XML문서를 이용한 환자 정보 교환 시스템(HIES)의 설계 및 구현

홍동완(Dong-Wan Hong),간광현(Kwang-Hyun Kan),윤지희(Jee-Hee Yoon),이건배(Keon-Bae Lee) 한국정보과학회 2000 한국정보과학회 학술발표논문집 Vol.27 No.2Ⅰ

최근 국내의 모든 병원에서 PACS(Picture Archiving and Communication System) 도입에 관한 관심을 보이고 있다. PACS가 구축이 되면 병원 내 모든 진료 과에서 디지털 데이터의 전송으로 정보를 공유할 수 있고, 진료가 자동화 되는 장점이 있다. 하지만, 환자가 다른 병원으로 이송될 경우 과거 진료 내역을 다른 병원으로 함께 전송하여야 되는데, 다른 병원의 시스템과 연계할 방법이 현재로는 존재하지 않는다. HIES 시스템은 의료 데이터 전송의 표준문서를 XML(eXtensible Markup Language)을 제안하고 있다. XML은 문서를 정의하는 메타 마크업(meta-markup) 언어로써 DICOM 프로토콜을 통하여 산출된 의료 데이터를 표현하기에 적당하다. 또한 병원 간 이질 데이터베이스 시스템 통합을 위하여 일관된 스키마 정보를 유지하는 정보 공유 관리자를 설계, 구현하였다.

도심리교회 실천 사례와 적용

홍동완(Dong Wan Hong) 장로회신학대학교 세계선교연구원 2018 선교와 신학 Vol.44 No.-

성경에서 교회이름은 지역 명으로 되어있다. 지역에 있는 주님의 교회라는 뜻이다. 사도행전에 나와 있는 교회들을 보면 온 유대와 갈릴리와 사마리에 있는 교회(행 9:31), 예루살렘에 있는 교회(the church at Jerusalem: 행 9:31), 안디옥에 있는 교회(the church at Antioch: 행 13:1)이다. 구약에서 회중, 총회를 70인역에서는 교회인 에클레시아로 번역하고 있다. 출애굽한 이스라엘백성을 광야에 있는 교회로 표현하고 있다.(행 7:38) 이것은 교회가 지역과 함께 하는 공동체임이 분명하다. 도심리교회의 개척과정에서 나타난 두 가지 큰 틀이 있었다. 하나는 하나님 주도적인 선교의 모습이다. 하나님을 절대타자로 보고 하나님에 의한 선교가 이루어졌다. 즉 하나님은 그의 나라를 이루기 위해 모두로부터 독립되어 있다는 것이다. 선교지 선택, 선교전략, 선교과정, 모두 하나님에 의해서 진행되었다. 다른 하나는 지역 주민에 의한 선교이다. 이것도 다른 형태의 타자를 의미한다. 선교방법, 선교사업, 선교이론은 모두 지역에 있는 주민들에 의해서 생기게 되었다. 안데스 산맥에서 전래된 감자를 보냄을 받았다는 수동적 의미의 선교사의 관점으로 볼 수 있다. 그러나 사람들에 의해 매우 능동적인 영향력을 발휘한 모습을 보면서 수동적이지만 역동적이고 능동적인 선교의 모습이라 말할 수 있다. 선교는 분명 단시간에 이루어질 수 없는 것이기에 오랜 지속성을 필요로 한다. 잣이 2년을 주기로 해서 열매를 얻을 수 있는 것처럼 선교는 우리가 기대하는 것보다 오랜 시간을 요구한다. 16년 동안 무교회지역에 도심리교회 개척과정을 지속성이라는 관점에서 네 가지로 살펴보았다. 첫째는 서로 알아가는 과정이다. 이때가 매우 중요한 것은 상대에게 어떤 선입견을 갖게 하는 시간이기 때문이다. 둘째는 서로에 대해서 반응하는 과정이다. 셋째는 신뢰하는 과정이다. 삶이 함께 나눠지는 단계이기도 하다. 넷째는 함께 꿈꾸는 과정이다. 이때 비로소 지역공동체를 위해 어떤 사업이든 할 수 있다. 지금 도심리교회는 바로 네 번째 과정에 와 있다. 여기에서 지속성을 가지고 해나가는 것이 중요하다. 마을 만들기 혹은 마을 목회가 새롭게 조명을 받고 있다. 이것이 하나의 선교유행처럼 되지 말아야 한다. 이런 용어가 나오기 전에 이미 마을 만들기를 실시하고 있는 지역교회들이 있다. 마을 만들기는 목회자 주도한다거나 지역교회가 주도하에 이루려는 생각보다는 지역 주민들 주도하에 이루어야 한다. 마을을 만들려고 하기 보다는 만들어져야 하는 것이다. 이러기 위해서는 교회공동체와 지역 공동체를 두 개의 공동체가 아닌 하나의 공동체로 보아야 한다. “너희는 유대인이나 헬라인이나 종이나 자유인이나 남자나 여자나 다 그리스도 예수 안에서 하나이니라”(갈 3:28) 이것이 초대교회 공동체의 모습이다. 성육신하신 그리스도 안에서 교회 공동체와 지역공동체가 하나가 돼야 한다.

