http://chineseinput.net/에서 pinyin(병음)방식으로 중국어를 변환할 수 있습니다.
변환된 중국어를 복사하여 사용하시면 됩니다.
sfs1 유전자의 cAMP-cAMP receptor protein에 의한 발현 조절
유주순,이승진,이희영,정수열,최용락,Yoo, Ju-Soon,Lee, Seung-Jin,Lee, Hee-Young,Chung, Soo-Yeol,Choi, Yong-Lark 한국응용생명화학회 1996 Applied Biological Chemistry (Appl Biol Chem) Vol.44 No.1
We have cloned several E. coli sfs genes which stimulate mal gene expression with $crp^{{\ast}1}$). One the genes (pPVC2) was sequenced and potential CRP binding site is located in the upstream of the putative promoter in the regulatory region. In order to investigate the regulation of the sfs1 gene by the cAMP-CRP complex, we have constructed the sfs-lacZ fusion gene in this research. The overall transcriptional stimulations of sfs1 gene in the presence cAMP were confirmed by ${\beta}-galactosidase$ activity and Western blot analysis of sfs1-lacZ fusion gene. Transcriptional regulation by cAMP-CRP was also confirmed by Northern blot analysis. End-labelled DNA of the DNA fragment in sfs1 regulation region were used for gel retardation assay to examine the CRP-DNA complex in the presence of cAMP. Results here indicate that CRP binding site in the regulatory region of sfs1 gene is positive regulator for the expression of sfs1 gene. $crp^{\ast}$ 유전자가 도입된 대장균 MK2001($crp^{{\ast}1}$}, cya::km)을 숙주로 사용하여 mal 유전자 발현을 촉진시키는 유전자의 하나인 sfs1(sugar fermentation stimulation)의 구조해석 결과에 의하면, 잠정적인 sfs1의 promoter 영역에는 CRP 단백질과의 결합영역으로 보이는 염기배열이 존재하였다. 본 실험에서는 sfs1 유전자의 cAMP-CRP에 의한 발현 조절을 확인하고자, lacZ 와의 융합 유전자를 작성하였다. 작성된 융합 유전자는 cya 결손주인 Tp2010에서 cAMP의 첨가에 의해 ${\beta}-galactosidase$ 활성이 크게 증가하였으며, Western blotting의 실험에서도 같은 결과를 나타냈다. in vivo에서 발현이 확인된 전사산물은 cAMP에 의해 전사 촉진이 일어났으며, CRP의 결합부위로 예상되는 DNA 영역은 cAMP가 존재하면 CRP 단백질과 결합하는 특성을 나타내었다. 이상의 결과로 보아, sfs1 유전자의 발현은 UMP-CRP에 의한 전사촉진 현상을 받는 것으로 나타났다.
Serratia marcescens에서 cAMP receptor protein(CRP) 유전자의 클로닝 해석
유주순,김혜선,문종환,정수열,최용락,Yoo, Ju-soon,Kim, Hae-Sun,Moon, Jong-Hwan,Chung, Soo-Yeol,Choi, Yong-Lark 한국생명과학회 1998 생명과학회지 Vol.8 No.3
전사조절인자로서 잘 알려져 있는 cAMP receptor protein(CRP)은 cAMP와 DNA에 결합하는 특별한 활성을 가지고 있으며, cAMP-CRP complex를 형성하여 수많은 유전자의 발현조절에 관여한다. 이러한 측면에서 cAMP-CRP의 조절은 어떤 면에서 총체적 조절체계라고까지 한다.본 연구는 Serratia 균주에서 crp 유전자의 분자적 특성 및 cAMP에 의한 발현조절을 받는 분자기구를 해석하고자 유전자를 클로닝하고 발현을 확인하였다. MacConkey 배지에서 maltose를 탄소원으로 충분히 이용하지 못하는 대장균 TP2139(${\Delta}crp$,${\Delta}lac$를 숙주로 이용하고, 염색체 DNA를 library로 작성하여 얻은 형질전환체 약 일만개의 콜로니에서 red colony를 나타내는 5종류의 양성 클론을 얻었다. 이들 클론을 Southern 방법으로 확인한 결과 3kh의 단편을 가진 pCKB12클론이 crp유전자를 coding하고 있음을 확인하였다. glpD-lacZ 융합 plasmid인 pLDC6의 BamHI부위에 pCKB12의 3kb 단편을 삽입시킨 재조합 plasmid pLDC6-Scrp를 작성하여, 클로닝된 Serratia의 crp유전자가 대장균에서 유전자 전사조절에 미치는 영향을 확인한 결과 cAMP-CRP 복합체 형성에 의한 전사조절 기능이 확인되어졌다. One of the better-characterized transcription factor of E. coli is the cAMP receptor protein(CRP) and the CRP binds cAMP and DNA. The cAMP-CRP complex is involved in regulation of many genes at bacteria. The cAMP-CRP regulatory element represents, in some respects, a global regulatory network. The aim of