Isolation and Characterization of hrp2+ Gene Related to SNF2 Family In Yeast

최인순,Choi In Soon Korean Society of Life Science 2005 생명과학회지 Vol.15 No.2

본 연구는 분열형 효모 Schizosaccharomyces pombe에서 여러 가지 DNA 절제회복 및 유전자 발현에 관여하는 SNF2/SW12유전자의 기능을 연구하기 위하여 이에 관련되는 유전자를 분리하고 그 특성을 연구하였다. SNF2 motif의 conserved sequence를 primer로 하여 중합효소 연쇄반응 (PCR) 방법으로 480 bp 크기의 DNA fragment를 분리하여, 이를 probe로 하여 효모에서 hrp2+ 유전자를 분리하였다. 분리한 hrp+ 유전자의 sequence homology를 비교한 결과 3개의 SNF2 motif를 포함하고 있었다. hrp2+ 유전자의 전사체 크기는 4.7kb임을 Northern hybridization으로 확인하였다. 분리한 유전자의 특성 연구를 위하여 Northern hybridization 으로 hrp2+ 유전자의 UV와 MMS에 대한 유도성을 조사한 결과 자외선에 대해서만 유전자의 발현이 유도되었다. 이 결과 분리한 hrp2+는 UV-inducible 유전자임을 확인하였다. 또한 분리한 유전자의 특성연구 중 하나로 hrp2+ 단백질을 분리하여 helicase activity를 측정하였다. 이 결과 분리한 hrp2+ 유전자는 전혀 helicase activity를 나타내지 않았다. The SNF2/SW12 family comprises proteins from a variety of species with in vivo functions, such as transcriptional regulation, maintenance of chromosome stability during mitosis, and various types of DNA repair. This study was shown the characterization of hrp2+ gene which was isolated by PCR amplification using the conserved domain of SNF2 motifs. Sequence analysis of hrp2+ gene showed striking evolutionary conservation among the SNF2 family of proteins. The transcript of hrp2+ gene was found to be a 4.7 kb as identified by Northern hybridization. To investigate the inducibility of hrp2+ gene, transcript levels were examined after treating the cells to various DNA damaging agents. The transcripts of hrp2+ were induced by UV-irradiation. But the transcripts were not induced by treatment of $ 0.25\%$ Methylmethane sulfonate (MMS). These results implied that the effects of damaging agents are complex and different regulatory pathways exist for the induction of this gene. Hrp2 protein was purified near homogeneity by combination of affinity chromatography. We tested the purified Hrp2 protein for the helicase activity in an oligonucleotide release assay. However we were unable to detect any helicase activity associated with the Hrp2 protein, indicating that the helicase motifs in Hrp2 are merely indicators of a broader DNA-dependent ATPase activity.

논문편 : 노년 여성의 연령집단별 동체부 형태 분석

최인순,남윤자 ( In Soon Choi,Yun Ja Nam ) 대한가정학회 1995 Family and Environment Research Vol.33 No.6

