Selection of bactericides for suppression of fire blight disease and possible strategies to control it via analyses of transmission routes in Korea

Duck Hwan Park(박덕환) 한국농약과학회 2019 한국농약과학회 학술발표대회 논문집 Vol.2019 No.10

화산력-시멘트 혼합 바이오 블록의 미생물 생장 특성

박성용,박덕환,김현선,김정면,임현택,배수빈,김용성,Park, Sung-Yong,Park, Duck-Hwan,Kim, Hyun-Sun,Kim, Jung-Myeon,Lim, Hyun-Taek,Bae, Su-Bin,Kim, Yong-Seong 한국농공학회 2015 한국농공학회논문집 Vol.57 No.1

This research aims to utilize lapilli from the Mt. Baekdusan as environmently-friendly construction material. First of all, the neutralizing method for fabricating lapilli-cement-mixed bioblock was examined. And then, by use of the neuralized bioblock with microorganism for water purification, the growth inhibition effect against the pathogenic coliform bacillus was evaluated. The result regarding growth inhibition effect on pathogenic coliform bacillus indicates that the pretreatment condition, which is a concurrent procession with aqueous solution of 10% di-ammonium Phosphate after water curing, led to pH degraded below 10 which was the target value. Therefore it was concluded that the method was effective on bio-block neutralization. The microorganisms purifying water and di-ammonium phosphate were detected through the examination for microorganism existence on the bioblock, therefore it was concluded that the bioblock composed of lapilli and cement is able to be utilized in various structures as an environment friendly construction material.

Draft genome sequence of Streptomyces sp. P3 isolated from potato scab diseased tubers

강민규,박덕환,Kang, Min Kyu,Park, Duck Hwan The Microbiological Society of Korea 2018 미생물학회지 Vol.54 No.2

Streptomyces sp. P3 균주는 대한민국 강원도 평창의 더뎅이병 이병괴경으로부터 2017년 분리되었다. 이 논문에서는 9,851,971 bp (71.2% G + C 함량)로 구성된 P3 균주의 전체염기서열을 보고한다. 지놈은 8,548개의 코딩서열, 18개의 rRNA 그리고 66개의 tRNA 유전자를 포함하고 있다. 특히 P3 균주는 감자표면과 무종자를 이용한 병원성 검정에서 병원성을 나타내지는 않았지만, 감자 더뎅이병 유발 Streptomyces들이 보유한 병원성 유전자 중 tomA 유전자만이 존재하였다. 따라서 본 논문에 제공되는 전체염기서열은 감자 더뎅이병원세균들의 병원성 획득을 위한 진화단계에서의 이해를 높이기 위한 중요한 단서가 될 것이다. Streptomyces sp. P3 was isolated from potato scab diseased tubers in Pyeongchang, Gangwon-do, Republic of Korea in 2017. Here, we report the draft genome sequences of P3 with 9,851,971 bp size (71.2% GC content) of the chromosome. The genome comprises 8,548 CDS, 18 rRNA and 66 tRNA genes. Although strain P3 did not show pathogenicity both potato tuber assay and radish seedling assay, it possesses tomatinase (tomA) gene among conserved pathogenicity-related genes in well characterized pathogenic Streptomyces. Thus, the genome sequences determined in this study will be useful to understand for pathogenic evolution in Streptomyces species, which already adapted to potato scab pathogens.

Draft genome sequence of a bacterial plant pathogen Erwinia pyrifoliae strain EpK1/15 isolated from an apple twig showing black shoot blight

이규민,오엄지,고세영,박정금,박덕환,김동혁,오창식,Lee, Gyu Min,Oh, Eom-Ji,Ko, Seyoung,Park, Jungkum,Park, Duck Hwan,Kim, Donghyuk,Oh, Chang-Sik The Microbiological Society of Korea 2018 미생물학회지 Vol.54 No.1

