XML 질의의 수행성능 향상을 위한 트리 구조 XPath 질의의 축약 기법에 관한 연구

이민수,김윤미,송수경,Lee, Min-Soo,Kim, Yun-Mi,Song, Soo-Kyung 한국정보처리학회 2007 정보처리학회논문지D Vol.14 No.6

일반적으로 XML 데이터는 트리 형태의 계층적인 구조를 가지고 있으며, XML 데이터의 저장 및 검색도 이러한 특성을 반영한다. 따라서 XML 데이터를 데이터베이스화 할 때에 XML 엘리먼트 간의 이러한 계층 관계를 반영하여 XML 데이터를 구조화하여 저장하고, 사용자의 검색을 지원하기 위해서는 질의에 명세 된 엘리먼트 구조 간의 계층 관계를 계산하여 처리하는 방법이 필요하다. 구조적 조인(structural joins) 연산은 이 문제의 한 해결책으로서 노드 번호 매기기 방식(node numbering scheme)에 기반한 XML 데이터베이스에 대하여 효율적인 계층 관계 연산 기법을 제시하고 있다. 하지만 계층 관계가 복잡하게 중첩되어 있는 트리 구조의 XML 질의를 처리하려면 여전히 다수의 구조적 조인을 수행해야 하기 때문에 질의 처리 비용이 많이 드는 또 다른 문제를 갖게 된다. 이에 본 논문에서는 선행 연구에서 제안된 트리 구조의 XML 질의 처리시에 필요한 다수의 중첩된 구조적 조인들의 수행비용을 효과적으로 줄이기 위한 사전 처리 방법으로서 동등 클래스 개념을 적용한 정규 표현식(regular expression)으로 된 경로 질의(path query)의 길이를 단축하는 경로식 단축 알고리즘을 소개하며 특히 분기 노드(branch node)가 포함된 경로식 단축 알고리즘을 제안한다. 제안한 알고리즘이 XML 경로식 질의 처리 시간을 평균적으로 1/3로 단축할 수 있음을 실험을 통해서 확인한다. XML data generally consists of a hierarchical tree-structure which is reflected in mechanisms to store and retrieve XML data. Therefore, when storing XML data in the database, the hierarchical relationships among the XML elements are taken into consideration during the restructuring and storing of the XML data. Also, in order to support the search queries from the user, a mechanism is needed to compute the hierarchical relationship between the element structures specified by the query. The structural join operation is one solution to this problem, and is an efficient computation method for hierarchical relationships in an in database based on the node numbering scheme. However, in order to process a tree structured XML query which contains a complex nested hierarchical relationship it still needs to carry out multiple structural joins and results in another problem of having a high query execution cost. Therefore, in this paper we provide a preprocessing mechanism for effectively reducing the cost of multiple nested structural joins by applying the concept of equivalence classes and suggest a query path reduction algorithm to shorten the path query which consists of a regular expression. The mechanism is especially devised to reduce path queries containing branch nodes. The experimental results show that the proposed algorithm can reduce the time requited for processing the path queries to 1/3 of the original execution time.

정신분열병 환자에서 Cytochrome P450 2D6 유형에 따른 부작용에 대한 연구

이민수,남종원,Lee, Min Soo,Nam, Jong Won 대한생물정신의학회 1999 생물정신의학 Vol.6 No.2

The genetically determined CYP2D6 activity may be considered to be associated with antipsychotic induced extrapyramidal side effects with interindividual variation. Genetic polymorphism of CYP2D6 was determined by polymerase chain reaction(PCR) and MspI restriction fragment length polymorphisms(RFLP) for 194 schizophrenics. Subjects with a 334bp band were classified a1a1, those with 229bp and 105bp bands a2a2, and those with all three bands a1-a2. We did not identify schizophrenic subject with poor metabolizer. 194 schizophrenic patients previously treated neuroleptic medication, were assessed by Extrapyramidal Symptom Rating Scale(ESRS).The cases were composed of 33 akathisia, 47 parkinsonism, 21 tardive dyskinesia. These results are similar to the previous understanding that the poor metabolizer is very rare in Orientals compared to Caucasians, therefore, it considered that CYP2D6 genotypes have maybe no association with schizophrenia and extrapyramidal side effects in Koreans.

