Enterobacter cloaceae K41 plasmid의 중금속 저항성

김영희,이상준,정영기,정경태,Kim Young-Hee,Lee Sang-Jun,Jeong Yong-Kee,Chung Kyung-Tae 한국생명과학회 2005 생명과학회지 Vol.15 No.4

담수 식물 수초의 근계에 부착하는 미생물 중 중금속에 높은 저항성을 가지는 균을 분리하고 이들 중 Enterobacter cloaceae K41를 대상으로 생육최적조건을 검토한 결과는 LB배지에 $1\%$ yeast extract, $1\%$ lactose, $1\%$ NaCl, pH7.0, 최적 온도는 $37^{\circ}C$, 24시간 진탕배양 이었으며 중금속 첨가 시에는 침전을 막기 위하여 Nutrient 배지로 대체하였다. 이 분리균주와 표준균주인 Enterobacter cloaceae KCTC2519를 대상으로 중금속인 구리와 카드뮴이온에 대한 최소생육저지농도(MIC)를 비교한 결과 분리균주인 E. cloacear K41은 구리는 150 ppm, 카드뮴은 50 ppm농도까지 생육이 확인되었으나 표준균주는 구리 50ppm에서 생육이 확인되었으나 카르뮴이나 두 혼합 중금속에서는 확인되지 않는 차이를 나타내었다. 두 균주를 대상으로 유전적 성상을 비교한 결과 분리균주에선 plasmid가 검출되었으나 표준균주에는 없었다. 그리고 분리균주에서 6.4Kb 절편의 plasmid를 분리하여 구리, 카드뮴의 중금속에 민감한 균주인 E, coli $DH5{\alpha}$에 형질전환 시켜 생육에 영향을 미치는 정도를 비교하였다. 그 결과 형질전환 균주의 두 중금속에 대 한 최소생육저지농도가 구리는 7배, 카드뮴은 6배로 증가한 것을 알 수 있었다. 또한 중금속 흡착률은 형질전환 균주가 E. ccli $DH5{\alpha}$보다 구리가 1.3배, 카드뮴은 1.5배 증가함을 알 수 있었다. 따라서 이 plasmid가 중금속 저항성을 증가시키는데 관여하는 것으로 보였다. A natural habitat bacterium, Enterobacter cloaceae K41 was isolated from fresh water plant root and identified. This strain was used to investigate heavy metal resistance. The optimal growth conditions of the bacterium were LB medium containing$1\%$ yeast extract, $1\%$ lactose, $1\%$ NaCl, pH 7.0, at $37^{\circ}C$, and for 24 hours on a shaker. The minimal inhibitory concentration (MIC) of heavy metals against E. cloaceae KCTC2519 and E. cloaceae K41 was compared. The MIC of E. cloaceae K41 was 150 ppm in Cu, 50 ppm in Cd whereas that of the standard strain was 50 ppm in Cu but no growth was observed either Cd or two mixed heavy metal solution. The presence of plasmid was cleared from the isolated strain whereas no possession from the standard strain. The plasmid from E. cloaceae K41 was transformed into E. coli $DH5{\alpha}$. The MIC of transformed strain increased resistance 7 times in Cu and 6 times in Cd by insertion of this plasmid. The metal adsorption of the transformant was increased 1.3 times in Cu and 1.5 times in Cd indicating the plasmid was responsible for heavy metal resistance.

삼중대각행렬 시스템 풀이의 빠른 GPU 구현

김영희,이성기,Kim, Yong-Hee,Lee, Sung-Kee 한국정보과학회 2005 정보과학회논문지 : 시스템 및 이론 Vol.32 No.11

