SCOPML과 SCOPBrowser에 관한 연구

안건태,윤형석,황의윤,김진홍,이명준,Ahn, Geon-Tae,Yoon, Hyeong-Seok,Hwang, Eui-Yoon,Kim, Jin-Hong,Lee, Myung-Joon 한국정보처리학회 2003 정보처리학회논문지D Vol.10 No.1

포스트지놈 시대에 있어서 가장 주된 연구는 단백질의 구조적 유사성이나 분류학적인 연관성을 밝히는 것이다. SCOP 단백질 구조 분류는 이러한 목적을 위한 대표적인 데이터베이스로서, 3차원 구조가 알려진 단백질에 대한 구조적 분류학적 관계에 대한 상세한 기술을 제공한다. 하지만, SCOP 데이터는 단순 텍스트 형식의 자료로만 제공되고 있어서 이를 이용한 다른 분석 도구나 자원을 개발할 경우 그 작업이 번거로우면서도 오류 발생의 소지가 높다. 따라서 이러한 데이터를 연주자들이 보다 효과적으로 이용할 수 있도록 표준화된 구조적인 형식으로 제공하는 것이 바람직하다. 이러한 요구를 충족시키기 위하여, 본 논문에서는 SCOP 데이터베이스에 대한 효율적인 검색을 지원하는 브라우징 도구인 SCOPBrowser를 구현하였다. SOPBrowser는 SCOP 사이트에서 제공되는 기본정보 및 단백질 구조 분류 정보에 대한 트리보기, 전체 단백질 도메인에 대한 검색, 특정 도메인에 대한 XML 내용 보기, 그리고 단백질 구조에 대한 유용한 통계 등 다양한 정보를 얻을 수 있다. The major challenge for post-genomic study is to identify structural similarity and relationships of proteins. SCOP (Structural Classification of Proteins) is a typical database for this purpose, providing a derailed description of the structural and functional relationships of the proteins whose three-dimensional structures have been determined. Unfortunately, since the SCOP data is only available as a plain text format, it is cumbersome and error-prone to develop tools and resources to utilize the data more effectively. To meet these researchers to utilize the data more effectively. To meet these requirements, we have developed an XML representation for the SCOP site, users of the tool, named, SCOPBrowser, for effective search of SCOP database. In addition to the information available from the SCOP site, users of the tool can obtain various information such as viewing the tree hierarchy of structure classification of proteins, searching into whole protein domains, showing XML contents of a specific domain, and some useful statistics about protein structures.

iPlace:EJB 기술을 이용한 웹 기반 협업시스템

안건태,정명희,이근웅,문남두,이명준,An, Geon-Tae,Jeong, Myeong-Hui,Lee, Geun-Ung,Mun, Nam-Du,Lee, Myeong-Jun 한국정보처리학회 2001 정보처리학회논문지D Vol.8 No.6

인터넷을 통한 공동작업이 활발해짐에 따라, 가상의 작업공간을 지원하는 시스템의 필요성이 증대되고 있다. 공동작업에 참여하는 구성원들은 이러한 가상의 공간을 통하여 서로의 정보를 효율적으로 교환하고 공유하게 된다. 이러한 시스템은 서비스의 안정성을 보장하면서도 다양한 사용자의 요구에 따라 용이하게 확장될 수 있는 것이 바람직하다. 본 논문에서는 협업지원 컴포넌트와 이를 통하여 개발된 iPlace (internet workPlace) 시스템에 대하여 기술한다. iPlace 시스템은 웹 상의 개인공간인 개인작업장과 그룹의 구성원이 공유하는 공간인 공동작업장을 통하여 구성원들 사이의 정보의 공유와 재사용을 효과적으로 지원한다. 또한, 협업지원 컴포넌트는 EJB(Enterprise JavaBeans) 기술을 이용하여 구현하여 높은 확장성과 안정성을 제공한다. As collaborative works have been spread over the internet, the need for information systems providing virtual workspaces has grown rapidly. Through virtual workspaces, the members participating in those collaborative works share and exchange their information effectively. It is desirable that these systems can be extended according to various requests of users, providing reliable services. In this paper, we describe a group of components for supporting collaboration and the iPlace (internet workPlace) system developed with those components. The iPlace system provides effective sharing and reusing of information among the members of collaborative groups through personal workspaces-the private spaces on the Web for each user and shared workspaces-the shared spaces for each of those groups. In addition, implemented with EJB technology, it provides highly scalable and reliable services.