DNA Chip 데이터의 군집화 성능 향상을 위한 Particle Swarm Optimization 알고리즘의 적용기법

이민수,Lee, Min-Soo 한국정보처리학회 2010 정보처리학회논문지D Vol.17 No.3

최근 DNA 칩의 등장으로 유전자 관련 실험과 연구가 매우 용이해졌으며 이를 활용한 다양한 실험 결과로 대량의 데이터가 제공되고 있다. DNA칩에 의해 제공된 데이터는 2차원 행렬로 표현되며 하나의 축은 유전자를 나타내고 다른 하나의 축은 샘플정보를 나타낸다. 이러한 데이터에 대하여 빠른 시간 안에 좋은 품질의 군집화를 수행함으로써 이후의 분석 단계인 분류화 작업의 정확도와 효율성을 높일 수 있다. 본 논문에서는 생태계 모방 알고리즘의 하나인 Particle Swarm Optimization 알고리즘을 사용하여 방대한 양의 DNA칩 데이터에 대한 효율적인 군집화 기법을 제안하였으며 실험을 통해서 PSO 기반의 군집화 알고리즘이 기존의 군집화 알고리즘들보다 수행속도 및 품질 면에서 우수한 성능을 가짐을 보였다. Experiments and research on genes have become very convenient by using DNA chips, which provide large amounts of data from various experiments. The data provided by the DNA chips could be represented as a two dimensional matrix, in which one axis represents genes and the other represents samples. By performing an efficient and good quality clustering on such data, the classification work which follows could be more efficient and accurate. In this paper, we use a bio-inspired algorithm called the Particle Swarm Optimization algorithm to propose an efficient clustering mechanism for large amounts of DNA chip data, and show through experimental results that the clustering technique using the PSO algorithm provides a faster yet good quality result compared with other existing clustering solutions.

Fluoxetine과 Haloperidol의 병합투여시 정신병리 및 추체외로 증상의 변화

이민수,한창수,김제원,원경식,곽동일,Lee, Min-Soo,Han, Chang-Su,Kim, Jae-Won,Won, Kyung-Sik,Kwak, Dong-Il 대한생물정신의학회 1997 생물정신의학 Vol.4 No.1

본 연구는 정신분열증 환자 38명을 대상으로 하여 haloperidol과 fluoxetine을 8주간 병합투여 하였고, PANSS, CGI, Simpson-Angus 척도를 투여전과 투여후 2, 4, 6, 8주에 시행하여 임상증상 및 추체외로 부작용을 평가하였다. 결과는 다음과 같다. 1) 8주간의 연구기간동안 양성, 음성증상의 유의한 변화가 없었다. 2) 8주의 연구기간동안 추체외로 부작용의 증가가 나타나지 않았다. 이는 기존 연구에서 fluoxetine에 의해 haloperidol의 혈중농도가 증가하여 효과 및 부작용이 증가한다는 연구보고와는 다르며, 이 결과는 haloperidol과 fluoxetine의 병합사용을 안전하게 할 수 있다는 것을 의미한다고 하겠다. Objectives : The authors have intended to know the drug interaction of fluoxetine and haloperidol when coadministering two drugs to the chronic schizophrenics by assessing the changes of positive, negative symptoms and extrapyramidal symptoms. Method : We selected 38 patients, the chronic schizophrenics with no physical problems. they are randomly assigned to placebo group and drug group. And then, placebo or fluoxetine 20mg were administered to the subjects of each group during 8 week period. We have assessed their psychopatholgy and extrapyramidal symptoms using Positive and Negative Syndrome Scale(PANSS), Clinical Global Impression(CGI), Simpson-Angus Scale at 0, 2, 4, 6, 8 week during the period. Results : 38 patients have completed the study during 8 weeks. 1) PANSS, CGI : no significant difference between groups and no significant change according to the times. 2) Simpson-Angus Scale : no significant changes. Conclusion : When co-administering fluoxetine and haloperidol, there were no significant changes of psychopathology and extrapyramidal symptoms. These results suggest that it is safe to coadminister fluoxetine to schizophrenic patients with haloperidol treatmemt.