컴퓨터 하드웨어의 급속한 발전으로 그래픽 프로세서 유닛(Graphics Processor Units : GPUs)은 굉장한 메모리 대역폭과 산술 능역을 보유하게 되어 범용 계산에 많이 활용되고 있으며, 특히 계산 집약적인 물리 기반 시뮬레이션(physics based simulation)의 GPU 구현이 활발하게 연구되고 있다. 물리 기반 시뮬레이션의 기본이 되는 미분방정식 풀이 과정에서 삼중대각행렬(tridiagonal matrix) 시스템은 유한차분(finite-difference) 근사에 의해서 자주 나타나는 선형시스템으로 물리 기반 시뮬레이션 관점에서 삼중대각행렬 시스템의 빠른 풀이는 중요한 연구 분야이다. 본 논문에서는 GPU에서 삼중대각행렬 시스템 풀이를 빠르게 구현할 수 있는 방법을 제안한다. 벡터 프로세서(vector processor) 계산에서 삼중대각행렬 시스템 풀이 방법으로 널리 사용되는 cyclic reduction 또는 odd-even reduction 알고리즘을 GPU에서 구현하였다. 본 논문에서 제안한 방법을 삼중대각행렬 시스템 풀이 방법으로 잘 알려져 있는 Thomas 방법과 GPU를 이용한 선형시스템 풀이에서 좋은 성과를 보이고 있는 conjugate gradient 방법과 비교할 때 상당한 성능 향상을 얻을 수 있었다. 또한, 열전도(heat conduction) 방정식, 이류 확산(advection-diffusion) 방정식, 얕은 물(shallow water) 방정식에 의한 물리 기반 시뮬레이션의 GPU 구현에 본 논문에서 제안한 방법을 사용하여 1024x1024 격자의 계산 영역에서 초당 35프레임 이상의 놀라운 성능을 보여주었다. With the improvement of computer hardware, GPUs(Graphics Processor Units) have tremendous memory bandwidth and computation power. This leads GPUs to use in general purpose computation. Especially, GPU implementation of compute-intensive physics based simulations is actively studied. In the solution of differential equations which are base of physics simulations, tridiagonal matrix systems occur repeatedly by finite-difference approximation. From the point of view of physics based simulations, fast solution of tridiagonal matrix system is important research field. We propose a fast GPU implementation for the solution of tridiagonal matrix systems. In this paper, we implement the cyclic reduction(also known as odd-even reduction) algorithm which is a popular choice for vector processors. We obtained a considerable performance improvement for solving tridiagonal matrix systems over Thomas method and conjugate gradient method. Thomas method is well known as a method for solving tridiagonal matrix systems on CPU and conjugate gradient method has shown good results on GPU. We experimented our proposed method by applying it to heat conduction, advection-diffusion, and shallow water simulations. The results of these simulations have shown a remarkable performance of over 35 frame-per-second on the 1024x1024 grid.

어병균 Vibrio anguillarum 생육 저해 인자를 생산하는 Bacillus amyloliquefaciens H41의 분리

김영희,정영기,정경태,류은주,정유정,Kim, Young-Hee,Jeong, Yong-Kee,Chung, Kyung-Tae,Rhu, Eun-Ju,Jeong, Yu-Jeong 한국생명과학회 2006 생명과학회지 Vol.16 No.4

양식 산업의 문제점인 어병균을 방제하기 위한 생물 전구체의 개발을 목적으로 해산어의 내장 추출물에서 어병균인 Vibrio anguillarum의 생육을 저해하는 새로운 균주를 분리, 동정하여 Bacillus amyloliquefaciens H41으로 명명하고 생육특성 및 생육저해인자 생성 조건을 검토하였다. 분리 균의 생육 최적 조건은 기본배지로 1% peptone, 질소원으로 1.5% yeast extract, 탄소원으로 1% sucrose, 0.5% NaCl, 금속이온으로는 0.05% $MgSO_4{\cdot}7H_20$이었으며 pH는 7.0-8.0, 온도는 $28-35^{\circ}C$에서 20시간의 진탕배양이었다. V. anguillarum 생육 저해물질은 B. amyloliquefaciens H41의 배양 상등 액에서 볼 수 있었는데 paper-disk 법으로 투명환의 생성여부로 확인하였다. 분리 균에 의한 생육저해 물질 생산 최적 조건은 1% peptone, 1.5% yeast extract, 1% NaCl, 0.05% $MgSO_4{\cdot}7H_20$, 1%의 sucrose이었으며 최적 pH는 7.5, 최적온도는 $35^{\circ}C$이었다. 분리 균은 최적 배양조건하에서 저해물질을 배양 후 16시간부터 24시간대에 가장 높은 활성을 나타내었다. 저해 활성반응은 분리 균에서는 저해 활성을 나타내었으나 B. amyloliquefaciens KCTC1724 표준균주에는 저해활성을 나타나지 않는 대조를 보였다. 또한 분리 균에 의해 생산된 저해물질은 V. anguillarum 에는 생육 억제 효과를 나타내었으나 다른 인체 병원성 Vibrio에는 전혀 영향을 미치지 않는 것으로 나타나 균주 선택성이 특이적이었다. To investigate the possible use of probiont in fish farming industry, a bacterium with inhibitory effect against Vibrio anguillarum was isolated from gastrointestinal tract of the marine fish of yellow tail. It was identified to be Bacillus amyloliquefaciens H41 based on biochemical and physiological characterization. The optimal growth conditions of the isolated strain were 1% peptone, 1.5% yeast extract, 1% sucrose, 0.5% NaCl, 0.05% $MgSO_4{\cdot}7H_20$, pH 7.0-8.0, and 20 hr of incubation between $28-35^{\circ}C$ under aeration. The culture supernatant of the isolated strain showed inhibition activity against V. anguillarum. Inhibition activity was cleared by forming a clear zone by a paper-disk method. The maximal production of growth inhibition factor was induced by cultivation under 1% peptone, 1.5% yeast extract, 1% sucrose, 1% NaCl, 0.05% $MgSO_4{\cdot}7H_20$, pH 7.5 and at $35^{\circ}C$. The highest growth inhibition factor production was observed after 16-24 hr cultivation under aeration. The culture supernatant of the isolated strain showed inhibition activity whereas no inhibition activity was shown from the standard B. amyloliquefaciens KCTC 1724 strain. The growth inhibition affected only against V. anguillarum among other pathogenic Vibrios tested here.

