흰쥐 뇌에서 발현되는 16 kDa Vacuolar (H⁺)-ATPase의 유전자 클로닝

신송우(Song-Woo Shin),유민(Min Yoo) 대한의생명과학회 2000 Biomedical Science Letters Vol.6 No.3

Vacuolar (H?)-ATPase (V-ATPase)는 multi-subunit로 구성된 단백질로서, proton pumping을 통해 세포내 산성화반응에 관여를 한다. 최근에 이 단백질이 synaptic vesicle에서도 발견된 것으로 보아 뇌 신경전달에 중요한 역할을 수행할 것으로 추정하고 있다. 우리는 흰쥐 뇌에서 분리한 mRNA를 주형으로 한 PCR 반응에서 16 kDa subunit의 V-ATPase cDNA를 클로닝할 수 있었고, 이의 염기서열 또한 결정하였다. 분리된 뇌 16 kDa V-ATPase의 coding sequence는 전체 468 bp로서 간에서 보고되었던 것과 동일한 크기였다. 단지 3’ 말단의 염기 하나가 A에서 C로 바뀌어 있었는데 모두 alanine (GCA, GCC)을 지정하기 때문에 단백질의 일치구조에는 변화가 없는 것으로 확인되었다. 한편 rat brain cDNA library에서도 동일한 clone이 분리되었는데 역시 같은 부분에서 polymorphism이 발견되었고, RNA splicing 등 더 이상의 조직특이적 변화는 없었다. 본 연구는 16 kDa V-ATPase의 뇌에서의 기능과 신경말단에서의 neurotransmission 및 synaptic vesicle의 재순환 기전을 이해하는데 유용한 정보가 될 것이다. Vacuolar (H?)-ATPase (V-ATPase) is an intracellular protein which consists of multiple subunits. It carries out acidification by pumping protons in the cell. This enzyme has also been found in the synaptic vesicles and may play an important role in the neurotransmission. We cloned cDNA fragments encoding the 16 kDa subunit of V-ATPase from the rat brain by RT-PCR and PCR using total RNA or recombinant phage DNA as templates. They contained the full coding sequences (468 bp) and one nucleotide at 3' region turned out to be different (A to C) when compared to the liver counterpart. However, this polymorphic difference did not cause any significant change in the primary structure of the protein because both GCA and GCC code for alanine. Our study would contribute to the understanding of the function of 16 kDa V-ATPase in the brain and of the mechanisms of neurotransmission.

쥐 뇌에서 발현되는 S-100 Beta 유전자의 Polymorphism에 대한 분자생물학적 증거

신송우(Song-Woo Shin),권오식(Oh-Sik Kwon),유민(Min Yoo) 대한의생명과학회 1998 Biomedical Science Letters Vol.4 No.2

쥐 뇌에서 발현되는 S-100 beta 유전자의 다형현상을 조사하였다. Polymerase chain reaction을 위한 주형으로는 뇌에서 분리한 mRNA를 직접 역전사한 cDNA, 또는 rat brain cDNA library에서 분리한 phage DNA를 사용하였다. 증폭된 DNA 절편들은 크기가 기존에 보고되었던 것과 일치하였으나 DNA sequencing을 통한 세부적인 분석 결과 coding region 내에 염기변화 (CAT가 CAC로 변함)가 있음이 확인되었다. 그러나 이들은 모두 histidine을 결정하는 유전암호이기에 단백질의 1차구조에는 아무런 영향을 미치지 않는 다형현상으로 결론지어졌다. 본 연구는 S-100 beta 단백질에 그동안 알려지지 않았던 다형현상이 존재함을 시사하는 것으로서 S-100 beta 효소 유전자의 전체적인 구조를 이해하기 위한 학문적 자료가 될 것으로 기대된다. We examined mRNAs, isolated from the rat brain, to ascertain if there is any polymorphism for S-100 beta protein gene. As templates for polymerase chain reaction (PCR) the reverse-transcribed cDNA from the rat brain or phage DNAs isolated from the rat brain cDNA libraries were used. Although PCR products turned out to be exactly same as the expected size based on the previously reported mRNA sequence a single base substitution (CAT to CAC) was identified at nucleotide level. This change was considered as polymorphism since it did not cause any change of the primary structure for S-100 beta protein. This result should facilitate the understanding of the overall structure of the gene for S-100 beta protein.