특징 추출과 분석 기법에 기반한 단백질 상호작용 데이터 신뢰도 향상 시스템

이민수,박승수,이상호,용환승,강성희,Lee, Min-Su,Park, Seung-Soo,Lee, Sang-Ho,Yong, Hwan-Seung,Kang, Sung-Hee 한국정보처리학회 2006 정보처리학회논문지B Vol.13 No.7

대용량 실험으로부터 산출된 단백질 상호작용 데이터는 위양성(false positive) 데이터의 비율이 높다는 단점을 가지고 있다. 본 논문에서는 오류가 섞여있는 단백질 상호작용 데이터를 입력으로 받아 각 단백질 상호작용의 신뢰도를 검증하는 시스템을 제안하고 구현하였다. 제안 시스템은 단백질 상호작용 데이터에 상호작용의 근거로서 사용될 수 있는 다양한 생물학적 특징들에 관한 데이터를 통합하고 특징 선택 방법을 사용하여 통합된 속성들 중 위양성 여부를 판별하는데 가장 적합한 특징들을 선택한 후 데이터 마이닝 분류 알고리즘을 적용하여 대용량 실험으로부터 산출된 단백질 상호작용 데이터의 신뢰도를 평가한다. 특징 선택의 결과와 분류 기법의 성능은 데이터 특성에 매우 의존하므로, 제안시스템에 가장 적합한 속성 부분집합과 가장 좋은 성능을 내는 분류 알고리즘을 찾기 위해 다양한 특징 선택 방법과 데이터 마이닝 분류 알고리즘들을 적용하고 그 성능을 다각적으로 비교분석 하였다. 실험 결과, 특징 선택 방법과 분류 알고리즘을 결합시킨 제안 시스템은 오류 데이터가 섞여있는 단백질 상호작용 데이터에서 실제로 상호작용하는 단백질 쌍을 골라내는 작업에 있어 기존 연구들에 비해 매우 뛰어난 성능을 보여줬다. 또한 본 연구를 통해 단백질 상호작용 데이터의 신뢰도를 검증함에 있어서 다양한 특징 선택 방법들과 분류 알고리즘들이 성능에 미치는 영향에 관해서도 정리할 수 있었다. Protein-protein interaction data obtained from high-throughput experiments includes high false positives. In this paper, we introduce a new protein-protein interaction reliability verification system. The proposed system integrates various biological features related with protein-protein interactions, and then selects the most relevant and informative features among them using a feature selection method. To assess the reliability of each protein-protein interaction data, the system construct a classifier that can distinguish true interacting protein pairs from noisy protein-protein interaction data based on the selected biological evidences using a classification technique. Since the performance of feature selection methods and classification techniques depends heavily upon characteristics of data, we performed rigorous comparative analysis of various feature selection methods and classification techniques to obtain optimal performance of our system. Experimental results show that the combination of feature selection method and classification algorithms provide very powerful tools in distinguishing true interacting protein pairs from noisy protein-protein interaction dataset. Also, we investigated the effects on performances of feature selection methods and classification techniques in the proposed protein interaction verification system.