Characterization of RAD3 Homologous Gene from Coprinus cinereus

최인순,Choi In Soon Korean Society of Life Science 2004 생명과학회지 Vol.14 No.6

The RAD3 gene of Saccharomyces cerevisiae is essential for the incision step of UV-induced excision repair. An yeast RAD3 gene has been previously isolated by functional complementation. In order to identify the RAD3 homologous gene from fungus Coprinus cinereus, we have constructed cosmid libraries from electrophoretically separated chromosomes of the C. cinereus. The 13 C. cinereus chromosomes were resolved by pulse-field gel electrophoresis, hybridized with S. cerevisiae RAD3 DNA, and then isolated RAD3 homologous DNA from C. cinereus chromosome. The RAD3 homolog DNA was contained in 3.2 kb DNA fragment. Here, we report the results of characterization of a fungus C. cinereus homolog to the yeast RAD3 gene. Southern blot analysis confirmed that the C. cinereus chromosome contains the RAD3 homolog gene and this gene exists as a single copy in C. cinereus genome. When total RNA isolated from the C. cinereus cells were hybridized with the 3.4 kb PvuII DNA fragment of the S. cerevisiae RAD3 gene, transcripts size of 2.8 kb were detected. In order to investigate whether the increase of the amount of transcripts by DNA damaging agent, transcript levels were examined after treating agents to the cells. The level of transcripts were not increased by untraviolet light (UV). This result indicated that the RAD3 homologous gene is not UV inducible gene. Gene deletion experiments indicate that the HRD3 gene is essential for viability of the cells and DNA repair function. These observations suggest an evolutionary conservation of other protein components with which HRD3 interacts in mediating its DNA repair and viability functions. 본 연구는 출아형 효모 Saccharomyces cerevisiae에서 자외선의 상해 시 이를 정상으로 회복시키는 절제회복(excision repair) 유전자로 알려진 RADS의 특성 규명을 위하여 균류 Coprinus cinereus에서 이와 유사한 유전자를 분리하였다. RADS 유사 유전자를 분리하기 위하여 균류 C. cinereus의 염색체 DNA를 전기영동하여 분리한 다음 효모 RADS DNA를 probe로 하여 이와 hybridization하였다. 이 결과 RADS유사 유전자는 3.4kb의 insert DNA를 갖고 있었다. 또한 Southern hybridization으로 이 유사 유전자는 fungus C. cinereus의 염색체에 존재함을 확인하였다. 분리한 RADS 유사 유전자의 전사체 크기는 2.8kb 였으며, 자외선의 상해시 전혀 자외선에 대한 유도성이 없음을 Northern hybridization으로 확인하였다. 또한 유사유전자 부분을 삭제하였을 때 이 부분이 없는 세포는 전혀 생존을 못하였다. 이 결과 분리한 RADS 유사유전자는 세포의 생존에 필수적인 유전자임을 알 수 있었다.

시판 미역의 영양성분 및 생리활성 분석

최재석(Jae-Suk Choi),배희정(Hee-Jung Bae),김양춘(Yang Chun Kim),박남희(Nam-Hee Park),김태봉(Tae Bong Kim),최영주(Young Ju Choi),최은영(Eun Young Choi),박선미(Sun Mee Park),최인순(In Soon Choi) 한국생명과학회 2008 생명과학회지 Vol.18 No.3

시판되는 기장산, 진도산 및 완도산 미역 완제품(가닥미역과 실미역)의 일반성분, 미량금속, 유리아미노산 함량, 알긴산 함량, 항산화 효과와 항염증 효과를 조사하여 산지별 미역의 생리활성을 비교, 분석하였다. 수분, 조지방, 조단백질, 탄수화물의 함량과 칼로리에서 큰 차이가 없었으나, 회분의 경우, 기장산 실미역은 32.5%, 완도산 실미역은 26.6%로 나타나 기장산 실미역이 다소 높은 함량을 보였다. 조지방의 경우, 기장산 가닥미역은 0.53%, 진도산 가닥미역은 1.47%로 나타나 진도산 가닥미역의 조지방 함량이 다소 높은 것으로 나타났다. 가닥미역의 주요 유리아미노산은 hydroxyproline, alanine, glutamic acid, proline 그리고 asparagine이었으며, 실미역은 유리아미노산 함량이 현저히 낮아 미역 가공 공정에 따라서 많은 유리아미노산이 소실되는 것으로 나타났다. 4종류의 주요금속원소(Na, K, Ca, Mg)과 3종류의 미량금속원소(Fe, Zn, P)의 농도를 비교한 결과, Ca, Fe, Zn, Mg 그리고 P의 함량은 기장산 가닥미역과 실미역에 비해 완도산 가닥미역과 실미역의 함량이 높은 것으로 나타났다. 알긴산의 함량은 가닥미역의 경우 제품별 유의한 차이가 없었으며, 실미역의 경우 완도산 실미역(26.0%)이 기장산 실미역(21.0%)에 비해 다소 높은 값을 나타내었다. DPPH 라디칼 소거능을 기장 및 진도산 가닥미역의 메탄올 추출물 40 ㎍/ml 농도에서 측정한 결과, 각각 45.5% 및 33.5%로 기장산 가닥미역에서 라디칼 소거능이 높게 나타났으며, 기장 및 완도산 실미역의 경우 각각 37.0%와 27.0%로 기장산 실미역의 라디칼 소거효과가 높은 것으로 분석되었다. SOD 유사활성을 측정 결과, 추출물 농도가 증가할수록 항산화 효과가 증가하였고, 기장 및 진도산 가닥미역의 메탄올 추출물(10 ㎎/ml)의 SOD 유사활성은 각각 66.1%와 72.5%였으며, 기장 및 완도산 실미역의 메탄올 추출물(10㎎/ml)의 SODA 유사활성은 각각 63.0% 및 71.4%로 분석되었다. LPS에 의하여 유도된 NO 합성은 미역의 methanol 추출물을 200 ㎍/ml농도로 처리하였을 때, 기장 및 완도산 실미역의 NO 활성은 각각 44.2%와 35.7%로 나타났으며 가닥미역의 경우는 기장 및 진도산이 각각 40.7%와 28.6%로 나타나 산지에 따른 차이를 보였다. 특히 가공과정에 따라 생리활성 성분이 소실되는 것으로 나타났다. This research was performed to determine the proximate compositions, mineral contents, alginic acid, antioxidative activities and amino acids of sea mustards (Miyeok: Undaria pinnatifida) collected from Gijang and Wando area. Ash content was higher in Gijang samples, whereas carbohydrate and moisture were higher in Wando Sil Miyeok. General compositions of dried sea mustard showed different contents as manufacture's company and places. The major free amino acids were hydroxyproline, alanine, glutamic acid and asparagine in Gijang samples. Both Gijang and Wando Sil Miyeok showed lower contents comparing with Gijang Gadak Miyeok. Major mineral content was Na, K, Ca, Mg and P, and especially, Na and K were the most abundant in both Gijang and Wando sea mustards. Alginic acid content was almost similar in both sea mustards. Antioxidative activity of methanol extract of sea mustards was measured by using DPPH radical scavenging and SOD-like activity. DPPH radical scavenging activity was 45.5% (40 ㎍/ml) in Gijang Gadak Miyeok and 37.0% and 26.0% (40 ㎍/ml) in Gijang and Wando Sil Miyok, respectively. SOD-like activity of Gijang and Wando Sil Miyok was 63% and 71% (10 ㎍/ml), respectively. These results show that biological activities depend on Miyeok manufacture's process. When stimulated macrophages RAW264.7 cells with lipopolysaccharide (LPS), inhibition of NO production in Gijang Sil Miyeok (44.2%) was 9% high comparing with that of Wando Sil Miyeok (35.7%).