사람의 게놈에 존재하는 Cytochrome P450 2E1의 Retropseudogene에 대한 분자유전학적 증거

유민(Min Yoo),신송우(Song-Woo Shin) 대한의생명과학회 1998 Biomedical Science Letters Vol.4 No.2

Cytochrome P450 2E1 (CYP2E1)의 retropseudogene이 사람에 존재하는 지 확인하기 위해 혈액에서 분리한 DNA를 주형으로 한 polymerase chain reaction (PCR)을 수행하였다. Primer는 CYP2E1 유전자를 기초하여 여러개 제작하되 적절한 조합에 따라 정상유전자와 retropseudogene이 동시에 증폭될 수 있도록 고안하였다. 본 실험의 결과 그동안 예상은 되었지만 DNA 차원에서 미처 확인되지 못하였던 CYP2E1의 retropseudogene을 직접 증폭해낼 수 있었다. 세부 구조는 Southern blotting과 DNA 염기서열 결정에서 최종 분석되었다. PCR 반응으로 증폭된 부분에서는 염기서열이 mRNA와 완전히 일치하고 있는 점으로 미루어서 CYP2E1의 retropseudogene은 비교적 최근에 발생했을 것으로 추정되었다. We have carried out polymerase chain reaction (PCR) to investigate if retropseudogene for CYP2E1 is present in human genome. PCR primers were designed based on the structure of functional CYP2E1 gene and used to amplify both functional gene and retropseudogene in one reaction. From the repeated experiments we were able to amplify a previously unidentified CYP2E1 retropseudogene that was present in human genome. Its detailed structure was confirmed by Southern blotting and DNA sequencing. Nucleotide sequence of this retropseudogene was completely matched up to human liver CYP2E1 mRNA suggesting that the development of this retropseudogene might be a relatively recent event.

중학생의 비만율 변화 및 대사증후군 발생 위험요소와의 상관관계

최순호(Choi, Soon-Ho),신송우(Shin, Song-Woo),유철인(Yoo, Cheol-In) 한국산학기술학회 2012 한국산학기술학회논문지 Vol.13 No.11

