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      • RNA 시퀀싱 데이터를 이용한 병렬 SNP 추출 알고리즘

        김덕근 ( Deok-keun Kim ),이덕해 ( Deok-hae Lee ),공진화 ( Jin-hwa Kong ),이은주 ( Un-joo Lee ),윤지희 ( Jee-hee Yoon ) 한국정보처리학회 2011 한국정보처리학회 학술대회논문집 Vol.18 No.1

        최근 차세대 시퀀싱 (Next Generation Sequencing, NGS) 기술이 발전하면서 DNA, RNA 등의 시퀀싱 데이터를 이용한 유전체 분석 방식에 관한 연구가 활발히 이루어지고 있다. 차세대 시퀀싱 데이터를 이용한 유전체 분석 방식은 마이크로어레이 혹은 EST/cDNA 데이터를 이용한 기존의 분석 방식에 비하여 비용이 적게 들고 정확한 결과를 얻을 수 있다는 장점이 있다. 그러나 이 들 DNA, RNA 시퀀싱 데이터는 각 시퀀스의 길이가 짧고 전체 용량은 매우 커서 이 들 데이터로부터 정확한 분석 결과를 추출하는 데에 많은 어려움이 있다. 본 연구에서는 클라우드 컴퓨팅 기술을 기반으로 하여 대용량의 RNA 시퀀싱 데이터를 고속으로 처리하는 병렬 SNP 추출 알고리즘을 제안한다. 전체 게놈 데이터 중 유전자 영역만을 high coverage로 시퀀싱하여 얻어지는 RNA 시퀀싱 데이터는 유전자 변이 추출을 목적으로 분석되며, SNP(Single Nucleotide Polymorphism)와 같은 유전자 변이는 질병의 원인 규명 및 치료법 개발에 직접 이용된다. 제안된 알고리즘은 동시에 실행되는 다수의 Map/Reduce 함수에 의해서 대규모 RNA 시퀀스를 병렬로 처리하며, 레퍼런스 시퀀스에 매핑된 각 염기의 출현 빈도와 품질 점수를 이용하여 SNP를 추출한다. 또한 이 들 SNP 추출 결과에 대한 시각적 분석 도구를 제공하여 SNP 추출 과정 및 근거를 시각적으로 확인/검증할 수 있도록 지원한다.

      • KCI등재
      • 양액 공급기에서 양액 농축액의 공급 유량이 EC, pH 제어 성능에 미치는 영향

        김덕근 ( Kim Deok-keun ),양승환 ( Yang Seung-hwan ),손현식 ( Son Hyun-sik ) 한국농업기계학회 2022 한국농업기계학회 학술발표논문집 Vol.27 No.1

        양액 공급기는 배합통에 A액과 B액, 산액으로 구성된 농축액 각각을 투입하여 목표로한 양액의 EC, pH로 조성한 뒤 일정 시간 혹은 일정량을 작물에 공급하는 장치이다. 양액 공급기의 특성상 다양한 구역의 배지에 다른 농도의 양액을 공급할 때 양액의 EC 및 pH를 맞추는 과정까지도 작물에 양액을 공급하게 되어 목표로 하였던 농도에 못미치거나 높은 농도의 양액을 작물에 공급하게 되는 문제점이 있다. 따라서 본 연구에서는 순차적으로 양액의 EC를 높일 때 목표한 EC, pH를 안정적으로 공급하는 시간을 최소화하기 위한 실험을 진행하였다. EC를 1 dS/m에서 2 dS/m, 2 dS/m에서 3 dS/m, 3 dS/m에서 4 dS/m으로 변경하며 pH 6.0을 목표로 양액 농축액의 공급 유량을 3, 4, 5 L/min으로 변경하며 매 10sec에 1회씩 EC 및 pH를 측정하였다. 양액 농축액의 공급 유량이 3, 4, 5 L/min일 때 EC 1 dS/m에서 2 dS/m에 도달하는데 걸리는 시간은 평균 110.0sec, 120.0 sec, 116.7sec였다. 2d S/m에서 3 dS/m에 도달하는데 걸리는 시간은 각각 평균 130.0sec, 120.0sec, 93.3sec였고, 3 dS/m에서 4 dS/m에 도달하는데 걸리는 시간은 각각 평균 130.0sec, 103.3sec, 86.7sec로 측정되었다. 실험결과 농축액의 투입량이 5 L/min일 때 목표 EC, pH에 도달하는데 가장 짧은 시간이 소요되는 것으로 나타나 EC, pH 제어 성능이 가장 우수한 것으로 나타났다.