this work was to study the structure and the mechanisms controlling the expression of CRP in Serratia marcescens. We have been get 5 different clones from Serratia which stimulated the cells to use maltose as a sole carbon source in E. coli TP2139. The crp gene clone, pCKB12, was confirmed by Southern hybridization with E. coli crp gene. The location of the crp gene was determined by construction subclones carrying various portions of pCKB12. To investigate the potential role of CRP in E. coli, lacZ fused plasmids were constructed and investigated the ${\beta}$-galactosidase activity of the fused plasmid. The Serratiamarcescens cAMP receptor protein can substitute the E. coli CRP in transcriptional activation at the lacZ gene. These results suggest that Serratia marcescens cAMP receptor protein complex functions to regulate several promoters in E. coli.
이승진,유주순,정수열,최용락 ( Seung Jin Lee,Ju Soon Yoo,Soo Yeol Chung,Yong Lark Choi ) 한국응용생명화학회 1997 Applied Biological Chemistry (Appl Biol Chem) Vol.40 No.2
A screening was performed to isolate the cellulose-producing microorganisms from vinegar in Korea. The isolated strain was identified as Acetobacter sp. with respect to physiological and biochemical characteristics and designated as Acetobacter CBI-2. Cellulose production of Acetobacter CBI-2 was equal with the well known cellulose-producing bacteria, A. xylinum. The result of separation on thin layer chromatography(TLC) was consistent with the degradation product of native cellulose. The presence of genes required for the cellulose biosynthesis in Acetobacter CBI-2 was confirmed by Southern hybridization.
이용석,유주순,정수열,박춘수,최용락,Lee, Yong-Seok,Yoo, Ju-Soon,Chung, Soo-Yeol,Park, Choon-Soo,Choi, Yong-Lark 한국응용생명화학회 2003 한국농화학회지 Vol.46 No.1
본 연구는 폐수 중의 질소 제거를 위한 생물학적 처리용 미생물 개발을 위한 목적으로 질소의 산화 능력이 뛰어난 균주를 분리하였다. 분리된 세균 중에서 질소 산화능과 생육 속도가 뛰어난 CH-N 균주를 선별하였으며, 생리, 생화학적 특성 조사에 의해 Bacillus sp로 추정되어 Bacillus sp. CH-N이라 명명하였다. 분리 균주는 0.5% glucose가 포함된 초기 pH가 7,0인 암모니아 및 아질산성 질소 함유 배지에서 30시간 배양 후 각각 85%와 90%의 암모니아성과 아질산성 질소의 감소율을 나타내었다. 폐수 및 생활하수에 분리 균주를 이용한 결과, 수질 속의 암모니아성 질소가 단시간에 크게 감소시키는 효과를 확인하였다. 균주를 고정시킨 담체의 질소산화 효과를 시험하고자 Bacillus sp. CH-N을 고정시킨 세라믹 담체를 이용한 결과, 배양 2일 후에는 암모니아성 질소가 전부 제거되었다. Abstract: In order to improve the system for biological nitrogen oxidizing process in sewage and wastewater, a bacterium having high abilities to oxidize of nitrogen was isolated from wastewater and polluted soils. The strain was identified to Bacillus sp. CH-N, based on the physiological and biochemical properties. Characteristics and oxidizing ability of both ammonia and nitrite were examined for the strain, Bacillus sp. CH-N. The strain showed the oxidizing rate about 80% to 90% on the sewage and wastewater after 48 h culture. The nitrogen oxidizing rate was increased in proportion to the initial concentration of glucose. The microorganism, Bacillus sp. CH-N cell immobilized on ceramic carrier were evaluated for the oxidation of ammonia in culture media.