국제물류주선업체의 부서 간 역학관계가 관계몰입과 성과에 미치는 영향

홍동완(Dong-Wan Hong),하명신(Myung-Shin Ha) 한국항만경제학회 2010 韓國港灣經濟學會誌 Vol.26 No.4

본 연구는 국제물류주선업체의 부서 간 역학관계가 시장지향성에 어떠한 영향을 미치는지, 그리고 시장지향성이 관계몰입을 통해 고객성과에 미치는 영향에 대해 규명하여 국제물류주선업체의 경쟁력을 향상시키고자 실시하였다. 연구결과 부서 간 연계를 통해 부서 간 갈등수준이 낮아져야 시장지향성이 높아진다는 것을 알 수 있었다. 하지만 시장지향성이 고객성과에 미치는 영향에 대해서는 유의한 영향력을 확인할 수 없었으며, 시장지향성은 관계몰입이라는 매개변수를 통해 고객성과에 유의한 영향을 미친다는 점이 밝혀졌다. 현재 우리나라의 국제물류주선업의 시장은 매우 경쟁적이며, 경쟁전략의 대부분이 비용전략이며, 비용전략은 다른 경쟁기업이 고객에게 제공하는 비용에 따라 수시로 바뀌는 실정임을 비추어 볼 때, 국제물류주선업체들은 출혈경쟁을 지양하고, 고객기업과의 신뢰형성과 장기적인 관계유지를 위해 노력을 기울여야 경쟁력이 강화될 것으로 보인다. Because of rapid changes in business environment and fierce competition, firms are facing a more competitive environment and a more serious global competition. Many of the previous literatures have indicated that a business which increases its market orientation will improve its market performance. Numerous authors have argued the interdepartmental dynamics as prior factor to market orientation, and relationship commitment are an essential part of successful long-term relationships. Based on previous literatures, this study proposes the structure about interdepartmental dynamics, market orientation, relationship commitment and performance. The purpose of this paper is to find the impact of market orientation and relationship commitment on customer performance. In addition, this suggests interdepartmental dynamics as prior factor to market orientation. Results indicate that interdepartmental connections can reduce interdepartmental conflict, and lower conflict is a key factor of market orientation. Furthermore, this paper finds evidences that support the mediating effects of the relationship commitment between market orientation and customer performance.

크로스 플랫폼을 지원하는 지리 정보 시스템의 설계 및 구현

홍동완(Dong-Wan Hong),윤지희(Jee-Hee Yoon) 한국정보과학회 1999 한국정보과학회 학술발표논문집 Vol.26 No.2Ⅰ

본 논문에서는 이기종 운영체제의 다수의 서버에 존재하는 데이터베이스 시스템을 기반으로 하는 지리정보시스템의 개발 방식에 대하여 논한다. 데이터베이스 시스템을 기반으로 하는 지리정보시스템의 개발 방식은 WWW과의 연계를 통하여 원거리에 있는 다중의 사용자들에게 정보를 제공하는 형태로 개발되어져 왔으며, 최근에는 이질의 데이터베이스의 정보를 사용하기 위하여 CORBA를 이용한 분산 응용 프로그램 환경으로 발전하고 있다. 하지만, CORBA를 이용하여 이질의 데이터베이스 시스템을 지원하는 지리정보시스템을 구축할 경우 개발 부담이 있으며, 또한 이기종의 운영체제상에 있는 데이터베이스 시스템을 지원하는 경우에 개발비용이 증가하게 된다. 본 논문에서는 이기종의 운영체제상에 존재하는 이질의 데이터베이스 시스템과 정보를 공유하는 방식으로 크로스-플랫폼관리자를 제시하고자 한다.

