새로운 신경전달물질 H₂S 발생 효소, cystathionine γ-lyase의 대량발현 조건과 활성측정

Kyoung-Ran Kim(김경란),Hae-Jung Byun(변혜정),Hyun-Nam Cho(조현남),Jung-Hyun Kim(김정현),Seun-Ah Yang(양선아),Kwang-Hwan Jhee(지광환) 한국생명과학회 2011 생명과학회지 Vol.21 No.1

질병과 밀접한 관계가 있는 hCGL 단백질의 경우 대량 배양 시 유도체를 사용하지 않아도 발현이 되는 점과 유전자 측면에서 조작이 쉬운 E.coli를 이용하여도 발현이 된다는 점에 있어서 중요한 이점을 가지고 있다. 본 연구에서는 배양되는 온도와 발현에 관련 있는 유도체의 농도, 600 ㎚에서의 균 성장 정도에 따른 유도체의 첨가 그리고 배지의 양을 조절하면서 유입되는 aeration의 조건으로 hCGL 단백질 발현의 최적의 조건 확립을 목적으로 하였다. 또 각 발생되는 inclusion body의 양을 측정하면서 보다 많은 가용성 단백질을 발현시키는 조건을 확립하고자 하였다. hCGL 단백질은 저온에서 보다 많은 양의 단백질이 발현되며 inhibitor의 억제를 담당하는 유도체의 농도와는 상관없이 발현이 되었다. 또한 균의 성장 정도에 따라 유도체의 첨가시기를 달리 하였을 때, 발현 비율에 차이는 있었으나 전체적인 단백질 양과 비교해 보면, 이는 hCGL 발현에 큰 영향을 미치지 않는다. 배지의 양을 달리하여 살펴본 aeration에 따른 hCGL 발현 정도는 배지의 부피가 15%일 때 높은 aeration으로 균의 양은 많았으나 목적 단백질인 hCGL의 발현은 aeration이 되지 않는 조건에서 더 잘되는 것을 확인하였다. 그리고 His-TEV-hCGL의 활성은 야생형 hCGL의 활성을 기준으로 하였을 때, L-cystathionine을 기질로 하였을 경우 76%, L-cysteine을 기질로 하였을 경우 88% 수준으로 유사한 활성을 나타내었고, 이는 손쉽게 정제 가능한 His-TEV-hCGL을 야생형을 대신하여 사용할 수 있음을 시사한다. 또한 His-TEV-hCGL이 야생형 hCGL과 같이, 427 ㎚에서 흡광을 가지는 것으로 보아 보효소PLP를 포함하고 있음을 알 수 있었다. 이로써 homocysteine 대사연구에 필수적인 hCGL 효소를 다량 얻는 방법을 확립하고, 관련 연구에 기여하리라 사료된다. There is a growing recognition of the significance of H2S as a biological signaling molecule involved in vascular and nervous system functions. In mammals, two enzymes in the transsulfuration pathway, cystathionine β-synthase (CBS) and cystathionine γ-lyase (CGL), are believed to be chiefly responsible for H₂S biogenesis. Genetic inborn error of CGL leads to human genetic disease, cystathioninuria, by accumulating cystathionine in the body. This disease is secondarily associated with a wide range of diseases including diabetes insipidus and Down's syndrome. Although the human CGL (hCGL) overexpression is essential for the investigation of its function, structure, reaction specificity, substrate specificity, and protein-protein interactions, there is no clear report concerning optimum overexpression conditions. In this study, we report a detailed analysis of the overexpression conditions of the hCGL using a bacterial system. Maximum overexpression was obtained in conditions of low culture temperature after inducer addition, performing low aeration during overexpression, and using a low concentration inducer (0.1 mM, IPTG) for induction. Expressed hCGL was purified by His-tag affinity column chromatography and confirmed by Western blot using hCGL antibody and enzyme activity analysis. We also report that the His tag with TEV site attached protein exhibits 76% activity for α-γ elimination reaction with L-cystathionine and 88% for α-β elimination reaction with L-cysteine compared to those of wild type hCGL, respectively. His tag with TEV site attached protein also exhibits a 420 ㎚ absorption maximum, which is attributed to the binding cofactor, pyridoxal 5’-phosphate (PLP).

