실시간 데이터 처리를 위한 개방형 데이터 프레임워크 적용 방안

박순호,김영길,Park, Sun-ho,Kim, Young-kil 한국정보통신학회 2019 한국정보통신학회논문지 Vol.23 No.10

오늘날의 기술 환경에서 대다수의 빅 데이터 기반 애플리케이션 및 솔루션은 스트리밍 데이터의 실시간 처리를 기반으로 한다. 빅 데이터 스트림의 실시간 처리 및 분석은 빅 데이터 기반 애플리케이션 및 솔루션 개발에서 중요한 역할을 한다. 특히 해사 분야 데이터 처리 환경에서도 데이터의 폭발적 증대에 따른 대용량 실시간 데이터를 빠르게 처리 및 분석할 수 있는 기술 개발의 필요성이 가속화되고 있다. 따라서 본 논문에서는 다양한 빅 데이터 처리를 위한 오픈소스 기술 중에 적합한 오픈소스로 NiFi, Kafka, Druid의 특징을 분석하여 한국형 e-Navigation 서비스에서 해사 분야 서비스 분석에 필요한 외부 연계 필요 정보들을 상시 최신 정보로 제공할 수 있도록 실시간 데이터 처리를 위한 개방형 데이터 프레임워크 기술 적용의 기초를 마련하고자 한다. In today's technology environment, most big data-based applications and solutions are based on real-time processing of streaming data. Real-time processing and analysis of big data streams plays an important role in the development of big data-based applications and solutions. In particular, in the maritime data processing environment, the necessity of developing a technology capable of rapidly processing and analyzing a large amount of real-time data due to the explosion of data is accelerating. Therefore, this paper analyzes the characteristics of NiFi, Kafka, and Druid as suitable open source among various open data technologies for processing big data, and provides the latest information on external linkage necessary for maritime service analysis in Korean e-Navigation service. To this end, we will lay the foundation for applying open data framework technology for real-time data processing.

변형 유비퀴틴 단백질을 이용하여 탐구한 이온이 단백질 구조의 안정성에 미치는 영향

박순호,Park, Soon-Ho 대한화학회 2016 대한화학회지 Vol.60 No.1

소수성 코어 residue가 변이된 유비퀴틴 단백질의 urea에 의한 unfolding 반응에서 보이는 m-value의 변화에 대한 분석

박순호,백미진,Park, Soon-Ho,Baek, Mi-Jin 대한화학회 2005 대한화학회지 Vol.49 No.5

유비퀴틴 단백질의 부분적으로 폴딩된 구조에 대한 분광학적 분석

박순호,Park, Soon-Ho 한국응용생명화학회 2003 한국농화학회지 Vol.46 No.4

Hydrophobic core가 변이된 유비퀴틴 단백질이 pH 2 용액에서 보이는 구조적인 특성을 여러 분광학적 방법으로 측정하였다. 낮은 pH값을 갖는 용액에서 이 변이 유비퀴틴의 intrinsic tryptophan fluorescence emission spectrum은 unfolded 상태보다 약간 blue shift되어 있고 또한 그 intensity도 상당히 낮게 나타났다. 이는 이 용액 조건에서 이 변이 유비퀴틴의 삼차구조가 약간 남아 있는 것을 의미한다. 같은 용액에서 이 변이 유비쥐틴의 far-UV circular dichroic spectrum은 native 상태나 unfolded 상태의 spectrum과 현저히 달랐으며 220 nm 에서의 molar ellipticity 값을 통하여 볼 때 pH 2인 용액에서 상당량의 이차구조를 지니고 있었다. 또한 같은 용액에서 이 변이 유비퀴틴은 hydrophobic dye인 8-anilinonaphthalene-1-sulfonic acid(ANS)외 fluorescence emission intensity를 증가시키고 fluorescence emission maximum이 짧은 파장에서 나타나게 하였다(blue shift). 이러한 현상은 pH 2 용액에서 이 변이 유비퀴틴의 hydrophobic core가 느슨하여져서 hydrophobic dye인 ANS가 결합할 수 있는 구조를 띠고 있음을 나타낸다. 이러한 분광학적인 관찰은 이 변이 유비귀틴이 pH 2인 용액에서 상당량의 이차구조를 지니고 있지만 hydrophobic core는 느슨하게 형성된 molten globule과 같은 형태를 지니고 있음을 나타낸다. 이 변이 유비퀴틴의 molten 히obule 형태는 단백질 폴딩 반응의 경로를 연구할 수 있는 좋은 모델이 될 수 있을 것으로 생각된다. Hydrophobic core variant of ubiquitin appeared to have partially folded structure at pH around 2. The intrinsic tryptophan fluorescence emission maximum of this ubiquitin variant at pH 2 showed slight blue shift compare to that of unfolded state, suggesting that some residual tertiary structures remain in this solvent condition. At the same solvent condition, this ubiquitin variant binds with hydrophobic dye, 8-anilinonaphthalene-1-sulfonic acid(AMS), which is known to bind to exposed hydrophobic surface. Furthermore, far-UV circular dichroic spectrum of this ubiquitin variant in the diminished pH was remarkably different from the far-UV CD spectrum of the native state or unfolded state. Based on the molar ellipticity at 220 nm, this ubiquitin variant at pH 2 appeared to have significant amount of secondary structures. All these observations suggest that this ubiquitin variant in the diminished solvent pH has loosely folded hydrophobic core with some secondary structures, which are key features of molten globule conformation. Since molten globule has long been considered as a protein folding intermediate, it is considered that this hydrophobic core variant ubiquitin will serve as a valuable model to study protein folding process.

