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이준승(Jun-Seung Lee),이경호(Kyong-Ho Lee) 한국정보과학회 2004 한국정보과학회 학술발표논문집 Vol.31 No.2Ⅱ
본 논문은 온톨로지를 활용한 스키마 매칭 알고리즘을 제안한다. 기존의 대부분의 스키마 매칭 방법은 단순매칭을 대상으로 하는 반면, 제안된 방법은 계층적 구조의 온톨로지에 기반하여 복합매칭을 계산할 수 있다. 특히, 제안된 온톨로지는 이전의 매칭결과에 대한 사용자의 피드백을 이용하여 자동으로 갱신됨에 따라 적절한 도메인 정보를 유지할 수 있다. 성능평가를 위한 실험결과, 온톨로지의 적용이 매칭 성능을 향상시킴을 확인할 수 있었다.
Jun Seung Lee(이준승),Ji Young Cha(차지영),Hyung Suk Baik(백형석) 한국생명과학회 2011 생명과학회지 Vol.21 No.2
Pseudomonas syringae pv. tabaci는 숙주인 담배에 감염하여 들불병(wild fire)을 일으키는 식물 병원성 세균이다. 이 세균의 pathogenicity island (PAI)는 Type III secretion system 및 병원성 유전자들을 암호화하고 있으며, 병원성 조절에 있어 핵심적인 역할을 한다. 최근 식물 병원성 세균인 Ralstonia solanacearum에서 식물 세포 접촉을 매개로 하여 hrp gene cluster를 양성조절하는 PrhA (plant regulator of hrp) receptor가 발견되었다. 본 연구에서는 P. syringae 에서 식물세포에 의해 hrp 유전자가 유도되는지 확인하기 위해, prhA 유사체를 동정하고 PrhA 결실돌연변이주(BL11)를 구축하였다. BL11은 숙주 감염 실험에서 병원성이 현저히 감소하였고, 식물 세포현탁액에서 hrpA 유전자의 발현수준이 hrp 유도배지에서 보다 3배 더 높게 나타났다. 이러한 결과들을 근거로 PrhA가 식물세포접촉에 의한 조절에 중요한 역할을 한다는 것을 확인하였으며, hrpA-gfp reporter fusion을 사용하여 이를 다시 검증하였다. The hrp gene cluster in the plant pathogen Pseudomonas syringae is a key determinant of pathogenicity. Recent studies have demonstrated that specific host cell induction of the Ralstonia solanacearum hrp gene cluster is controlled by the PrhA (plant regulator of hrp) receptor. To characterize the role that P. syringae PrhA plays in the virulence of plant cells, a prhA homolog was isolated from P. syringae pv. tabaci and a ΔprhA mutant was constructed by allelic exchange. The ΔprhA mutant had reduced virulence in the host plant, and co-culture of P. syringae pv. tabaci and plant cell suspensions induced a much higher level of hrpA gene transcription than culture in hrp-inducing minimal medium. These results indicate that PrhA of P. syringae is a putative pathogen-plant cell contact sensor, therefore, we used a hrpA-gfp reporter fusion to monitor the in situ expression of PrhA. The results of this study demonstrated that PrhA induces hrp gene expression in P. syringae pv. tabaci in the presence of plant cells.
