해녀콩 ( Canavalia lineata ) 의 뿌리혹 발달 단계에 따른 뿌리혹 특이 단백질의 변화 양상

최성화(Sung Hwa Choi),안정선(Chung Sun An) 한국식물학회 1991 Journal of Plant Biology Vol.34 No.2

Total soluble proteins from three developmental stages of induced root nodules of Canavalia lineata were compared with those of non-nodulated roots by SDS-PAGE and two dimensional (2-D) gel electrophoresis. Thirteen nodule-specific protein (nodulin) bands were identified by the former and 30 nodule specific protein spots were detected by the latter method respectively. Some of the nodulins were detected differentially depending on the nodule`s developmental stages. For example, only three leghemoglobin (Lb)-like protein spots appeared at stage Ⅰ (d<2 ㎜), but two additional Lb-like protein spots appeared at stage Ⅱ (d<4-5 ㎜). pI value and molecular weight of nomomers of Lb-like protein were narrower and greater than those of soybean, ranging from 4.4 to 5.0 and 15.7 kd respectively. Northern blot hybridization of total RNAs from roots and root nodules using soybean Lb cDNA as a probe made it clear that Lb gene was expressed tissue-specifically only in the root nodules.

부산지역 유흥업소 종사여성으로부터 분리된 HPV16형의 발암유전자(E6/E7) 돌연변이 유형 분석

민상기(Sang-Kee Min),김성순(Sung Soon Kim),최병선(Byeong-Sun Choi),장대호(Dai-Ho Jang),이미옥(Mee-Ok Lee),최성화(Seung-Hwa Choi),김남호(Nam-Ho Kim),박연경(Yon-Koung Park),정영아(Yeong-A Jeong),김성준(Seong-Joon Kim),빈재훈(Jae-Hun Bi 한국생명과학회 2009 생명과학회지 Vol.19 No.6

HPV-16형의 염기배열 변이는 지역적, 인종적으로 특징적인 차이가 있으며 특히 HPV-16형 E6/E7 유전자의 특정 염기서열변이는 자궁경부암 및 자궁상피내 신생종양물의 발생을 일으키는 고위험 요인으로 알려져 있다. 본 연구는 2007년 부산지역 유흥업소 종사여성으로 분리된 HPV-16형 19건을 대상으로 E6/E7 유전자 영역(nt 34-880)을 표적으로 지역적 염기서열 변이를 조사하였다. nucleotide 수준에서 HPV16형 E6 유전자는 T178G (n=11), T178A (n=1), T350G (n=4), A442C (n=2), A104T, A111G, C116T, G145T, T183G, C335T, G522C 등 11종의 변이주가 발견되었고, E7 유전자는 A647G (n=12), A645C, A777C, G663A, T732C, T760C, A775T, T789C, T795G 등 9종의 변이주가 발견되었다. 아미노산 수준에서는 HPV-16형 E6 단백질의 경우 D25E (n=12), L83V (n=4), E113D (n=2), M1L, Q3R, P5S, Q14H, D25N, I27R, H78Y, C140S 등 11종의 변이주를, HPV16형 E7 단백질의 경우 N29S (n=12), L28F, T72S 등 3종의 변이주를 관찰할 수 있었다. 본 연구 결과, 부산지역의 HPV-16형 E6/E7 우점 돌연변이주는 E6 D25E (75%), E7 N29S (78%)로 각각 나타났다. 앞으로 자궁경부암 환자 및 일반여성을 포함한 더 많은 모집단을 대상으로 HPV-16형 E6/E7의 intratypic variants를 비교 조사하여 실제 HPV-16형 E6/E7 어떤 변이주가 자궁경부암 유발 위험성과의 관련성은 더 많이 연구되어져야 할 것으로 사료된다. Recent studies have reported that the distribution of HPV-16 sequence variation differs geographically, and more specifically that HPV-16 E6/E7 intratypic variants might carry a high risk for development of ICC (invasive cervical cancer) and CIN (cervical intraepithelial neoplasia) in a given population. To investigate the genetic diversities of HPV-16 E6/E7 oncogene by region, we collected nineteen HPV-16 isolates from sexually high-risk women in Busan, and analyzed the HPV-16 E6/E7 coding regions (nt 34 to 880) with HPV-16 E6/E7 specific PCR amplification. At the nucleotide level, eleven variants of the E6 genes and nine variants of the E7 genes were identified as follows: E6 T178G (n=11), E6 T178A (n=1), E6 T350G (n=3), E6 A442C (n=2), E6 A104T, E6 A111G, E6 C116T, E6 G145T, E6 T183G, E6 C335T, E6 G522C and E7 A647G (n=12), E7 A645C, E7 A777C, E7 G663A, E7 T732C, E7 T760C, E7 A775T, E7 T789C and E7 T795G, respectively. At the amino acid level, the isolated HPV-16 E6 and E7 genes showed eleven E6 variants: E6 D25E (n=12), E6 L83V (n=4), E6 E113D (n=2), E6 M1L, E6 Q3R, E6 P5S, E6 Q14H, E6 D25N, E6 I27R, E6 H78Y, E6 C140S and three E7 variants: N29S (n=12), L28F, T72S. HPV16 E6 L83V, the dominant variant in the Caucasian population, showed relatively low frequencies in our study population. We elucidated that the dominant HPV-16 E6/E7 variants were HPV-16 E6 D25E (63.2%) and HPV-16 E7 N29S (63.2%), which were phylogenetically included in Asian lineage. Further study is needed to evaluate the risk of cervical cancer related HPV-16 E6/E7 intratypic variants in the Korean population.

