DHPLC를 이용한 β₂-교감신경수용체 유전자에서의 돌연변이 분석

박상범,오충훈,김종완,장원철,Park, Sang-Bum,Oh, Chung-Hun,Kim, Jong-Wan,Jang, Won-Cheoul 한국분석과학회 2002 분석과학 Vol.15 No.3

본 연구에서는 ion-pair reversed-phase high performance liquid chromatography (IP-RP-HPLC)방식을 이용한 denaturing high performance liquid chromatography (DHPLC)방법을 사용하여 기관지 천식을 조절하는 ${\beta}_2$-교감신경수용체 유전자의 돌연변이를 검출하였다. 50명의 천식 환자의 혈액에서 genomic DNA를 추출하여 중합효소연쇄반응 (polymerase chain reaction, PCR)을 이용해 증폭하고, 그 산물을 DHPLC로 분석한 결과, 50개의 시료 가운데 15개 (30%)의 돌연변이를 검출하였다. 최종적으로 유전자 염기서열결정법을 통해 DHPLC의 돌연변이 검출률이 정확함을 확인하였다. We analysed mutation of ${\beta}_2$-adrenergic receptor gene that controls bronchial asthma by denaturing high performance liquid chromatography (DHPLC) according to ion-pair reversed-phase high performance liquid chromatography (IP-RP-HPLC). We extracted genomic DNA from 50 asthma patients, amplified DNA using PCR, and analysed PCR product by DHPLC. As a result, we obtained that mutation frequency was 15 (30%) among 50 cases. Consequently DHPLC mutation detection was confirmed that the result of direct sequencing was coincide exactly.

한국인 베체트 환자의 분자유전학적 연구

박상범,남윤형,박수민,이상현,안영창,조민호,김종규,최재구,김성규,장원철,Park, Sang-Bum,Nam, Youn-Hyoung,Park, Su-Min,Lee, Sang-Hyun,Ahn, Young-Chang,Cho, Min-Ho,Kim, Jong-Gyu,Choi, Jae-Gu,Kim, Seong-Kyu,Jang, Won-Cheoul 대한화학회 2007 대한화학회지 Vol.51 No.6

베체트 병은 여러 장기에서 발생하는 만성 염증성 질환이다. 베체트병에서 염증은 T-helper type 1 (Th1) 림프구에서 분비된 싸이토카인에 의해 유도된다. 베체트병의 발병원인이나 기전에 대해 확실히 밝 혀지지는 않았으나 유전적인 소인이 있는 사람에서 감염 등 환경적인 요인이 면역 반응에 이상을 일으켜 질병의 여러 증상이 발현된다. 주조직복합체(major histocompatibility complex, MHC)와 non-MHC gene 등 다양한 유전자들이 베체트병의 병인으로 관여한다. 이 연구에서는 HLA-B51, IL-18, SLC11A1, TNF-α의 유 전적 다형성이 한국인 베체트병의 감수성에 관여하는지를 확인하였다. 실험 결과, HLA-B51이 베체트병과 가장 연관성이 큰 유전인자로 나타났지만, HLA 분자가 베체트병의 직접접인 병인인지는 확실하지 않다. IL- 18은 베체트병 환자와 대조군 간에 연관성은 없었으나 안구병변을 가지고 있는 환자에서 -137 G/G 유전자 형이 높게 나타났다. SLC11A1 유전자에서 (GT)n의 다형성의 allele 3과 genotype allele 3/ allele 3이 한국 인 베체트병의 방어 효과를 갖는 것으로 추정된다. TNF-α gene의 유전자 다형성은 베체트병 감수성에 있 어서의 연관성을 찾지 못하였다. Behcet's disease (BD) is a chronic inflammatory disorder, involving several organs. Inflammation in the disease is thought to be mediated by cytokines derived from T-helper type 1 (Th1) lymphocytes. Although the exact pathogenesis for BD is not completely understood, it has been suggested that the disease is triggered in genetically susceptible individuals by environmental factors, such as microbial agents. It is noted that multiple genes, including MHC (major histocompatibility complex) and non-MHC genes, are implicated in the pathogenesis of BD. This study tries to determine whether HLA-B51, IL-18, SLC11A1 and TNF-α polymorphisms are associated with susceptibility to Behcet's disease in Koreans. As a results, HLA-B51 was a genetic factor with the strongest association with BD. But it is still uncertain whether this HLA molecule is directly involved in the pathogenesis of BD. Although the IL-18 gene polymorphisms were not associated with a susceptibility to BD in the Korean population, the patients carrying the GG genotype at position 137 had a higher risk of developing the ocular lesions. This study suggests that the allele 3 and the genotype allele 3 / allele 3 of 5'-promoter (GT)n polymorphism in the SLC11A1 gene may have a protective effect for the development of BD in the Korean population. There were no evidences for genetic association conferred by the TNF-α gene with respect to susceptibility to BD.