      • 온실 내 재배 구역별 단위 냉방 시스템 개발

        김덕근 ( Deok-keun Kim ),양승환 ( Seung-hwan Yang ),손현식 ( Hyun-sik Son ) 한국농업기계학회 2023 한국농업기계학회 학술발표논문집 Vol.28 No.1

        고온기 냉방에 소요되는 비용은 온실의 운영비에 직접적인 영향을 끼치는 요인 중의 하나로 효율적인 냉방을 위한 연구가 활발히 진행되고 있다. 기존의 포그 냉방, 팬앤 패드 시스템 등은 온실 전체를 냉방하기 위한 시스템을 구성하였다. 본 연구에서는 일부분만 직접 냉각하는 단위 냉방 시스템을 개발하였다. 냉매의 압축, 응축, 팽창, 증발의 냉방 사이클을 활용한 냉방기와 일정한 간격으로 타공되어 있는 냉풍 토출구를 포함한 냉풍관, 냉방기의 냉기를 가두어 두기 위한 냉기 가이드로 구성이 되어있으며, 냉풍토출구는 토출구 가이드가 장착되어 있어 냉풍관의 시작부터 끝까지 토출되는 냉풍의 풍속이 유사할 수 있도록 제작되었다. 냉방 시스템의 효과검증을 위해 냉방구역과 비냉방구역의 온도를 측정하고, 냉풍관 내, 온실 내부온도를 측정하여 냉방구역과 비냉방구역의 온도차이를 확인하였다. 냉방구역이 비냉방구역에 비해 평균 5.5°C 낮은 결과를 보였다. 냉방구역의 온도와 비냉방구역의 온도는 설명력(R2) 0.9234의 선형적인 상관관계가 있는 것으로 나타났는데, 냉방구역의 온도는 비냉방구역 온도가 1°C 증가할 때 0.6251°C 증가하는 것으로 나타났다. 냉방효율을 더욱 향상시키기 위해서는 냉풍의 사각지대 해소와 냉풍의 냉기손실을 감소에 관련한 추가연구가 필요할 것으로 판단된다.

      • KCI등재

        학부모의 교육권 인식 변화에 대한 비교 분석

        김덕근(Deok-Keun Kim) 한국교육행정학회 2007 敎育行政學硏究 Vol.25 No.2

        이 연구의 목적은 학부모의 교육권 인식 변화에 대하여 1998년과 2007년도의 통계자료를 비교 분석하는 것이다. 분석 결과를 바탕으로 한 연구결론은 다음과 같다. 첫째, 교육에 대한 학부모의 권리가 어느 정도 보장되고 있는지에 대하여, 2007년에는 고학력일수록 긍정적인 견해를 보였다. 둘째, 학교선택권의 보장정도에 대하여 고학력자일수록, 생활수준이 높을수록 학교선택권에 대해서 부정적인 견해를 보였다. 셋째, 학교선택권이 완전히 부여될 경우, 학교선택에 있어서 자녀의 능력과 적성을 가장 고려하는 것으로 나타났다. 특히 통학거리에 대해서는 별로 고려하지 않는 것으로 드러났다. 넷째, 재정적 부담을 학부모가 감수할 용의가 있는지에 대한 질문에 대하여 2007년 조사에서 고학력일수록, 생활수준이 높을수록 긍정적으로 인식하고 있는 것으로 나타났다. 다섯째, 현재 학부모들의 교육에 대한 관심을 학교행정이나 교육정책에 반영시킬 수 있는 가능성이 모색되어 있다고 생각하는지에 대하여 부정적인 인식이 다소 완화된 것으로 나타났다. 여섯째, 학교조직 참여에 대한 입장이 어떠한지에 대한 질문에 대해서 잘 참여하지 않는 것으로 나타났다. 잘 참여하지 않는 이유에 대해 이번 조사에서 1998년에 비해 필요성을 공감하나 경제적인 이유로 참여하지 않는다는 응답이 다소 높게 나타났다. Purpose of this study analyzes statistical data of 1998 and 2007 comparison about parents' rights to education perception change. The conclusions of this study are as follows: First, positive opinion was seen as attainments in scholarship is higher in 2007 how parents' rights about teaching is guaranteed. Second, contradictory opinion was seen about school choice as social stratum is high about guarantee degree of school choice. Third, I appeared consider best student's ability and aptitude in school selection in case of school choice attaches perfectly. Fourth, students' parents appeared by thing which recognize positively as social stratum is high in investigation in 2007 about question whether is willing to suffer financial burden. Fifth, I appeared by thing which contradictory realization is alleviated a little whether think now interest about teaching of students' parentses that possibility that can be reflected in school administration or educational policy was groped. Sixth, I appeared do not participate well about question whether situation about school formation participation is some. I sympathize with necessity than 1998 in this investigation about reason which do not participate well but response that do not participate for economical reason showed a little high.

