SNP 마커를 이용한 벼 흰잎마름병 저항성 선발 효율 증진

신운철,백소현,서춘순,강현중,김정곤,신문식,이강섭,한장호,김현순,Shin, Woon-Chul,Baek, So-Hyeon,Seo, Chun-Sun,Kang, Hyeon-Jung,Kim, Chung-Kon,Shin, Mun-Sik,Lee, Gang-Seob,Hahn, Jang-Ho,Kim, Hyun-Soon 한국식물생명공학회 2006 식물생명공학회지 Vol.33 No.4

본 연구는 흰잎마름병 K1 레이스에 감수성인 상주찰벼와 저항성인 HR13721-53-3-1-3-3-2-2를 인공교배하여 육성된 F2, F3를 재료로 하천 Kl 레이스에 대한 저항성 검정과 SNP 마커를 이용한 유전자형 분석 및 저항성과의 연관성을 분석하였다. Kl 레이스에 대한 저항성 검정 결과 $F_2,\;F_3$에서 각각 이론적 분리비인 3:1, 1:1의 분리비를 나타냈으며 SNP 마커를 이용한 유전자형 분석은 16PFXa1 primer를 이용하여 유전자를 증폭한 후 Eco RV 제한효소 처리하여 다형성을 분석하여 저항성 및 유전자형을 확인할 수 있었다. K1 레이스에 대한 저항성 검정과SNP마커를 이용한 유전자형의 연관분석 결과 저항성과 마커간에 연관성이 일치하였으며, 특히 SNP 마커를 이용한 유전자형 분석에서는 K1 레이스에 대한 저항성 검정에서 알 수 없었던 $F_2$ 개체가 동형접합체인지 이형접합체인지를 판별할 수 있어 저항성 품종 육종을 위한 선발 효율을 높일 수 있었다. Discovery of single nucleotide polymorphisms (SNPs), including small insertions and deletions, is one of the hot topics in genetic research. The most common type of sequence variant consists of single base differences or small insertions and deletions at specific nucleotide positions. Significance of SNPs in rice is increasing for genetic research, positional cloning and molecular breeding. $F_2$ 170 lines and $F_3$ 194 lines derived from Sangjuchalbyeo/HR13721-53-3-1-3-3-2-2 Were used for Searching SNP markers related to bacterial blight resistance. Sangjuchalbyeo is susceptible to bacterial blight, but HR13721-53-3-1-3-3-2-2 has Xa1 gene resistant to bacterial blight. Individual lines were inoculated with $K_1$ race of bacterial blight and resistant or susceptible was evaluated after 3 weeks from inoculation. The genotypes of population were analysed by PCR-RFLP for SNP marker developing. The segregation of $F_2\;and\;F_3$ population showed almost 3:1, 1:1 ratio, respectively. Analysis of genotype using SNP marker is capable of confirming resistance for $K_1$ race and genotype through amplifying the gene using 16PFXal primer and digested the PCR product with Eco RV. There were close relation between resistance test for $K_1$ race and SNP marker genotype. Especially, DNA analysis using SNP marker is capable of judging homozygote/heterozygote in $F_2$ population compared with resistant test for Kl race. So, it seems to improve the selection efficiency in disease resistant breeding.

자포니카 벼품종을 이용한 파보일드미의 침지 조건 및 이화학적 특성

유재수 ( Jae Soo Yoo ),백소현 ( So Hyeon Baek ),백만기 ( Man Kee Baek ),박현수 ( Hyun Su Park ),김보경 ( Bo Kyeong Kim ),하기용 ( Ki Young Ha ) 한국산업식품공학회 2012 산업 식품공학 Vol.16 No.4

