보문 : 느타리 버섯에서 원형 품종 특이 SCAR marker 개발

서경인 ( Kyoung In Seo ),장갑열 ( Kab Yeul Jang ),유영복 ( Young Bok Yoo ),박순영 ( Soon Young Park ),김광호 ( Kwang Ho Kim ),공원식 ( Won Sik Kong ) 한국균학회 2011 韓國菌學會誌 Vol.39 No.1

Weonhyeong is one of important commercial strains. It has good characteristics of bundle formation, grey colored pilei and high productivity. We previously reported grouping of 70 strains of Pleurotus ostreatus in which one group contained 35 strains including Weonhyeong. Four strains in that group showed same profiles implicating no variety distinction for mushroom cultivation. Now we developed a specific marker for identification of Weonhyeong. Sequence Characterized Amplified Region (SCAR) marker was developed from the RAPD amplicon. SCAR marker ``S-OPO5`` produced only one band specific to 2183, 2240, 2595 and 2725 strains showing similar banding patterns to Weonhyeong in RAPD-PCR results. The sequence of ``S-OPO5`` marker was unknown when compared with the data in the Genbank using BLASTN. BLASTX results indicated that the marker showed significant alignment with the protein sequences in Tricholoma bakamatsutake reverse transcriptase. The results indicate that this new SCAR marker (``S-OPO5``) will be valuable to distinguish the Weonhyeong similar strains from Pleurotus spp.

AFLP 분석 및 체세포 불화합성에 의한 느타리 유사품종의 확인

서경인 ( Kyoung In Seo ),유영복 ( Young Bok Yoo ),장갑열 ( Kab Yeul Jang ),신평균 ( Pyung Gyun Shin ),오연이 ( Youn Lee Oh ),김광호 ( Kwang Ho Kim ),공원식 ( Won Sik Kong ) 한국균학회 2013 韓國菌學會誌 Vol.41 No.1

We already reported four groups which contains some similar strains based on URP-PCR in the previous paper. The objective of this study was to confirm those strains by the amplified fragment length polymorphism (AFLP) and vegetative compatibility group (VCG). AFLP analysis showed no difference among these strains except ASI 2595 and 2183 in Weonhyeong group and ASI 2829 in Suhan group. They showed specific DNA bands only in the result of P + AG/M + AAG and P + GT/ M + ATG primer combinations out of eight different combinations. The AFLP primers produced a total of 330 fragments between 80 and 1000 bp in length for 31 Pleurotus ostreatus strains. At a genetic similarity of 0.96, the UPGMA analysis separated the isolates into four distinct clusters. Each group was classified by similar strains. Confrontation test by vegetative compatibility groups (VCGs) also showed distinct line between strains from different groups, but no line between similar strains within the cluster. Our results indicate that most of similar strains was not distinctness. Thus, similar strains are considered to be very close on the genealogy of their parent or same strain with different name.

배양 양성 감염각막염의 임상양상 및 항생제감수성 변화: 10년간의 국내 다기관 연구

유인천(In-Cheon You),이상범(Sang-Bumm Lee),서경률(Kyoung Yul Seo),김미금(Mee Kum Kim),윤경철(Kyung-Chul Yoon),고재웅(Jae Wong Koh),이지은(Ji Eun Lee),김성재(Seong-Jae Kim),KOAIDS 대한안과학회 2021 대한안과학회지 Vol.62 No.4