폐렴사슬알균 수막염 환자에서 발생한 양안 내인성 안내염 1예

이민수,장무환,Min Soo Lee,Moo Hwan Chang 대한안과학회 2013 대한안과학회지 Vol.54 No.2

Purpose: To report a case of bilateral endogenous endophthalmitis in a Streptococcus pneumoniae meningitis patient. Case summary: A 45-year-old woman with bacterial meningitis was referred to the ophthalmologic clinic with acute visual impairment in both eyes. The patient`s visual acuities were hand motion in both eyes. Ophthalmoscopy revealed inflammation in the anterior chamber and vitreous opacities in both eyes. Streptococcus pneumoniae was isolated in the cerebrospinal fluid sample, but not in vitreal, blood samples. Vision improved to 70/100 in the right eye and 2/100 in the left eye after 8 days of treatment. Conclusions: Endogenous endophthalmitis constitutes a rare complication of Streptococcus pneumoniae meningitis, and a prompt diagnosis and administration of empirical intravitreal antibiotics can lead to a more favorable visual prognosis.

세로토닌 재흡수억제제의 약리학과 임상적용

이민수,김표한,Lee, Min-Soo,Kim, Pyo-Han 대한생물정신의학회 1995 생물정신의학 Vol.2 No.2

1) Paroxetine이 5-HT흡수에 가장 강력하고, 선택적이었으며, 그 다음이 fluvoxamine, sertraline, fluoxetine순이었고, sertraline은 다른 SSRIs와는 달리 NE보다 DA억제작용이 더 강했다. 2) Paroxetine이 muscarinic cholinergic 수용체에 대한 친화력이 다소 높았을 뿐, 전반적으로 SSRIs는 histamine $H_1$과 ${\alpha}_1$에 대한 친화력은 약했다. 3) Paroxetine은 ${\beta}$-adrenoceptor와 cyclic AMP에 영향을 미치지 않는 반면, sertraline은 ${\beta}$-adrenoceptor와 cyclic AMP의 감소를 가져왔다. 4) SSRIs의 생체이용율은 대략 50%이었으며, 투약후 2~8시간 사이에 최고혈중농도에 도달하였으며, 특히 sertraline은 음식물과 같이 복용시 혈장의 concentration time curve와 최고 농도를 증가시켰다. 5) Sertraline은 혈중농도가 용량에 비례하였으며, 모든 SSRIs는 비교적 큰 용량분포를 보이고, 높은 비율로 혈장 단백질과 결합되어 있었다. 6) Fluoxetine 대사물의 5-HT 억제 작용이 제일 강했다. 그러나 paroxetine, fluoxetine, sertraline 대사물은 강도는 서로 다르지만 간의 isoenzyme IID6를 억제하며, 그 중에서 paroxetine의 억제작용이 제일 강력하다. 7) Sertraline은 TCAs나 haloperidol과 병합사용시 TCAs나 haloperidol의 혈중농도의 유의한 변화가 없었으며, MAOI A형인 moclobemide와 비교적 안전하게 병용 치료할 수 있다. 8) SSRIs는 TCAs와 비교해볼 때 치료효과는 유사하였으나 fluvoxamine은 자살사고에, paroxetine은 우울중에서 나타나는 불안과 운동성 초조증에 효과적이다. 9) 급성 우울증 삽화시 현저한 효과를 보인 후 적어도 4개월 이상의 유지치료기간이 필요하다. 10) SSRIs는 위장관계통의 부작용이 가장 많았고, 부작용은 일반적으로 분복한 경우가 적었다. In comparison with tricyclic antidepressants(TCAs), one of the most interesting characteristics of selective serotonin reuptake inhibitors(SSRIs) is its structural differences, reveals different pharmacological properties. The applications at the moment are most effective in clinical applications to depression. The limited result of the research to date on the various applications of SSRIs has not revealed the total potential and applicability of SSRIs. Therefore, attending physicians utilizing SSRIs do not know the full capabilities of the drug on patients and what the patients may reap in terms of benefit from its curing elements. Physicians must first try to understand the full potential of SSRIs and its potential applications for it to be effective on patients. recently, it has been determined that SSRIs and other drugs when administered together may be more effective in the healing process because SSRIs complements and aids in the enhancement and effect of the other drugs. This article is written to give attention to the reader of the pharmacological properties and the clinical use of SSRIs. It is the authors's hope that continuous research on the particular aspects of SSRIs can aid the clinicians in the use of this SSRIs.

