA), significance analysis of microarray to gene-set analysis(SAM-GS) and parametric analysis of gene set enrichment(PAGE) have been applied widely as a tool for gene-set analyses. We describe their problems and propose an alternative method using a parametric analysis by adopting normal score transformation of gene expression values. Performance of the newly derived method is compared with previous methods on three real microarray datasets.

유전자집합분석에서 순열검정의 대안

이선호,Lee, Sunho 한국통계학회 2018 응용통계연구 Vol.31 No.2

The analysis of gene sets in microarray has advantages in interpreting biological functions and increasing statistical powers. Many statistical methods have been proposed for detecting significant gene sets that show relations between genes and phenotypes, but there is no consensus about which is the best to perform gene sets analysis and permutation based tests are considered as standard tools. When many gene sets are tested simultaneously, a large number of random permutations are needed for multiple testing with a high computational cost. In this paper, several parametric approximations are considered as alternatives of the permutation distribution and the moment based gene set test has shown the best performance for providing p-values of the permutation test closely and quickly on a general framework. 마이크로어레이 자료의 유전자집합분석은 개별유전자분석에 비해 검정력도 높일 수 있고 결과 해석이 쉬워서 이에 대한 연구가 활발히 진행되어 왔다. 표현형에 따라 유의한 차이를 보이는 유전자집합의 검색은 검정통계량들이 유도된 배경에 따라 결과에 차이를 보이지만 대체적으로 t-통계량의 제곱합을 이용한 순열검정이 제일 무난한 방법으로 여겨진다. 그러나 유전자집합분석에서 다중검정은 필수이고 많은 집합들의 유의성에 변별력을 주기 위해서는 순열검정에서 생성하는 치환표본의 수가 많이 필요하고 시간이 오래 걸린다는 문제점이 있다. 순열검정을 대신할 모수적 방법들을 검토한 결과, 적률을 이용한 근사가 각 집합의 유의확률 계산시간도 훨씬 단축하며 순열검정에서 구한 유의확률과 크기와 순위가 거의 일치함을 확인하였다.

특이발현과 특이공발현을 고려한 유의한 유전자 집단 탐색

이선호,Lee, Sunho 한국통계학회 2016 응용통계연구 Vol.29 No.3

서로 상관있는 유전자들의 발현조절이 질병이나 종양의 발생에 영향을 미치기 때문에 단일유전자 분석 대신 공통의 생물학적 요소를 지닌 유전자 집단 분석이 각광을 받게 되었고 생물학적으로 좀더 설명하기 쉬운 결과를 얻게 되었다. 표현형에 따라 유의한 차이를 보이는 유전자 집단을 찾는 여러 방법들이 있지만, 대부분의 방법들이 집단에 속한 유전자들의 표현형에 따른 발현의 차이를 탐색하거나 유전자들 사이의 공발현 구조가 다른지 탐색하는 것이다. 본 연구에서는 특이발현과 특이공발현의 차이를 모두 고려하는 탐색방법을 제시하였고 p53이란 유전자 자료와 모의자료를 이용하여 제시한 방법의 성능을 알아 보았다. Gene set analysis utilizing biologic information is expected to produce more interpretable results because the occurrence of tumors (or diseases) is believed to be associated with the regulation of related genes. Many methods have been developed to identify statistically significant gene sets across different phenotypes; however, most focus exclusively on either the differential gene expression or the differential correlation structure in the gene set. This research provides a new method that simultaneously considers the differential expression of genes and differential coexpression with multiple genes in the gene set. Application of this NEW method is illustrated with real microarray data example, p53; subsequently, a simulation study compares its type I error rate and power with GSEA, SAMGS, GSCA and GSNCA.