본 연구는 최근 울산 지역 중학생의 비만율 변화와 대사증후군 발생위험 요소들의 상관관계를 파악하여 학 교건강증진사업의 기초자료를 제공하기 위하여 수행되었다. 연구를 위하여 2007년부터 2011년까지 ‘인구보건복지협 회 울산지회’에서 실시한 울산시 관내 중학교 2학년생에 대한 건강검진에 참여한 58,298명의 자료를 수집 분석하였 다. 울산지역 중학교 2학년생의 비만율의 변화는 조사 대상 전체와 여학생에 있어서는 2007년부터 2010년까지 줄고 있다가 2011년 다시 증가하였다. 남학생은 2008년에 비만율이 가장 높았고 2010년에 가장 낮았다. 모든 연도에서 남 학생에서 여학생보다 과체중과 비만 유병률이 모두 통계적으로 유의하게 높았다. 혈압 항목을 제외한 4개 항목 만으 로서의 판정에서 전체 학생의 대사증후군 유병률은 0.58%였으며 저체중군은 0%, 정상군은 0.01%, 과체중군은 0.31%, 비만군에서는 4.53%로 비만도가 증가할수록 대사증후군 유병률은 급격히 증가하였다. 전체 학생 중 대사증후 군 진단항목별 유병률은 고중성지방혈증이 36.58%로 가장 높았고 다음이 저HDL 6.47%, 복부비만 3.72%, 고혈당 0.47% 순으로 나타났다. 비만군의 경우 대사증후군 진단항목 모두에 있어 타군에 비해 통계적으로 유의하게 높았다 (P<0.05). 본 연구에서 나타난 2007년부터의 비만율의 감소추세를 이어가기 위해서는 학교에서 학생들을 대상으로 보다 다 양한 비만예방 프로그램을 개발하여 지속적으로 실시해 나가는 것이 필요하다고 생각된다. 2011년의 비만도 증가에 대한 추가적인 원인 분석이 이루어진다면 보다 체계적인 학교보건정책 수립에 도움이 될 것이다. The purpose of this study was to provide fundamental materials for improving school health promotion programs by investigating the relationships between the change in obesity rate and risk factors of metabolic syndrome among middle school students in Ulsan. We analyzed the routine health check-up data in 58,298 2nd-year middle school students in Ulsan, which conducted by the Planned Population Federation of Korea from 2007 to 2011. The overall and girls obesity rates gradually decreased throughout the first four years but increased again in 2011. The boys obesity rates were highest in 2008 and lowest in 2010. Throughout the research years, the incidence rates of over-weight and obesity were statistically significantly higher in boys compared to girls(P<0.05). Prevalence rates of the metabolic syndrome, assessed with the modified Cook criteria except high blood pressure, were 0.58%, 0%, 0.01%, 0.31% and 4.53%, respectively in total, low, normal, over-weight, and obese groups. It indicates that the prevalence of metabolic syndrome is increasing and directly related to the obesity rate among adolescents. Hypertriglyceridemia was the most common component (36.58%) of the metabolic syndrome among the middles school students followed by low HDL cholesterol (6.47%), abdominal obesity (3.72%), and high blood sugar (0.47%). Prevalence of the various components of the metabolic syndrome were significantly higher in the obese group compared to other groups. In this study we observed the decrease in obesity rates between 2007 and 2010, and developing obesity prevention programs is essential in order to maintain the trend. Additional study should be necessary to find the cause of increase of obesity rate in 2011 and so to create more effective school health promotion programmes.

Rickettsia typhi 종특이항원의 특성

우수동(Soo-Dong Woo),윤창순(Chang-Soon Yoon),이진상(Jin-Sang Lee),장인애(In-Ae Chang),김영진(Young-Jin Kim),신송우(Song-Woo Shin),전현진(Hyun-Jin Jeon),조민기(Min-Kee Cho),김윤원(Yoon-Won Kim) 대한미생물학회 2002 Journal of Bacteriology and Virology Vol.32 No.3

젊은 한국 여성의 시상면상 골반 형태에 대한 방사선학적 계측

김원중(Won Joong Kim),이상호(Sang-Ho Lee),민상혁(Sang-Hyuk Min),최병관(Byung Kwan Choi),이은숙(Eun-Suk Lee),신송우(Song-Woo Shin) 대한정형외과학회 2005 대한정형외과학회지 Vol.40 No.1