대장암에서 PCR-SSCP와 DHPLC를 이용한 p53 돌연변이의 검출

박상범,한상만,남윤형,장원철,Sang-Bum Park,Sang-Man Han,Youn-Hyoung Nam,Won-Cheoul Jang 대한화학회 2003 대한화학회지 Vol.47 No.5

p53 유전자의 변이는 다양한 인체암 중 가장 일반적인 유전자적 변화로 알려져 있으며, 양성에서 악성 대장암으로 전이되는 과정에서 연관이 있는 것으로 알려져 있다. 본 연구에서는 PCR-SSCP와 DHPLC를 이용하여 대장암 환자의 조직에서 p53 유전자의 엑손 5-8에서 돌연변이를 분석하였다. SSCP에서는 50개의 샘플중 엑손 5에서 C13109>T 형태의 돌연변이가 7례가(14%) 발견되었고, DHPLC에서는 C13109>T 7례와 C13202>A, C13204>G 형태의 돌연변이 2례, 모두 9례의(18%) 변이가 검출되었다. DHPLC 분석법을 이용하여 SSCP에서 발견하지 못했던 2례(4%)의 변이를 더 발견하였다. 최종적으로 염기서열분석법을 통해 위의 결과를 확인하였고, p53 돌연변이 검출법으로 SSCP보다 DHPLC가 더 감도가 좋고 효과적인 검출법임을 확인하였다. Structural alteration of p53 and overexpression of p53 protein are the most common genetic abnormalities in various kinds of human cancer. Mutations in the p53 tumor-suppressor gene are usually associated with an advanced development of colorectal cancer characterized by the transition from the adenoma to carcinoma stage. Mutations in exons 5-8 of the p53 gene were analyzed by the polymerase chain reaction-single strand conformation polymorphism(PCR-SSCP) and denaturing high performance liquid chromatography(DHPLC). SSCP analysis detected 7 mutations(C13109>T) in 50 colorectal cancer samples(14%) at exon 5, and DHPLC analysis detected 7 mutations (C13109>T) and 2 mutation(C13202>A, C13204>G) in 50 colorectal cancer samples(18%) at exon 5. All of 9 mutations were proved by sequencing analysis. We conclude that DHPLC is a highly sensitive and specific method for p53 gene mutations.

SSCP와 DHPLC에 의한 β₂-교감신경수용체 유전자의 돌연변이 분석

박상범,한상만,남윤형,장원철,Park, Sang-Bum,Han, Sang-Man,Nam, Youn-Hyoung,Jang, Won-Cheoul 한국분석과학회 2004 분석과학 Vol.17 No.1

현재 일반적으로 많이 사용되는 single strand conformation polymorphism (SSCP)나 denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE)같은 돌연변이 검출법은 많은 시간과 비용, 그리고 노동력이 소모된다는 단점과 실험자의 실험에 대한 숙련도에 의해 실험 결과가 달라지는 한계점을 가지고 있다. 이런 단점들을 보완하기 위하여 ion-pair reversed phase chromatography (IP-RPC)방식을 이용한 denaturing high performance liquid chromatography (DHPLC)방법을 사용하여 기관지 천식 (bronchial asthma)을 조절하는 베타2-교감신경수용체 유전자의 돌연변이를 검출하였다. 80명의 천식 환자의 혈액에서 genomic DNA를 추출하여 중합효소연쇄반응 (polymerase chain reaction)을 이용해 증폭하고, 그 산물을 SSCP와 DHPLC로 분석하였다. 그 결과, 베타2-교감신경수용체 유전자에서 SSCP는 80명의 sample 가운데 19개 (23.75%)의 돌연변이를 검출하였고, DHPLC는 25개 (31.25%)의 변이를 검출하였다. 돌연변이 검출법으로 DHPLC 분석법이 SSCP보다 더 빠르고 효과적인 방법임을 확인하였다. Up to now, methods for the detection of genetic alterations as single strand conformation polymorphism (SSCP) or denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) have been used. It is too labor-intensive and expensive to serve for routine analysis. Moreover, lower in its sensitivity and specificity being also strongly dependent on the experience of the investigater. To improve these problems, we analysed mutation of ${\beta}_2$-adrenergic receptor gene that controls bronchial asthma by denaturing high performance liquid chromatography (DHPLC) according to ion-pair reversed phase chromatography (IP-RPC). We extracted genomic DNA from 80 asthma patients and then amplified DNA using PCR and analysed PCR product by SSCP and DHPLC. As a result, we analysed mutation frequency is 19 (23.75%) on SSCP and 25 (31.25%) on DHPLC in ${\beta}_2$-adrenergic receptor gene. We conclude that DHPLC is a fast and simple screening method rather than SSCP analysis.