위성영상을 활용한 이포보 개방에 따른 하천공간 변화 분석

정수은(Jung, Soo Eun),최성화(Choi, Sung Hwa),박문성(Park, Mun Sung) 대한토목학회 2019 대한토목학회 학술대회 Vol.2019 No.10

전자선 조사한 아몬드(Prunus amygosalus L.)와 땅콩(Arachis hypogaea)에서 유래한 지방분해산물 분석

정인선(In Seon Jeong),김재성(Jae Sung Kim),황인민(In Min Hwang),최성화(Sung Hwa Choi),최지연(Ji Yeon Choi),노은영(Eun Yeong Nho),나임칸(Naeem Khan),김병숙(Byung Sook Kim),김경수(Kyong Su Kim) 한국식품과학회 2013 한국식품과학회지 Vol.45 No.1

아몬드와 땅콩의 비조사 시료와 1, 3, 5, 10 kGy로 전자선을 조사한 시료에서 유도된 hydrocarbon류의 생성량을 분석하기 위하여 지방을 n-hexane으로 추출하여 florisil column으로 분리 및 GC/MS로 분석하였다. 전자선 조사된 아몬드와 땅콩에서 유래한 hydrocarbon류는 oleic acid에서 1,7-hexadecadiene(C<SUB>16:2</SUB>)과 8-heptadecene(C<SUB>17:1</SUB>), linoleic acid에서 1,7,10-hexadecatriene(C<SUB>16:3</SUB>)과 6,9-heptadecadiene(C<SUB>17:2</SUB>), 그리고 palmitic acid에서 1-tetradecene(C<SUB>14:1</SUB>) 및 pentadecane(C<SUB>15:0</SUB>) 생성되었고, oleic acid와 palmitic acid에서는 C<SUB>n-2</SUB>, linoleic acid에서는 C<SUB>n-1</SUB> 화합물이 보다 더 높게 생성되었다. 전자선을 1, 3, 5, 10 kGy의 선량별로 조사한 시료에서 생성된 hydrocarbon류의 함량은 조사선량에 따라 증가하였고 비조사 시료에서는 확인되지 않았다. 특히, oleic acid와 linoleic acid에서 유래한 1,7-hexadecadiene(C16:2), 8-heptadecene(C17:1)과 1,7,10-hexadecatriene(C<SUB>16:3</SUB>) 및 6,9-heptadecadiene(C<SUB>17:2</SUB>)의 경우 아몬드와 땅콩 모두에서 다른 hydrocarbon류에 비해 전자선 조사에 의한 생성량이 높게 나타난바 전자선 조사유무 판별 marker로 사용 가능함을 확인하였다. Food irradiation has recently become one of the most successful techniques to preserve food with increased shelf life. This study aims to analyze hydrocarbons in almonds (Prunus amygosalus L.) and peanuts (Arachis hypogaea) induced by electron beam irradiation. The samples were irradiated at 0, 1, 3, 5 and 10 kGy by e-beam and using florisil column chromatography fat, and content was extracted. The induced hydrocarbons were identified using gas chromatography-mass spectrometry (GC/MS). The major hydrocarbons in both irradiated samples were 1,7-hexadecadiene (C<SUB>16:2</SUB>) and 8-heptadecene (C<SUB>17:1</SUB>) from oleic acid, 1,7,10-hexadecatriene (C<SUB>16:3</SUB>) and ,9-heptadecadiene (C<SUB>17:2</SUB>) from linoleic acid and 1-tetradecene (C<SUB>14:1</SUB>) and pentadecane (C<SUB>15:0</SUB>) from palmitic acid. Concentrations of the hydrocarbons produced by e-beam were found to be depended upon the composition of fatty acid in both almonds and peanuts. The Cn-2 compound was found to be higher than Cn-1 compound in oleic acid and palmitic acid, while in case of linoleic acid, Cn-1 compound was higher than Cn-2 compound. The radiation induced hydrocarbons were detected only in irradiated samples, with 1 kGy or above, and not in the non-irradiated ones. The production of 1,7-hexadecadiene (C<SUB>16:2</SUB>), 8-heptadecene (C<SUB>17:1</SUB>), 1,7,10-hexadecatriene (C<SUB>16:3</SUB>) and 6,9-heptadecadiene (C<SUB>17:2</SUB>), in high concentration gave enough information to suggest that these may be the possible marker compounds of electron beam irradiation in almonds and peanuts.