임상연구 목적에 따른 임상연구 설계 방법

최인순 ( In Sun Choi ) 대한간학회 2021 임상연구방법론워크숍 Vol.2021 No.2

효모에서 절제회복에 관여하는 HRD3 유전자 과 발현이 숙주세포에 미치는 영향

최인순(In Soon Choi) 환경독성보건학회 2003 환경독성보건학회지 Vol.18 No.4

출아형 효모 Saccharomyces cerevisiae RAD3 유전자는 절제회복 및 세포의 생존에 필수적이며, DNA dependent ATPase와 DNA-RNA helicase활성을 가지고 있는 것으로 알려져 있다. 본 연구는 분열형 효모 Schizisaccharomyces pombe에서 절제회복과 세포의 생존에 필수적인 출아형 효모 RAD3유전자와 유사한 유전자를 S.pombe genomic DNA library에서 분리하여 그 특성을 연구하였다. 분리한 RAD3 유사유전자를 HRD3 유전자라 명명하였다. 발현 vetor pET3a를 이용하여 분리한 HRD3 유전자를 과 발현 하였을 때, HRD3단백질은 숙주단백질의 합성 억제 또는 분해 촉진을 유발하여 숙주세포인 대장균에 독성효과를 나타냄이 관찰되었다. HRD3유전자와 lacZ 유전자를 융합시킨 여러 가지 재조합 vector를 만들어이들 융합단백질을 분리하였다. 이 결과 HRD3단백질의 카르복실 말단 부위가 DNA회복기능과 대장균에서의 독성효과를 나타내는 중요한 부위로 생각된다.

의상 이미지의 응용 기호론적 연구 (Ⅰ)

최인순(In Soon Choi) 한국복식학회 1998 服飾 Vol.38 No.-

The purpose of this study is to define the fundamentals of one symbolic concept, so calles vestment-sign, based on the logical relationship of sign system about the trichotomy by Charles S. Peirce`s sign concept for the communication system of meaning in the nonlinguistic image domain. To prove the argument of vestment-sign, I selected 3 types of vestment language by styliste, Elsa Schiaparelli. The third image vestmental chosen here, titled Larme-Illusion(1938). printed by Salvador Dali will produce one symbolic proposition as a logical result which is generated and developed through the interpretation of other images. First of all the text, which is manifested by Elsa Schiaparelli`s first image vestmental, titled Notation Musical(1937) and is symbolized as one category in the representation of the form, is regarded symbolic and metaphorical from a standpoint that the title and the meaning is connected to the form. The second image vestment, titled Ruches Noirs(1938) represents externally splendid feminity manifested by the symbolic and metaphorical expression. And the purity of sensitivity aiming to humanity in the detail of the poetic feeling of naturalism makes us imagine the battle fild of furious sensitivity. Like as the result of the battle, the third image stimulated our eyesight with the absence of dressing function. The proposition of the text, <Death> which the third image delivers, constructs sign system to bring up a meaning with the disappearance of physical signifier. This establishment of the symbolic concept presents the etymological authority of symbol generation called Design.