연구논문 : 질소 - 프로판 - 공기 분위기에서 유동상 침탄특성

김영희,이상화,황용길 ( Young Hee Kim,Sang Hwa Lee,Yong Kil Whang ) 대한금속재료학회 ( 구 대한금속학회 ) 1991 재료.물성 심포지엄 Vol.- No.-

양자암호통신 테스트베드 구축과 활용방안에 관한 연구

김영희(Young Hee Kim),이용선(Lee Yong Sun),최진욱(Choi Jin Wook),장유환(Jang Yu Hwang),김정현(Kim Jung Hyun) 한국통신학회 2022 한국통신학회 학술대회논문집 Vol.2022 No.6

입도 개량된 부순골재를 사용한 콘크리트의 품질 특성

김영희(Kim, Young Hee),손호정(Son, Ho Jung),박민용(Park, Min Yong),김정빈(Kim, Jung Bin),한천구(Han, Cheon Goo),한민철(Han, Min Cheol) 한국콘크리트학회 2012 한국콘크리트학회 학술대회 논문집 Vol.2012 No.5

Specific Pathogen-Free BALB/c 마우스와 C57BL/6 마우스의 혈액학 및 혈액생화학 지표

김영희(Young-Hee Kim),이현숙(Hyun-Sook Lee),김용범(Yong-Beom Kim),임완중(Wan-Jung Im),임송(Song Lim),강부현(Boo-Hyon Kang) 한국실험동물학회 2005 Laboratory Animal Research Vol.21 No.3

Establishment of the basic data line is very important in the evaluation of the result of clinical and/or nonclinical experiments, in the improvement the confidence of test results. A reference range data base containing serum chemistry and hematology values in 5 weeks old BALB/c and C57BL/6 mice which were purchased from the different companies is described. Hematological parameters are white blood cell count, red blood cell count, hemoglobin concentration, hematocrit, mean corpuscular volume, mean corpuscular hemoglobin, mean corpuscular hemoglobin concentration, platelet count. In the BALB/c mice, there are significant differences observed between lots, sexes and strains. In the C57BL/6 mice, there are significant differences observed between lots and strains but no significant differences observed between sexes. Serum biochemistry parameters are aspartate aminotransferase, alanine aminotransferase, alkaline phosphatase, blood urea nitrogen, creatinine, glucose, total cholesterol, total bilirubin, total protein, albumin, triglyceride, calcium, inorganic phosphate, phospholipid, high density lipoprotein cholesterol, low density lipoprotein cholesterol, albumin globulin ratio, sodium, potassium, chloride. In both stains of mice, there are significant differences observed between lots, sexes and strains. Data from the present study will support in the proper interpretation and validation of these results.