목적: 최근 10년간 감염각막염 중 배양검사상 균주가 확인된 환자에 대하여 여러 임상양상에 대해 알아보고자 한다. 대상과 방법: 2008년 1월부터 2017년 12월까지 전국 8개 병원에서 균주가 확인된 감염각막염 956명의 의무기록을 후향적으로 분석하여, 선행요인, 원인균, 치료 방법, 예후 등을 분석하였다. 결과: 감염각막염의 가장 흔한 선행요인은 안외상(33.2%)이었다. 초기시력은 안전수지 이하가 449안(47.0%)이었다. 각막궤양은 중심부에서 흔하였고, 크기는 4 mm² 이하가 가장 많았다. 전방축농이 동반된 경우는 295안(30.9%)이었다. 배양된 균주는 총 1,039균으로 그람음성균 443균주(42.6%)가 가장 많았다. 가장 흔한 균은 그람음성균은 녹농균, 그람양성균은 피부포도알균, 진균은 푸사륨이었다. 수술 치료는 201안(21.0%)에서 양막이식술 66안, 안구내용제거술 44안 순이었다. 최종시력은 0.2보다 좋은 시력이 422안(44.1%)이었다. 그람양성균은 목시플록사신과 반코마이신에, 그람음성균은 레보플록사신과 세프타지딤에 높은 감수성을 보였지만 일부 장알균과 슈도모나스 등에서 저항성을 보였다. 결론: 국내 감염각막염은 안외상으로 흔히 발생하였고 그람음성균이 가장 많았다. 대표적인 원인균은 피부포도알균, 녹농균, 푸사륨이었다. 입원 후 약물 및 수술적 치료로 시력이 호전된 경우가 많았지만 일부 저항성을 보이는 세균과 진균에 대해서는 주의가 필요하다. 세균에서 불량한 임상결과에 이르는 위험인자는 초기시력 0.02 미만, 전방축농, 65세 이상 나이, 각막중심부 궤양이었고 진균은 70세 이상 나이였다. Purpose: To analyze the clinical manifestations of culture-proven infective keratitis patients over a recent 10-year period. Methods: We retrospectively reviewed the medical records of 956 cases of infective keratitis between January 2008 and December 2017 at eight tertiary hospitals. The study was performed to analyze the risk factors, causative microbial organisms, therapeutic outcomes, and prognosis. Results: The most common risk factor of keratitis was trauma (33.2%). Initial visual acuity (V/A) was finger count or less in 449 eyes (47.0%). The common location of keratitis was central, and the size was 4 mm2 or less. Hypopyon was observed in 295 eyes (30.9%). Of the 1,039 cultured isolates, 443 (42.6%) grew Gram-negative bacteria with the most common being Pseudomonas aeruginosa. The most prevalent Gram-positive bacteria was Staphylococcus epidermidis, and fungi was Fusarium species. Surgical treatments were performed in 201 eyes (21.0%), followed by amniotic membrane transplantation (66 eyes) and evisceration (44 eyes). Final V/A was 20/100 or more in 422 eyes (44.1%). Gram-positive organisms were highly susceptible to moxifloxacin and vancomycin, and Gram-negative organisms were highly susceptible to levofloxacin and ceftazidime. An increase in resistance to these antibiotics was detected for Enterococcus and Pseudomonas. Conclusions: In South Korea, infective keratitis occurs frequently in eyes with trauma. Staphylococcus epidermidis, Pseudomonas aeruginosa, and Fusarium species are commonly identified etiologies of microbial keratitis. The appropriate administered medical and surgical treatments of suspected infectious keratitis can lead to visual improvement with particular care taken to minimize infection related to resistant bacteria and fungal microbes as needed. An initial V/A of 0.02 or less, the presence of hypopyon, age of 65 years or more, and a central lesion were associated with poor clinical outcome of bacterial keratitis. Age of 70 years or more was a significant risk factor for poor clinical outcome of fungal keratitis.

보문 : Universal Rice Primer(URP)에 의한 DNA 핵산지문법을 이용한 느타리의 유통 품종간 구분

서경인 ( Kyoung In Seo ),장갑열 ( Kab Yeul Jang ),유영복 ( Young Bok Yoo ),박순영 ( Soon Young Park ),김광호 ( Kwang Ho Kim ),공원식 ( Won Sik Kong ) 한국균학회 2008 韓國菌學會誌 Vol.36 No.2

건성안 환자들의 주관적인 안구 불편감과 안검염 중증도의 관계

문인희(In Hee Moon),김태임(Tae Im Kim),서경률(Kyoung Yul Seo),김응권(Eung Kweon Kim),이형근(Hyung Keun Lee) 대한안과학회 2016 대한안과학회지 Vol.57 No.10