죽로차의 생엽과 반발효차의 휘발성 화합물 비교

전동복(Dong-Bok Jeon),이순임(Sun-Im Lee),김재성(Jae-Sung Kim),홍영신(Young-Shin Hong),정인선(In-Seon Jeong),최성화(Sung-Hwa Choi),노은영(Eun-Yeong Nho),최지연(Ji-Yeon Choi),나임칸(Naeem Khan),서혜영(Hye-Young Seo),김경수(Kyong-Su Kim 한국차학회 2012 한국차학회지 Vol.18 No.1

죽로차 생엽과 반발효차의 휘발성 화합물을 SDE 방법으로 추출하여 GC/MS로 분석하여 비교하였다. 생엽에서는 총 93종의 휘발성 화합물이 분석되었으며 alcohol류가 32종으로 함량은 75.9 ㎎/㎏으로 동정되었다. 그 외 화합물로 aldehyde류, ester류, hydrocarbon류, keton류, 함질소화합물류, acid류 등의 함량은 22.7 ㎎/㎏으로 확인되었다. 반발효차에서는 총 76종의 휘발성 화합물이 분석되었으며, alcohol류가 23종으로 함량은 59.0 ㎎/㎏이 확인되었다. Aldehyde류, ester류, hydrocarbon류, ketone류, 함질소화합물류, acid류 등 화합물은 44.9 ㎎/㎏으로 확인되었다. 죽로차 생엽에서 다량 동정된 휘발성 화합물은 (E)-2-hexenal, phenylethyl alcohol, geraniol 그리고 linalool이 총화합물의 31.5%를 차지하였고, 반발효차에서 각각 0.3, 1.2, 3.1 및 4.4 ㎎/㎏으로 동정되어 발효시 감소함을 확인하였다. 반발효차에서는 (E)-nerolidol, indole, ethyl acetate, coumaran, (Z)-jasmone 등이 주요 화합물로 확인되었고, peak area의 합계는 전체 화합물의 31.0%에 해당되었으며, 이들의 함량을 생엽과 비교 했을때 많은 양이 증가하였다. C6 화합물은 생엽에서 7.8 ㎎/㎏ 동정되었으며, 반발효차에서는 1.0㎎/㎏으로 많은 양이 감소하였다. Terpenoid의 화합물은 생엽과 반발효차에서 28.2 ㎎/㎏ 및 24.9 ㎎/㎏으로 확인되었다. 관능기별 함량은 alcohol류과 aldehyde류를 제외한 ester류, ketone류, hydrocarbon류, 함질소화합물류의 함량은 발효시 증가하였다. This study aimed to compare volatile compounds among fresh and semi-fermented leave of Zukro tea. Volatile compounds were extracted the using SDE method and analyzed by GC/MS. A total of 93 and 76 compounds were identified in fresh and semi-fermented leave, respectively. Alcohols were the predominant chemical group, with a proportion of 76.96% and 56.85% in fresh and semi-fermented leaves. The major alcohol compound in both samples was phytol, which had a higher aroma threshold and resulted from hydrolysis of chlorophyll. Terpenoid compounds were present at 29.1 and 24.9 ㎎/㎏, in fresh and semi-fermented leaves, respectively. Terpene alcohols such as linalool and geraniol were present as major volatile compounds at concentrations of 7.8 and 14.4 ㎎/㎏ in fresh leaves of Zukro tea, respectively. The contents of these two terpene alcohols were 4.4 and 3.1 ㎎/㎏ in semi-fermented leaves. C6 compounds were present at 7.8 ㎎/㎏ in fresh leaves but decreased to 1.0 ㎎/㎏ in semi-fermented leave. The contents of esters, ketones, hydrocarbons, and N-containing compounds all increased after semi-fermentation.

