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정진우,김진우,조경연,Chung, Jin-Woo,Kim, Jin-Woo,Cho, Kyung-Yun 한국미생물학회 2010 미생물학회지 Vol.46 No.4
점액세균의 16S rDNA에 특이적으로 부착하는 프라이머를 사용한 중합효소연쇄반응(PCR)을 통해 아산시와 우포늪에서 채취한 다섯 토양시료 내 점액세균의 다양성을 조사하였다. 점액세균의 16S rDNA을 갖는 76개 PCR 조각의 서열분석 결과, 표준균주와 95% 미만의 상동성을 보이는 5개의 신속 추정 점액세균이 관찰되어 국내 토양에 아직까지 분리되지 않은 많은 새로운 점액세균들이 존재함을 보여주었다. Diversity of myxobacteria in five soil samples from Asansi and Uponeup in Korea was explored by means of polymerase chain reaction (PCR) using primers that specifically bind 16S rDNA of myxobacteria. DNA sequence analysis of 76 PCR fragments containing myxobacterial 16S rDNA revealed five putative novel myxobacterial genera whose 16S rDNA sequences shared <95% sequence identity with those of the type strains. This finding indicates the presence of many uncultured and unidentified myxobacterial species in Korean soil.
셀룰로오스 분해성 점액세균 Sorangium cellulosum의 분리
현혜숙,정진우,이한빛,윤진권,이차율,김도희,조경연,Hyun, Hye-Sook,Chung, Jin-Woo,Lee, Han-Bit,Youn, Jin-Kwon,Lee, Cha-Yul,Kim, Do-Hee,Cho, Kyung-Yun 한국미생물학회 2009 미생물학회지 Vol.45 No.1
한국의 여러 지역에서 채취한 토양으로부터 셀룰로오스를 유일한 탄소원으로 이용하여 자라는 591균주의 점액 세균을 순수 분리하였다. 세포, 집락, 그리고 자실체의 모양과 같은 형태적인 특징과 16S rRNA 염기서열은 이들 균주들이 모두 Sorangium cellulosum임을 나타내었다. 그리고 생리활성조사는 114균주 중 최소한 20균주가 Candida albicans의 성장을 저해하는 항진균물질을 생산함을 보여주었다. 591 strains of myxobacteria that grew on cellulose as a sole carbon source were isolated from soils collected from various locations in Korea. Morphological characteristics such as the shape of cells, colonies and fruiting bodies and 16S rRNA sequences of the isolates suggested that all the isolates are Sorangium cellulosum. An antifungal assay has indicated that at least 20 strains among the 114 isolates tested produce antifungal substances inhibiting growth of Candida albicans.
Corallococcus와 Myxococcus 속 점액세균 균주들에 의한 항균 물질의 생산
신혜진 ( Hye Jin Shin ),윤진권 ( Jin Kwon Youn ),안동주 ( Dong Ju An ),조경연 ( Kyung Yun Cho ) 한국미생물생명공학회(구 한국산업미생물학회) 2013 한국미생물·생명공학회지 Vol.41 No.1
국내 토양시료에서 분리한 174 Corallococcus 속 균주와 207 Myxococcus 속 균주들의 배양추출물을 제조하고 Candida albicans, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus에 대한 항균 활성을 비교하였다. 항진균 활성을 보이는 균주의 비율은 Corallococcus가 7.5%(174균주 중 13균주)로 51.7%(207균주 중 107균주)를 보인 Myxococcus에 비해 낮았다. 하지만, 항세균 활성을 보인 균주의 비율은 Corallococcus가 12.1%(21균주)로 1%(2균주)를 보인 Myxococcus에 비해 상대적으로 높았다. Corallococcus 균주 중 P. aeruginosa, S. aureus에 모두 활성을 보이는 6 C. coralloides 균주들은 자실체 형성에서는 차이를 보였지만 항세균 활성을 나타내는 배양추출물의 HPLC 크로마토그램은 유사하였는데, 이들이 생산하는 항세균 물질의 생산은 CYS 배지에서 6일 이상 배양할 때 가장 높았다. We prepared culture extracts of 174 Corallococcus and 207 Myxococcus strains isolated in Korea, and compared their antimicrobial activity against Candida albicans, Pseudomonas aeruginosa, and Staphylococcus aureus. The percentage of strains showing antifungal activity was lower in Corallococcus (7.5% [13 of the 174 strains]) than in Myxococcus (51.7% [107 of the 207 strains]). However, the percentage of strains exhibiting antibacterial activity was higher in Corallococcus (12.1% [21 strains]) than in Myxococcus (1% [2 strains]). The culture extracts of 6 Corallococcus strains inhibited both P. aeruginosa and S. aureus and displayed similar high-performance liquid chromatography chromatograms, although the shapes of their fruiting bodies were dissimilar. The rate of production of antibacterial substances was the highest when the strains were cultured in CYS medium for more than 6 days.
Cellulase 유전자 염기서열에 기초한 Sorangium cellulosum 균주들의 계통분류
이한빛 ( Han Bit Lee ),윤진권 ( Jin Kwon Youn ),조경연 ( Kyung Yun Cho ) 한국미생물생명공학회(구 한국산업미생물학회) 2011 한국미생물·생명공학회지 Vol.39 No.1
두 개의 cellulase 유전자 xynB1, bglA2과 groEL1 유전자 염기서열에 기초하여 국내에서 분리한 34균주의 Sorangium cellulosum 균주들을 계통 분석한 결과, 점액세균 중 가장 많은 생리활성물질이 발견된 종인 S. cellulosum 내에는 최소한 5그룹의 소그룹이 존재함을 보였다. 이 분석은 또한 S.cellulosum 균주들의 다양성을 보여주어 분석한 34균주 중 30균주가 서로 다른 균주인 것으로 나타났다. Phylogenetic analysis of two cellulase genes, xynB1 and bglA2, and the groEL1 gene from 34 Sorangium cellulosum strains isolated in Korea suggested that there are at least five subgroups in S. ellulosum, which is the most proficient producer of secondary metabolites among myxobacteria. This analysis also revealed diversity among the isolated S. cellulosum. It appeared that at least 30 out of 34 strains are different each other.
점액세균 Myxococcus stipitatus KYC4013에 의한 생리활성물질 생산
안동주 ( Dong Ju An ),박수현 ( Soo Hyun Park ),이종석 ( Jong Suk Lee ),조경연 ( Kyung Yun Cho ) 한국미생물생명공학회(구 한국산업미생물학회) 2014 한국미생물·생명공학회지 Vol.42 No.4
국내 분리 Myxococcus 속 점액세균 207 균주들 중 가장 높은 항진균 활성을 보인 M. stipitatus KYC4013 균주의 배양추출물을 고분해능 LC-MS로 비교 분석한 결과 melithiazol 유도체로 추정되는 5개 항진균 물질과 phenalamide 유도체로 추정되는 3개 이차대사산물을 생산하고 있는 것으로 나타났다. Melithiazol 유도체 추정 물질들은 CYS 배지에서 가장 잘 생산되었으며, phenalamide 유도체 추정 물질들은 VY3 배지에서 가장 잘 생산되었다. Myxococcus stipitatus KYC4013 extract exhibited the most potent antifungal activity among the extracts of 207 Myxococcus strains isolated in Korea. High-resolution LC-MS analysis revealed that M. stipitatus KYC4013 produces five antifungal substances and three other secondary metabolites that were predicted to be melithiazol and phenalamide derivatives, respectively. The putative melithiazol derivatives were best produced in CYS medium and the putative phenalamide derivatives were best produced in VY3 medium.