http://chineseinput.net/에서 pinyin(병음)방식으로 중국어를 변환할 수 있습니다.
변환된 중국어를 복사하여 사용하시면 됩니다.
제주흑우, 한우 및 수입 소 품종에서 새로운 indel 마커의 다형성과 대립인자 분포
한상현(Sang-Hyun Han),김재환(Jae-Hwan Kim),조인철(In-Cheol Cho),조상래(Sang-Rae Cho),조원모(Won-Mo Cho),김상금(Sang-Geum Kim),김유경(Yoo-Kyung Kim),강용준(Yong-Jun Kang),박용상(Yong-Sang Park),김영훈(Young-Hoon Kim),박세필(Se-Phil Pa 한국생명과학회 2012 생명과학회지 Vol.22 No.12
본 연구는 소 유전자 database들에 대한 사전 비교연구에서 발견된 삽입/결실(indel) marker들의 다형성과 각각의 유전자형의 분포를 확인하고자 수행하였다. 먼저, 소의 유전체 서열과 발현서열표식(EST) database 간의 생물정보학적 비교를 통해 전체 51 종의 indel marker들을 검출하였다. 이 중에서 42 종을 평가하여 최종적으로 9 종의 정보력이 있는 marker들을 집단분석을 위해 선발하였다. 각각의 marker들에 대한 염기서열을 재분석하였으며, marker의 다형성을 한국 재래소 품종인 한우와 제주흑우(JBC), Holstein, Angus, Charolais, Hereford 등 6 품종에서 조사하였다. 본 연구에서 이용한 소 6 품종은 8 종의 marker들에 대해 다형성을 나타내었으나, Indel_15의 경우 Holstein과 Charolais에서 다형성이 발견되지 않았다. JBC 집단에 대한 분석에서는 관찰된 이형 접합자 빈도는 HW_G1 (0.600)에서 가장 높고, Indel_29 (0.274)에서 가장 낮았다. Marker에 대한 다형정보량의 수준은 HW_G4 (0.373)에서 가장 높고, Indel_6 (0.305)에서 가장 낮은 수준을 보였다. 본 연구에서 조사한 새로운 indel marker들은 특히 제주흑우 집단의 생산성 향상을 위한 분자육종 체계의 개발뿐만 아니라 친자확인이나 생산이력추적을 위한 유전정보를 제공하는데 유용할 것으로 기대된다. The aim of this study was to screen the polymorphisms and distribution of each genotype of insertion/deletion (indel) markers which were found in a preliminary comparative study of bovine genomic sequence databases. Comparative bioinformatic analyses were first performed between the nucleotide sequences of Bovine Genome Project and those of xpressed sequence tag (EST) database, and a total of fifty-one species of indel markers were screened. Of these, forty-two indel markers were evaluated, and nine informative indel markers were ultimately selected for population analysis. Nucleotide sequences of each marker were re-sequenced and their polymorphic patterns were typed in six cattle breeds: Holstein, Angus, Charolais, Hereford, and two Korean native cattle breeds (Hanwoo and Jeju Black cattle). Cattle breeds tested in this study showed polymorphic patterns in eight indel markers but not in the Indel-15 marker in Charolais and Holstein. The results of analysis for Jeju Black cattle (JBC) population indicated an observed heterozygosity (Ho) that was highest in HW_G1 (0.600) and the lowest in Indel_29 (0.274). The PIC value was the highest in HW_G4 (0.373) and lowest in Indel_6 (0.305). These polymorphic indel markers will be useful in supplying genetic information for parentage tests and traceability and to develop a molecular breeding system for improvement of animal production in cattle breeds as well as in the JBC population.