본 실험은 6개 자포니카 품종의 벼를 이용하여 파보일드미 제조를 위한 침지조건 및 이화학적 특성을 조사하였다. 파보일드미 제조과정 중 정조의 전분이 완전하고 균일한 호화가 될 수 있도록 하기위한 최적 수분함량은 30%이며, 침지온도와 시간은 각각 65oC 및 4시간 이었다. 파보일드미의 길이와 폭은 모든 품종에서 감소되었고, 완전미율은 증가되었으며, 쇄미와 균열미 발생은 낮았다. 파보일드미의 조단백질 함량은 모든 품종에서 낮고, 조지방과 조회분 함량은 높아졌다. 파보일드미의 쌀알의 경도는 일반백미보다 단단하고, 명도는 낮고 적색도와 황색도는 높아졌다. 환원당 함량은 일반백미 보다 파보일링 후 증가되었고 품종 중설갱벼가 가장 높았으며, 드래찬, 보람찬, 양조 및 평안벼 등 4품종은 유의한 차이는 없었으며 신동진이 가장 낮게 평가되었다. 조리 중 취반수에 유출된 고형분함량은 파보일링 후 모든 품종에서 감소되었다. 파보일드미의 취반후의 경도는 원료미 보다 단단하고 탄성은 높아졌으며, 응집성은 낮아졌다. This study was carried out to investigate the most suitable soaking condition and the characteristics of parboiled rice using six japonica rice cultivars. It is important to maintain 30% of moisture content in the soaking process to acquire perfect and uniform gelatinization of starch of unhulled rice, and the most suitable soaking temperature and time are found to be 65oC and 4 hours, respectively. The length and width in forming of milled rice tend to be shortened in parboiled rice. The percentage of head rice in parboiled rice was higher than that of raw milled rice, and it was the highest 99.8% in Boramchan, The rate of broken and cracked rice in parboiled rice were lower than those of the raw milled rice. The crude protein contents after parboiling in all cultivars were lower than those of raw rice, whereas those of crude fat and ash increased. After parboiling, the hardness increased, colorimetric L value decreased, and increased colorimetric a and b values in comparing with those of milled rice, The reducing sugar contents increased after parboiling, and were the highest value in Seolgaeng. Solid contents in the parboiled rice were lower than those of raw milled rice in all cultivars, In a result of measuring textural properties after cooking, the hardness and springiness were measured higher in parboiled rice than raw rice, the cohesivness was measured higher in the raw milled rice than parboiled rice.

벼 품종 간 누룽지의 특성 비교 연구

유재수 ( Jae Soo Yoo ),백만기 ( Man Kee Baek ),백소현 ( So Hyeon Baek ),박현수 ( Hyun Su Park ),조영찬 ( Young Chan Cho ),김보경 ( Bo Kyeong Kim ),하기용 ( Ki Young Ha ) 한국산업식품공학회 2012 산업 식품공학 Vol.16 No.4

자포니카 품종을 이용하여 제조된 누룽지의 품종 간 차이를 비교하기 위하여 이화학적인 특성, 조직감 및 관능 특성에 대해 조사하였다. 품종들의 수분함량은 12.6-14.4%, 단백질 함량은 5.7-7.9%, 지질 함량은 0.6-3.4%, 회분 함량은 0.3-0.5% 범위이었다. 아밀로스 함량은 14.3-17.3% 범위로 대립벼가 가장 높고 친농이 가장 낮게 평가되었다. 물결합력은 품종 중 보람찬이 가장 높았으며, 경도는 신동진이 가장 높아 단단하였고 보람찬이 낮아 부드러운 특성을 나타냈다. 색도는 친농이 가장 밝게 평가되었고, 환원당 함량은 1.8-2.11 mg/mL 범위로 색도와의 상관관계는 알 수 없었다. 관능검사 결과 색깔에 대한 평가는 친농이 가장 높았고, 냄새는 친농>드래찬>보람찬 순으로 우수하였으며, 맛, 경도, 씹힘성과 전반적인 기호도는 보람찬이 우수하였다. This study was carried out to compare the varietal difference in physicochemical properties, texture and sensory characteristics of nuroong-gi prepared japonica rice cultivars. Moisture content of the cultivars was 12.6-14.4%, crude protein content was 5.7-7.9% and crude lipid content was 0.6-3.4%, ash content was 0.3-0.5%. Amylose content is varied from 14.3% to 17.3% and Daeribbyeo 1 scored the highest, Chinnong the lowest. The water binding capacity of Boranchan scored the highest, Shindongjin showed hard characteristics because it scored the highest in hardness whereas Boramchan showed soft characteristics because it scored the lowest in hardness, Lightness of Hunter color values indicates that Chinnong was evaluated as the brightest, reducing sugar content is arranged from 1.8 to 2.11mg/mL which doesn`t show correlation with color. In regard to a result of sensory evaluation, Chinnong scored the highest in color assessment, flavor scored higher in turn of Chinnong, Deuraechan, Boramchan, Boramchan scored higher in taste, hardness, chewiness evaluation and overall acceptability.