심층 신경망과 서포트 벡터 머신을 이용한 고속 화자 인식에 관한 연구

이경준(Lee Kyung June),이성민(Lee Seong Min),최성화(Choi Seong Hwa),이준규(Lee Jun Kyu),이상훈(Lee Sang Hoon) 한국통신학회 2019 한국통신학회 학술대회논문집 Vol.2019 No.1

부산지역에서 유행한 계절인플루엔자바이러스의 유전자 특성 및 계통분석(’06~’08 절기)

Yon-Koung Park(박연경),Nam-Ho Kim(김남호),Seung-Hwa Choi(최성화),Mi-Oak Lee(이미옥),Sang-Kee Min(민상기),Seong-Joon Kim(김성준),Kyung-Soon Cho(조경순),Young-Nan Na(나영란) 한국생명과학회 2010 생명과학회지 Vol.20 No.3

2006년 10월부터 2008년 6월까지 총 인플루엔자 의사 환자 1,822건의 인후도찰물 및 비인후도찰물에서 277건의 인플루엔자바이러스를 분리했다. 절기별로는 2006~2007 절기의 1,154검체 중 52건(4.5%), 2007~2008절기의 668검체 중 210건(31.4%)에서 인플루엔자바이러스를 분리하였다. 인플루엔자바이러스 A/H1N1의 HA 유전자의 경우, 2008~2009 절기의 백신주인 A/Brisbane/59/2007과는 96.7%~97.7%, A/Solomon Islands/3/2006 96.5%~97.3%, A/New Caledonia/20/99와는 95.6%~96.6%의 유사성을 나타냈으며, NA 유전자의 경우, A/Brisbane/59/2007과는 97.8%~98.5%, A/Solomon Islands/3/2006과는 96.7%~97.6%, A/New Caledonia/20/99와는 96.8%~97.7%의 유사성을 보여 2008~2009절기의 백신주인 A/Brisbane/59/07과 가장 유사성이 컸다. 인플루엔자바이러스 A/H3N2의 분리주 중 1주를 제외한 모든 분리주가 HA 유전자에서 2008~2009 절기 백신주인 A/Brisbane/10/2007과는 98.4%~99.7%의 유사성을 보였고, A/Wisconsin/67/2005와는 96.5%~97.5%의 유사성을 보였으며, NA 유전자에서는 A/Brisbane/10/2007과는 98.9%~99.4%, A/Wisconsin/67/2005와는 98.0%~98.6%, A/California/7/2004와는 98.3%~98.9%의 유사성을 보였다. 인플루엔자바이러스 B의 HA 유전자의 경우는 2주를 제외하고는 2008~2009 절기의 백신주인 B/Florida/4/2006과는 96.5%~99.7%의 유사성을 보였으며, B/Malaysia/2506/2004와는 86.7%~87.7%의 유사성을 보여 B/Florida/4/2006과의 유사성이 크게 나타났다. NA 유전자의 경우는 reassortant분리주가 96.7%와 97.3%의 유사성을 나타내는 것을 제외하고는 B/Florida/4/2006에 98.9%~100%의 유사성을 나타냈으며, 분리주 유행시기의 백신주인 B/Malaysia/2506/2004와는 94.5%~96.7%의 유사성을 나타내어 2008~2009 절기의 백신주와 더 큰 유사성을 보였다. HA 유전자에서는 conserverd receptor binding site는 아미노산의 치환 없이 모든 분리주에서 잘 보존되어 있었으며, N-linked glycosylation site도 인플루엔자바이러스 A/H1 1주, A/H3 1주를 제외하고는 모두 같은 수의 N-linked glycosylation sites를 가졌으며, 인플루엔자바이러스 B의 경우는 2008~2009 절기의 백신주보다 1개가 많은 4개의 N-linked glycosylation sites를 가지고 있었다. Antigenic sites의 경우는 인플루엔자바이러스 A/H1의 Sb의 3개의 아미노산에서 백신주들과 다른 아미노산을 가지고 있으며, A/H3에서는 A, B, E 부위에서는 아미노산의 변화가 나타났고, C, D 부위에서는 변화가 없었다. 인플루엔자바이러스 B의 4개의 분리주에서는 150 loop와 160 loop에서 B/Florida/4/2006과 비교하여 1개의 아미노산에서 치환이 나타났으며, 190 helix에서 모든 분리주가 B/Florida/4/2006과 비교하여 1개의 아미노산에서 치환이 나타났다. To monitor newly emerged influenza virus variants and to investigate the prevalence pattern, our laboratory performed isolation of the viruses from surveillance sentinel hospitals. In the present study, we analysed influenza A/H1N1, A/H3N2, B viruses isolated in Busan during the 2006/07 and 2007/08 seasons by sequence analysis of the hemagglutinin (HA1 subunit) and neuraminidase (NA) genes. The isolates studied here were selected by the stratified random sample method from a total of 277 isolates, in which 15 were A/H1N1, 16 were A/H3N2 and 29 were B. Based on the phylogenetic tree, the HA1 gene showed that A/H1N1 isolates had a 96.7% to 97.7% homology with the A/Brisbane/59/2007, A/H3N2 isolates had a 98.4% to 99.7% homology with the A/Brisbane/10/2007, and B isolates had a 96.5% to 99.7% homology with the B/Florida/4/2006(Yamagata lineage), which are all the vaccine strains for the Northern Hemisphere in 2008~2009 season. In the case of the NA gene, A/H1N1 isolates had 97.8% to 98.5% homologies, A/H3N2 isolates had 98.9% to 99.4% homologies, and B isolates had 98.9% to 100% homologies with each vaccine strain in the 2008~2009 season, respectively. Characterization of the hemagglutinin gene revealed that amino acids at the receptor-binding site and N-linked glycosylation site were highly conserved. These results provide useful information for the control of influenza viruses in Busan and for a better understanding of vaccine strain selection.