김남영 ( Nam Young Kim ),신광윤 ( Kwang Ynu Shin ),이종언 ( Chong Eon Lee ),한상현 ( Sang Hyun Han ),이성수 ( Sung Soo Lee ),박용상 ( Yong Sang Park ),고문석 ( Moon Suck Ko ),홍현주 ( Hyun Ju Hong ),양재혁 ( Jae Hyuk Yang ),정덕지 한국동물자원과학회(구 한국축산학회) 2012 한국축산학회지 Vol.54 No.5
본 연구는 제주마 월라(Wolla) 모색의 백반형태 (Tobiano, frame Overo, sabino)에 대해 유전학적 특성을 구명하고자 수행하 였다. 제주마 376두 (월라 142두, 비월라 234두)에 대해 Tobiano 모색 확인을 위해 ECA3-inversion을 분석하였으며, frame Overo 모색은 EDNRB 2-bp 염기치환 상태를 확인하였고, sabino 모색 인자형 확인은 KIT intron 16 SNP를 분석하였다. 제주마 월라 모 색 개체에서 ECA3-inversion 유전자형이 +/To 이형접합 형태가 140두 (0.986), To/To 동형접합 형태 2두 (0.013)가 나타나 제주마 월라 모두에서 ECA3-inversion이 확인되었다. 반면에 EDNRB와 KIT intron 16 SNP에서는 frame Overo나 sabino 인자는 나타나 지 않았다. 제주마 비월라에서는 ECA3-inversion, EDNRB 그리고 KIT intron 16 SNP에서 백반형태와 관련된 인자는 나타나지 않았 다. 따라서, 본 연구 결과 제주마 월라(Wolla) 모색은 모색 유전학 적 분류에서 Tobiano 모색 유형에 속하는 것으로 사료된다. This study was carried out to define the "Wolla" coat color using 376 Jeju registered horses (white patched 142, solid coat color 234). Three major factors related to the white patches i.e ECA3-inversion for Tobiano, EDNRB 2 bp nucleotide substitution for frame Overo, and the KIT intron 16 single nucleotide polymorphism (SNP) for Sabino types of coat color were analyzed. It was found that out of 142 Jeju horses with white patches that have the genotype for ECA3-inversion (To) 140 horses were +/To heterozygous and 2 horses were To/To homozygous all Jeju horses with white patches had ECA3-inversion allele. However, there was no frame Overo or Sabino allele type in EDNRB and KIT intron 16 SNP in Jeju horses with white patches. As for 234 Jeju horses with a solid coat color, there was no ECA3-inversion allele related to the white patches. Thus, it could be considered that Wolla coat color with white patches in Jeju horses might have come from the Tobiano line in the genetic classification by coat color.
일부 종합검진 수검자 중 비알코올성 지방간과 심혈관질환 위험요인과의 관련성
유재희,이강숙,이선영,홍아름,박용상,Yu, Jae-Hee,Lee, kang-Sook,Lee, Seon-Young,Hong, A-Rum,Park, Yong-Sang 대한예방의학회 2008 예방의학회지 Vol.41 No.6
Objectives: The purpose of this study was to evaluate the relationship of nonalcoholic fatty liver and cardiovascular risk factors. Methods: This study was conducted to investigate the association of nonalcoholic fatty liver and cardiovascular risk factors for adult men (n=2976) and women (n=2442) who were over 19 years old, after excluding the HBsAg(+) or anti-HCV(+) patients and the men and women with increased alcohol intake (men: 40g/week, women: 20g/week). Results: Compared with the normal liver subjects, the nonalcoholic fatty liver subjects showed a significantly increased frequency of abnormal systolic blood pressure (${geq}120mmHg$), fasting blood sugar (${\geq}100mg/dL$), total cholesterol ($({\geq}200 mg/dL$), triglyceride ($({\geq}150mg/dL$), high density lipoprotein cholesterol (<40 mg/dL), low density lipoprotein cholesterol ($({\geq}130g\; m/dL$) and abdominal obesity in men, and all these measures were significantly increased in the women except for abnormal HDL cholesterol. After adjusting for the body mass index, age, smoking, exercise and a nonalcoholic liver, the odds ratios of an abnormal waist hip ratio were 1.35(95% Confidence Interval=1.05-4.72) in the mild fatty liver, 1.61 (1.19-2.18) in the moderate fatty liver, 2.77(1.57-4.92) in the severe fatty liver compared with a normal liver. The adjusted odds ratios for abnormal fasting blood sugar were 1.26(1.03-1.53) in the mild fatty liver, 1.62(1.27-2.06) in the moderate fatty Iiver and 1.77(1.12-2.78) in the severe fatty liver. The adjusted odds ratios for abnormal triglyceride were 1.38(1.11-1.72) in the mild fatty liver, 1.73(0.33-2.24) in the moderate fatty liver and 1.91 (1.17-3.10) in the severe fatty liver of men. Adjusted odds ratios for abnormal triglyceride were 1.50(1.04-2.15) in mild, 1.71(1.07-2.68) in moderate, 1.81(0.69-4.38) in severe fatty liver of women. Conclusions: The nonalcoholic fatty liver subjects had more cardiovascular risk factors compared with the normal liver subjects. Thus, prevention and treatment of the nonalcoholic fatty liver is necessary by lifestyle modifications such as restriction of alcohol intake, no smoking, exercise and adequate eating habits.