레스베라트롤 합성 GM 벼 검정을 위한 계통특이 마커 개발

우희종(Hee-Jong Woo),친양(Yang Qin),백소현(So-Hyeon Baek),여윤수(Yunsoo Yeo),신공식(Kong-Sik Shin),임명호(Myung-Ho Lim),조현석(Hyun-Suk Cho) 한국육종학회 2016 한국육종학회지 Vol.48 No.2

A variety of genetically modified (GM) crops have been developed in Korea. In these crops, the resveratrol-enriched transgenic rice plant (Agb0102) has moved ahead to generate the dossier for regulatory review process required for commercialization of GM crop. The resveratrol-enriched transgenic rice plant could be released to farmers for cultivation after national regulators have determined that it is safe for the environment and human health. Here, we developed a PCR-based DNA marker based on flanking sequences of transgene for the discrimination of resveratrol-enriched transgenic rice plant. This DNA markers will be useful for identifying of resveratrol-enriched transgenic rice plant, and can also be used to estimate transgene movement occurred by pollen transfer or seed distribution. Moreover, it is helpful for prompt screening of a homozygote-transgenic progeny in the breeding program.

연구보문 : 제초제 저항성 및 기능성 GM벼와 Non-GM벼의 농업적 특성 및 기능성분 비교

이동진 ( Dong Jin Lee ),김욱 ( Wook Kim ),백형진 ( Hyung Jin Baek ),장영석 ( Young Seok Jang ),백소현 ( So Hyeon Baek ),김헌웅 ( Heon Woong Kim ),윤이관 ( Yi Kwan Yoon ),이재성 ( Jae Sung Lee ),이광식 ( Kwang Sik Lee ) 韓國國際農業開發學會 2009 韓國國際農業開發學會誌 Vol.21 No.3

한국산 돌나물 수집종의 RAPD에 의한 유연관계 분석

김효진(Hyo-Jin Kim),안정호(Jeong-Ho Ahn),백소현(So-Hyeon Baek),이승엽(Seung-Yeob Lee) 한국원예학회 2008 원예과학기술지 Vol.26 No.1

국내에서 수집된 31개 돌나물(Sedum sarmentosum) 지방수집종에 대하여 15종의 10-mers와 12종의 20-mers primer를 가지고 RAPD를 이용한 유연관계를 분석하였다. 선발된 14종의 10-mers primer로부터 47개의 polymorphic band를 얻어 primer당 평균 band수는 3.4개였으며, 20-mers primer로부터는 90개의 polymorphic band를 얻어 primer당 평균 15개의 band를 얻었다. 10-mers보다 20-mers primer에서 polymorphism이 높았으며, 유연관계 분석결과도 20-mers primer에서 형태적 특성과 잘 일치하였다. 31개 수집종들은 크게 2군으로 분류할 수 있었으며, Ⅰ군에는 완주 및 군산 수집종을 포함한 27개 수집종이 속하였고, 꽃이 피지 않는 완주와 군산 수집종을 제외한 Ⅰ군 내의 수집종들 간에는 매우 가까운 유연관계를 보였다. Ⅱ군에는 줄기와 잎이 가늘고 꽃이 잘 피는 금산,부천,포천,용인 등4수집종이 속하였다. The genetic relationship among 31 Sedum sarmentosum local strains was analyzed using randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) with fifteen 10-mers random primers (Operon Technologies Inc., USA) and twelve 20-mers random primers (SeouLin Bioscience Inc., Korea). Forty-six polymorphic bands (3.3 per primer) and ninety (15.0 per primer) were generated by polymerase chain reaction with selected fourteen 10-mers primers, and six 20-mers primers, respectively. The production of polymorphic bands in 20-mers primers was more efficient than in 10-mers primers. The cluster analysis based on RAPD markers generated by 20-mers primers was matched well with morphological characteristics compared to 10-mers primer. Thirty-one local strains analyzed with UPGMA were clustered into 2 groups. Twenty-seven local strains were clustered into the group Ⅰ, and the geneticrelationship in Group I was very closed except Wanju and Gunsan local strains as no-flowering. Group Ⅱ included Keumsan, Bucheon, Pocheon and Yongin local strains with long hight, slender stem, narrow leaf, and abundant flowering characteristics.