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토마토 TYLCV 분자마커 Ty-3를 이용한 유전형 분석
최학순,Andreas Ebert,Peter Hanson,양은영,이우문,장석우,조명철,채수영,김정호,윤무경 한국종자연구회 2012 종자과학과 산업 Vol.9 No.3
토마토 TYLCV는 병이 발생되면 약제나 다른 방법으로 방제가 어려우므로 내병성 품종의 개발이 반드시 필요 하다. 특히, TYLCV 저항성 유전자 Ty-1,2,3(부분우성)를 한 개체 내로 집적을 시켜서 저항성이 증대된 품종의 개발이 필요하다. 모든 작물이 마찬가지지만 품종을 육종함에 있어서 목적으로 하는 개체 또는 계통을 선발 하는 작업은 매우 중요하다. 현재 우리는 토마토 TYLCV 저항성 품종을 육성하는 초기단계이다. 이 단계에서 토마토 TYLCV에 저항성인 자원 또는 계통을 선발하는 작업은 이 사업의 성패를 가늠하는 중요한 작업이다. 이를 위해서는 보독인 담배가루이를 이용하여 생물접종을 하거나 분자마커를 이용하여 선발하는 방법 두 가지 가 있다. 본 연구는 두 번째 방법인 분자마커 Ty3를 이용하여 TYLCV 저항성 계통을 대상으로 마커의 유전 분석을 실시하였다. 11-TY-4-AV 등 네 계통 모두 Ty-3 마커가 χ2 검정 결과 정상적으로 후대에 유전되는 것을 확인하였다.
Distribution of DArT Markers in a Genetic Linkage Map of Tomato
Truong, Hai Thi Hong,Graham, Elaine,Esch, Elisabeth,Wang, Jaw-Fen,Hanson, Peter Korean Society of Horticultural Science 2010 원예과학기술지 Vol.28 No.4
토마토풋마름병에 저항성인 $Solanum$ $lycopersicum$ H7996와 극도감수성인 $S.$ $pimpinellifolium$ WVa700 간의 교배를 통해 획득한 재조합순계계통 $F_9$ 세대의 188개체를 이용하여 유전자연관지도를 작성하였다. 유전자지도는 DarT 260종, AFLP 74종, RFLP 4종, SNP 1종 및 SSR 22종 등 총 361종의 마커로 구성되었다. 작성된 유전자지도는 총 13개의 연관군(LG)에 2042.7cM을 포함하였으며 마커간의 평균지도거리는 5.7cM이고 이중 DArT마커는 평균 7.9cM당 1개가 분포하였다. SSR 마커의 분포를 기초로 작성된 11개 연관군들은 토마토 염색체의5번과 12번을 제외한 10개 염색체에 해당하였다. DArT 마커는 다른 마커들처럼 토마토 유전체 상에 고르게 분포하였으며, 인접 마커와의 상호분석(${\leq}$ 0.5cM) 결과 클러스터링 빈도가 13.5%인 AFLP 마커보다 3배 정도 높은 38.8%의 빈도로 최고치를 나타내었다. 본 연구를 통해 토마토에서 최초로 DarT 마커를 이용한 유전자연관지도를 작성하였다. A genetic linkage map was constructed using 188 $F_9$ RILs derived from a cross between $Solanum$ $lycopersicum$ H7996 (resistant to bacterial wilt) and $S.$ $pimpinellifolium$ WVa700 (highly susceptible to bacterial wilt). The map consisted of 361 markers including 260 DArTs, 74 AFLPs, 4 RFLPs, 1 SNP, and 22 SSRs. The resulting linkage map was comprised of 13 linkage groups covering 2042.7 cM. The genetic linkage map had an average map distance between markers of 5.7 cM, with an average DArT marker density of 1/7.9 cM. Based on the distribution of anchor SSR markers, 11 linkage groups were assigned to 10 chromosomes of tomato except chromosomes 5 and 12. The DArT markers were distributed across the genome in a similar way as other markers and showed the highest frequency of clustering (38.8%) at ${\leq}$ 0.5 cM intervals between adjacent markers, which is 3 times higher than AFLPs (13.5%). The present study is the first utilization of DArT markers in tomato linkage map construction.