제주재래흑돼지와 Landrace, 교배집단 F<SUB>2</SUB>에서 척추의 수적 변이와 도체형질의 상관관계
조인철(In-Cheol Cho),김상금(Sang-Keum Kim),김유경(Yoo-Kyung Kim),강용준(Yong-Jun Kang),양성년(Sung-Nyun Yang),박용상(Yong-Sang Park),조원모(Won-Mo Cho),조상래(Sang-Rae Cho),김남영(Nam-Young Kim),채현석(Hyun-Seok Chae),성필남(Pil-Nam 한국생명과학회 2013 생명과학회지 Vol.23 No.7
포유류 중 돼지의 척추 중 요추, 흉추의 수는 고정되지 않은 형질로 개체간의 차이를 나타내는 것으로 알려져 있다. 본 연구는 제주재래흑돼지와 Landrace, 두 품종 간 F<sub>2</sub> 교배집단에서 경추 수, 흉추 수, 요추 수, 척추 수 등 체형관련 형질과 도체형질의 상관관계를 살펴보기 위해 수행되었다. 세 축군 모두 경추 수의 변이는 나타나지 않았으나, 흉추 수, 요추 수, 척추 수는 상이한 양상을 보였다. 도체형질의 성적과 요추 수만이 세 축군들 사이에서 통계적인 유의성을 나타내지 않았고(p>0.05), 도체중, 육색, 근내지방도, 등심단면적, 등지방두께, 도체장, 흉추 수, 척추 수 등은 통계적인 유의성을 나타내었다(p<0.05). 제주재래흑돼지는 흉추 수 14-16 개, 요추 수 5-6 개, 척추 수 27-29 개의 범위, Landrace는 흉추 수 15-16 개, 요추 수 5-7 개, 전체 척추 수 28-29 개, F<sub>2</sub> 교배집단은 흉추 수 14-17, 요추 수 5-7 개, 전체 척추 수 27-30 개로 확인되었다. F<sub>2</sub> 교배집단에서 흉추 수와 척추 수의 증가는 도체중, 도체장, 등지방두께의 평균이 유의적으로 다른 양상을 보인다(p<0.05). 또한 척추 수의 증가는 요추 수의 증가보다 흉추 수의 증가에 더 많은 영향을 받는 것으로 나타났다. 흉추 수 및 척추 수의 증가가 등지방두께를 점점 두껍게 만들기는 하지만, 도체중과 도체장 등 경제성을 결정하는 핵심적인 도체형질을 향상시킨다는 점은 추후 제주재래흑돼지나 Landrace 품종을 활용한 양돈산업에서 체형개선을 통한 생산성 증가를 유발할 수 있는 좋은 전략이 될 것으로 판단된다. The number of thoracic and lumbar vertebrae is known to be an unfixed trait among mammals. This study focused on the relationship between numerical variations of cervical (CER), thoracic (THO), and lumbar (LUM) vertebrae and the total number of vertebrae (TNV) and carcass traits in Jejunative black pigs (JBPs), Landrace pigs, and their intercrossed F<sub>2</sub> population. There were no numerical variations in CER vertebrae. On the other hand, the numbers of THO and LUM vertebrae and the TNV varied in all three populations. Of the traits investigated in the three populations, only the means±SE of the LUM vertebrae did not show statistical significance (p>0.05). The carcass weights (CW), meat color (MC), marbling score (MS), backfat thickness (BFT), carcass length (CLE), THO vertebrae, and TNV all showed statistical significance (p<0.05). The JBP had 14-16 THO vertebrae, 5-6 LUM vertebrae, and 27-29 TNV. The Landrace pigs had 15-16 THO vertebrae, 5-7 LUM vertebrae, and 28-29 TNV. The F<sub>2</sub> population had 14-17 THO vertebrae, 5-7 LUM vertebrae, and 27-30 TNV. In the F<sub>2</sub> population, increased numbers of THO vertebrae and TNV were associated with a significant increase in the CW, CLE, and BFT (p<0.05). In particular, the increase in the TNV was caused by an increase in the number of THO rather than LUM vertebrae. Although the animals with a greater number of THO and TNV had thicker backfat, they had a longer CLE and a heavier CW. Both these traits are economically more important than the level of backfat when determining the productivity level. These results suggest that genetic selection to increase the number of vertebrae, especially in Landrace pigs, JBPs, and their related populations, may be an excellent strategy for improving productivity.