건조 녹차잎 첨가량에 따른 열수추출 된 마유의 품질특성관찰

홍동완 ( Dong-wan Hong ),천지연 ( Ji-yeon Chun ) 한국산업식품공학회 2018 산업 식품공학 Vol.22 No.3

본 연구는 마지에서 마유 추출시 천연 항산화제인 건조 녹차잎을 다양한 농도로 첨가하여 추출공정 및 저장기간동안 지방산패 특성을 관찰하고자 하였다. 마유의 품질특성을 식품공전에 고시되어 있지 않지만 산가, 과산화물과, TBA가, 요오드화가 등의 품질특성관찰을 통해 다른 종류의 식용유지의 규격과 비교하여 보았다. 또한 천연 항산화 제인 녹차잎 첨가로 인해 추출 및 저장시 지방산패를 어느정도 방지할 수 있는지 확인 가능하였다. 지방산조성 분석을 통해 마유의 포화지방산 및 불포화지방산 조성 변화도 관찰하였다. 따라서 본 연구를 통하여 최근 이용도가 높아지는 마유의 기준 규격마련을 위한 기초자료로 사용 가능할 것으로 판단된다. This study was carried out to investigate horse oil qualities which were extracted by hot water by adding various amounts of green tea leaves. To observe the lipid oxidation of various horse oils, factors such as acid value, peroxide value, TBA value, iodine value, and fatty acid composition were evaluated for 49 days. The Ministry of Food and Drug Safety regulations permits edible beef tallow or edible lard to have <0.3 mg KOH/g of acid value and most horse oil complied with the specification of animal fat and oils except for the 0.5% green tea leaves-treated horse oil. The peroxide value and TBA value of all the horse oil were significantly increased during storage but the rate of lipid oxidation was lower in the sample where higher concentration green tea leaves were added. Iodine value was also lower when the amount of green tea leaves was higher in the horse oil extraction processing. In fatty acid composition observation, palmitoleic acid which is a predominantly unsaturated fatty acid in human sebum lipid was increased by adding green tea leaves during extraction processing, but it was decreased for storage. This study would present the basic information of lipid oxidation properties of horse oil and suggest appropriate extraction conditions to inhibit lipid peroxidation by using green tea leaves.

정렬된 리드의 통계적 분석을 기반으로 하는 CNV 검색 알고리즘

홍상균,홍동완,윤지희,김백섭,박상현,Hong, Sang-Kyoon,Hong, Dong-Wan,Yoon, Jee-Hee,Kim, Baek-Sop,Park, Sang-Hyun 한국정보처리학회 2009 정보처리학회논문지D Vol.16 No.5

인간의 유전체 서열에는 유전체 단위반복변위(copy number variation, CNV)를 포함하는 다양한 유전적 구조 변이(genetic structural variation)가 존재하며, 이는 기능적으로 질병에 대한 감수성, 치료에 대한 반응, 유전적 특성 등과 밀접한 관련이 있다. 본 논문에서는 기가 시퀀싱(giga sequencing)의 결과 산출되는 대량의 짧은 길이의 DNA 서열 데이터를 이용한 새로운 CNV 검색 방식을 제안한다. 제안하는 알고리즘에서는 레퍼런스 시퀀스에 DNA 서열 데이터를 서열 정렬시켜 각 레퍼런스 시퀀스의 위치에 대한 서열 데이터의 출현 빈도 정보를 얻은 후, 출현 빈도 정보의 패턴을 분석하여 통계적 유의성을 갖는 1kbp 이상의 연속 영역을 CNV 후보 영역으로 추출한다. 또한 제안된 알고리즘을 효율적으로 지원하기 위한 서열 정렬 방식에 대한 비교 및 분석을 수행한다. 제안된 기법의 유용성을 규명하기 위하여 다양한 실험을 수행하였다. 실험 결과에 의하면, 제안된 기법은 비교적 낮은 커버리지의 기가 시퀀싱 데이터를 이용하여 반복되거나 결실되는 다양한 형태의 CNV 영역을 효율적으로 검출하며, 또한 작은 사이즈의 CNV 영역에서부터 큰 사이즈의 CNV 영역까지 다양한 크기의 CNV 영역을 효율적으로 검출 할 수 있는 것으로 나타났다. Recently it was found that various genetic structural variations such as CNV(copy number variation) exist in the human genome, and these variations are closely related with disease susceptibility, reaction to treatment, and genetic characteristics. In this paper we propose a new CNV detection algorithm using millions of short DNA sequences generated by giga-sequencing technology. Our method maps the DNA sequences onto the reference sequence, and obtains the occurrence frequency of each read in the reference sequence. And then it detects the statistically significant regions which are longer than 1Kbp as the candidate CNV regions by analyzing the distribution of the occurrence frequency. To select a proper read alignment method, several methods are employed in our algorithm, and the performances are compared. To verify the superiority of our approach, we performed extensive experiments. The result of simulation experiments (using a reference sequence, build 35 of NCBI) revealed that our approach successfully finds all the CNV regions that have various shapes and arbitrary length (small, intermediate, or large size).

