Aptamer‑linked immobilized sorbent assay for detecting GMO marker, phosphinothricin acetyltransferase (PAT)

Woo‑Ri Shin,Mun‑Jong Lee,SEKHONSIMRANJEET SINGH,Ji Hun Kim,Sun Chang Kim,Byung‑Kwan Cho,Ji‑Young Ahn,Yang‑Hoon Kim 대한독성 유전단백체 학회 2020 Molecular & cellular toxicology Vol.16 No.3

Background Development of genetically modified crops has rapidly increased in last few years. The most widely grown GM crops express genes that confer herbicide tolerance and insect resistance. Detection system of GM crops is important for safety evaluation before its consumption. Objective The purpose of this research is to detect GM crops, especially PAT, in food-samples. Results The bar gene (PAT protein, herbicide resistant) was cloned in pGEX-4T-1 and expressed by E. coli. The high-affinity PAT-specific single-stranded DNA (ssDNA) aptamers were obtained from a random DNA library. MOE docking study was performed to identify the potential binding region of the selected aptamers on PAT. Aptamer-linked immobilized sorbent assay (ALISA) method was used to detect PAT. Conclusion We screened aptamer against PAT for developing an efficient detection method. The selected PAT specific aptamers, HRPA-05 and HRPA-07, showed the distinct target binding behaviors, and detected PAT protein by aptamer-linked immobilized sorbent assay method with high efficiency and selectivity.

아미노글리코사이드 사용제한에 따른 병원성 균혈증 유발 그람음성간균의 내성변화 및 임상적 의의

오종택,김신우,손종원,도병훈,한승우,신병철,박지현,이종명,김능수 대한감염학회 2003 감염과 화학요법 Vol.35 No.4

목적 : 항균제 오남용으로 인한 내성균의 출현, 약물부작용의 발생 및 약제 비용의 증가는 환자 개인뿐만 아니라 사회적으로 문제가 되고 있다. 본 연구는 항생제의 오남용을 막기 위한 제도의 일환으로 시행한 아미노글리코사이드 사용 제한정책의 비용 효과적인 측면을 조사하고 그람음성간균에 의해 병원성 균혈증이 발생한 환자들을 대상으로 이 정책이 항생제 내성률과 환자 사망률에 미치는 영향을 연구하였다. 방법 : 930병상 규모의 3차 병원인 일개 대학병원에서 아미노글리코사이드 사용제한정책이 시행된 직후인 2002년 3월에서 9월 사이에 그람음성간균(Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa, Klebsiella pneumoniae, Escherichia coli, Enterobacter cloacae, Enterobacter aerogenes, Serratia marcescens, Stenotrophomonas maltophilia, Burkholderia cepacia)에 의해 발생한 병원성 균혈증 환자 60명(실험군)과, 이 정책이 시행되기 전에 입원한 환자들 중 균주별로 같은 수만큼 선별한 병원성 균혈증 환자 60명(대조군)의 의무기록을 후향적으로 조사하였다. 결과 : 아미노글리코사이드 사용제한정책이 시행된 시기인 2002년 3월에서 9월 사이에 처방된 아미노글리코사이드 사용량 및 비용을 이 정책이 시행되기 전인 2001년 3월에서 9월 사이와 비교한 결과, 아미노글리코사이드의 사용량(antimicrobial utilization density)은 사용제한 후 225.2에서 130.3으로 42% 감소하였고 약제 비용은 44% 감소하였다. 아미노글리코사이드 사용제한 후 병원성 균혈증을 유발한 그람 음성간균의 이 항생제에 대한 내성률은 유의한 변화를 보이지 않았으며 균혈증과 직접 연관된 사망률도 환자의 나이, 성별, 기저질환 및 원발병소 등을 보정할 경우 유의한 차이를 보이지 않았다(40.4% vs. 24.1%, P=0.11). 결론 : 아미노글리코사이드를 5일을 초과한 사용 시 감염전문가의 사전 승인을 필요로 하는 사용제한정책은 아미노글리코사이드의 사용량과 비용을 유의하게 감소시켰다. 또한 이 정책 시행 후 그람음성간균에 의한 균혈증 환자에서 균혈증으로 인한 사망률과 아미노글리코사이드에 대한 내성률은 유의한 차이가 없었다. Objective : To evaluate the effects of an aminoglycoside restriction policy on expenditures for aminoglycosides, antimicrobial resistance rates and clinical outcome of nosocomial bacteremia caused by Gram-negative bacilli (GNB). Methods : Starting in February, 2002, a prior consultation with an infectious disease specialist for using aminoglycoside antibiotics over 5 days was required in a 930-bed university hospital. In retrospective analysis of medical records 7 months after initiation of the aminoglycoside restriction policy, sixty cases of clinically relevant nosocomial bacteremia caused by GNB were found. These bacteremic patients were compared with sixty, species-matched, control patients with nosocomial Gramnegative bacteremia before the policy for total expenditures for aminoglycosides, susceptibility to antibiotics and clinical outcomes of bacteremia. Results : During the same period of 7 months before and after the restriction policy, total expenditures for aminoglycosides decreased by 44% in cost (from 465,030,841 Won to 259,618,337 Won) and the antimicrobial utilization density of aminoglycosides decreased by 42% (from 225,2 to 130.3). On the other hand, the patterns of antibiotic susceptibility and bacteremia-related in-hospital mortality rates after the policy did not show a significant change, compared with those before the policy. Conclusion : Antibiotic restrictions are among the most popular methods to diminish the practice of antibiotic overuse in hospitals. In this study, requirement for prior approval of aminoglycoside use over 5 days led to a significant decrease in the amount and cost of total aminoglycosides without a significant change in susceptibility patterns and bacteremia-related mortality rates.