mRMR과 수정된 입자군집화 방법을 이용한 다범주 분류를 위한 최적유전자집단 구성

이선호,Lee, Sunho 한국통계학회 2020 응용통계연구 Vol.33 No.6

표본의 다범주 표현형을 예측하는데 사용되는 최적의 유전자집단이란 적은 수의 유전자로 표현형을 정확히 예측할 수 있는 유전자들의 모임이다. 특이발현유전자를 검색하는 통계량은 이미 여러 가지가 있고, K-평균 군집화를 곁들여 중복성이 적은 특이발현유전자들을 선택 가능하다. 이들을 바탕으로 적은 수로 정확하게 다범주 분류가 가능한 유전자집단을 구성할 수 있도록 수정한 입자최적화 방법을 제안한다. 널리 알려진 ALL 248례와 SRBCT 83례를 이용하여 제안된 방법으로 최적유전자집단을 찾을 수 있음을 보였다. The aim of this research is to find an optimal gene set that provides highly accurate multi-class classification with a minimum number of genes. A two-stage procedure is proposed: Based on minimum redundancy and maximum relevance (mRMR) framework, several statistics to rank differential expression genes and K-means clustering to reduce redundancy between genes are used for data filtering procedure. And a particle swarm optimization is modified to select a small subset of informative genes. Two well known multi-class microarray data sets, ALL and SRBCT, are analyzed to indicate the effectiveness of this hybrid method.

원격 저장소 환경에서 다중 키워드를 이용한 효율적인 검색 가능한 대칭키 암호 시스템

이선호,이임영,Lee, Sun-Ho,Lee, Im-Yeong 한국정보처리학회 2011 정보처리학회논문지 C : 정보통신,정보보안 Vol.18 No.4

매우 가벼운 무게와 손안에 들어가는 작은 크기로 휴대성을 제공하는 휴대용 저장매체는 사용자들로부터 많은 호응을 받고 있다. 하지만 휴대용 저장매체의 휴대성으로 인하여 USB 메모리의 분실 및 도난이 잦아졌고 그로 인하여 저장매체 내부에 저장되어 있는 개인정보가 유출되는 사고가 발생하는 문제점이 발생되었다. 따라서 분실위험이 없고 네트워크를 통하여 언제든 자료를 저장하고 접근할 수 있는 원격 저장소 서비스가 등장하게 되었다. 정보통신산업이 발달함에 따라 여러 종류의 정보 기기를 통하여 언제 어디서든 빠른 네트워크에 접근할 수 있게 되었고, 이는 원격 저장소를 이용하는 사용자들을 더욱 증가하게 하였다. 하지만 여러 사용자의 주요 자료가 저장됨에 따라 비윤리적인 관리자 및 공격자로 인하여 서버에 저장된 여러 사용자의 주요자료가 동시에 유출될 수 있는 위험이 존재한다. 이를 해결하기 위해 서버에 저장되는 자료의 암호화가 필요해졌으며, 이와 동시에 암호화한 자료의 효율적인 검색 및 이용을 위하여 검색 가능 암호 시스템이 필요하다. 하지만, 기존의 대칭키 검색 가능 암호 시스템은 문서의 삽입/삭제 효율성 및 다중 키워드 검색 시 연산의 효율성이 떨어지는 문제점이 존재한다. 따라서 본 논문은 기존 대칭키 검색 가능 암호의 문제점을 해결할 수 있는 효율적인 대칭키 검색 가능 암호 시스템을 제안한다. Removable Storage provides the excellent portability with light weight and small size which fits in one's hand, many users have recently turned attention to the high-capacity products. However, due to the easy of portability for Removable Storage, Removable Storage are frequently lost and stolen and then many problems have been occurred such as the leaking of private information to the public. The advent of remote storage services where data is stored throughout the network, has allowed an increasing number of users to access data. The main data of many users is stored together on remote storage, but this has the problem of disclosure by an unethical administrator or attacker. To solve this problem, the encryption of data stored on the server has become necessary, and a searchable encryption system is needed for efficient retrieval of encrypted data. However, the existing searchable encryption system has the problem of low efficiency of document insert/delete operations and multi-keyword search. In this paper, an efficient searchable encryption system is proposed.

17-4PH 스테인레스강의 기계적 , 화학적 성질에 미치는 회수재의 사용과 조성변화의 영향

이선호,강춘식,이경환,김도경 ( Seon Ho Lee,Choon Sik Kang,Kyong Hwan Lee,Do Kyong Kim ) 한국주조공학회 1993 한국주조공학회지 Vol.13 No.2

N/A Mechanical and chemical properties of the 17-4PH have been investigated after recycled melting. As the result, it has been ascertained that the change of Ni, Cu, Nb, C amount affects the mechanical and chemical properties. It is important to minimize contamination of impurities and to control the amount of Ni, Cu, Nb, C.