목적: 건성안 질환을 평가하는 데 여러 가지 임상적 지표들이 알려져 있지만, 그중 어떠한 인자가 임상적인 안구 불편감에 가장 크게 영향을 끼치는지에 대해서는 논란이 있었다. 안검염은 눈물 증발형 건성안의 가장 중요한 원인 중의 하나로 인식되고 있지만, 건성안 증상에 안검염의 중증도가 끼치는 영향을 조사한 연구는 이전에 행해진 적이 없었다. 본 연구의 목적은 안검염을 동반한 건성안 환자들의 주관적 안구 불편감에 영향을 끼치는 인자들을 평가하고 어떠한 지표가 가장 안검염의 심한 정도와 관련이 있는지 분석하는 것이다. 대상과 방법: 본 연구는 단면, 임상 증례 연구로서 연구 대상자는 안검염을 동반한 건성안 환자들로 구성되었다. 22세부터 81세까지(평균 연령 56.36세) 73명의 대상자가 등록되었고 그중 49명(평균 연령 55.44세), 49안이 모든 검사를 마쳤다. 문진, visual analogue scale (VAS) 통증 점수, 건성안 자각 증상 점수 설문 조사(ocular surface disease index, OSDI), 안검염의 정도(score 0-4), 각결막플루오레신 염색 정도(score 0-4), 눈물막 파괴 시간(tear break up time) 측정을 포함한 검사를 진행하였다. 결과: 주관적인 증상과 안검염의 정도가 중요한 연관 관계가 있음이 밝혀졌다. 건성안 환자들이 갖고 있는 안검염의 정도가 심할수록 VAS 통증 점수와 OSDI 점수가 증가하였다(p=0.031, p=0.006). 결막 미란의 정도 또한 VAS 통증과 관련이 있었다(p=0.016). 다른 건성안 측정 지표들은 VAS, OSDI 점수와 통계적으로 유의한 관계를 보이지 않았다. 추가적으로 결막 미란은 안검염의 정도와 연관이 있었지만(p<0.0001) 각막 미란의 정도는 안검염의 정도와 연관이 없었다(p=0.809). 눈물막 파괴 시간 또한 안검염의 정도와 통계적으로 유의한 관계를 보이지 않았다(p=0.593). 결론: 본 연구 결과는 안검염의 정도가 건성안 환자들의 주관적인 안구 통증과 불편감에 영향을 끼치는 중요한 요소이고 안검염의 정도는 건성안의 알려져 있던 임상적 지표인 각막 미란, 눈물막 파괴 시간과는 관련이 있지 않다는 것을 보여주었다. 이는 건성안으로 고통스러워하는 환자들의 삶의 질의 개선을 위하여 건성안 치료에는 안검염의 치료가 병행되어야 함을 시사한다. <대한안과학회지 2016;57(10):1507-1513> Purpose: Although a number of clinical parameters are well known to affect dry eye (DE) disease, it is unknown which factor mostly affects the discomfort of DE. Blepharitis is recognized as one of the leading causes of evaporative-type DE disease, but there have been no large-scale study to investigate the effect of blepharitis on DE symptoms. The purpose of this study was to evaluate the factors influencing subjective ocular discomfort in DE patients with blepharitis and to determine which parameter is most highly related to severity of blepharitis. Methods: This investigation was a cross-sectional, clinical study. The test population consisted of DE patients suffering from moderate blepharitis. Seventy-three subjects aged 22 to 81 years (mean age 56.36) were enrolled, 49 of whom completed the investigation on a total of 49 eyes. A detailed assessment was conducted, including history taking, visual analog scale (VAS) pain scoring, ocular surface disease index (OSDI) questionnaire, blepharitis severity grading (score 0-4), conjunctival, corneal fluorescein staining (score 0-4), and tear break up time (TBUT) assessment. Results: The results revealed significant correlations between subjective symptoms and blepharitis severity. Significant increases in overall VAS score, OSDI score (p = 0.031, p = 0.006) were recorded in DE patients with severe blepharitis. Conjunctival erosion was significantly related to VAS score (p = 0.016). Other parameters were not significantly related with VAS and OSDI scores. Additionally, conjunctival erosion was related with blepharitis severity (p < 0.0001), and corneal erosion was not correlated with blepharitis severity. TBUT also did not show any statistical correlation with blepharitis. Conclusions: Our results showed that blepharitis severity is the main factor influencing subjective pain and discomfort in DE patients, although blepharitis severity was not related with the known clinical parameters of DE such as corneal erosion and TBUT. This study indicates that targeting treatment for blepharitis can significantly improve quality of life for patients suffering from DE disease. J Korean Ophthalmol Soc 2016;57(10):1507-1513

계절별 온도에 따른 느타리 품종의 재배적 특성

유영복,서경인,공원식,장갑열,신평균,박윤정,Yoo, Young Bok,Seo, Kyoung In,Kong, Won Sik,Jang, Kab Yeul,Shin, Pyung Gyun,Park, Yunjung 한국버섯학회 2009 한국버섯학회지 Vol.7 No.3