아시아지역 고추 토마토 품종육성 기술 개발 협력 과제 수행 결과 및 금후 계획
조명철,양은영,정효봉,조인숙,김우재,박종윤,권택윤,장성회,Derek Barchenger,Peter Hanson,Lawrence Kenyon 한국국제농업개발학회 2022 한국국제농업개발학회 학술대회 Vol.2022 No.09
본 연구과제는 아시아지역 AFACI(Asian Food & Agriculture Cooperation Initiative) 회원 13개국을 대상으로 토마토 또는 고추 품종육성 기술을 지원하기 위해 수행 되었다. AFACI 회원국 별 채소 육종 및 종자 생산, 가공, 유통 기술 수준 차이가 크다. 라오스, 미얀마, 캄보디아 등의 회원국에서는 자가 종자 생산이 어려워 필 요 종자의 70~80%를 다른 나라에서 수입하여 활용하고 있다. AFACI 회원국들의 자가 종자 생산기술 향상을 통한 자체 종자 생산을 지원하기 위해 회원국들의 요 청을 받아 고추 또는 토마토 작목의 품종육성 기술지원을 수행하였다. 회원국에서 보유하고 있는 다양한 재래종 자원들의 수집, 평가 및 선발과 세계채소센터에서 육성한 자원들을 공급받아 육종 재료로 활용하였다. 본 과제는 2019년 11월부터 2022년 10월까지 1단계 과정을 통해 회원국별로 다양한 성과들을 창출하고 있다. 효율적인 기술지원을 위해 세계채소센터 전문가들을 활용하여 육종 기술과 재료 들을 공급하였다. 2단계에서는 1단계에서 확보된 다양한 자원들을 활용한 우수 고 정종 품종 등록과 일대잡종 품종육성 기술을 지원할 계획이다. 육성된 품종들은 국가별 품종 등록 절차에 따라 품종보호출원 및 농가 보급을 추진할 계획이다. 1 단계에서는 코로나 19로 인한 대면 교육이 불가능하여 국내 종자회사들과의 소통 이 어려웠다. 하지만 2단계에서는 대면 교육 기회를 확대하고, 국내 채소 종자 업 체와 회원국의 연구원들 간의 소통을 확대하여 국내 종자 기업들의 해외 진출에 도 기여 할 수 있도록 노력할 계획이다.
Distribution of DArT Markers in a Genetic Linkage Map of Tomato
Hai Thi Hong Truong,Elaine Graham,Elisabeth Esch,Jaw-Fen Wang,Peter Hanson 한국원예학회 2010 원예과학기술지 Vol.28 No.4
A genetic linkage map was constructed using 188 F? RILs derived from a cross between Solanum lycopersicum H7996 (resistant to bacterial wilt) and S. pimpinellifolium WVa700 (highly susceptible to bacterial wilt). The map consisted of 361 markers including 260 DArTs, 74 AFLPs, 4 RFLPs, 1 SNP, and 22 SSRs. The resulting linkage map was comprised of 13 linkage groups covering 2042.7 cM. The genetic linkage map had an average map distance between markers of 5.7 cM, with an average DArT marker density of 1/7.9 cM. Based on the distribution of anchor SSR markers, 11 linkage groups were assigned to 10 chromosomes of tomato except chromosomes 5 and 12. The DArT markers were distributed across the genome in a similar way as other markers and showed the highest frequency of clustering (38.8%) at ≤ 0.5 cM intervals between adjacent markers, which is 3 times higher than AFLPs (13.5%). The present study is the first utilization of DArT markers in tomato linkage map construction.