뇨중 파라쿼트(paraquat)측정용 진단 시험지의 개발

박상범,장원철,김종완,Park Sang-Bum Park,Won-Cheoul Jang,Jong-Wan Kim 대한화학회 2003 대한화학회지 Vol.47 No.4

Paraquat는 가장 효과적이고 널리 사용되는 제초제이지만 인간에게 매우 유독한 물질이다. 중독환자에 있어 뇨중 농도는 가장 중요한 인자중의 하나로 알려져 있으나 일반 검사실에서 이를 위한 정량검사는 거의 시행되지 않고 있다. 본 연구에서는 sodium dithionite를 이용하여 뇨중의 paraquat의 농도를 측정하는 새로운 방법의 진단 시험지를 개발하였다. 이 이차유도성 방식을 사용하여 paraquat의 농도를 측정한 결과 $0.5{\%}$ borate 완충용액(pH 8.0), 유도체 0.25 M $Na_2S_2O_4,\0.1~0.8{\%}$ PolyVinyl Pyrrolidone(PVP) 안정제, $1{\%}$ decanol의 구성비로 만들어진 진단시험지의 반응 색상이 안정하며 표준 비색표에 의한 육안적인 감별은 물론 화학 자동분석기에서의 응용성이 좋았다. Paraquat is an effective and widely used herbicide, but it is also very toxic to humans. It is well-known that urine paraquat concentration is one of the most important prognostic indicator for paraquat-poisoning. Quantitative analysis of paraquat, however, are not generally used in clinical laboratories. In this work, a new test strip to detect paraquat concentration using sodium dithionite in urine was developed. Using these second-derivative method, the test strip prepared in $0.5{\%}$ borate buffer (pH 8.0), 0.25 M $Na_2S_2O_4,\0.1~0.8{\%}$ PVP, and $1{\%}$ decanol showed not only better color reaction but also an excellent application possibility to be used in automatic analyzer.

은행나무 잎을 혼합하여 제조한 파티클보드의 물리ㆍ기계적 성질과 포름알데히드 저감효과

박상범(Sang-Bum Park) 한국산림바이오에너지학회 2006 산림바이오에너지 Vol.25 No.2

본 연구에서는 대기오염에 대한 저항성과 내충성, 항균성 등이 강하여 가로수로 많이 심어진 은행나무에 있어서, 그 잎의 파티클보드 제조 원료로서의 가능성을 모색하고자 하였다. 이를 위해 은행나무 잎을 분쇄한 다음 목재 파티클에 소량 혼합하여 파티클보드를 제조하였다. 은행나무 잎을 혼합하여 제조한 파티클보드의 물리, 기계적 성질을 조사하고 포름알데히드 방출량의 저감효과에 대해 검토하였다. 목재 파티클에 대하여 은행나무 잎을 1~5% 첨가하여 제조한 파티클보드는 은행나무 잎을 첨가하지 않은 대조구에 비해 밀도, 함수율, 흡수두께팽창률 등 물리적 성질과 휨강도, 박리강도와 같은 기계적 성질은 크게 감소하지 않았으며 모두 KS 파티클보드의 기준을 만족하였다. 은행나무 잎의 혼합량에 따라 포름알데히드 방출량은 점차 감소하였으며, 특히 은행나무 잎이 3% 첨가된 파티클보드의 포름알데히드 방출량은 2.81㎎/ℓ에서 1.66㎎/ℓ로 대조구에 비해 약 40% 감소하였다. 은행나무 잎이 지닌 고유한 항균성에 덧붙여 본 연구로부터 얻어진 결과는 낙엽으로 폐기되는 은행나무 잎을 원료로 포름알데히드 방출량이 낮은 기능성 파티클보드를 제조할 수 있다는 새로운 사실을 보여주고 있다. This study was conducted to find potentialities of the leaves of gingko tree (Gingko biloba L.) which has been planted as a roadside tree in Korea because of its resistance on air pollution, insect, fungi, etc. Various amounts of the leaves were mixed with wasted wood particles to manufacture particleboard. Their influences on physical and mechanical properties and the formaldehyde emission of PB were investigated. Physical and mechanical properties, such as density, modulus of rupture (MOR), and internal bond (IB) strength, of manufactured particleboard were not much different from those of control board. Formaldehyde emission values were decreased with increasing amount of leaves in PB prepared. Especially, particleboard made with 3 percent of leaves was decreased to 1.66㎎/ℓ in formaldehyde emission, which is about 40% lower emission than that of control. From these results, the leaves of gingko tree may be considered as a formaldehyde emission lowering additive in a functional PB manufacturing process.