최근까지 보급된 느타리버섯류 81개 품종을 URP를 이용하여 PCR에 의한 DNA 패턴으로 유연관계 분석과 자실체 특성조사로 품종간의 유사성을 결정하였고, 계절별로 상자재배 하여 온도 적응성에 대한 그 특성을 분석하였다. 재배품종의 DNA 패턴과 자실체 특성분석으로 품종의 유연관계를 조사한 결과 원형느타리는 1, 수한은 15, 왕흑평은 4, 춘추2호는 6, 신농11호는 1, 삼구01호는 2품종과 유사하거나 구별성이 뚜렷하지 않았다. 또한 수한 근연종으로는 5품종으로 나타났다. 느타리는 버섯 생육 시 산소공급을 위하여 환기가 필수적이므로 재배사내에서 외부기온의 영향을 크게 받는다. 따라서 계절에 따라 알맞은 품종을 선택하여야 에너지 절감과 생산량을 높일 수 있다. 봄~여름 재배 시 높은 온도($16^{\circ}C$ 이상)에 적응성이 강한 품종(내서성이 강함) 으로는 사철느타리종, 여름느타리종, 분홍느타리종의 8개 품종들이 속하였다. 봄~여름 재배 시 높은 온도에 적응성이 다소 강한 품종(내서성이 다소 강함)으로는 느타리종 51개 품종으로 나타났다. 가을~겨울 재배 시 낮은 온도($11^{\circ}C$ 이하)에 적응성이 다소 강한 품종으로는 느타리종 64품종으로 나타났다. 사계절 재배 시 적응성이 다소 강한 품종으로는 49개 품종으로 나타났다. 큰느타리, 아위느타리, 전복느타리종은 균사생장이 느려 오염이 심하여 상자 재배에서는 적합하지 않았다. 이러한 품종 특성 구명은 품종의 계절별 올바른 선택으로 에너지 절감과 생산성 향상에 의한 농가소득에 기여할 것이며, 나아가 농가와 종균배양소간의 분쟁해소, 품종육성자의 본인 개발 품종에 대한 상대적 위치, 육종모본 선택, 농가지도 사업에 유용하게 활용될 수 있을 것이다. We determined the genetic relatedness among 81 commercial varieties of oyster mushrooms by either comparison of fruiting body characteristics or using PCR amplification with URP primers. Also, we assessed their temperature adaptation by using box cultivation. Based on our data, some varieties such as Wonhyung and variety 1, Suhan and variety 20, Wang-hukpyung and variety 4, Chunchu #2 and variety 6, Shinong #11 and variety 1, Samgu #1 and variety 2, showed the close genetic relatedness between each other. It is known that mushroom culture room is affected by outer temperature because mushroom need the adequate aeration for their growth. Therefore, in aspect of saving energy, the cultivation of season favorable mushroom species has been recommended. Eight different commercial varieties including Sa-chul, Yeoreum and Bunhong(Pink) grew well at high temperature ($16^{\circ}C$). Also, about 51 different oyster mushroom strains were good at relatively high temperature. However, other 64 different oyster mushroom varieties were grew well at low temperature ($11^{\circ}C$). Fourty-nine varieties were adapted well in most temperatures. The slow growth rate were observed in some varieties including Kun(P. eryngii ), Awi(P. nebrodensis ), and Cheunbok(P. abalonus ), which are not suitable for box cultivation. We believe that the culture characterization of each mushroom varieties should help many farmers in many aspects such as saving energy, quantity improvement and new variety development etc.

웨이브프론트 방식을 이용한 라식과 라섹 수술 간의 Aberrometer 측정을 통한 고도수차의 비교

오상준 ( Sang Joon Oh ) , 이인식 ( In Sik Lee ) , 이영기 ( Young Ghee Lee ) , 김응권 ( Eung Kweon Kim ) , 이준모 ( Jun Mo Lee ) , 서경률 ( Kyoung Yul Seo ) 대한안과학회 2004 대한안과학회지 Vol.45 No.10

급성산재성뇌척수염(Acute disseminated encephalomyelitis)에 의한 시신경염 1예

이준모 ( Jun Mo Lee ),신인하 ( In Ha Shin ),서경률 ( Kyoung Yul Seo ) 대한안과학회 2003 대한안과학회지 Vol.44 No.5

벼 잡종초기세대에서 이삭줄기 대유관속 수와 이삭 특성의 분리양상

김광호,안종국,서경인 建國大學校附設農業資源開發硏究所 2001 農資源開發論集 Vol.23 No.-

The segregation modes and the selection efficiency of large vascular bundle(LBV) number and panicle characteristics were measured in three hybrid populations of rice. F_1 plants of the three crosses showed different direction and degree of dominance in vascular bundle number and panicle characteristics. The panicle neck diameter(ND), number of primary branches(PB) and LVB showed a typical normal distribution in F_2. When F_2 plants were divided into two groups up culm length of 90cm, the distribution of LVB number and panicle characteristics were not different between two populations. The selected and non-selected F_3 populations showed no difference in distribution of LVB number and panicle characteristics. However, F_3 populations grouped by culm length of 90cm showed different distributions in LVB and 100-grain weight among six characteristics observed. In F_2 populations, ND showed positive correlationship with PB, LVB number and grain number per panicle(GN). ND was positively correlated with PB, LVB number, GN and panicle length in selected and non-selected F_3 populations.