전자선 조사한 자두의 휘발성 유기성분 변화

정인선 ( In Seon Jeong ),이순임 ( Sun Im Lee ),전동복 ( Dong Bok Jeon ),홍영신 ( Young Sin Hong ),김재성 ( Jae Sung Kim ),최성화 ( Sung Hwa Choi ),노은영 ( Eun Yeong Nho ),최지연 ( Ji Yeon Choi ),김병숙 ( Byung Sook Kim ),김경수 ( 한국식품저장유통학회 ( 구 한국농산물저장유통학회 ) 2012 한국식품저장유통학회지 Vol.19 No.2

The changes in the volatile organic compounds in plum after its electron beam irradiation and storage were determined using the simultaneous distillation extraction method and gas chromatograph-mass spectrometry. There were 44, 46, 45, 47, and 38 volatile compounds in the 0-, 0.25-, 0.5-, 0.75-, and 1 kGy irradiated samples, respectively. Also, the volatile flavor components of the plum that was stored for 30 days were identified as 48, 40, 40, 39, and 40 components. The compositions of the volatile compounds of the control and irradiated samples showed a similarity after the storage. Especially, the more important volatile flavor of the plum was identified as hexanal of the C6compounds, (E)-2-hexenal and (Z)-3-hexenal. In particular, hexanal, (E)-2-hexenal, and (Z)-3-hexen-1-ol increased in all the doses, where as hexanol and (E)-2-hexen-1-ol decreased. Among the lactone compounds, γ-hexalactone, γ-octalactone, and γ-decalactone were identified during the storage period in the raw samples. Hexanonic acid and 2-hexenoic acid were not identified during the storage of the samples, and 2-methylprrole was detected only when the storage samples were irradiated at a dose higher than 0.5kGy. Therefore, it was shown that there was no effect on the variation of the volatile organic component suntil 1 kGy in the plum was irradiated with an electron beam.