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Density Profile 추출 방법에 따른 염색체 분류정확도 비교분석
최광원(Kwang-Won Choi),송혜정(Hae-Jung Song),김종대(Jong-Dae Kim),김유섭(Yu-Seop Kim),이완연(Wan-Yeon Lee),박찬영(Chan-Young Park) 한국정보과학회 2010 한국정보과학회 학술발표논문집 Vol.37 No.1C
본 연구에서는 다양한 density profile 특징추출에 기반한 염색체 자동분류방법들의 성능을 비교분석하였다. density profile은 염색체의 밴드패턴을 가장 잘 표현한 특징으로 염색체의 중심축을 구성하는 화소들의 밝기 값을 추출하는 방법이다. 염색체의 밴드패턴은 염색체의 끝단까지를 잘 표현해주어야만 정확한 염색체번호를 확인할 수 있다. 따라서 염색체의 중심축을 추출하여 염색체 끝단까지 확장 처리한 방법에 대한 성능을 확인하였다. 염색체 중심축에 위치한 화소만을 이용한 프로파일은 잡음에 민감할 수 있으므로 이를 해결하기 위하여 염색체의 중심축에 대한 화소 값 대신 주변 밝기 값들에 대한 평균을 이용한 국소평균방법과 중심축의 수직라인 상에 존재하는 화소 값들에 대한 평균을 구한 수직평균방법을 비교하였다. 분류알고리즘은 k-NN을 사용하였고, 실험데이터는 (주)Gendix 로부터 제공받은 임상적으로 정상인 100명(남자 50명, 여자 50명)으로부터 추출한 4600개의 염색체 영상을 훈련데이터와 테스트데이터로 각각 50%씩 랜덤하게 분리하여 실험하였다. 실험결과 중심축을 확장하고 수직평균에 대한 프로파일을 특징으로 추출하여 분류한 경우가 가장 좋은 성능을 보였다.
난소암 조기진단을 위한 다중 바이오마커 선택 알고리즘 성능 비교
최광원(Kwang-Won Choi),김승일(Seung-il Kim),조상연(Sang-yeun Cho),송혜정(Hae-Jung Song),김종대(Jong-Dae Kim),김유섭(Yu-Seop Kim),박찬영(Chan-Young Park),신규성,경민선,김영목(Young-Mog Kim),박형기(Hyung-Ki Park),이은영(Eun-Young Lee),이명선 한국정보과학회 2011 한국정보과학회 학술발표논문집 Vol.38 No.1C
본 연구에서는 T-Test와 Genetic Algorithm을 사용해 Luminex 사용 환경에서 난소암을 진단할 수 있는 바이오마커의 조합을 찾고 Cancer와 Normal간의 분류 성능을 평가해 보았다. 바이오마커는 혈액, 체액 내의 특정 질환 여부나 상태를 나타내는 단백질, DNA들의 지표 물질이다. 정상인과는 다른 분포를 가진 성분이 환자의 혈액이나 체액에서 발견되면 이를 토대로 질병유무와 상태를 판단할 수 있다. 난소암을 진단할 수 있는 바이오마커 조합을 찾기 위해 T-Test와 Genetic Algorithm를 사용하여 분류성능이 좋은 바이오마커 조합을 각각 선별해 보았고, 선별된 각각의 마커조합을 선형분류기(LDA)를 사용해 평균 민감도, 특이도, 정확도를 비교해 보았다. 실험데이터는 두 곳의 병원에서 제공받은 총 58명(Cancer 27명, Normal 31명)의 혈청에서 21 종류의 바이오마커 데이터를 Luminex-PRA를 통해 얻었다. 본 연구에서는 T-Test로 만들어진 마커조합이 Genetic algorithm으로 만들어진 마커조합 보다 더 좋은 민감도, 특이도, 분류정확도를 보여주었다.