뇌실외 배액술 시행과 관련된 뇌실염 : 원인균주와 경험적 치료약제의 적절성

도병훈,김신우,오종택,손종원,하상우,이응갑,장현하,이종명,김능수 대한감염학회 2005 감염과 화학요법 Vol.37 No.2

목적 : 본 연구는 뇌실외 배액술을 시행한 신경외과 환자들에서 뇌실염 발생 빈도, 원인균주와 감수성 추이 및 경험적 치료로 사용되는 항생제인 ceftazidime과 vancomycin의 적절성 여부에 대하여 조사하였다. 재료 및 방법 : 2000년 12월부터 2003년 10월까지 EVD를 시행한 경북대학교병원 신경외과 입원환자 340명 중 뇌실염이 발생한 39명을 대상으로 후향적으로 조사하였다. 결과 : 340명 중 39예 (11.5%)에서 뇌실염이 발생하였고 이들 가운데 4명이 뇌실염과 연관하여 사망하였다(10.3%). EVD 시행일로부터 뇌실염 발생까지는 평균 8.4일이었다. 원인균은 33예(87.1%)에서 확인되었으며 Aci-netobacter (19예, 45%), methicillin-resistant coagulase negative Staphylococcus (9예, 22%), methicillin-resistant Staphylococcus aureus (9예, 22%) 등의 순이었다. 가장 많이 동정된 Acinetobacter 19예 중에서 8예(42.1%)가 ceftriaxone에 내성을 보였으며 현재 경험적으로 널리 사용되는 ceftazidime에 대해서는 11예중 3예(27%)가 내성을 보였다. 결론 : 최근 EVD 시행과 관련된 뇌실염 뇌실염 최근 그람음성 non-fermenter 특히 Acinetobacter에 의한 경우가 증가하고 있으며, 이들 그람음성 non-fermenter는 현재까지 경험적으로 사용되는 ceftazidime에 점차 내성을 보이고 있다. 경험적 치료제에 대한 성공률을 높이기 위해서는 각 병원별 내실염의 원인균주의 감수성에 대한 검사가 필요하겠다. Purpose : To investigate the etiologic microorganisms of external ventricular drain (EVD)-related ventriculitis and the appropriateness of using ceftazidime and vancomycin as an empiric therapy in neurosurgical patients with EVD-related ventriculitis. Materials and Methods : Retrospective analysis of 39 patients with EVD-related ventriculitis among 340 neurosurgical patients to whom EVD had been placed during December 2000 and October 2003 at Kyungpook National University Hospital. Results : Thirty-nine EVD-related infections (39/340, 11.5%) occurred and the attributable mortality rate was 10.3% (4/39). The average duration from the ventricular catheter placement to the development of ventriculitis was 8.4 days. All patients with EVD infection had fever and 89.7% (35/39) of the patients showed nuchal rigidity. The positive culture rate in CSF was 87.1% (34/39) and the frequency of individual organism is as follows : Acinetobacter 45% (19 cases), methicillin-resistant coagulase negative Staphylococcus 22% (9 cases), methicillin-resistant Staphylococcus aureus 22% (9 cases), Enterococcus 5% (2 cases), Streptococcus pneumoniae 3% (1 case), non-fermenting gram-negative bacilli 3% (1 case). The polymicrobial infection rate was 15.4% (6/39). Among 19 cases of Acinetobacter infection, 42.1% (8/19) of the strains showed resistance to ceftriaxone and 15.7% (3/11) to ceftazidime. However, all cases were sensitive to meropenem. Conclusion : These findings show that the major etiologic organisms causing EVD-related ventriculitis have recently changed to Gram-negative non-fermenters, especially Acinetobacter. Because Gram-negative non-fermenting rods resistant to ceftazidime are increasing, an immediate change from ceftazidime plus vancomycin, the widely accepted empiric antibiotic therapy, to meropenem plus vancomycin should be considered when clinical symptoms and signs show no improvement or even deterioration.