스마트무인기 기술개발의 경제적·기술적 파급효과 분석

박상범(Park, Sang-Bum) 한국산학기술학회 2011 한국산학기술학회논문지 Vol.12 No.7

본 연구의 목적은 스마트무인기 기술개발의 경제적효과를 측정하고자 하는데 있다. 기술개발의 경제적효과는 투입산물의 파급효과는 물론 기술개발에서 오는 파급효과 측정 또한 매우 중요하다. 본 연구에서는 투입산출법에 의 한 효과분석을 하였으며 전체적으로 약13조원의 효과가 있는 것으로 나타나고 있다. The Smart UAV is one of the 21st Century Frontier R&D Programs funded by the Ministry of Knowledge Economy. This paper is to analyze the economic and technological effects of the Smart UAV project. Interindustry Analysis (Input-Output Analysis) is used, Overall, the total amount of economic effects is almost 13,000 billion won.

전략적 경영을 위한 생산전략의 내용

박상범(Sang-Bum Park),이교상(Kyo-Sang Lee),길종구(Jong-Gu Kil) 동국대학교 경영연구원 1989 경영과 사례연구 Vol.13 No.1

예측타이밍 반응의 효율성 증진을 위한 최적 안구운동전략

박상범 ( Sang Bum Park ) 한국스포츠심리학회 2005 한국스포츠심리학회지 Vol.16 No.4

연령에 따른 우성상지와 비우성상지의 조준능력 차이

박상범(Sang Bum Park),김태호(Tae Ho Kim),장재혁(Jae Hyeok Jang) 한국발육발달학회 2011 한국발육발달학회지 Vol.19 No.2

The purpose of this study was to investigate the differences in the aiming ability between dominant and non-dominant hands with increasing age by analyzing the performance level of dart-throwing. A total of 75 females participated in the experiment as subjects, 15 each in age groups of Childhood, Early Adolescence, Adolescence, Middle Age, and Senescence. Subjects performed dart-throwing task at the distance of 2.37 m with dominant and non-dominant hand. From the measured data, average radial error and average variable error were calculated and analyzed by 2-way ANOVAs(5 age groups × 2 hands) with repeated measure on the last factor. Analysis of performance accuracy revealed that while the Childhood and Senescence groups showed no difference between dominant and non-dominant hand conditions, the Early Adolescence, Adolescence, and Middle Age groups displayed significantly higher accuracy in the dominant hand condition than the non-dominant. In both hand conditions, the performance accuracy of the Childhood group was significantly lower than those of other age groups. In the non-dominant hand condition, however, the accuracy of the Senescence group was significantly lower than those of the Early Adolescence, Adolescence and Middle Age groups. Analysis of performance consistency revealed that while the Senescence group showed no difference between dominant and non-dominant hand conditions, other groups displayed higher accuracy in the dominant hand condition than the non-dominant. As the accuracy result, the performance consistency of the Senescence group was lower than those of the Early Adolescence, Adolescence and Middle Age groups in the non-dominant hand condition, and than those of all other groups in the dominant hand condition. These results suggest that the aiming ability develops rapidly after childhood, performance of the dominant hand being superior to that of the non-dominant hand. In the Senescence, however, the aiming ability deteriorates substantially because of the decrease in the coordination of vision and hands, especially in the performance of the dominant hand.