계면 결합력과 나노튜브의 응집에 따른 나노튜브/고분자 복합재의 탄소성 거동 예측에 대한 연구

양승화,유수영,류정현,조맹효,Yang, Seunghwa,Yu, Suyoung,Ryu, Junghyun,Cho, Maenghyo 한국전산구조공학회 2013 한국전산구조공학회논문집 Vol.26 No.6

본 연구에서는 탄소나노튜브와 폴리프로필렌 기지 간 계면결합력과 나노튜브의 국부적 응집에 따른 나노복합재의 탄소성 거동 변화에 대한 파라메트릭 연구를 수행한다. 나노복합재의 탄소성 거동 예측을 위해 분자동역학 전산모사를 수행하고, 분자동역학 결과와 Mori-Tanaka 모델을 적용한 비선형 미시역학 모델을 연계하여 나노복합재 내 흡착계면의 탄소성 거동을 역으로 도출하는 2단계 영역분할 기법을 적용하였다. 미시역학 모델에서는 시컨트 계수방법을 Mori-Tanaka 모델에 적용하여 나노복합재의 비선형 거동을 예측하는 방법을 적용하였으며, 나노튜브와 기지 간 재료계면의 불완전 결합을 고려하기 위해 변위 불연속 조건을 적용하였다. 흡착영역을 고려한 미시역학 모델을 통해 흡착계면의 유무 및 재료계면 결합력 변화 그리고 나노튜브의 국부적 응집현상에 따른 나노복합재의 응력-변형률 관계를 예측하였다. 그 결과 나노튜브의 국부적 응집이 나노복합재의 강화효과를 저하시키는 가장 중요한 변수임을 확인하였다. In this research, a paramteric study to account for the effect of interfacial strength and nanotube agglomeration on the elastoplastic behavior of carbon nanotube reinforced polypropylene composites is performed. At first, the elastoplastic behavior of nanocomposites is predicted from molecular dynamics(MD) simulations. By combining the MD simulation results with the nonlinear micromechanics model based on the Mori-Tanaka model, a two-step domain decomposition method is applied to inversely identify the elastoplastic behavior of adsorption interphase zone inside nanocomposites. In nonlinear micromechanics model, the secant moduli method combined with field fluctuation method is used to predict the elastoplastic behavior of nanocomposites. To account for the imperfect material interface between nanotube and matrix polymer, displacement discontinuity condition is applied to the micromechanics model. Using the elastoplastic behavior of the adsorption interphase zone obtained from the present study, stress-strain relation of nanocomposites at various interfacial bonding condition and local nanotube agglomeration is predicted from nonlinear micromechanics model with and without the adsorption interphase zone. As a result, it has been found that local nanotube agglomeration is the most important design factor to maximize reinforcing effect of nanotube in elastic and plastic behavior.

식재 시기 및 묘목 종류에 따른 낙엽송 조림목의 초기 생장 특성

양아람 ( A Ram Yang ),황재홍 ( Jae Hong Hwang ),조민석 ( Min Seok Cho ) 한국임학회 2014 산림과학 공동학술대회 논문집 Vol.2014 No.-

