5,10-Methylenetetrahydrofolate Reductase (MTHFR C677T와 A1298C) 유전자 돌연변이의 반복자연유산 관련성 연구

김남근,남윤성,이수만,김선희,신승주,장성운,김세현,차광렬,오도연,Kim, Nam-Keun,Nam, Yoon-Sung,Lee, Su-Man,Kim, Sun-Hee,Shin, Seung-Joo,Chang, Sung-Woon,Kim, Se-Hyun,Cha, Kwang-Yul,Oh, Do-Yeun 대한생식의학회 2002 Clinical and Experimental Reproductive Medicine Vol.29 No.3

Objective : Previous studies have suggested that hyperhomocysteinemia and methylenetetrahydrofolate reductase (MTHFR C677T) mutations are associated with increased risk of recurrent spontaneous abortion (RSA). Recently, a second site polymorphism in MTHFR, 1298A-->C, which changes a glutamic acid into an alanine residue, was shown to be associated with a decreased enzyme activity. We tested whether the variant alleles of MTHFR C677T and A1298C are risk factor (biomarker) for RSA. Materials and Methods: We analyzed DNA from a case-control study in the Korean DNA was extracted from blood samples of 118 patients with RSA and 123 healthy fertile patients as the controls. MTHFR variant alleles were determined by a PCR-restriction fragment length polymorphism assay. Results: We found no evidence for an association between 677TT genotype and risk of RSA (OR=1.95, 95% CI=$0.84{\sim}4.50$, p=0.12). However, the MTHFR 1298AC (OR=0.36, 95% CI=$0.20{\sim}0.63$, p=0.0004) and 1298AC+CC (OR=0.35, 95% CI=$0.20{\sim}0.61$, p=0.0002) genotypes were lower among 118 RSA cases compared with 123 controls, conferring a 2.8-fold decrease in risk of RSA, respectively. Moreover, the combined genotypes of MTHFR 677CC/1298AC (OR=0.30, 95% CI=$0.10{\sim}0.88$, p=0.029) and 677CT/1298AC (OR=0.77, 95% CI=$0.60{\sim}0.99$, p=0.043) also showed significantly lower risk than those with MTHFR 677CC/1298AA type. Conclusion: MTHFR 1298AC, MTHFR 677CC/1298AC and 677CT/1298AC genotypes may represent genetic markers for the protection of RSA at least in Korean women.

청국장으로부터 Bacillus cereus에 대한 길항 균주 분리 및 길항 효과

이남근(Nam Keun Lee),박정완(Joung Whan Park),조일재(Il Jae Cho),김병용(Byung-Yong Kim),권기옥(Ki-Ok Kwon),함영태(Young Tae Hahm) 한국식품과학회 2008 한국식품과학회지 Vol.40 No.6

청국장 내에 B. cereus을 효과적으로 저지하기 위한 생물학적 제어 방법의 개발을 위하여 전통적 방법으로 제조한 백태 및 흑태 청국장으로부터 총 20종의 Bacillus 속 균주를 분리하였고, 이중에서 24시간 배양액에서 B. cereus에 대한 길항활성이 가장 높은 Bacillus sp. SC-8 균주를 선별하였다. 이 균주를 B. cereus와 혼합하여 청국장을 제조한 후 길항능을 분석한 결과 청국장 발효 중에는 B. cereus에 대한 길항효과가 있었으나, 발효 후 4℃ 저장 중에는 균체수가 감소하여 억제효과가 감소하는 것으로 분석되었다. 또한 대조군으로 사용하였던 Bacillus sp. SC-15 균주에서는 배양액에서는 B. cereus에 대한 길항 활성이 낮았으나 청국장 내에서는 길항효과를 보임에 따라 청국장 발효에 관여하는 균들은 배양 환경에 따라 길항물질의 생성에 차이가 있음을 보였다. For the development of a biological control method against B. cereus in cheonggukjang, 20 Bacillus spp. were isolated from the naturally fermented baektae and heuktae cheonggukjang, identified by using 16S rDNA sequences. Among the isolated strains, Bacillus sp. SC-8 was selected using the B. cereus lawn cell assay as an antagonistic microorganism against B. cereus. The culture medium of Bacillus sp. SC-8 after 24 hr of incubation at 37℃ also evidenced a high level of antagonistic activity. In cheonggukjang fermented with the mixed culture of Bacillus sp. SC-8 and B. cereus, antagonistic effect against B. cereus was maintained during the fermentation of cheonggukjang, while its effect was reduced during storage at 4℃ due to the decrement of cell population of Bacillus sp. SC-8. In Bacillus sp. SC-15, which was utilized a control, antagonistic activity against B. cereus was not demonstrated on the lawn cell plate assay and culture medium, but its effects were detected in cheonggukjang. Therefore, the production of antagonistic substances of Bacillus spp. depends on the fermentative environment.