우세안과 비우세안의 망막신경섬유층 두께, 시신경유두 형태 비교

이민수,조경진,조우형,경성은,장무환.Min Soo Lee. MD. Kyong Jin Cho. MD. Woo Hyung Cho. MD. Sung Eun Kyung. MD. PhD.Moo Hwan Chang. MD. PhD 대한안과학회 2013 대한안과학회지 Vol.54 No.5

Purpose: To investigate the comparison of retinal nerve fiber layer (RNFL) thickness and optic disc parameters measured by optical coherence tomography (Cirrus HD-OCT<sup>®) in dominant and non-dominant eyes. Methods: Seventy-one subjects without underlying ocular disease were recruited for the present study. Ocular dominance was determined using the hole-in-the-card test. Comprehensive standardized eye examinations were performed. Scans of the optic disc and RNFL were performed using OCT. Results: The mean intraocular pressure (IOP) of the dominant eye was higher than its counterpart (p = 0.025). No significant differences were observed in uncorrected visual acuity, refractive error and axial length between dominant and non-dominant eyes (p = 0.235, 0.180, 0.850). No RNFL and optic disc features were identified in the dominant from non-dominant eyes. Conclusions: Although dominant eyes tended to have higher IOP than non-dominant eyes, no consistent ocular structural differences between dominant and non-dominant eyes with the use of OCT were found.

중력금형주조에서 기공량에 미치는 경동속도 및 경동각도의 영향

이민수,김기영,김성우 ( Min Soo Lee,Ki Young Kim,Sung Woo Kim ) 한국주조공학회 1994 한국주조공학회지 Vol.14 No.4

N/A Gas is prone to be entrapped in the casting resulting from the reaction of molten metal with mold coating material and resin hardened sand cores during filling in gravity diecasting of aluminum alloys with complex shape. Tilted pouring is known to be one of the method to eliminate the gas defect, in which tilting speed and angle are important as operation variables. Transparent water model was employed to observe the gas entrapment and liberation during pouring of complex shaped casting in this study. As a result, slow tilting combined with movable pouring ladle is recommended to evolute gas effectively in gravity diecasting.

세로토닌 수송체와 기분장애

이민수,Lee, Min Soo 대한생물정신의학회 2001 생물정신의학 Vol.8 No.2

As numbers of serotonin's function are so many, studies of serotonin are numerous nowadays. In the beginning, concentration of metabolites such as 5-HIAA was a key issue, but recent studies have been challenged for serotonin receptor genes and their relation to mood disoder. Serotonin transporter(5-HTT) gene is a strong candidate gene of mood disoder for following reason. Serotonin transporter is a key protein in the serotonin pathway as it regulate the concentration of serotonin in the synaptic clept and essential pathophysiology of depression is dysregulation of 5-HTT so that all antidepressants have effect of 5-HTT antagonist. The decrease of 5-HTT in the platelet and in brain of the depressive patients is much consistent results in the studies of the pathophysiology of mood disorder till now. By this, we will be able to develop simple and easy marker for diagnosis, type, and treatment monitoring of depression. Many psychiatrists have sought the independent genes in relation to depression or schizophrenia. Obviously, the hereditary vulnerability contributes to etiology of mood disorders, but it is difficult to discriminate the independent genes because of many environmental factors. Moreover, in the hereditarily complex diseases such as mood disorder, the only vulnerability of gene can not sufficiently explain the etiology. In the future, to exclude the role of the gene-environmental interaction, the methods such as gene transfer can be considered. In the opposite direction, by using the gene destruction method, the role of target genes can be examined. As yet the concept of the gene expression, neural plasticity, neurogenesis and etc, is the elementary stage. The development of this field will help to establish the treatment strategy of chronic and refractory mood disorders.