Erwinia pyrifoliae는 그람 음성 세균으로 사과와 배에 가지검은마름병을 일으킨다. E. pyrifoliae EpK1/15 균주가 병징을 보이는 경기도 포천지역의 사과나무 가지에서 2014년도에 분리되었다. 본 논문에서는 PacBio RS II 플랫폼을 이용하여 E. pyrifoliae EpK1/15 균주의 전체 유전체를 분석하여 보고한다. 본 균주는 G + C 비율이 53.4%이며, 4,027,225 bp로 구성된 염색체와 G + C 비율이 50.3%이며, 48,456 bp로 구성된 plasmid를 지니고 있다. 이들 염색체와 plasmid DNA에서 3,798개의 단백질 코딩 유전자, 22개의 rRNA, 77개의 tRNA, 13개의 non-coding RNA 및 231개의 위유전자(pseudo gene)가 확인되었다. Erwinia pyrifoliae is a Gram-negative bacterium causing black shoot blight in apple and Asian pear trees. E. pyrifoliae strain EpK1/15 was isolated in 2014 from an apple twig from the Pocheon, Gyeonggi-do, South Korea. In this study, we report the draft genome sequence of E. pyrifoliae EpK1/15 using PacBio RS II platform. The draft genome is comprised of a circular chromosome with 4,027,225 bp and 53.4% G + C content and a plasmid with 48,456 bp and 50.3% G + C content. The draft genome includes 3,798 protein-coding genes, 22 rRNA genes, 77 tRNA genes, 13 non-coding RNA genes, and 231 pseudo genes.

감자흑각병(Potato Blackleg Disease) 방제를 위한 살균제 선발

Zhu Yong-Zhe,박덕환(Duck-Hwan Park),박동식(Dong-Sik Park),유용만(Yong-Man Yu),김성문(Songmun Kim),임춘근(Chun-Keum Lim),허장현(Jang-Hyun Hur) 한국농약과학회 2003 농약과학회지 Vol.7 No.2

Draft genome sequences of Pseudomonas syringae pv. syringae strain WSPS007 causing bacterial shoot blight on apple

임연정,유덕규,강민규,전용호,박덕환,Lim, Yeon-Jeong,Ryu, Duck Kyu,Kang, Min Kyu,Jeon, Yongho,Park, Duck Hwan The Microbiological Society of Korea 2019 미생물학회지 Vol.55 No.1

Pseudomonas syringae pv. syringae WSPS007 균주는 대한민국 경상북도 영주시 사과 과원에서 나타난 가지마름병 병징으로부터 2013년 분리되었다. 본 논문에서는 6,238,498 bp(59.04% G+C 함량)인 WSPS007 균주의 전체 염기서열을 보고한다. 전체 지놈은 5,379개의 코딩서열, 65개의 tRNA, 16개의 rRNA 유전자를 가지고 있다. 특히 WSPS007 균주의 전체 염기서열 분석은 냉해와 관련된 빙핵 활성 유전자 클러스터를 중심으로 분석을 수행하였으며, P. syringae pv. syringae 국외 대표 균주인 PssB728a와 유사한 빙핵활성 유전자 구성을 가지고 있는 것으로 나타났다. 따라서 본 논문에서의 염기서열 분석 결과를 바탕으로 경상북도 일원 사과 과원에서 동해로 추정되는 병원균의 원인을 규명하기 위한 기본 자료를 제공하는데 있어서 의의가 있다고 사료된다. Pseudomonas syringae pv. syringae strain WSPS007 was isolated from infected twigs (Malus pumila) in 2013 in Yeongju, Gyeongbuk Province, Republic of Korea. Here, we report the draft genome sequence of WSPS007 with a chromosome size of 6,238,498 bp (59.04% G+C content). The genome comprises 5,379 CDS, 16 rRNA genes, and 65 tRNA genes. The P. syringae pv. syringae strain WSPS007 genome possesses an ice-nucleating activation (INA) gene and an antifreeze operon that may be related to frost damage by this pathogen. Thus, the genome sequence determined in this study will be useful in understanding the relationship between the outbreak of bacterial shoot blight disease and frost damage in northern Gyeongbuk Province.