세라믹 주형법에 의하여 주조된 SM50C 강의 탈탄과 그 방지에 관한 연구

이선호,이경환,강춘식 ( Seon Ho Lee,Kyong Hwan Lee,Choon Sik Kang ) 한국주조공학회 1992 한국주조공학회지 Vol.12 No.4

N/A Decarburization phenomena of SM50C steel casted in ceramic mold was investigated. As result, decarburized depth increased by increased by increasing the volume-to-surface area ratio and mold temperature. And the relations between them is y(㎝)=(1.96×10^(-5)T+0.0135)×M-1.05×10^(-5)T+9.73×10^(-3). When mold is controlled by Ar ags, reducing atmosphere, decarburized depth is decreased. In case of adding graphite powder in the mold, decarburization is decreased more. Specially, when graphite powder is added on the mold materials and the wax is layed on the mold, decarburization is almost prevented.

Ultrasensitive serum thyroglobulin의 유용성 평가

이선호,조은빛,신영균,이영지,유선희,김년옥,Lee, Sun Ho,Cho, Eun Bit,Shin, Young Kyun,Lee, Young Ji,Yoo, Seun Hee,Kim, Nyun Ok 대한핵의학기술학회 2015 핵의학 기술 Vol.19 No.2

Purpose Serum Thyroglobulin measurement is a major tool for the follow-up of differentiated thyroid cancer (DTC) patients. Thyroglobulin is Normal thyroid tissue, or thyroid cancer tissue produced only. Thyroid hormone to a halt without Tg differentiation of thyroid cancer recurrence just by measuring how to decide whether there was increasing expectations if I can do it instead. Therefore, in excellent sensitivity Tg new inspection of the functional sensitivity by measuring the looked to evaluate the usefulness of reagents. Thyroidectomy is measuring the numbers Tg (total thyroidectomy) remaining thyroid ablation and radioactive iodine (radioactive iodine remnant ablation, RRA) DTC in patients being diagnosed with or help predict the remaining early detection of thyroid cancer recurrence. Materials and Methods Agent that I'm currently using Tg of the measurements of low clinical specimen for a second drainage of the three (0.08 0.17, 0.98, ng/mL) within the scope of the dilute magnification (2, 4, 8, 16, 32 times) by dilute Intraassy (n=10) and Interassay (n=10) out in no time. Concentration value according to the coefficient of variation and the mean and standard deviation of each measurement (Coefficient of variation, CV) the absolute value of the measured values that corresponds to 20 percent target a coefficient of variation of CV Find the value of the concentration of the functional sensitivity measurement did. Also, analytical sensitivity with recovery rates, Dilution test inspections, and interrelationship, compared. Results Sensitivity is an excellent analytical sensitivity within the prosecutor kit Tg 0.006 ng/mL, and core analytical sensitivity, conducted by the 0.006 ng/mL to same conclusion. Be rather high to 142 percent recovery rate was 60 to measurement and functional sensitivity, 0.01766 ng/mL(Intraassay n=10) was measured at. CBC is relatively good correlation as ($R^2=0.949$) the correlation. Conclusion Recently ultrasensitive thyroglobulin this clinically important indicators of the previous kit and demands are lower than sensitivity to the measurement results. Therefore, ultrasensitive thyroglobulin test is correlated that there would be useful in value in nuclear medicine the thyroid gland.

마이크로어레이 자료에서 생존과 유의한 관련이 있는 유전자집단 검색

이선호,이광현,Lee, Sun-Ho,Lee, Kwang-Hyun 한국데이터정보과학회 2012 한국데이터정보과학회지 Vol.23 No.1

When the microarray experiment developed, main interest was limited to detect differentially expressed genes associated with a phenotype of interest. However, as human diseases are thought to occur through the interactions of multiple genes within a same functional category, the unit of analysis of the microarray experiment expanded to the set of genes. For the phenotype of censored survival time, Gene Set Enrichment Analysis(GSEA), Global test and Wald type test are widely used. In this paper, we modified the Wald type test by adopting normal score transformation of gene expression values and developed a parametric test which requires much less computation than others. The proposed method is compared with other methods using a real data set of ovarian cancer and a simulation data set. 환자의 생존시간과 함께 유전자 마이크로어레이 자료가 주어진 경우 생존에 유의한 영향을 미치는 대사경로를 찾는 방법을 연구하였다. 기존의 방법인 유전자 집합 농축도 분석, 글로벌 검정과 왈드 형태 검정을 비교 분석하였고, 치환을 통하여 p값을 구하는 단점을 개선한 수정된 왈드 형태 검정을 제안하였다. 모의실험과 실제자료 분석을 이용하여 새로운 방법의 적용 가능성을 보였다.