목적: 척추의 시상면상 균형과 밀접한 관계가 있는 골반의 형태 요소 중 가장 많이 사용되는 pelvic lordosis angle (PRS1)과 pelvic angle of incidence (AQI)를 측정하여 한국 여자 성인에서의 평균치와 평균적인 범위를 설정하는 것이었다. 대상 및 방법: 후향적 탐색을 통하여 2002년 1월 1일부터 12월 31일까지 본원에 내원하였던 20대와 30대의 발병 2주 미만의 급성 요부 염좌 환자들을 골라 전화 문진을 실시하였다. 문진상 당해 급성 염좌가 단발성이었고 완전히 회복되어 정상 적인 일상생활로 복귀한 경우에 한하여 기립 측면 방사선 디지털 영상 사진 상에서 PRS1과 AOI를 계측하였다. 환자들의 병록번호순으로 측정을 시행하여 20대와 30대의 수가 각각 40명이 되도록 하였다. 결과: 두 각도 모두 연령간의 차이는 없었다. 평균 PRS1은 38.7±8.3° (range: 13.6-52.9° 였으며 평균 AOI는 48.5±9.4° (range: 30.5-74.7°)였다. PRS1과 AOI 사이에는 밀접한 상관관계가 있었으며(상관계수, r=-0.965), PRS1=79.909-0.850×AOI, AOI=90.902-1.096×PRS1 (linear regression analysis, p=0.000, R²=0.931) 의 관계가 있었다. 결론: 본 연구의 결과는 향후 한국인의 시상 만곡과 척추골반 균형의 연구와 수술적 복원에 대한 연구의 기초자료로 사용될 수 있을 것으로 생각된다. Purpose: To determine the normative data for the pelvic morphology parameters in the young Korean female population. Materials and Methods: Young Korean female patients in 20s and 30s who had visited the outpatient clinic for a first attack acute sprain underwent a telephone interview at a minimum of 1 year after their last hospital visit. Those who had recovered completely and had no back-related complaints were selected for the pelvic lordosis angle (PRS1) and pelvic angle of incidence (AOI) measurements (n=40 each age group). Results: There was no age difference in both parameters. The PRS1 in the young female population was 38.7±8.3° (range: 13.6-52.9°) and the AOI was 48.5±9.4° (range: 30.5-74.7°), which shows a close correlation between the two parameters (correlation coefficient, r=-0.965). The linear regression equation obtained is as follow; Equation I: PRS1=79.909-0.850×AOI, Equation Ⅱ: AOI=90.902-1.096×PRS1 (linear regression analysis, p=0.000, R²=0.931). Conclusion: The data obtained from the study may be used for future studies related to the sagittal spinopelvic balance.

흰쥐 뇌에서 발현되는 16kDa Vacuolar(H^+)-ATPase의 유전자 클로닝

신송우,유민 대한의생명과학회 2000 Journal of biomedical laboratory sciences Vol.6 No.3

Yacuolar (H+)- ATPase (V-ATDase)는 multi-subunit로 구성된 단백질로서, proton pumping을 통해 세포내 산성화반응에 관여를 한다. 최근에 이 단백질이 synaptic vesicle에서도 발견된 것으로 보아 뇌 신경전달에 중요한 역할을 수행할 것으로 추정하고 있다. 우리는 흰쥐 뇌에서 분리한 mRNA를 주형으로 한 PCR 반응에서 16 kDa subunit의 V-ATPase cDNA를 클로닝할 수 있었고, 이의 염기서열 또한 결정하였다. 분리된 뇌 16 kDa V-ATPase의 coding seqence는 전체 468 bp로서 간에서 보고되었던 것과 동일한 크기였다. 단지 3' 말단의 염기 하나가 A에서 C로 바뀌어 있었는데 모두 alanine (GCA, GCC)을 지정하기 때문에 단백질의 일차구조에는 변화가 없는 것으로 확인되었다. 한편 rat brain cDNA library 에서도 동일한 clone이 분리되었는데 역시 같은 부분에서 polymorphism이 발견되었고, RNA splicing 등 더 이상의 조직특이적 변화는 없었다. 본 연구는 16 kDa V-ATPase의 뇌에서의 기능과 신경말단에서의 neurotransmission 및 synaptic vesicle의 재순환 기전을 이해하는데 유용한 정보가 될 것이다. Vacuolar (H+)-ATpase (V-ATPase) is an intracellular protein which consists of multiple subunits. It carries out acidificatioon by pumping protons in the cell. This enzyme has also been found in the synaptic vesicles and may play an important role in the neurotransmission. We cloned cDNA figments encoding the 16 kDa subunit of V-ATPase from the rat brain by RT-PCR and PCR using total RNA or recombinant phage DNA as templates. They contained the full coding sequences (468 bp) and one nucleotide at 3' region turned out to be different (A to C) when compared to the liver counterpart. However, this polymorphic difference did not cause any significant change in the primary structure of the protein because both GCA and GCC code for alanine. Our study would contribute to the understanding of the function of 16 kDa V-ATPase in the brain and of the mechanisms of neuro transmission.