리기다소나무는 1960년대 우리나라 주요 조림수종 중 하나로서 인공림 면적의 약 27%를 차지하고 있으며, 최근 벌기령 경과에 따른 생장량 감소로 주요 수종갱신 대상이 되고 있다. 본 연구는 리기다소나무 벌채지 내 식재된 낙엽송 조림목의 식재 시기와 묘목 종류에 따른 초기 생장 특성을 구명하기 위하여 수행되었다. 연구 대상지는 경기도 평택과 강원도 횡성이며, 2009년 봄에 파종한 용기묘는 평택 시험지 내 2010년 8월에, 노지묘(1-1)는 횡성 시험지 내 2011년 4월에 식재하였다. 두 조사지 모두 3반복으로 400 m2의 조사구를 설치하였으며 각 조사구당 묘목 30본을 임의로 선정 후 2011년부터 2013년까지 10월에 낙엽송 조림목의 근원경과 수고를 측정하였다. 약 8개월의 생산 기간이 단축된 평택 조사지 내 낙엽송 조림목의 근원경과 수고 생장이 횡성 조사지보다 매년 우수하여 용기묘를 활용한 하기(장마기) 조림이 춘기 노동력 집중화의 대안이 될 수 있을 것으로 예상된다. 그러나, 횡성 조사지 내 낙엽송 조림목 근원경 및 수고의 상대생장량이 매년 평택 조림지에 비해 유의하게 증가하고 있어 낙엽송 노지묘와 용기묘의 생장 비교는 지속적으로 수행되야 할 것으로 판단된다. Pinus rigida plantation occupies about 27% of artificial forest in Korea. Although P. rigida as one of the major planting species were widely planted in Korea during 1960-1970s, this species has been a target for regeneration due to reduced growth. The objective of this study was to compare the effects of planting season and seedling types (containerized and bare-root seedlings) on early growth of Larix kaempferi seedlings in harvested P. rigida plantations. Containerized seedling of L. kaempferi sowed in 2009 were planted with the 3,000 seedlings ha-1 at Pyeongtaek site and 2 years old bare-root seedling were planted in April, 2011 at Hoengseong site. Three plots (400m2 per plot) were established and 30 seedlings were selected to measure root collar diameter and seedling height in October, from 2011 to 2013. Root collar diameter and seedling height of 2012 and 2013 at Pyeongtaek site were significant higher than those at Hoengseong site. Planting containerized seedlings in summer rainy season might be useful as an alternative for the reduction of labor concentration in spring. Because annual relative growth rate of root collar diameter and seedling height at Hoengseong site has significantly increased compared to Pyeongtaek site, we need more time to know the exact differences between both sites where different seedling types were planted at different seasons.

우측 쇄골하 중심정맥도관 삽입 후 발생한 종격동 수종과 양측성 수흉(증례보고)

양헌주 ( Hun Ju Yang ),조희경 ( Hee Kyung Jo ),김영주 ( Young Ju Kim ),조정하 ( Jung Ha Cho ),조춘규 ( Choon Kyu Cho ) 대한마취과학회 2008 Korean Journal of Anesthesiology Vol.55 No.1

고장력 강판 스프링백 저감 기술 개발

양우열(WooYul Yang),이승열(Seung Yeol Lee),금영탁(YoungTag keum),황진영(JinYoung Hwang),윤치상(ChiSang Yoon),신철수(ChirlSoo Shin),조원석(WonSuk Cho) 한국자동차공학회 2002 한국자동차공학회 Symposium Vol.2002 No.11

In order to develope springback reduction technology for high-strength steel sheets, 3 studies have been conducted: dome stretching tests, stepped s-rail forming and springback measurement, and optimally shaped initial blank design. First, to find out the formability of TRIP60, dome stretching test was performed. Next, the stepped s-rail die, which was designed to form a channel type panel with large twist and wall curl, was manufactured and used to know the effect of controlling forming variables, such as blank holding force and flange amount on the springback. Furthermore, new measurement technology of the springback was introduced to define wall curl and twist in geometrically complex panels. Finally, the optimally shaped initial blank was employed to verify one of the best ways to reduce the springback in chanel type, high strength sheet panels.