최광원 ( Kwang-won Choi ),김남형 ( Nam-hyeoung Kim ),박진웅 ( Jin-woong Park ),유영준 ( Young-jun You ),안정호 ( Jung-ho An ),김진환 ( Jin-hwan Kim ),박찬영 ( Chan Young Park ) 한국정보처리학회 2010 한국정보처리학회 학술대회논문집 Vol.17 No.1
최근 학습 패러다임은 문서 중심에서 지식 및 정보 기반으로 크게 변화하고 있다. 또한 유비쿼터스 사회로의 전환을 맞이하여 다양한 USN 기술 기반의 학습 연구가 활발히 진행 중이다[1,2,3,4]. 그 중 RFID 기술 기반의 학습 연구에서는 대부분 유비쿼터스 학습 환경 구축에 관한 연구가 주를 이루고 있다. 따라서 실질적인 학습에 적용하는 연구의 결과는 미미하다. 본 논문에서는 RFID기술 기반의 다국어 학습기를 구현하였다. 태그를 인식하여 특정 사물을 사용자로 하여금 모국어뿐만 아니라 다국어로도 변역하여 여러 가지 언어들을 학습할 수 있게 지원하는 장치이다. 실험에서는 13.56Mhz의 RFID 및 PXA255A ARM보드 사용하여 학습기를 제작하여 효율성 테스트를 하였다.
ARM 프로세서 하에서의 코드 최적화 전략에 대한 성능 평가
최광원 ( Kwang-won Choi ),선주택 ( Ju-teak Sun ),이정근 ( Jeong-gun Lee ) 한국정보처리학회 2009 한국정보처리학회 학술대회논문집 Vol.16 No.2
임베디드 소프트웨어의 경우, 시스템 제약으로 인해서 일반 소프트웨어에 비해 최적화의 역할이 상대적으로 매우 중요하다. 본 논문에서는 임베디드 시스템 환경에서 다양한 코드 최적화 기법을 적용하고 각 최적화 기법의 성능 향상기여도를 평가하여, 다양한 최적화 전략에 대한 효율성을 분석하였다. 이는 향후 임베디드 소프트웨어 엔지니어를 위한 코드 최적화 가이드라인으로 활용되거나, 자동화된 최적 임베디드 코드 생성을 위한 기초 자료로 사용될 수 있을 것으로 기대한다.
Ubi-Home 환경에서 로봇을 이용한 학습형 맵 작성기법의 설계 및 구현
최광원 ( Kwang-won Choi ),김동욱 ( Dong-yuk Kim ),김남형 ( Nam-hyung Kim ),안정호 ( Jung-ho An ),박승용 ( Seung-yong Park ) 한국정보처리학회 2009 한국정보처리학회 학술대회논문집 Vol.16 No.1
Ubi-Home 환경에서 장치제어를 하기위해 다양한 방법이 제안되었다. 그 중 원격지에서 장치제어를 하기 위해 특정 기기(로봇)를 활용할 수 있다. 하지만 이와 같은 방법에는 로봇과 장치들의 위치인식과 이동경로 설정에 따른 제약사항이 따른다. 또한 이러한 위치인식 및 이동에는 미리 작성된 하나의 맵이 사용되므로 새로운 환경의 변화나 확장에 적용할 수 없다. 따라서 본 논문에서는 로봇과 장비의 위치인식과 이동경로를 위한 학습형 맵 작성1)기법을 제안하며, 테스트를 위해 Atmega128v4 MCU와 AX-12+ Motor, AX-S1 Sensor, ZBS-200 Zigbee, CL-1L5/ 603LM Infrared Ray Sensor로 로봇을 제작하여 실내 환경 모형에서 테스트하였다.