저장기간 및 정식시기가 곤달비 조직배양묘의 생육에 미치는 영향

박종남(Jong Nam Park),최해진(Hae Jin Choi),강영기(Yung Ki Kang),박덕환(Duck Hwan Park),조세열(Sae Youll Cho) 한국원예학회 2011 한국원예학회 학술발표요지 Vol.2011 No.10

환경친화적 단백질 HrpNEp 처리에 의한 백합의 생육 및 절화 특성 검정

김학기(Hak Ki Kim),박덕환(Duck Hwan Park),임춘근(Chun Keun Lim),이미림(Mi Rim Lee),홍세진(Sae Jin Hong),엄병헌(Byung-Hun Um) 한국원예학회 2006 원예과학기술지 Vol.24 No.2

본 연구는 환경친화적 단백질 HrpNEp를 처리하여 백합의 생육특성을 알아보기 위해 수행하였다. 환경친화적 단백질 HrpNEp 백합의 줄기 길이 신장을 촉진하고 두께를 굵게 하며, 줄기의 경도를 높여주고 절화의 휘는 정도를 감소시켰다. 또한 줄기내 무기질 함량 중 줄기 경도 향상에 유리한 칼슘과 마그네슘의 흡수를 촉진하였다. 환경친화적 단백질 HrpNEp 처리는 10mg L⁻¹의 농도에서는 4회 이상 그리고 40mg L⁻¹에서는 2회의 처리만으로도 각각의 품질 요인면에서 효과가 상승하는 것으로 조사되었으며, 처리 횟수를 많이 할수록 효과는 우수하였다. HrpNEp와 칼슘 또는 마그네슘과의 교호처리는 백합줄기 내 흡수에 상호 길항작용이 관찰되었으며, 환경친화적 단백질 HrpNEp는 길항작용을 일으키지 않는 한도 내에서 마그네슘과 특히 환경친화적 단백질 HrpNEp 10mgㆍL⁻¹과 칼슘의 교호처리와 HrpNEp 40mg L⁻¹ 단독처리가 백합 절화의 품질에 유리하였다. This study was conducted to investigate the effect of HrpNEp protein extracted and purified from Erwinia pyrifoliae WT3 on the growth and cut flower quality of oriental hybrid lily. HrpNEp, a kind of environment-friendly protein, stimulated growth of the shoot length and stem diameter, and increased the stem strength, but decreased the curvature of the shoots with flower buds. Calcium and magnesium which are supposed to have some positive effects on the hardness of tissues were absorbed more in HrpNEp-treated shoots than the control. To improve the quality of cut flowers, the lily needed 4 or 2 times treatments with 10 or 40 mg L⁻¹ HrpNEp, respectively, and additional treatment with HrpNEp gave even better quality. There was some antagonism between magnesium and calcium when they were used alternatively with HrpNEp. High quality cut flowers were produced by treatment with 10 mg L⁻¹1 HrpNEp and calcium, with a synergistic effect within the limits of antagonism, and also with 40 mg L⁻¹ HrpNEp treatment alone.

2006~2010년도 국내 노지재배 고추의 바이러스병 발생현황

이장하,홍진성,주호종,박덕환,Lee, Jang Ha,Hong, Jin Sung,Ju, Ho-Jong,Park, Duck Hwan 한국유기농업학회 2015 韓國有機農業學會誌 Vol.23 No.1