고장력 강판 스프링백 저감 기술 개발

양우열(WooYul Yang),이승열(Seung Yeol Lee),금영탁(YoungTag Keum),황진영(JinYoung Hwang),윤치상(ChiSang Yoon),신철수(ChirlSoo Shin),조원석(WonSuk Cho) 대한기계학회 2002 대한기계학회 기타 간행물 Vol.2002 No.11

Amplification of transglutaminase 2 enhances tumor-promoting inflammation in gastric cancers

Cho Sung-Yup,오유미,Jeong Eui Man,박상희,Dakeun Lee,Xiaorui Wang,Qiqi Zeng,Hongyu Qin,Fang Hu,Hui Gong,Xi Liu,Guanjun Zhang,나득채,이지은,채지수,서윤석,공성호,Hyuk-Joon Lee,Jong-Il Kim,박한수,Chengsheng Zhang,양한광,Charles Lee 생화학분자생물학회 2020 Experimental and molecular medicine Vol.52 No.-

Tumor-promoting inflammation is a hallmark of cancer and is highly associated with tumor progression, angiogenesis, and metastasis. Tumor-associated macrophages (TAMs) are major drivers of tumor-promoting inflammation, but due to the complexity of the tumor microenvironment, the detailed regulatory mechanisms are still under investigation. Here, we investigated a novel role for transglutaminase 2 (TGM2) in the development of tumor-promoting inflammation and recruitment of TAMs to gastric cancer (GC) tissues. When estimated by array comparative genomic hybridization and droplet digital PCR, the copy numbers of the TGM2 gene were amplified in 13.6% (14/103) of GC patients and positively associated with TGM2 expression. Gene set enrichment analysis of expression microarray data for GC samples with high or low TGM2 expression showed that increased TGM2 expression was associated with tumor-promoting inflammation in GC. In addition, the expression of TGM2 was correlated with the expression of markers for macrophages, neutrophils, blood vessels, and lymphatic vessels. Overexpression of TGM2 in GC cells augmented the IL-1β-induced secretion of macrophage-recruiting chemokines and NF-κB activation. TGM2 protein levels were associated with the expression levels of the macrophage marker CD163 in human GC tissue samples. Moreover, GC patients with high expression of TGM2 had a worse prognosis than those with low expression of TGM2. These results suggest TGM2 as a novel regulator of the tumor microenvironment of GC and provide a promising target for constraining tumor-promoting inflammation.

난독화 해제를 위한 Opaque Predicate Detector

양종환(Jonghwan Yang),김영철(Yeongcheol Kim),목성균(Seong-Kyun Mok),조은선(Eun-Sun Cho),최석우(Seokwoo Choi) 한국정보과학회 2019 한국정보과학회 학술발표논문집 Vol.2019 No.12

분자동역학 전산모사를 이용한 나노임프린트 리소그래피 공정에서의 스탬프-레지스트 간의 상호작용 및 원자분포에 관한 연구

양승화(Seunghwa Yang),조맹효(Maeghyo Cho) 대한기계학회 2007 대한기계학회 춘추학술대회 Vol.2007 No.5

Molecular dynamics study of thermal NIL (Nano Imprint Lithography) process is performed to examine stamp-resist interactions. A layered structure consists of Ni stamp, poly-(methylmethacrylate) thin film resist and Si substrate was constructed for isothermal ensemble simulations. Imposing confined periodicity to the layered unit-cell, sequential movement of stamp followed by NVT simulation was implemented in accordance with the real NIL process. Both vdW and electrostatic potentials were considered in all non-bond interactions and resultant interaction energy between stamp and PMMA resist was monitored during stamping and releasing procedures. As a result, the stamp-resist interaction energy shows repulsive and adhesive characteristics in indentation and release respectively and irregular atomic concentration near the patterned layer were observed. Also, the spring back and rearrangement of PMMA molecules were analyzed in releasing process.

아미노산계 공융용매(DES) 전처리에 따른 DES 리그닌 특성

양봉숙(Bong Suk Yang),조윤지(Yunji Cho),이상윤(Sangyoon Lee),강규영(Kyu-Young Kang) 한국펄프·종이공학회 2021 한국펄프·종이공학회 학술발표논문집 Vol.2021 No.10