CNV 영역 검색 알고리즘

홍상균 ( Sang-kyoon Hong ),홍동완 ( Dong-wan Hong ),윤지희 ( Jee-hee Yoon ) 한국정보처리학회 2008 한국정보처리학회 학술대회논문집 Vol.15 No.2

최근 생물정보학 분야에서 인간 유전체에 존재하는 CNV(copy number variation)에 관한 연구가 주목 받고 있다. CNV 영역은 lkbp~3Mbp 사이의 서열이 반복되거나 결실되는 변이 영역으로 정의된다. 우리는 선행 연구에서 기가 시퀀싱(giga sequencing)의 결과 산줄되는 DNA 서열 조각인 리드(read)를 레퍼런스 시퀀스에 서열 정렬하여 CNV 영역을 찾아내는 새로운 CNV 검색 방식을 제안하였다. 후속 연구로서 본 논문에서는 DNA 서열에 존재하는 repeat 영역 문제를 해결하기 위한 새로운 방안을 제안하고, 리드의 출현 빈도 정보를 분석하여 CNV 영역을 찾아내는 CNV 영역 검색 알고리즘을 보인다. 제안된 알고리즘은 Gaussian 분포를 갖는 출현 빈도 정보로부터 통계적 유의성을 갖는 영역을 추출하여 CNV 영역 후보로 하고, 다음 정제 과정을 거쳐 최종의 CNV 영역을 추출한다. 성능 평가를 위하여 프로토타입 시스템을 개발하였으며, 시뮬레이션 실험을 수행하였다. 실험 결과에 의하여 제안된 방식은 반복되거나 결실되는 형태의 CNV 영역을 효율적으로 검출하며, 또한 다양한 크기의 CNV 영역을 효율적으로 검출할 수 있음을 입증한다.

객체지향 데이터베이스상의 협력질의응답

원정임(Jung-Im Won),홍동완(Dong-Wan Hong),이경준(Kyung-Jun Lee),윤지희(Jee-Hee Yoon) 한국정보과학회 1997 한국정보과학회 학술발표논문집 Vol.24 No.1B

기존의 질의처리 시스템에서 사용자가 질의문을 잘못 작성하거나, 문제 영역을 잘못 기술한 경우, 사용자는 일반적으로 원하는 해를 얻지 못하거나 매우 제한적인 해만을 얻게 된다. 객체지향 데이터베이스 시스템상에서 이와같은 문제점을 보완하여, 사용자의 질의 응답 과정을 적극 지원하는 협력 질의 응답 기능에 대하여 논한다. 이를 위한 시스템 요구 사항, 시스템 기능 등을 정의하고, 클래스 구조의 지식베이스 구성 방법, 클래스 객체의 계층 구조 및 객체의 유사도 개념을 활용한 질의 수정 및 변환처리 방식 등에 제안한다. 또한 이들 이론에 근거한 질의 처리 시스템의 설계 및 구현 방식에 대하여 설명한다. 질의 처리 시스템은 사용자와의 합의하에 질의의 구문 보정, 스키마 질의, 질의 그래프 출력, 유사 객체 검색, 결과의 설명 기능 등을 제공한다.