Optimal time interval between surgery and adjuvant chemotherapy of gastric cancer

안건태,백선경,김시영,윤휘중,한재준,맹치훈 대한내과학회 2018 대한내과학회 추계학술대회 Vol.2018 No.1

자바컴포넌트 기반의 유전체 연구 협업지원 시스템

안건태,김진홍,한인섭,이명준 한국정보과학회 프로그래밍언어연구회 2003 프로그래밍언어논문지 Vol.17 No.1

이기종간의 상호운용성을 지원하는 이동 에이전트 시스템

이명준,박양수,유양우,문남두,김진홍,안건태 울산대학교 2000 공학연구논문집 Vol.31 No.1

현재 대부분의 이동 에이전트 시스템들은 그들 자신의 구조를 가지며 서로 다른 방법으로 구현되어 있다. 이러한 에이전트 시스템들은 서로 다른 인터페이스를 제공하고 있어서 이기종의 에이전트 시스템에서 새성된 에이전트들은 상호 이동하여 작업을 수행할 수 없다. 이러한 문제를 해결하기 위하여 이동 에이전트 시스템간의 상호운용성 지원이 중요한 과제로 다루어지고 있다. OMG(Object Management Group)는 이질적인 에이전트 시스템간의 상호운용성을 증진시킬 목적으로 MAF(Mobile Agent Facilities)명세를 제안하였다. MAF명세는 MADAgentsystem과 MAFFinder 두개의 인터페이스로 구성되어 있으며 에니전트 관리, 코드의 이동성, 명명 규칙에 관한 기능을 제공한다. 본 논문에선는 OMG의 MAF 명세를 만족하는 SMART 이동 에이전트 시스템의 설계와 이의 구현에 대하여 설명한다 SMART 이동 에이전트 시스템의 구성은 에이전트를 실행시키는 환경을 제공하는 플레이스(place), 에이전트의 라이프사이클과 플레이스를 감시하는 모니터(monitor) 그리고 에니전트에게 시스템의 자원을 할당하는 자원관리자(resource manager)로 이루어져 있다. Most current mobile agent systems adopted their own architectures, being implemented in various ways. Since those agent systems provide different interfaces, agents created in one mobile agent system could not move to other agent systems to perform their tasks. To solve this problem, interoperability becomes one of the important issues on mobile agent systems. The OMG(Object Management Group) proposed the MAF(MAF(Mobile Agent Facilities) specification for the interoperability among heterogeneous mobile agent systems. the MAF specification contains MAF Agent System and MAFFinder interfaces, and defines agent management, code mobility and naming rules. In this paper, we describe the design and implementaion of the SMART mobile agent system which satisfies the OMG MAF specification. The SMART system consists of Places that provide execution environments for agents, Monitor that monitors life-cycle of agents and places, and Resource Manager that allocates resources of system for agent.

효과적인 협업을 지원하는 강좌 관리시스템의 설계

안건태(GeonTae Ahn),정혜영(HyueYoung Jung),황의윤(EuiYoon Hwang),이명준(MyungJoon Lee) 한국정보과학회 2003 한국정보과학회 학술발표논문집 Vol.30 No.2Ⅱ

인터넷을 통한 교육이 활발해지면서 강좌의 진행을 보다 효과적으로 관리하고 운영할 수 있는 시스템에 대한 요구가 증가하게 되었다. 특히, 실험 및 공동과제 수업과 같은 강좌의 경우 사용자들 사이의 상호 의견 교환 및 자료의 공유를 용이하게 지원해주는 협업 기능이 제공되는 것이 바람직하다. 본 논문에서는 학습자와 학습자, 교육자와 교육자, 그리고 교육자와 학습자 간의 다양한 의사교환 방법과 협업 기능을 제공하는 협업지원 강좌 관리시스템을 설계하였다. 본 논문에서 설계된 시스템은 웹상의 가상공간인 개인작업공간, 팀작업공간, 그리고 학습작업공간을 이용하여 강좌 진행 관리 및 중간 결과물에 대한 관리를 효과적으로 지원하고자 한다.