만성퇴행성 신경질환과 Apoptosis

유민,정영주,박영춘,신송우 啓明大學校 醫科大學 1996 계명의대학술지 Vol.15 No.4

쥐 뇌에서 발현되는 S-100 Beta 유전자의 Polymorphism에 대한 분자생물학적 증거

유민,권오식,신송우 THE KOREAN SOCIETY FOR BIOMEDICAL LABORATORY SCIEN 1998 Journal of biomedical laboratory sciences Vol.4 No.2

쥐 뇌에서 발현되는 S-100 beta 유전자의 다형현상을 조사하였다. Polymerase chain reaction을 위한 주형으로는 뇌에서 분리한 mRNA를 직접 역전사한 cDNA, 또는 rat brain cDNA library에서 분리한 phage DNA를 사용하였다. 증폭된 DNA 절편들은 크기가 기존에 보고되었던 것과 일치하였으나 DNA sequencing을 통한 세부적인 분석 결과 coding region 내에 염기변화 (CAT가 CAC로 변함)가 있음이 확인되었다. 그러나 이들은 모두 histidine을 결정하는 유전암호이기에 단백질의 1차 구조에는 아무런 영향을 미치지 않는 다형현상으로 결론지어졌다. 본 연구는 S-100 beta 단백질에 그 동안 알려지지 않았던 다형현상이 존재함을 시사하는 것으로서 S-100 beta효소 유전자의 전체적인 구조를 이해하기 위한 학문적 자료가 될 것으로 기대된다. We examined mRNAs, isolated from the rat brain, to ascertain if there is any polymorphism for S-100 beta protein gene. As templates for polymerase chain reaction (PCR) the reverse-transcribed cDNA from the rat brain or phage DNAs isolated from the rat brain cDNA libraries were used. Although PCR products turned out to be exactly same as the expected size based on the previously reported mRNA sequence a single base substitution (CAT to CAC) was identified at nucleotide level. This change was considered as polymorphism since it did not cause any change of the primary structure for S-100 beta protein. This result should facilitate the understanding of the overall structure of the gene for S-100 beta protein.

사람의 게놈에 존재하는 Cytochrome P450 2E1의 Retropseudogene에 대한 분자유전학적 증거

유민,신송우 THE KOREAN SOCIETY FOR BIOMEDICAL LABORATORY SCIEN 1998 Journal of biomedical laboratory sciences Vol.4 No.2

Cytochrome P450 2E1 (CYP2E1)의 retropseudogene이 사람에 존재하는 지 확인하기 위해 혈액에서 분리한 DNA를 주형으로 한 polymerase chain reaction (PCR)을 수행하였다. Primer는 CYP2E1 유전자를 기초하여 여러개 제작하되 적절한 조합에 따라 정상유전자와 retropseudogene이 동시에 증폭될 수 있도록 고안하였다. 본 실험의 결과 그 동안 예상은 되었지만 DNA차원에서 미처 확인되지 못하였던 CYP2E1의 retropseudogene을 직접 증폭해낼 수 있었다. 세부 구조는 Southern blotting과 DNA 염기서열 결정에서 최종 분석되었다. PCR 반응으로 증폭된 부분에서는 염기서열이 mRNA와 완전히 일치하고 있는 점으로 미루어서 CYP2E1의 retropseudogene은 비교적 최근에 발생했을 것으로 추정되었다. We have carried out polymerase chain reaction (PCR) to investigate if retropseudogene for CYP2E1 is present in human genome. PCR primers were designed based on the structure of functional CYP2E1 gene and used to amplify both functional gene and retropseudogene in one reaction. From the repeated experiments we were able to amplify a previously unidentified CYP2E1 retropseudogene that was present in human genome. Its detailed structure was confirmed by Southern blotting and DNA sequencing. Nucleotide sequence of this retropseudogene was completely matched up to human liver CYP2E1 mRNA suggesting that the development of this retropseudogene might be a relatively recent event.