한국인 조기 난소부전 불임환자에서 황체형성 호르몬 유전자 변이 분석

김남근,이유진,남윤성,이숙환,전혜선,박찬,김종욱,이경아,고정재,차광열,Kim, Nam-Keun,Lee, Eu-Gene,Nam, Yoon-Sung,Lee, Sook-Hwan,Jeon, Hye-Sun,Park, Chan,Kim, Jong-Wook,Lee, Kyung-Ah,Ko, Jung-Jae,Cha, Kwang-Yul 대한생식의학회 2000 Clinical and Experimental Reproductive Medicine Vol.27 No.2

This study was performed to determine whether the $LH{\beta}$-subunit gene missense mutation is present in Korean infertile patients with 46,XX POF women. The variants of $LH{\beta}$ exon 2 (Trp 8Arg; TGG to CGG and Ile15Thr; ATC to ACC) were studied in forty-four 46,XX idiopathic POF and 54 nonpregnant women. The $LH{\beta}$ exon 2 variants were more frequent in POF patients (20.5%) than nonpregnant (16.7%) women (p>0.05). POF patients with the variant was slightly higher than nonpregnant women with the variant.

The Analysis of the $LH{\beta}$ Gene Mutation in Infertile Patients with Endometriosis and Amenorrhea Women

김남근,이유진,남윤성,이상희,정기화,고정재,이숙환,차광열,Kim, Nam-Keun,Lee, Eu-Gene,Nam, Yoon-Sung,Lee, Sang-Hee,Chung, Ki-Wha,Ko, Jung-Jae,Lee, Sook-Hwan,Cha, Kwang-Yul The Korean Society for Reproductive Medicine 2000 Clinical and Experimental Reproductive Medicine Vol.27 No.1

연구목적: 본 연구는 자궁내막증과 무월경 불임환자들을 대상으로 $LH{\beta}$ exon 2 유전자의 돌연변이를 탐색하고자 시도하였다. 연구재료 및 방법: 그 대상으로 22명의 자궁내막증 환자와 12명의 무월경 환자 그리고, 54명의 건강한 비임신 여성을 대조군으로 사용하였다. 이들을 대상으로 한 돌연변이 탐색은 PCR-RFLP(polymerase chain reaction-restriction fragment polymorphism) 방법으로 수행되었다. 결과: 그 결과 자궁내막증과 무월경증 환자에서 그 변이의 비율이 각각 18.2%, 16.7% 그리고, 대조군에서 역시 16.7%의 빈도를 나타냈다. 결론: 따라서, 자궁내막증과 무월경증 환자는 $LH{\beta}$ exon 2 돌연변이와는 서로 관련이 없거나 매우 적음을 알 수 있었다.

Amino-carbonyl 반응에 의한 glucose-poly-γ-glutamate (Glu-PGA) 갈변 반응물질의 항산화적 특성 연구

이남근(Nam-Keun Lee),함영태(Young-Tae Hahm) 한국식품과학회 2005 한국식품과학회지 Vol.37 No.5

미생물,발효,생물공학 : 경기,강원 지역의 전통발효 청국장으로부터 Bacillus 균주의 분리 동정 및 특성 분석

이남근 ( Nam Keun Lee ),전은희 ( Eun Hee Jeon ),이효진 ( Hyo Jin Lee ),조일재 ( Il Jae Cho ),함영태 ( Young Tae Hahm ) 한국응용생명화학회 2006 Applied Biological Chemistry (Appl Biol Chem) Vol.49 No.4