차세대 시퀀싱 데이터를 위한 SNP 분석 방법

홍상균 ( Sang-kyoon Hong ),이덕해 ( Deok-hae Lee ),공진화 ( Jin-hwa Kong ),김덕근 ( Deok-keun Kim ),홍동완 ( Dong-wan Hong ),윤지희 ( Jee-hee Yoon ) 한국정보처리학회 2010 한국정보처리학회 학술대회논문집 Vol.17 No.2

최근 차세대 시퀀싱 기술의 급속한 발전에 따라 서열 정보의 해독이 비교적 쉬워지면서 개인별 맞춤 의학의 실현에 대한 기대와 관심이 높아지고 있다. 각 개인의 서열 정보 사이에는 SNP (single nucleotide polymorphism), Indel, CNV (copy number variation) 등의 다양한 유전적 구조 변이가 존재하며, 이러한 서열 정보의 부분적 차이는 각 개인의 유전적 특성 및 질병 감수성 등과 밀접한 관련을 갖는다. 본 연구에서는 차세대 시퀀싱 결과로 산출되는 수많은 짧은 DNA 서열 조각인 리드 데이터를 이용한 SNP 추출 알고리즘을 제안한다. 제안된 알고리즘에서는 레퍼런스 시퀀스의 각 위치에 대한 리드 시퀀스의 매핑 정보를 기반으로 SNP 후보 영역을 추출하며, 품질 정보 등을 활용하여 에러 발생률을 최소화한다. 또한 대규모 시퀀싱 데이터와 SNP 구조 변이 데이터의 효율적인 저장/검색을 지원하는 시각적 분석 도구를 구현하여 제안된 방식의 유용성을 검증한다.

마이크로어레이 데이터 공유 시스템

윤지희(Jee-Hee Yoon),홍동완(Dong-Wan Hong),이종근(Jong-Keun Lee) 한국콘텐츠학회 2009 한국콘텐츠학회논문지 Vol.9 No.8

최근, 마이크로어레이 실험 데이터의 품질과 재생산성에 대한 신뢰도가 증가하고 있어 마이크로어레이 데이터의 공유 및 활용에 대한 요구가 급속히 증가하고 있다. 그러나 공개되어 있는 국내, 외 마이크로어레이 데이터는 실험 방식, 플랫폼 등에 따라 서로 다른 데이터 항목과 포맷을 가지므로 데이터의 실제적 접근 및 활용이 어려운 상황이다. 본 논문에서는 실험 플랫폼, 데이터 포맷, 정규화 기법, 분석 방식 등이 서로 다른 기존의 마이크로어레이 데이터를 효율적으로 검색, 공유, 통합할 수 있는 마이크로어레이 데이터 공유 시스템을 제안한다. 제안된 시스템은 웹 서비스 기반 기술을 이용하여 분산된 마이크로어레이 데이터를 통합하며, 각 사이트의 사용자는 UDDI를 통하여 검색한 데이터를 표준 MGED 기반의 공통데이터 구조로 자동 변환하여 다운 받을 수 있다. 정의된 공통 데이터 구조는 IDF, ADF, SDRF, EDF로 구성되어 다양한 구조의 마이크로어레이를 통합할 수 있는 템플릿 역할을 수행하며, MAGE-ML, MAGE-TAB, XML Schema 문서로 저장할 수 있다. 또한 제안된 시스템의 자동 데이터 제출기, 파일관리자 등은 마이크로어레이 데이터 공유를 위한 다양한 부가 기능을 제공한다. Improved reliability of microarray data and its reproducibility lead to recent increment in demand of data sharing and utilization among laboratories, but house-keeping and publicly opened microarray experimental data can hardly be accessed and utilized since they are in heterogeneous formats according to the various experimental methods and microarray platforms. In this paper, we propose a microarray sharing method which can easily retrieve and integrate microarray data from different experiment platforms, data formats, normalization methods, and analysis methods. Our system is based on web-service technology. The biologists of each site are able to search UDDI(Universal Description, Discovery, and Integration) registry, and download microarray data with common data structure of standard format recommended by MGED(Microarray Gene Expression Databases) society. The common data structure defined in this paper consists of IDF(Investigation Design Format), ADF(Array Design Format), SDRF(Sample and Relationship Format), and EDF(Expression Data Format). These components play role as templates to integrate microarray data with various structure and can be stored in standard formats such as MAGE-ML, MAGE-TAB, and XML Schema. In addition, our system provides advanced tools of automatic microarray data submitter and file manager to manipulate local microarray data efficiently.