프래너리 오코너의 악마 : 『선한 사람은 찾기 어렵다』를 중심으로

최인순(Choi, In-Soon) 신영어영문학회 2013 신영어영문학 Vol.56 No.-

As the title suggests, Flannery O’Connor’s modern landscape is “a territory held largely by the devil,” in which a good man is hard to find. O’Connor’s devil is not simply a psychological tendency or a vehicle for her satire for “our godless actuality”; He is to be “recognized as existing in himself and as a dramatic necessity for the writer.” The devil exists at the center of O’Connor’s literary imagination, which is located squarely in her Catholic faith. The ego-bloated, self-intoxicated characters are the surest candidates to fall victim to the devil. The fatal encounter between the devil and the main characters is at the core of the O’Connor narrative. The devil plays the role of a spiritual catalyst by ripping apart their outward facade and delivering a harsh lesson leading them to painful self-knowledge, which is the prologue of grace. The paper keeps track of the process of the devil’s working as “the unwilling instrument of grace” through “piercing pretensions” of the intruded.

향기흡입법이 복부수술 환자의 수술 전 불안 감소에 미치는 효과

최인순(Choi In Sun),이명선(Lee Myung Sun),류언나(Ryoo Eon-Na),박경숙(Park Kyung Sook) 한국성인간호학회 2008 성인간호학회지 Vol.20 No.2

Characterization of hrp2+ Gene Related to SNF2 Family in Schizosaccharomyces pombe

최인순(In Soon Choi) 한국환경성돌연변이발암원학회 2002 한국환경성돌연변이·발암원학회지 Vol.22 No.3

본 연구는 분열형 효모 Schizosaccharomyces pombe에서 여러 가지 DNA 절제회복 및 유전자 발현에 관여하는 SNF2/SW12 유전자의 기능을 연구하기 위하여 이에 관련되는 유전자를 분리하고 그 특성을 연구하였다. SNF2 motif의 conserved sequence를 primer로 하여 중합효소 연쇄반응(PCR) 방법으로 480 bp 크기의 DNA fragment를 분리하여, 이를 probe로 하여 효모에서 hrp2+ 유전자를 분리하였다. 분리한 hrp2+ 유전자의 sequence homology를 비교한 결과 3개의 SNF2 motif를 포함하고 있었다. hrp2+ 유전자의 전사체 크기는 4.7 kb임을 Northern hybridization으로 확인하였다. hrp2+ 유전자의 전사 개시 부위를 알기 위하여 primer extension 분석을 한 결과, 첫 번째 ATG에서 약 47 base pair 위쪽에 위치함을 확인하였다. 토한 특성 연구를 위하여 Northern hybridization으로 hrp2+ 유전자의 UV와 MMS에 대한 유도성을 조사한 결과 자외선에 대해서만 유전자의 발현이 유도되었다. 이 결과 분리한 hrp2+는 UV-inducible 유전자임을 확인하였다. The SNF2/SW12 family comprises proteins from a variety of species with in vivo functions, such as transcriptional regulation, maintenance of chromosome stability during mitosis, and various types of DNA repair. This study was shown the characterization of hrp2+ gene which was isolated by PCR amplification using the conserved domain of SNF2 motifs. Sequence analysis of hrp2+ gene showed striking evolutionary conservation among the SNF2 family of proteins. The transcript of hrp2+ gene was found to be a 4.7 kb as identified by Northern hybridization. In addition, to determine the transcription initiation site of hrp2+ gene, primer extension analysis was performed. This result showed the band of 64 bp. The<br/> transcriptional start point was mapped to a position of 47 base pair from the first ATG codon of translational initiation codon. In order to investigate the inducibility of hrp2+ gene, transcript levels were examined after treating the cells to various DNA damaging agents. The transcripts of hrp2+ were induced by<br/> UV-irradiation. But the transcripts were not induced by treatment of 0.25% Methylmethane sulfonate (MMS). These results implied that the effects of damaging agents are complex and different regulatory<br/> pathways exist for the induction of this gene.