다중 중합효소연쇄반응 ( Multiplex PCR ) 방법을 이용한 한국인 자궁경부암 환자에서의 HPV 고 위험군 및 저 위험군의 동시 분석

김남근(Nam Keun Kim),이찬(Chan Lee),이숙환(Sook Hwan Lee),고정재(Jung Jae Ko),손태종(Tae Jong Sohn),오유경(Yu Kyoung Oh),안희정(Hee Jung Ahn),차광열(Kwang Yul Cha) 대한산부인과학회 2000 Obstetrics & Gynecology Science Vol.43 No.9

목적 : 다중 중합효소연쇄반응 (Multiplex PCR) 방법을 이용하여 자궁경부암 환자에서 인유두종부 바이러스 (human papilloma virus; HPV)의 고 위험군과 저 위험군을 동시에 검색하고, 이를 진단 및 예후판정에 이용하고자 시도하였다. 연구방법 : 1995년 6월부터 11월까지 분당 차병원 산부인과에 내원하여 생검이나 수술적 적출술을 수행한 71명의 환자를 대상으로 실시하였다. Multiplex PCR 방법으로 한번의 RCR 수행으로 HPV 감염여부 및 고 위험군, 저 위험군을 동시에 typing하였다. 이때, HPV의 L1, E6, E7 DNA에 대한 3 set의 primer를 동시에 반응시켜 결과를 얻었다. 결과 : 총 68명의 자궁경부암 환자를 대상으로 HPV 감염여부 및 고 위험군과 저 위험군여부를 검색하였다. 이들을 자궁경부암의 진행정도에 따라 상피내종양 (cervical intraepithelial neoplasia; CIN)과 침윤암 (Invasive carcinoma; ICa)으로 구분하였다. 이들은 CIN I이 75% (9/12), CIN II가 75% (9/12), CIN III가 92.0% (23/25), 그리고 ICa가 94.7% (18/19)로 각각 나타났다. 또한, 고 위험군 (HPV16/18), 저 위험군 (HPV6/11) 및 기타 type이 각각 50.0%(34/68), 4.4%(3/68), 32.4%(22/68)로 나타났다. 전체적으로는 86.8%(59/68)의 HPV 감염 양성율을 나타냈다.결론 : 이러한 연구결과로 보아 다중 중합효소연쇄반응 (Multiplex PCR)은 자궁경부암 환자에서 HPV 고 위험군 및 저 위험군의 동시 분석에 매우 효과적인 방법으로 임상진단 및 예후판정에 널리 활용될 수 있을 것으로 기대된다. Objective : To investigate simultaneous detection of high and low-risk type of HPV in Korean cervical carcinoma using multiplex PCR method. Methods : HPV typing in cervical carcinoma was performed by multiplex PCR using three set of consensus primers for L1, E6, E7 of HPV DNA. Results : A total of 68 cervical carcinomas were examined. Histological examination revealed a specimen of carcinomas, which were classified as CIN I, CIN II, CIN III and invasive carcinoma (ICa). Of 68 cervical carcinomas, 75.0% (9 of 12) of CIN I, 75.0% (9 of 12) of CIN II, 92.0% (23 of 25) of CIN III and 94.7% (18 of 19) of invasive carcinoma (ICa) were positive for at least one type of HPV by the multiplex PCR. HPV 6/11, HPV 16/18 and other HPVs (general) were detected in 86.8% (59/68) were detected in 4.4% (3/68), 50.0% (34/68) and 32.4% (22/68) of cervical carcinomas of patients from Korea, respectively. Conclusion : We also confirmed that multiplex PCR is a simple, convenient, and cost-beneficial technique in simultaneous detection of high and low-risk type of HPV for genetic diagnosis in Korean cervical carcinoma patients.