효과적인 자원공유를 위한 WebDAV의 확장과 그 응용

안건태(Geontae Ahn),정혜영(Hyeyoung Jung) 한국정보과학회 2007 한국정보과학회 학술발표논문집 Vol.34 No.1D

WebDAV(Web-based Distributed Authoring and Versioning)는 웹 기반의 분산 저작과 버전관리를 지원하는 표준 명세로서, 인터넷을 통하여 다양한 콘텐츠의 비동기적인 협업을 지원하는 표준 하부구조를 제공한다. 특히 WebDAV의 속성 관리 기능은 자원의 주요 정보를 속성으로 설정하여 관리할 수 있는 기능이다. 이러한 WebDAV의 속성 관리기능을 이용하는 경우 사용자 측에서 자유롭게 속성관리가 가능하여 웹을 기반으로 하는 협업시스템 및 자원공유 시스템을 개발하는데 매우 유용하게 활용될 수 있다. 본 논문에서는 웹을 통한 문서 및 데이터의 관리를 제공하는 응용시스템의 개발을 효율적으로 지원할 수 있도록한 WebDAV 프로토콜의 확장과 이를 이용하여 기업내에서 생성되는 기술문서 및 도면 문서에 대한 협업을 지원해주는 도면공유시스템을 개발하였다. 확장된 WebDAV의 기능을 이용하는 경우 응용시스템 개발자는 사용자 속성을 정의함으로써 어플리케이션을 간편하게 설계할 수 있게 되며, 기존의 웹 서버에서는 복잡하게 구현해야했던 자원에 대한 잠금관리 및 버전관리 기능도 지원받을 수 있게 된다.

BioPlace

안건태(GeonTae Ahn),김진홍(JinHong Kim),신원준(WonJoon Shin),박희종(HeeJong Park),이명준(MyungJoon Lee) 한국정보과학회 2003 한국정보과학회 학술발표논문집 Vol.30 No.2Ⅱ

오늘날 생물정보기술의 발달은 유전체 연구의 활성화에 지대한 영향을 미치고 있으며, 작게는 소그룹 규모의 연구에서부터 크게는 지리적으로 떨어진 국가적인 협업의 형태로 연구가 진행 중이다. 이처럼 지리적으로 분산되어 있는 연구 그룹의 경우 서로의 연구 자료나 실험데이터들을 효과적으로 공유하고 교환할 수 있는 도구의 지원이 필요하다. 또한, 유전체 연구 전략에 대한 기본 지침서나 구성원들의 통합 일정 관리를 지원함으로써 연구의 효율을 향상시킬 수 있는 방법의 모색이 요구된다. 본 논문에서는 유전체 연구자들의 효과적인 연구 진행을 도와주며, 연구 참여자 및 연구 초연생들이 용이하게 유전체 연구에 참여하며 따를 수 있도록 다양한 유전체 지원 도구를 제공하는 웹기반 협업지원 시스템인 BioPlace의 개발에 대하여 기술한다.

귀납적 논리 프로그래밍을 이용한 단백질 구조 분류 기법

안건태(Geon-Tae Ahn),김진홍(Jin-Hong Kim),윤형석(Hyeong-Seok Yoon),박양수(Yang-Su Park),이명준(Myung-Joon Lee) 한국정보과학회 2002 한국정보과학회 학술발표논문집 Vol.29 No.1A

정보의 급속한 확산과 더불어 체계적이고 효율적으로 정보를 분류하고 활용할 수 있는 방법에 대한 연구의 필요성이 증대되고 있다. 생물정보에 있어서도 기존에 축적된 많은 정보 뿐 만 아니라 새로 밝혀지는 정보들을 자동적으로 분류하고 재활용하는 방법의 일환으로 귀납적 논리 프로그래밍을 적용한 방법론이 채택되고 있다. 본 논문에서는 귀납적 논리 프로그래밍을 이용하여 단백질 구조 분류 데이터베이스를 생성하고 이를 기반으로 단백질 폴더에 내재된 공통의 규칙들을 발견하고, 새로운 단백질에 적용하여 구조를 예측할 수 있는 방법론에 대하여 기술한다.

RFID기반 부품조립라인 구축을 효율적으로 지원하는 공정 설계 도구의 개발

안건태(Geontae Ahn),이태호(Taeho Lee) 한국정보과학회 2009 한국정보과학회 학술발표논문집 Vol.36 No.2D

RFID 기술의 확산과 더불어 다양한 제조산업에서, 생산 공정 혁신을 위한 도구로 RFID 기술을 도입하고 있다. 하지만 높은 초기 투자비용이나 실질적으로 필드 테스트시 발생하는 인식률 문제는 RFID 기술의 보급 확산의 걸림돌이 되고 있어서 보다 효율적인 도구의 지원과 개발이 요구되고 있다. 본 논문에서는 이러한 요구사항을 충족시키고, RFID 기반의 부품 조립 공정 구축을 보다 간편하고 효율적인 방법으로 구현할 수 있는 RFID기반 공정관리시스템을 설계하고 구현하였다. 본 시스템을 이용하는 경우 조립 공정의 설계 및 수정에 신속한 대응이 가능하고, 실제 라인상에서 발생할 수 있는 인식률 문제를 실험적인 방법으로 해결할 수 있는 도구들을 지원함으로써, 개발 공기의 단축 및 RFID 기반 시스템 관리의 효율성을 높일 수 있는 효과가 있을 것으로 기대한다.