한의진단명과 진단요건의 표준화 연구 II (표준화 실례) : 2차년도 연구결과 중간 보고

양기상,최선미,최승훈,안규석,박경모,박종현,김성우,신승호,정우열,전병훈,고현,김정범,신상우,김성훈,김동희,권영규,엄현섭,장혜옥 한국한의학연구원 1996 한국한의학연구원논문집 Vol.2 No.1

The diagnostic requirements were suggested and explained regarding the systems of differentiation of symptoms and signs in the second year study of standardization and unification of the terms and conditions used for diagnosis in oriental medicine. The systems were as follows; - differential diagnosis according to condition of body fluid, differentiation of syndromes according to the state of qi and blood, differential diagnosis according to relative excessiveness or deficiency of yin and yang(氣血陰陽津液辨證) - differentiation of diseases according to pathological changes of the viscera and their interrelation - analyzing and differentiating of febrile diseases in accordance with the theory of the six channels(傷寒辨證) The individual diagnosis pattern was arranged by the diagnostic requirements in the following order : another name(異名), notion of diagnosis pattern, index of differentiation of symptoms and signs(辨證指標), the main point of diagnosis, analysis of diagnosis pattern(證候分析), discrimination of diagnosis pattern(證候鑑別), a way of curing a diseases(治法), prescription(處方), herb in common use(常用藥物), diseases appearing the diagnosis pattern(常見疾病), documents(文獻調査). This study was carried out on the basis of the Chinese documents and references.

한국 정신장애의 역학 조사 연구[I] : 각 정신장애의 유병률

조맹제,함봉진,김장규,박강규,정은기,서동우,김선욱,조성진,이준영,홍진표,최용성,박종익,이동우,이기철,배재남,신정호,정인원,박종한,배안,이충경 大韓神經精神醫學會 2004 신경정신의학 Vol.43 No.4

Objectives : This study aims to estimate the prevalence of the DSM-IV psychiatric disorders in Korean population using the Korean version of Composite International Diagnostic Interview (K-CIDI). Methods : Subjects were selected by taking multi-stage, cluster samples of 7,867 adult household residents, 18 to 64 years of age, in ten catchment areas. Total 78 trained interviewers administered the K-CIDI to the selected respondents, from June 1 to November30,2001. Results : Total 6,275 respondents completed the interview. Some 33.5% of respondents reported at least one lifetime disorder, 20.6% reported at least one-year disorder, and 16.7% reported at least one-month disorder. The most common lifetime disorders were alcohol abuse/dependence (17.24%), nicotine dependence/withdrawal (11.19%), specific phobia (5.16%), and major de-pressive disorder (4.25%). The lifetime prevalence of substance abuse/dependence (0.25%) and schizophrenia (0.16%) was very low. Nicotine and alcohol use disorder showed very high male/female ratio. Mood disorder and anxiety disorder were more prevalent among female than male. Conclusion : The prevalence of psychiatric disorders was high. In comparison with other studies, remarkable differences in distributions of psychiatric disorders across the areas and times were observed.