최광원(Kwang Won Choi),조원철(Won cheol Cho),이태식(Tae shik Lee) 한국방재안전학회 2010 한국방재안전학회 논문집 Vol.3 No.2
본 연구는 부력가방의 익사사고 저감성능 분석에 관한 연구로서, 시민들은 레저 활동 및 물놀이 활동 시 부주의로 인하여 익사사고가 발생할 경우 119구조대나 타인의 구조활동만으로는 사고자 생존율이 저조하다고 할 수 있다. 이에 따라 수상 전문가들은 부력제품을 활용하여 익사사고를 줄이고, 시민은 일상용 휴대가방에 안전관리 기능을 추가한 부력가방을 평상시에 차량안이나 개인이 직접 휴대함으로써 본인의 생명과 위급한 상황에 봉착한 타인을 신속하게 구조할 수 있는 구명용 도구로 활용할 수 있도록 하였다. 본 연구를 통하여 개발된 부력가방은 편리성, 안전성, 지속성의 3 가지 방재특성을 지니고 있으며, 서류·물품 동을 보관하는 편리성, 성인 l 명 기준인 90 kg 무게를 띄울 수 있는 부력재를 내피 분산방식으로 처리한 안전성, 그리고 방수원단 및 방수지퍼 사용으로 장시간 안전을 유지하는 지속성 등을 갖춘 제품이다. 성능분석 결과 부력가방이 다른 구조장비와 비교해도 현장 간접 구조장비로 사용하는데 아무런 문제점이 없다는 것을 알 수 있었으며 부력성능과 디자인적인 측면만 더 보완하면 국민의 귀중한 생명을 보호하는데 많은 기여를 할 수 있을 것이다. This study is to reduce the rate of drowning accident by using of buoyancy bag. People are exposed to the high risk of drowning accident when they have water leisure activities due to the lack of safety mind-set and shortage of safety products. In case of drowning accident, the rescue action is normally depending on the other people's assistance. Therefore, rescue activities which relyn the people doesn't improve the ratio of survival in the drowning accidents. The submarine specialists should use the buoyancy products to rescue the people in the drowning accident. The citizen can carry portable buoyancy product in the automobile as well as by hands anywhere and anytime. It will be effective rescue tool to save his/her life in the emergency. In addition, it will contribute to rescue other's life because it can be used immediately. There are 3 positive characteristics on the buoyancy bag. First, it is convenience. Documents and other stuffs can be kept in the bag. Second is safety. The material of buoyancy is placed in the inner of the bag. It is possible to float the person whose weight is 90 kg. Lastly, it is durability. It can be used long-term because the outer of the bag is made of anti-water material and anti-water zipper. As a result of performance analysis, it is evident that the buoyancy bag can be used to rescue the people in the drowning accident as a indirect rescue tool compared with the current other rescue products. It is recommended that the design of outer box and performance of buoyancy are required to be improved in order to contribute more to rescue people in the accident.
김승일(Seung-il Kim),최광원(Kwang-Won Choi),조상연(Sang-yeun Cho),김종대(Jong-Dae Kim),김유섭(Yu-Seop Kim),박찬영(Chan-Young Park),송혜정(Hye-Jeong Song),신규성(Kyu-Sung Shin),경민선(Min-Sun Kyoung),김영목(Young-Mog Kim),박형기(Hyung 한국정보과학회 2011 한국정보과학회 학술발표논문집 Vol.38 No.1C
본 논문에서는 진단 검사 의학 분야에서 통계적 지식이나 도구사용능력이 부족한 임상의학자들을 위해 개발된 통계적 데이터 분석 시스템을 소개한다. 개발된 시스템은 질병진단에 필요한 다중 바이오마커 데이터를 Luminex장비를 통하여 측정한 후, 분석이 용이한 형태로 변환하는 시각화 기술과 데이터에 내재된 패턴을 찾아내어 유용한 지식을 생성하는 데이터 마이닝 기술을 포함한다. 주요 모듈로는 마커선택, 데이터 시각화, 마커 평가 모듈로 구성되며 MATLAB을 기반으로 개발되었다.
밀도 프로파일 추출 방법에 따른 염색체 분류 성능 분석
송혜정(Hye-Jeong Song),최광원(Kwang-Won Choi),권경훈(Kyoung-Hun Kwon),이용식(Yong-Sik Lee),김유섭(Yong-Sik Lee),김종대(Jong-Dae Kim) 한국정보기술학회 2011 한국정보기술학회논문지 Vol.9 No.2
This work presents the performance comparison according to the density profile extraction methods for the automated chromosome classification system based on banding pattern. Chromosome length and density profiles were chosen as the features for the classification system. They were estimated from the medial axes of the chromosomes that were detected by the conventional thinning algorithm. The extracted medial axes extended to the boundaries, because they do not cover both ends of chromosomes. Also filters applied along or perpendicular to the medial axes to reduce the noise. This paper investigated the classification performances of the above feature extraction methods. The dataset consists of 4561 chromosomes were supported by Gendix. Classification method used 3-NN. Experimental result showed that employing the extension of the medial axis and the vertical filter improved performance by 13%.