2006년부터 2010년까지 국내 고추 노지재배 포장을 대상으로 경상남도와 제주도를 제외한 강원도 11개 지역 등 전국에 걸쳐 총 83개 지역을 중심으로 바이러스 이병체를 채집하여 연차별 고추 발생 바이러스의 발병률, 바이러스 종류 및 감염 형태를 조사하였다. 2006년부터 2010년까지의 고추에서의 평균 단독 감염률은 46.6%, 복합 감염률은 48.0%로 조사되어 고추 생산에 있어서 가장 큰 위해요소는 바이러스 발병으로 나타났다. 바이러스별로는 CMV가 평균 34.8% 발병률로 가장 우점 바이러스로 조사되었다. 반면 BBWV2는 낮은 발병율을 보여주었으며, TSWV는 충남과 전남지역에 국한되는 것으로 조사되었다. 따라서 고추 노지재배 시 발생하는 바이러스의 위해도를 발병률에 따라 구분하면 CMV, PMMoV, 그리고 PepMov 순으로 조사되었다. 또한 복합 감염의 발생도 모든 조사지역 시료에서 검출되었으며, 이에 대한 감염 별 바이러스 종류와 발생률을 분석하였다. 복합 감염에서 가장 빈번하게 검출된 바이러스는 CMV로, CMV+BBWV2, CMV+PepMoV, CMV+PMMoV의 복합 감염형태가 검출률이 높게 나타났다. 따라서 고추의 유기농 재배 생산에 가장 큰 위협요인으로 작용하는 바이러스의 적절한 대책마련을 위한 지속적인 바이러스 모니터링과 3종 이상의 복합 감염 위해성을 판단하기 위한 추가 연구가 필요하다고 사료된다. In this study, viral disease samples were obtained between 2006 and 2010 from pepper fields in 11 major pepper-growing districts in Gangwon-do, and in 83 areas from other provinces, with the exception of Gyeongsangnam-do and Jeju island in Korea. In order to assess the type of infection, field surveys were conducted with regard to viral disease severity and virus type, based on typical symptoms on leaves. The means of single and mixed-virus infections were 46.6% and 48.0%, respectively, during those periods, suggesting that viruses are the agents that most severely decrease pepper production in field cultivation in Korea. In terms of single infection, Cucumber mosaic virus (CMV) was the most prevalent virus based on its disease severity ratings (34.8%). Next, Pepper mild mottle virus (PMMoV) and Pepper mottle virus (PepMoV) were shown to cause severe viral diseases in pepper, with disease severities of around 5-10%. On the other hand, Tomato spotted wilt virus (TSWV) occurs in a limited area in Chungcheongnam-do and Jeollanam-do. Thus, the viral disease caused by CMV, PMMoV, and PepMoV in pepper can be severe, and these virus types should remain considered critical reasons for decreased pepper production in field cultivation in Korea. In addition to single infection, mixed infections are frequently observed in collected pepper samples from all areas. The ratios of mixed infection were therefore studied to evaluate the disease severity of mixed infections and to define individual virus types. These data showed that different types of viruses were present, and CMV was the most abundant virus for mixed infection, as in the case of single infection. Among mixed infections, the highest disease severity was seen with CMV+Broad beam wilt virus 2 (BBWV2), followed by other types of mixed infection such as CMV+PepMoV and CMV+PMMoV. However, further work is needed to reduce the severe damage caused by viruses and to assess mixed infection types involving three or more viruses.

미생물제 엽면처리가 토마토의 생리적 활성 및 품질에 미치는 영향

정천순(Cheon Soon Jeong),박종남(Jong Nam Park),경장현(Jang Hun Kyoun),임춘근(Chun Keun Lim),허장현(Jang Hyun Hur),박덕환(Duck Hwan Park) 한국원예학회 2005 원예과학기술지 Vol.23 No.3

미생물제인 HrpNEP 단백질 및 Messenger의 토마토 재배 시 엽면처리가 식물체의 생리적 활성 및 품질에 미치는 영향을 조사하였다. 광합성, 기공전도도 및 엽록소 함량은 무처리 보다 미생물제 처리구에서 높게 나타났는데, 특히 HrpNEP 단백질 처리구에서 가장 높았다. 무기물 흡수는 HrpNEP 단백질 처리구와 Messenger 처리구가 무처리구에 비해 많았다. 과실 내 Ca 함량은 HrpNEP 단백질 처리구에서 무처리구보다 높았으며, 배꼽썩음과 발생이 억제되어 총수량이 증가하는 효과를 보였다. 또한 미생물 처리에서 토마토 과실의 산 함량을 제외한 가용성 고형물, 당 및 비타민 C 함량이 높게 나타나 품질을 향상시키는 결과를 얻었다. The HrpNEP protein and Messenger were applied on leaves of tomato as microbial fertilizer and their effects on the physiological activities of plant and the fruit quality were examined. The treatments of microbial fertilizers showed higher photosynthetic rate, stomatal conductivity and chlorophyll contents than those in the control treatment. Additionally, inorganic ion contents were higher in the treatment of microbial fertilizers to those of control treatment. This result indicated that the microbial fertilizer application promoted uptake of inorganic ion. Besides, tomato treated with HrpNEP protein showed higher physiological activities when compared to that of treated with microbial fertilizer, Messenger. Moreover, blossom-end rot of fruit was decreased, while total yield was increased in the HrpNEP protein treated plant when compared with Messenger treated plant due to highest calcium content in fruit. The contents of soluble solid, sugar and vitamin C, except acid content, were higher and fruit quality was also improved in the treatment with HrpNEP protein.