웨이브렛 계수 Zero Crossings를 이용한 영상의 잡음제거 및 압축

신재호,이용준,은종숙,이성우 동국대학교 산업기술연구원 1997 산업기술논문집 Vol.10 No.-

윤곽선이나 에지같은 영상 데이터의 중요한 성분들은 웨이브렛 계수의 zero crossings를 통해 검출할 수 있다. 이런 방법은 영상의 패턴 인식에 관한 연구에서 sharp variation points를 검출하는데 사용되었다. 웨이브렛 변환과 zero-crossings를 거쳐 국부 극치의 위치를 검출하는데 이 방법을 적용하여서 영상의 잡음제거에 사용하도록 개선하였다. 더욱이 영상 데이터에서 전체 영상의 픽셀과 정보를 저장하는 대신, 대부분의 중요한 성분을 효과적으로 몇몇 국부 극치값으로 압축하였다. 그 결과 새로 개선된 기법은 패턴 인식 분야에서만 아니라 높은 압축률의 잡음 제거에도 사용될 수 있다. The important image data components such as contours and edges could be detected by zero crossings of wavelet coefficient. This method has been used for the studies on pattern recognition of images to detect sharp variation points. We have applied it to detection of the position of local maxima through zero-crossings and wavelet transform, so that it is improved to be used for noise-eliminating of image. In addition it could compress the image data into a few of local maxima which held the most of important component efficiently without saving All image pixels and information. As the result, the newly improved method could be implemented not merely for the field of pattern recognition but for that of noise removal at the higher compression ratio.

지속가능한 산림경영을 위한 기준 및 지표의 산림기능구분에 대한 적용성 연구

우종춘,장재영,신현지 江原大學校 森林科學硏究所 2005 Journal of Forest Science Vol.21 No.-

지속가능한 산림경영을 위하여 우리나라는 여러 가지 프로세스 중에 몬트리올 프로세스를 채택하고 있다. 본 연구에서는 우리나라에 적용 가능한 7개 기준. 27개 지표를 산림의 6가지 기능에 적용하였다. 산림기능에 대표성, 적합성, 가능성 기준과 지표를 각각의 산림 상태와 목표로 하는 방향을 고려하여 가장 비중 있게 적용되는 기준과 지표를 선정하였다. 그리고 각각 다른 산림에 모두 같은 기준과 지표를 가지고 산림을 평가할 수는 없으며 이를 적용하기 위해서는 산림에 대한 정확한 데이터와 지식이 필요 하다고 사료된다. To be a sustainable forest management, Korea took a Montreal process in many proccsses. This study applied seven criterias. twenty-seven indicators that are applicable indicators to the forest function type. Forest function type choose representation. suitability, possibility criterias and indicators that forest conditions are thought a great deal of wegit on th forest by a goal. And we can't estimate many forest with same criteria and indicators every time, to apply them need correct data and knowledge about forest.

초등학교 저학년을 대상으로 한 창의적 체험활동용 환경교육 프로그램의 개발 및 효과 분석

신명주,김종우,이상원 이화여자대학교 사범대학 교과교육연구소 2012 교과교육학연구 Vol.16 No.4

The purpose of this study was to develop an environmental education program for creative activities in the lower grades of elementary school. The methods of this study were literature review, evaluation of elementary environmental education experts, and a field test. In addition, a qualitative analysis was also conducted to complement the quantitative analysis through portfolios, observations, and interviews. The results of this study are as follows. First, the development of the curriculum design model was based on a theory of an environmental education program which uses creative activities. Second, the post-test was more effective in prompting a pro-environmental attitude compared to the pre-test. Third, the students were concerned and interested in the environmental learning, and they demonstrated positive attitudes and participation toward the environment and environmental problems. The creative activities for this environmental education program indicated an ability to promote active learning participation and various positive actions. In conclusion, this environmental education program for creative activities had a positive effect on the pro-environmental attitude of the lower grade elementary school students. It is therefore suggested, as a follow-up activities, that more intensive research related this study be conducted, linking both teaching and learning methods. 본 연구는 창의적 체험활동용 환경교육 프로그램을 개발하고 초등학교 저학년 학생들의 환경친화적 태도에 미치는 효과를 검증하는데 그 목적이 있다. 본 연구의 목적을 달성하기 위하여 초등학교 2학년 1개 학급 28명을 대상으로 20차시에 걸쳐 창의적 체험활동용 환경교육 프로그램을 적용하였다. 실험집단을 대상으로 사전·사후 검사지를 이용하여 수집된 자료들을 SPSS 12.0 통계 프로그램을 이용하여 결과를 분석하였다. 그리고 정량적 분석을 보완하기 위하여 연구자의 참여 관찰, 학생들의 포트폴리오 및 면담을 통해 정성적 자료를 분석하였다. 연구 결과, 첫째, 개발된 창의적 체험활동용 환경교육과정 모형은 1차원을 교육과정 유형, 2차원을 교육과정 접근, 3차원을 교육과정 내용으로 설정하였다. 둘째, 초등학교 저학년을 대상으로 한 창의적 체험활동용 환경교육 프로그램은 주제선정 및 교수·학습 지도안 및 활동지를 개발하여 현장교사에 대한 조사 연구와 전문가의 자문을 받아 수정·보완하였다. 셋째, 개발된 프로그램을 적용후, 학생들은 정의적 및 행동적 요소를 포함한 환경친화적 태도에 유의하게 향상되는 것으로 나타났다. 그리고 정성적 분석 결과, 개발된 프로그램을 진행하는 동안 학생들은 자신의 삶과 주변 환경의 밀접한 관련성에 대해 인식하였을 뿐만 아니라 일상생활에서도 환경친화적 행동을 실천하고자 노력하는 모습을 보였다. 이러한 연구를 종합해 볼 때, 본 연구에서 개발된 창의적 체험활동용 환경교육 프로그램은 초등학교 저학년 학생들에게 환경친화적 태도를 향상에 효과적인 수업 방법이라 할 수 있으므로 초등학교에서 환경교육이 보다 활발하게 이루어지기 위해서는 창의적 체험활동용 프로그램을 체계적으로 실시하기 위한 심층적인 연구와 교수·학습 활동에 관한 후속 연구가 필요하다고 사료된다.