PCR-SSCP 기법에 의한 조기난소부전 환자의 여포자극호르몬 수용체 (FSH receptor) exon 10 (Thr307Ala; A919G)의 분자변이에 관한 연구

김남근(Nam Keun Kim),이숙환(Sook Hwan Lee),남윤성(Yoon Sung Nam),손태종(Tae Jong Sohn),박상희(Sang Hee Park),박찬(Chan Park),고정재(Jung Jae Ko),차광열(Kwang Yul Cha) 대한산부인과학회 2000 Obstetrics & Gynecology Science Vol.43 No.7

목적 : 본 연구는 46,XX 조기난소부전 불임환자에서 FSH receptione xon 10(Thr307Ala;A919G) 유전자 돌연변이르 탐색하고자 시도하였다. 연구방법 : 그 대상으로 13명의 원인불명 조기난소부전 환자와 4명의 임신 경력이 있는 정상 여성을 대조군으로 조사하였다. 이들을 대상으로 한 돌연변이 탐색은 polymerase chain reaction-single conformation polymorphusm(PCR- SSCP)방법으로 수행되었다. 연구결과 : 여포자극 호르몬 수용체 exon 10의 돌연변이는 정상 대조군과 POF 환자군에서 발견되었다. 결론 : 이 돌연변이가 조기난소부전 환자와 정상 대조군에서 유의한 차이가 있는지는 좀 더 많은 연구가 진행되어야 결론을 내릴 수 있을 것이다. Objective : This study was performed to determine whether the FSH receptor mutation is present in infertile Korean patients with 46,XX premature ovarian failure (POF) women. Methods : The variant of FSH receptor exon 10 in thirteen 46,XX idiopathic POF and 4 healthy fertile (control) women were studied. Missense mutation in Exon 10 was detected in POF patients and healthy fertile women by polymerase chain reaction-single stranded conformation polymorphism (PCR-SSCP).Results : The variant types of FSH receptor exon 10 (Thr307Ala; A919G) were found in healthy fertile (control) and POF women. Conclusion : This mutation may not be specific in POF patients and further study is needed in fertile (control) and POF women.

한국전통 궁중간장류의 생리활성 분석

이남근(Nam Keun Lee),류영준(Young Jun Ryu),여인철(In-Cheol Yeo),권기옥(Ki Ok Kwon),서은미(Eun-Mee Suh),함영태(Young Tae Hahm) 한국식품영양과학회 2012 한국식품영양과학회지 Vol.41 No.2

본 연구는 고급 장류인 궁중간장과 한식간장 및 시판 개량 간장의 갈변도, 총 phenol 함량, SOD 유사활성, 항균활성, 혈전용해능, α-glucosidase 및 lipase 억제효과를 한외여과기로 분획된 1,000 이하 저분자 물질과 1,000 이상 고분자 물질의 분획물을 이용하여 in vitro에서 측정하였다. 분자량이 1,000 이하 및 1,000 이상 궁중간장류의 분획물의 갈변물질에 따른 갈변도는 각각 0.101±0.001~0.206±0.006과 0.486±0.145~2.503±0.008 범위 흡광도 값을 보였으며, 궁중간 장류 중 꽃장의 갈변도가 가장 높았다. 총 페놀 화합물 함량에 있어서, 분자량 1,000 이하 궁중간장류 분획물은 101.55±1.49~114.00±0.11 mg/L 범위에서 측정되었으며, 이는 일본 및 중국에서 제조된 시판 개량간장에 비해 높았다. 그러나 분자량이 1,000 이상의 분획물에서는 일본 및 중국에서 제조된 시판 개량간장들보다는 낮았다. 궁중간장류의 항산화 활성은 대부분 1,000 이하 분획물 시료에서 평균 51%의 SOD 유사활성을 보였으며, 한식간장과 시판 개량간장들보다 높게 나타났다. 혈전용해능 및 항균활성에 있어서는 본 연구에 사용된 모든 간장 분획물 시료에서는 뚜렷한 결과를 얻지 못했다. α-glucosidase 저해활성은 분자량이 1,000 이하의 분획된 궁중간장류는 6.34±1.51~8.79±0.81% 범위에서 저해활성을 보여 한식간장과는 유의적인 차이가 없었으나 시판 개량간장들보다는 약 2.9배 높은 유의적 차이를 보였다. 분자량이 1,000 이상의 분획물은 꽃장(75%)을 제외하고는 평균 약 6.7%로 한식간장 및 국내 제조 개량간장들과는 유의적 차이가 없었다. 분자량 1,000 이하 및 이상 분획된 간장 시료들로부터 lipase 저해활성은 시판 개량간장들에서는 거의 볼 수 없었으며 대부분 궁중간장인 청장, 덧간장, 진장, 어육간장 시료들에서만 lipase 저해활성을 확인할 수 있었다. In this study, the functional properties of royal court (RC) soy sauces, Gungjung-kanjang, were analyzed in vitro. RC soy sauces, traditional soy sauce, and commercial soy sauces were fractionated based on an MW cut-off of 1,000. The total phenolic compounds smaller than and larger than 1,000 MW (low and high fraction) in RC soy sauces were determined to be 101.55±1.49~114.00±0.11 mg/L and 32.51±0.32~113.47±0.43 mg/L, respectively. The low fraction of RC soy sauces showed around 51% superoxide dismutase (SOD)-like activity, which was higher than other soy sauces. Among RC soy sauces, Cheong-jang showed significantly high activity. Significant differences in fibrinolytic and antibacterial activities were not observed between soy sauces. α- Glucosidase inhibitory activities in the low and high fractions of RC soy sauces were in the range from 6.34±1.51 ~8.79±0.81% and 5.72±1.29~7.94±0.34%, respectively. However, α-glucosidase inhibitory activity in the high fraction of Kot-jang soy sauce was 75.88%±1.20%. Lipase inhibitory activities in the low fractions of RC soy sauces, especially Cheong-jang, Deot-kangang, Jin-jang, and Euyeuk-kanjang, were also measured.