위해성 평가를 위한 대학생들의 이산화질소 노출량 추정

김영희(Young-Hee Kim),김지현(Ji-Hyun Kim),양원호(Won-Ho Yang),송영웅(Young-Woong Song),윤충식(Chung-Sik Yoon),허용(Yong Heo) 한국실내환경학회 2006 한국실내환경학회지 Vol.3 No.1

Indoor air quality tends to be the dominant contributor to personal exposure, because most people spend over 80% of their time indoors. In this study, indoor and outdoor NO² concentrations were measured simultaneously with personal exposures of 30 university students in weekday and weekend in Daegu, Korea. House characteristics and subject"s activity pattern were used to determine the effects on personal exposure. Since university students spent most of their times indoor, their NO² exposure was associated with indoor NO² level during both weekday and weekend in spite of different time activity. Using a time-weighted average model, NO² exposures of university students were estimated by NO² measurements in indoor home, indoor school, and outdoor home. In conclusion, major personal exposure to NO² resulted from air quality of indoor environment at house.

저품위 잔골재와 부순잔골재의 혼합사용이 콘크리트의 특성에 미치는 영향

김영희(Kim, Young Hee),곽용진(Kwak, Yong Jin),김정빈(Kim, Jung Bin),한민철(Han, Min Cheol),양성환(Yang, Seong Hwan),한천구(Han, Cheon Goo) 한국콘크리트학회 2012 한국콘크리트학회 학술대회 논문집 Vol.2012 No.11

N-Linked Glycosylation 저해에 의한 닭의장풀 추출물의 미백효능

박선희 ( Sun Hee Park ),이방용 ( Bang Yong Lee ),이승현 ( Seung Hyun Lee ),한창성 ( Chang Sung Han ),김진국 ( Jin Guk Kim ),김경태 ( Kyoung Tae Kim ),김기호 ( Ki Ho Kim ),김영희 ( Young Heui Kim ) 대한화장품학회 2009 대한화장품학회지 Vol.35 No.1

닭의 장풀(Commelina communis L., Dayflower) 추출물의 미백효능을 확인하기 위하여 B16 melanoma 세포를 이용하여 melanin 생성에 관련된 다양한 실험을 실시하였다. 닭의장풀 추출물은 버섯 tyrosinase 활성 실험에서 저해 효과를 보이지 않았으나, melanin 생성 저해효과를 나타내었다. B16-F10 멜라노마 세포를 이용한 활성시험 결과에서, 닭의장풀 추출물은 1,000 ug/mL의 농도에서 약 32 %의 멜라닌 생성을 억제하였으며,세포내 티로시나제 활성 억제 능도 우수하여 닭의장풀 추출물 250 ug/mL 이상의 농도에서 50 % 이상의 저해 효과를 보였다. 추출물의 melanin 생성 기작에 대한 영향을 조사한 결과, melanin 합성의 key protein인 tyrosinase 발현의 우수한 저해 능력을 보였고,tyrosinase related protein-1 (TRP-1)의 발현 억제와 tyrosinase related protein-2 (TRP-2)의 N-glycosylation 억제를 통해 mela-nin 합성이 억제되는 것으로 분석되었다. 따라서 닭의장풀 추출물은 melanin 합성에 필수적인 효소(tyrosinase, TRP-1)의 발현 저해 및 TRP-2의 N-glycosylation 억제를 통해 미백 효과를 나타내는 것으로 확인되었으며, 이에 따라 본 추출 물은 melanin 합성의 효소 경로를 저해하는 미백 소재로 활용할 수 있을 것으로 사료된다. In order to investigate the potential of a Dayflower (Commelina communis L.) extract as an active ingredient for whitening cosmetics,we prepared aqueous Commelina communis L. extract We measured its mushroom tyrosinase inhibitory activity, cellular tyrosinase activity, and melanin synthesis inhibitory activity in B16 melanoma cells. It did not show inhibitory activity against mushroom tyrosinase but showed melanin synthesis inhibitory activity. In a melanin synthesis inhibition assay using mouse B16―F10 melanoma cell, it suppressed melanin production up to 32 % at a concentration of 1,000 ug/mL without cytotoxicity, and also reduced cellular tyrosinase activity to above 50 % above the concentration of 250 ug/mL. In study on the melanogenic protein expressions, it had especially influence on expression of tyrosinase protein, which is a well-known key protein on melanogenesis, and tyrosinase expression was gradually decreased in a dose-dependent. Dayflower also blocked Ar-glycosylation of TRP-2, but affected on the expression of TRP-1 rather than on blocking of N-glycosylation processing. Therefore, this result suggests that aqueous Commelina communis L. extract could be used as an active ingredient for whitening cosmetics.