Bacillus atrophaeus DYL-130이 생산하는 biosurfactant의 분리 및 특성
김선희,이상철,박인혜,유주순,주우홍,황철원,최용락,Kim Sun-Hee,Lee Sang-Cheol,Park In-Hye,Yoo Ju-Soon,Joo Woo-Hong,Hwang Cher-Won,Choi Young-Lark Korean Society of Life Science 2005 생명과학회지 Vol.15 No.5
원유 분해능이 강력한 균주를 얻고자 덕유산의 토양으로부터 crude oil을 탄소원으로 이용하는 수십 종을 분리하였다. 분리된 균주 중 원유분해능 및 biosurfactant 생성능이 우수한 균주를 선별하여, 형태학적 특성을 관찰하고 165 rDNA sequence와 』gyrA gene sequence를 통하여 Bacillus atrophaeus DYL-130으로 동정하였다. 동정된 균주 배양액의 표면장력은 최저 28 mN/m까지 감소되었다. 또한 Bacillus atrophaeus DYL-130이 생산하는 biosur-factant가 column chromatography에 의하여 분리 되었으며, 분리된 biosurfactant의 toluene 유화능 및 crude biosurfactant의 유화활성과 안정성이 시험 되었다. Crude biosurfactant의 유화활성은 kerosene에서 최대였으며, soybean oil에서도 높은 편이였으나 유화안정성의 경우 soybean oil을 기질로 하였을 경우가 kerosene을 기질로 하였을 때 보다 우수하였다. 또한 crude biosurfactant의 유화안정성을 합성계면활성제와 비교 한 결과 DYL-130이 생산하는 biosurfactant의 유화안정성이 합성계면활성제와 유사하거나 뛰어남을 확인하였다. Column chroma-tography에 의하여 분리된 biosurfactant는 drop-collapsing method에 의하여 surface-activity가 확인 되었으며 또한 toluene에 대한 유화력이 매우 뛰어난 것을 확인 하였다. 따라서 DYL-130에서 추출한 biosurfactant는 합성계면활성제를 대체할 수 있는 환경친화적인 생물 계면활성제로 사용될 수 있는 가능성을 보여주고 있다. 산업적으로 이 물질을 이용하기 위해서 Bacillus atrephaeus DYL-130이 생산하는 biosurfactant에 대한 구조분석과 물리 화학적 특성, 생분해도 및 환경독성 등의 조사를 수행하여야 할 것으로 생각된다. The objective of this study was investigate the characteristic of biosurfactant produced from the iso-lated strain. The strain was isolated from soli samples of Duck-Yu Mountain and it was identified as Bacillus atrophaeus DYL-130 by 16S rDNA and gyrA gene nucleotide sequence analysis. The surface ten-sion of culture filtrate of Bacillus atrophaeus DYL-130 decreased to 28 mN/m and its biosurfactant con-centration was determined by diluting the culture filtrate until the critical micelle concentration (CMC). The emulsifying activity and stability of crude biosurfactant was measured by using water-immiscible hydrocarbons and oils as substrate. The biosurfactant was purified by affinity chromatography and the surface activity of purified biosurfactant was measured by drop-collapsing method and it could be effectively emulsify toluene.
sfs1 유전자의 cAMP - cAMP receptor protein 에 의한 발현 조절
최용락(Yong Lark Choi),유주순(Ju Soon Yoo),이승진(Seung Jin Lee),이희영(Hee Young Lee),정수열(Soo Yeol Chung) 한국응용생명화학회 1996 Applied Biological Chemistry (Appl Biol Chem) Vol.39 No.3
We have cloned several E. coli sfs genes which stimulate mal gene expression with crp^(*1). One the sfs genes (pPVC2) was sequenced and potential CRP binding site is located in the upstream of the putative promoter in the regulatry region. In order to investigate the regulation of the sfs1 gene by the cAMP-CRP complex, we have constructed the sfs-lacZ fusion gene in this research. The overall transcriptional stimulations of sfs1 gene in the presence CAMP were confirmed by β-galactosidase activity and Western blot analysis of sfs1-lacZ fusion gene. Transcriptional regulation by AMP-CRP was also confirmed by Northern blot analysis. End-labelled DNA of the DNA fragment in sfs1 regulatory region were used for gel retardation assay to examine the CRP-DNA complex in the presence of cAMP. Results here indicate that CRP binding site in the regulatory region of sfs1 gene is positive regulator for the expression of sfs1 gene.