저삼투질 비이온성 조영제에 의한 신손상시 뇨중 N - Acetyl - β - D Glucosaminidase ( NAG ) 활성도의 의의
이준승(Jun Seung Lee),박지현(Jee Hyoun Park),곽귀철(Guee Chul Kwak),오동진(Dong Jin Oh),민철홍(Cheol Hong Min),강응택(Eung Taek Kang),유석희(Suk Hee Yu) 대한내과학회 1996 대한내과학회지 Vol.51 No.5
Objectives: It has been claimed that the incidence of the contrast media induced nephrotoxicity (CMN) was reduced with the introduction of the nonionic low-osmolar contrast media (CM). The commonly used diagnostic tools for nephrotoxicity including serum creatinine levels, creatinine clearance and urine analysis cannot detect damage of renal proximal tubule in early stage. Urine N-Acetyl-β-D Glucosaminidase (NAG) is well documented a useful indicator for proximal tubular damage. Therefore we investigated incidence of nonionic low-osmolar CMN and whether the urine NAG activity could be used as a indicator of CMN. Methods: We studied 32 patients with normal renal functions (mean age: 58.7, M:F=23:9) and assayed their serum concentration of creatinine, urine NAG activities and SDS-PAGE profiles in the urine for 5 days after exposure to CM. Results: Mean creatinine level of 32 patients did not increase in comparison to their preexposure level on post exposure day 1, 3 and 5. But mean urine NAG activities increased significantly in comparison to their preexposure activities from day 1 to day 4 (p<0.05). Serum creatinine level increased either more than 50% or at least 1㎎/dL comparing the preexposure levels in 5 patients (15.6%) and did not in 27 patients (84.4%) and urine NAG activities increased from day 1 to day 4 in the former group and from day 1 to day 3 in latter group (p<0.05). Serum creatinine level increased either more than 20% or at least 0.3㎎/dL comparing the preexposure levels in 13 patients (40.6%) and did not in 19 patients (59.4%) and urine NAG activities increased from day 1 to day 3 in two groups (p<0.05). Serum creatinine level increased only 25% (sensitivity) of the patients with low molecular weight (LMW) protein in their urine SDS-PAGE and did not increased 90% (specificity) of the patients without LMW protein in their urine SDS-PAGE (50% or 1.0㎎/dL). The sensitivity and specificity of creatinine level were 33.3% and 55% (20% or 0.3㎎/dL) upon SDS-PAGE. Urine NAG activity revealed 76.9% of sensitivity and 52.6% of specificity. Conclusion: Nonionic low-osmolar contrast media, compared to ionic high osmolar contrast media, results in similar incidence of CMN and have the potential CMN subclinically. Urine NAG activity can be a useful indicator for CMN.
이준승(Jun-Seung Lee),이경호(Kyong-Ho Lee) 한국정보과학회 2004 한국정보과학회 학술발표논문집 Vol.31 No.1B
본 논문은 점증적으로 갱신되는 온톨로지에 기반한 스키마 매칭 알고리즘을 제안한다. 스키마 매칭에 사용되는 온톨로지는 전문가에 의하여 작성된 정적인 것으로 모든 어휘관계를 포괄하기는 힘들다. 제안된 방법은 이전의 매칭 결과와 사용자 피드백에 따라 점증적으로 온톨로지를 갱신하여 매칭의 성능을 향상시킨다. 특히, 제안된 온톨로지는 분할, 병합 관계를 기술하고 있어 단순한 매칭관계뿐만 아니라 복합매칭관계 추출을 가능케 한다. 성능평가를 위한 실험결과, 점증적 온톨로지의 적용이 매칭 성능을 매우 향상시킴을 알 수 있었다.
이준승(Jun-Seung Lee),조성배(Sung-Bae Cho) 한국정보과학회 2002 한국정보과학회 학술발표논문집 Vol.29 No.2Ⅱ
본 논문에서는 대화형 유전자 알고리즘을 이용한 음악검색 시스템을 개발한다. 기존의 음악검색 시스템을 찾고자 하는 음악에 대한 정보를 필요로 하기 때문에 사용자가 시스템이 요구하는 정보를 가지고 있지 않는 경우 검색이 힘들다. 하지만 대화형 유전자 알고리즘을 통한 질의어 생성방식을 이용하면 사용자의 주관적 감정에 의한 음악검색을 할 수 있다. 먼저 사용자가 초기 유전자형에 의해 선택된 음악을 듣고 주관적인 평가를 내리면 이 평가값으로 유전자 알고리즘을 이용하여 질의어를 생성, 가장 가까운 음악을 검색하여 들려준다. 사용자는 이러한 과정을 반복하여 자신의 주관적 평가에 따라 진화되는 유전자형에 의해 원하는 음악을 점진적으로 검색한다. 이를 통해 사용자는 전문적인 음악적 지식이나 찾고자 하는 음악에 대한 특별한 정보없이 개인의 주관에 의한 검색을 할 수 있을 것이다.
XML 문서의 자동변환을 위한 효율적인 스키마 매칭 알고리즘
이준승(Jun-Seung Lee),이경호(Kyong-Ho Lee) 한국정보과학회 2003 한국정보과학회 학술발표논문집 Vol.30 No.2Ⅱ
본 논문에서는 XML 문서의 자동변환을 위해 2단계의 상향식 매칭 방법을 제안한다. 제안된 방법은 단말노드 사이의 유사도 비교를 통해 임계값을 넘는 후보 매칭집합을 결정하고, 단말노드가 포함되어 있는 경로의 유사도 비교를 통해 적절한 일대일 애칭을 추출한다. 특히, 노드 사이의 유사도 비교를 위해 축약어 사전, 일반 동의어 사전, 도메인 온톨로지를 적용한다. 실제 전자상거래용 XML 스키마를 대상으로 실험한 결과 제안된 방법은 평균적으로 97%의 정확률을 보였다.