http://chineseinput.net/에서 pinyin(병음)방식으로 중국어를 변환할 수 있습니다.
변환된 중국어를 복사하여 사용하시면 됩니다.
Nested PCR을 이용한 Cowpea chlorotic mottle virus 정밀 진단 시스템 개발
민병대(Byung-Dae Min),김영석(Young-Suk Kim),이시원(Siwon Lee),이수헌(Su-Heon Lee) 충남대학교 농업과학연구소 2014 농업과학연구 Vol.41 No.4
Cowpea chlorotic mottle virus (CCMV)는 Group IV positive sense single strand RNA virus, Bromoviridae과, Bromovirus속으로 분류하는 식물병원성 바이러스로, 강낭콩(Phaseolus vulgaris), 나비완두(Clitoria ternatea), 담배(Nicotiana tabaccum), 대두(Glycine max), 동부(Vigna unguiculata, Vigna siensis) 및 땅콩(Arachis hypogaea)이 국내로 수입될 경우, 검사를 수행하는 관리급 검역바이러스이다. 본 연구에서는, RT-PCR, nested PCR 및 유전자-삽입 양성대조구를 개발하여, CCMV를 현장에서 신속, 정확하게 진단할 수 있는 정밀검정 시스템을 구현하였다. 본 연구에서 개발한 방법은 지속적으로 현장에서 활용되어 식물검역에 기여할 것이라고 기대된다. Cowper chlorotic mottle virus (CCMV) is the ‘controlled’ quarantine virus as plant pathogenic virus that are classed as group Ⅵ (+) ssRNA virus that belongs to the genus Bromovirus and family Bromoviridae, When plants that are Phaseolus vulgaris, Clitoria ternatea, Nicotiana tabaccum, Glycine max, Vigna unguiculata and Vigna siensis, and Arachis hypogaea is imported in domestic. In this study, inspection system is implemented to analyze CCMV accurately and rapidly by developing RT-PCR, nested PCR, and gene insertion positive control. It is expected that the method developed in this study will contribute to the plant quarantine to be consistently utilized in the field.
항진균 세균과 난용성 인산염 가용화 효모의 혼합 배양액을 이용한 고추 병해의 생물학적 방제
이건웅,민병대,박수정,정원화,고은별,이귀재,채종찬,Lee, Gun Woong,Min, Byung-Dae,Park, Sujeong,Jheong, Weonhwa,Go, Eun Byeul,Lee, Kui-Jae,Chae, Jong-Chan 한국미생물학회 2013 미생물학회지 Vol.49 No.4
고추생장 촉진을 위해 병원균에 대한 방제력과 난용성 인산염에 대한 가용화 활성을 보이는 미생물 혼합배양액의 효과를 검증하였다. Saccharomyces sp. L13은 난용성 인산염에 대한 가용화 활성으로 분리되었으며 Bacillus sp. L32는 고추역병과 고추탄저병에 대한 길항력 활성으로 분리되었다. 특히 L32 균주는 대치배양법과 잎을 이용한 실증실험에서 모두 길항능력을 보였으며 시설재배를 이용한 실증실험에서도 병의 발병율을 저감시켰다. 두 균주의 혼합배양은 각 균주들의 생장율에 영향을 주지 않았으며 고추에 대한 혼합배양액 처리는 고추역병과 고추탄저병의 발병율을 저감시키는 동시에 난용성 인산염의 가용화를 통해 고추의 생장율을 증대시키는 효과를 확인할 수 있었다. 본 결과는 두 균주의 혼합배양액이 작물재배를 위한 미생물제제로서 잠재적 효용성이 높다는 것을 제시한다. This study was to investigate beneficial effects of microbial mixture on red pepper which was capable of promoting plant growth by solubilizing insoluble phosphate as well as protecting plants from pathogenic attack. Saccharomyces sp. L13 was isolated for phosphate solubilizing activity on aluminium phosphate, tricalcium phosphate, calcium hydrophosphate, and magnesium hydrophosphate. On the other hand, Bacillus sp. L32 was isolated for antagonistic activity against Phytophthora capsisi and Colletotrichum gloeosporioides, causing Phytophthora blight and Anthracnose disease in pepper, respectively. The strain L32 exhibited antagonistic activities both under dual culture assays and detached leaves assays. The each strain under the condition of mixed cultivation exhibited the same growth rates as one under pure cultivation. In greenhouse study, the mixed culture showed the both effect of plant growth promotion and reduction of disease symptom development against P. capsisi and C. gloeosporioides providing a potential as effective microbial agent for plant husbandry.