전통간장으로부터 분리한 Cladosporium sp.과 Sterigmatomyces sp. 미생물의 동정 및 NaCl 농도에 따른 미생물 효소활성 분석

이남근(Nam Keun Lee),류영준(Young Jun Ryu),여인철(In-Cheol Yeo),박성준(Sung-Joon Park),권기옥(Ki Ok Kwon),차창준(Chang-Jun Cha),함영태(Young Tae Hahm) 한국식품과학회 2012 한국식품과학회지 Vol.44 No.4

전통방식으로 숙성되고 있는 한식간장의 표면으로부터 분리된 바위꽃과 메밀꽃이라 불리는 미생물을 18S rDNA ITS1과 ITS4 지역의 염기서열를 분석한 결과, 각각 Cladosporium 종들과 S. halophilus의 염기서열과 높은 상동성을 보였다. 이에 따라 바위꽃 미생물은 Cladosporium sp. NK1로, 메밀꽃 미생물은 S. halophilus NK2로 명명하였다. YPD 액체 배지를 이용한 최적 생장 pH와 온도에 있어서 Cladosporium sp. NK1은 각각 pH 6과 22-27℃였고, S. halophilus NK2는 각각 pH 5-7과 22℃였다. Cladosporium sp. NK1는 NaCl를 첨가하지 않은 YPD 액체배지에서 가장 잘 생장하였으나, protease 및 amylase 효소활성에 있어서는 각각 10%와 15% NaCl이 첨가된 YPD 배양액 시료에서 가장 높았다. S. halophilus NK2는 10% NaCl이 첨가된 YPD 액체배지까지 매우 잘 생장하였으며, protease 활성은 10% NaCl이 첨가된 YPD 배양액 시료에서, amylase 활성은 5% NaCl이 첨가된 배양액 시료에서 가장 높았다. Cladosporium sp. NK1과 S. halophilus NK2의 lipase 활성은 보이지 않았다. 간장의 관능평가 결과 Cladosporium sp. NK1 균주는 간장의 맛에서, S. halophilus NK2 는 향미에서 유의적 차이를 보였다. Two strains, traditionally referred to as rock flower (Bawhi-kot) and buckwheat flower (Memil-kot or Chile-Kot), were isolated from stored traditional soy sauce and were identified by using the 18S ITS1/4 region sequences. The rock flower strain showed 99% of similarity with Cladosporium sp. and buckwheat flower strain was 99% identical with yeast Sterigmatomyces halophilus. Both strains were tentatively named Cladosporium sp. NK1 and Sterigmatomyces halophilus NK2, respectively. The optimal growth pHs and temperatures of both strains in a YPD broth medium were in the range of pH 5.0 to 7.0 and 22 to 27℃. Both strains were able to grow in more than 20% of NaCl. In the enzyme activity assay, high protease activity of Cladosporium sp. NK1 and S. halophilus NK2 were obtained in YPD containing 10% of NaCl. High amylase activities of both stains were in 15% and 5% of NaCl, respectively. Lipase activity was, however, not detected in both strains.