      • 조도 조건별 아이스플랜트의 생육 데이터 측정 및 비교

        김덕근 ( Kim Deok-keun ),양승환 ( Yang Seung-hwan ),손현식 ( Son Hyun-sik ) 한국농업기계학회 2022 한국농업기계학회 학술발표논문집 Vol.27 No.2

        아이스플랜트는 번행초과의 식물이며 표면의 블러더 세포에는 인체에 유용한 성분이 다량 함유되어 있는 것으로 알려져 있다. 본연구에서는 저온기 온실에서 조도에 따른 생육 비교를 위하여 무차광, 35%차광, 55% 차광 3수준의 차광정도에서 생육 측정 및 분석을 진행하였다. 동시에 각 차광 지점별로 온도와 조도의 생육환경을 측정하였다. 생육은 엽장, 엽폭, 관부직경, 생체중에 대해서 측정을 하고 측정된 결과를 던컨 분석을 통해 유의성을 판단하였다. 생육은 2021년 12월 14일부터 2022년 1월 19일까지 진행하였으며 실험에 사용된 아이스플랜트는 각 수준별로 24뿌리씩 생육을 진행하였다. 무차광일 때의 엽장, 엽폭, 관부직경, 생체중은 각각 평균 48.88 cm, 95.91 cm, 7.3 mm, 1110.3 g으로 35% 차광에서의 생장과 55% 차광에서의 생장과 비교하여 가장 우수한 생장 정도를 보였다. 일평균기온은 무차광과 35% 차광에서 13.5℃, 55% 차광에서 13.3℃로 유의미한 차이가 없었으며 일평균조도는 무차광일 때 2239 lx, 35% 차광일 때 2052.9 lx, 55% 차광일 때 1044.3 lx로 측정되어 무차광과 35% 차광, 55% 차광에서의 생육 정도의 차이가 여기서 발생한 것으로 판단된다.

      • KCI등재

        「참여정부」의 사립학교법 개정과정 분석: Allison Model의 적용을 중심으로

        김덕근 ( Deok Keun Kim ) 경북대학교 중등교육연구소 2011 중등교육연구 Vol.59 No.1

        이 연구는 Allison이 제시한 정책결정모형을 적용하여 참여정부의 사립학교법 개정과정에 대해 분석하였다. Allison은 과거에 논의된 정책결정과정에 대한 여러 가지 모형을 합리모형(ModelⅠ)과 조직모형(ModelⅡ)으로 대별하여 정리하고 제3의 모형으로 정치모형(ModelⅢ)을 제시하였다. 이에 기초하여 연구자는 참여정부의 사립학교법 개정과정을 Allison Model의 분석틀을 이용하여 어느 모형이 적용될 수 있는 지를 분석해 보았다. 분석결과는 조직관, 목표의 공유도, 정책결정의 양태, 정책결정의 일관성, 권력의 소재 등 모든 요소에서 정치모형(ModelⅢ)이 적용되는 것으로 분석되었다. It is the purpose of this study to analyze on The Private School Law amendment process of Roh moo-hyun government in korea on application of G. T. Allison`s decision making model. Allison`s model has three different dimensions so called rational actor model, organizational process model and government politics or bureaucratic politics model to explain decision making case in policy This paper applies Allison`s model to case of decision making on the Private School Law amendment process of Roh moo-hyun government in korea by analyzing five constituent elements of each model such as concept of policy, goal of policy, rule of policy making, consistency of policy making and location of power. As a results of application, the paper conclude The Private School Law amendment process of Roh moo-hyun government can be applied to the modelⅡ.

      • KCI등재
      • 진공식 마늘 배종 장치의 흡착판 형상이 배종 성능에 미치는 영향

        김덕근 ( Deok-keun Kim ),최영수 ( Yeong Soo Choi ),양승환 ( Seung Hwan Yang ) 한국농업기계학회 2019 한국농업기계학회 학술발표논문집 Vol.24 No.1

        본 연구는 전기 구동이 가능하고, 모듈화가 가능하며, 낮은 구동력으로 기존에 개발된 버킷형 마늘 파종기, 줄형 마늘 파종기, 집게형 마늘 파종기에 비해 빠른 배종 속도를 보이며 추가적인 작업이 필요하지 않은 진공식 마늘 파종기의 기본 설계 구조를 제시하고 마늘의 형상에서 최적의 성능을 보여줄 수 있는 진공식 배종 장치 흡착구에 위치한 실리콘 흡착판에서의 흡착면의 높이, 가이드의 높이, 흡착면의 지름을 변화시키면서 난지형 마늘과 한지형 마늘에서의 배종 성능을 분석하였다. 난지형 마늘에서 가이드가 없는 경우에는 약 81.1 %, 8.5 %의 배종율과 다립률을 보였지만 4mm의 가이드가 있을 때에는 평균 91.2 %, 15.3 %, 8 mm의 가이드가 있을 때는 평균 95.5 %, 21.8 %의 배종율과 다립률을 보였다. 한지형 마늘에서는 가이드가 없을 때 81.3 %, 14.5 %, 4 mm 가이드 일 때 89.8 %, 28.0%, 8 mm 가이드일 때 95.4 %, 40.3 %의 배종율과 다립률을 보였다. 이는 한지형 마늘이 난지형 마늘에 비해 얇고 긴 특성 때문에 한지형 마늘이 난지형 마늘에 비해 높은 다립률을 보이는 것으로 판단된다.

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