김근수,민병대,박수정,오정환,조익환,장석재,김지혜,박상민,박주현,정현미,안태영,정원화,Kim, Geun-Su,Min, Byung-Dae,Park, Su-Jeong,Oh, Jung-Hwan,Cho, Ik-Hwan,Jang, Seok-Jea,Kim, Ji-Hae,Park, Sang-Min,Park, Ju-Hyun,Chung, Hyen-Mi,Ahn, Tae-Yo The Microbiological Society of Korea 2013 미생물학회지 Vol.49 No.4
정수처리 시설에서 급 배수관으로 많이 사용되는 스테인리스관과 동관에 형성되는 생물막의 특성에 대해 16주 동안 조사하였다. 생물막 반응기는 실제 배급수관의 구조와 유사하게 설계하였으며, 정수처리장으로 유입되는 상수원수와 약품혼화 응집수, 침전수, 여과수, 처리수를 사용하였다. 평균 종속영양세균수는 $1.6{\times}10^4CFU/ml$, $5.8{\times}10^3CFU/ml$, $1.8{\times}10^3CFU/ml$, $1.3{\times}10^2CFU/ml$, 1 CFU/ml로 각 처리 과정을 거치면서 감소하였다. 스테인리스관과 동관에 형성된 생물막 세균수는 원수, 응집수, 침전수에서 2주만에 $2.9{\times}10^3CFU/cm^2$ 이상으로 증가하였고, 동관보다 스테인리스관에서 생물막 세균수가 높게 검출되었다. 여과수(평균 잔류염소 0.44 mg/L)에서는 두 관 재질에 따른 생물막 세균수의 명확한 차이는 없었으며, 5주 이후부터 두 관재질 모두 $18CFU/cm^2$ 이하의 생물막 세균이 검출되었다. 정수(평균 잔류염소 0.88 mg/L)에서는 두 관 재질 모두 생물막 세균이 검출되지 않았다. DGGE 분석결과, 원수, 응집수, 침전수에서 스테인리스관은 Sphingomonadaceae가 우점이였고, 동관에서는 Bradyrhizobiaceae와 함께 Sphingomonadaceae도 우점이였다. 여과수의경우, 5주차 이후 스테인리스관과 동관에 형성된 생물막에서 Propionibacterium sp., Sphingomonas sp., Escherichia sp. 등과 유사한 16S rRNA 유전자 서열을 가지는 밴드들이 검출되었다. 종 풍부도 및 다양성은 동관에 비해 스테인리스관이 더 높게 나타났다. Biofilm formed on stainless and copper in water treatment plant was investigated for sixteen weeks. Biofilm reactor was specially designed for this study. It was similar to that of a real distribution pipe. Raw water, coagulated, settled, filtered and treated water were used in this study. The average number of heterotrophic bacteria counts was $1.6{\times}10^4CFU/ml$, $5.8{\times}10^3CFU/ml$, $1.8{\times}10^3CFU/ml$, $1.3{\times}10^2CFU/ml$, 1 CFU/ml, respectively. Density of biofilm bacteria formed on stainless and copper pipes in raw, coagulated and settled water increased above $2.9{\times}10^3CFU/cm^2$ within second weeks while more biofilm bacteria counts were found on the stainless pipe than on the copper pipe. In case of filtered water (free residue chlorine 0.44 mg/L), there was no significant difference in the number of biofilm bacteria on both pipes and biofilm bacteria below $18CFU/cm^2$ were detected on both pipe materials after fifth weeks. Biofilm bacteria were not detected on both pipe materials in treated water (free residue chlorine 0.88 mg/L). According to the results of DGGE analysis, Sphingomonadacae was a dominant species of biofilm bacteria formed on the stainless pipe while the copper pipe had Bradyrhizobiaceae and Sphingomonadaceae as dominant bands. In case of filtered water, a few bands (similar to Propionibacterium sp., Sphingomonas sp., Escherichia sp., and etc.) that have 16S rRNA sequences were detected in biofilm bacteria formed on both pipes after fifth weeks. Stainless pipe had higher species richness and diversity than the copper pipe.
박과류 관련 종자전염 검역바이러스 3종의 PCR 진단시스템 개발
이시원 ( Si Won Lee ),민병대 ( Byung Dae Min ),이진영 ( Jin Young Lee ),신용길 ( Yong Gil Shin ),이수헌 ( Su Heon Lee ),정원화 ( Weon Hwa Jheong ) 한국미생물생명공학회(구 한국산업미생물학회) 2015 한국미생물·생명공학회지 Vol.43 No.1
박과는 스쿼시, 호박, 애호박, 조롱박, 오이 및 수박 등 100여 속이 넘는 속이 포함된 식물과이며, 종자의 수입량이 매우 많은 작물이다. 이들이 우리나라로 수입될 때, 규제바이러스인 Squash mosaic virus (SqMV), Cucumber green mottle mosaic virus (CGMMV) 및Kyuri green mottle mosaic virus (KGMMV)에 대하여 검역을 수행한다. 본 연구에서는 SqMV, CGMMV 및 KGMMV를 신속·높은 감도로 검출할 수 있는 특이적 RT-PCR 및 nested PCR 프라이머 조합과 유전자변형-양성대조구 플라스미드를 개발하였다. 또한 본 연구에서 개발한 진단시스템을 2010년부터 2014년 상반기까지 현장적용하여, SqMV 47건, CGMMV 67건 및 KGMMV 17건을 검출하였다. The Cucurbitaceae are a plant family that consist of over a hundred genera, the most important of which are squash, pumpkin, zucchini, some gourds, cucumber and watermelon. These are among the top imported seeds in Korea. At the time of their import, the Squash mosaic virus (SqMV), the Cucumber green mottle mosaic virus (CGMMV) and the Kyuri green mottle mosaic virus (KGMMV) are designated as regulated viruses for quarantine in Korea. This study was conducted to develop specific primer sets for easy and rapid detection of SqMV, CGMMV and KGMMV. RT-PCR with the nested PCR primer sets and modified positive control plasmids were capable of highly sensitive detection and verification of such viruses. In addition, developed diagnostic PCR systems applied to quarantine sites detected 47 cases of SqMV, 67 cases of CGMMV and 17 cases of KGMMV between 2010 and the first half of 2014.