형상기억합금 기반 공구 클램핑장치의 자동 공구교환 시스템 개발

신우철,노승국,김병섭,박종권 한국공작기계학회 2009 한국공작기계학회 춘계학술대회논문집 Vol.2009 No.-

This study developed an auto tool change system of the SMA-based tool clamping device for applications of micro-machine tools. This paper first introduces clamping/unclamping mechanisms of the auto tool change system and its basic configuration. In addition, it shows experimental results of times needed for clamping/unclamping operations of a prototype of the auto tool change system. The average values were estimated to 7.2(s) and 2.6(s) respectively. These results confirm that the auto tool change system is feasible.

Sprague-Dawley 백서의 소뇌 과립신경세포에서 Sevoflurane 에 의한 Baseline Potassium Channel 의 활성화

신우종,Winegar,Bruce D 대한마취과학회 2002 Korean Journal of Anesthesiology Vol.42 No.1

Background : Volatile general anesthetics have been widely used to produce reversible unconsciousness and analgesia in clinical practice over the last one hundred years, but the basic mechanism of anesthetic action is not yet completely understood. In addition to the well known mechanism of GABA_A and glycine channels, accumulating evidence indicates that neuronal baseline K^+ channels are also activated by volatile anesthetics. The goal of this study was to test the hypothesis that sevoflurane, one of the newly developed volatile anesthetics, activates baseline potassium channels in the cerebellar granule neurons of rats. Methods : whole cell measurement techniques were performed from cultured cerebellar granule neurons of seven day old male Sprague-Dawley rats using patch clamp techniques to see the effects of two MACs of sevoflurane on baseline K^+ channels. Holding potentials were set to -20 ㎷ and collect pulses from -90 to 90 in 10 ㎷ increments of 300 ㎳ duration. The electrode filling solution contained (in mM) 150 KOH, 105 aspartic acid, 3 Nacl, 10 HEPES, 86 glucose, 1 EGTA, 5 MgCl_2 (pH 7.4) and standard saline were used as bath solution. The bath contained 150 NaCl, 3 KCl, 10 HEPES, 12 glucose, 1 EGTA, 5 MgCl_2 (pH 7.4). Results : Analysis of multiple patch clamp experiments showed the presence of outward-rectifying K^+ selective ion channels with a conductance of 1.064 ± 0.32 nS (n = 10) at depolarized potentials. Cerebellar granule neurons exhibit rapid rising, noninactivating, outward-rectifying currents. These channels are insensitive to conventional K^+ channel blockers. Clinically relevant concentrations of sevoflurane (518 ㎛) increased the baseline K^+ channel outward currents from the control value by 225% in a standard saline perfusate (n = 10, P < 0.05, paired t-test). Channel activity enhanced during the duration of the exposure period to sevoflurane returned to the baseline activity level quickly upon wash. Conclusions : These outward-rectifying whole cell Ⅰ-Ⅴ curves are consistent with the properties of tandem pore K^+ channels. Activation of baseline K^+ channels in central neurons by two MACs of sevoflurane causes membrane hyperpolarization and increases neuronal input conductances providing an additional inhibitory mechanism that could contribute to the overall central depressant effects of this compound. (Korean J Anesthesiol 2002; 42: 107~114)