순환정지 후 장기기증의 의료윤리적 문제

박순호,허정식,김기영,Park, Sunho,Huh, Jung-Sik,Kim, Ki-Young 제주대학교 의과학연구소 2020 The Journal of Medicine and Life Science Vol.17 No.3

It is necessary to expand organ donations of the deceased, as more ethical problems are emerging from the increase in organ donations from the living. As the legal and ethical discussions on donation after circulatory death (DCD) as a field with the potential to expand such domestic organ donation are being held, the need for a social consensus is increasingly highlighted. Organ DCD refers to the donation of an organ from a patient whose spontaneous blood circulation has stopped due to cardiac death. In this study, we aimed to examine whether there are legal and ethical obstacles or medical uncertainties for expanding the practice of DCD. By law, death is recognized as cardiac death, and brain death is recognized as an exception for organ transplantation. Although circulatory death precedes brain death, this paper presents a discussion to begin the process of reaching an ethical and legal agreement on whether or not circulatory death can be recognized as death. Successful implementations of DCD, including Category III DCD, in other countries are currently being reviewed to introduce Category III DCD in Korea.

정오표 : '김광석 다시 그리기 길'의 장소 만들기와 장소성

박순호,Park, Soon Ho 한국경제지리학회 2021 한국경제지리학회지 Vol.24 No.1

오픈 소스를 활용한 공공 데이터 기반의 질병 검색 시스템 구현

박순호,김영길,Park, Sun-ho,Kim, Young-kil 한국정보통신학회 2019 한국정보통신학회논문지 Vol.23 No.11

의료기관은 급속한 ICT 융합 보급에 따른 의료 기관 간의 경쟁력을 확보하고, 의료 산업을 통해 발생하는 데이터의 빅 데이터화 및 사물 인터넷 의 등장으로 엄청난 속도로 증가하는 데이터를 관리해야하는 과제에 직면해 있다. 이러한 의료계의 빅 데이터 패러다임은 단순히 크기가 큰 자료나 그것을 처리하고 분석하는 도구와 과정만을 의미하는 것이 아니라 인간이 생활하고 사고하고 연구하는 방식의 전산적인 전환을 의미한다고 볼 수 있다. 최근 의료분야 데이터가 공개됨에 따라 의료 데이터의 활용 요구가 증가하고 있으므로 합리적이고 효율적인 의사 결정에 도움을 줄 수 있는 오픈 소스를 활용한 공공 데이터 기반의 질병 검색 시스템 연구를 진행하였다. 실험 결과 기존 공공 기관에서 제공하는 단순 질병 조회나 단일 질환에 대한 증상 조회와는 달리 증상이나 원인으로 검색해도 관련 질병들이 검색되며 병명이 재지정 되었거나 유사한 증상을 가지는 질병들도 검색이 되었다. Medical institutions face the challenge of securing competitiveness among medical institutions due to the rapid spread of ICT convergence, and managing data that is growing at an enormous rate due to the emergence of big data and the emergence of the Internet of Things. The big data paradigm of the medical community is not just about large data or tools and processes for processing and analyzing it, but also means a computerized shift in the way people live, think and study. As the medical data is recently released, the demand for the use of medical data is increasing. Therefore, the research on disease detection system based on public data using open source that can help rational and efficient decision making was conducted. As a result of the experiment, unlike a simple disease inquiry or a symptom inquiry about a single disease provided by a public institution, related diseases are searched by a symptom or a cause.

해상 물류 효율성을 위한 선박의 전자적 처리 수단과의 항만 정보 연계 방안 연구

박순호(Park Sunho),박원재(Park Wonjae),박새롬(Park Saerom) 한국통신학회 2014 한국통신학회 학술대회논문집 Vol.2014 No.6

생화학,분자생물학 : Ubiquitin 폴딩 intermediate의 열역학적 특성

박순호 ( Park Sun Ho ) 한국응용생명화학회 2004 Applied Biological Chemistry (Appl Biol Chem) Vol.47 No.1

Thermodynamic properties of ubiquitin transient folding intermediate were studied by measuring folding kinetics in varying temperatures and denaturant concentrations. Through quantitative kinetic modeling, the equilibrium constant, hence folding free energy, between unfolded state and intermediate state in several different temperatures were calculated. Using these values, the thermodynamic parameters were estimated. The heat capacity change (△C_(p)) upon formation of folding intermediate from unfolded state were estimated to be around 80% of the overall folding reaction, indicating that ubiquitin folding intermediate is highly compact. At room temperature, the changes of enthalpy and entropy upon formation of the intermediate state were observed to be positive. The positive enthalpy change suggests that the breaking up of the highly ordered solvent structure surrounding hydrophobic side-chain upon formation of intermediate state. This positive enthalpy was compensated for by the positive entropy change of whole system so that formation of transient intermediate has negative free energy.

소각시설 설계를 위한 의료폐기물 발열량 분석

박순호 ( Soonho Park ),고인범 ( Inbeom Ko ),이병선 ( Byungson Lee ),김동균 ( Dongkyun Kim ),김경 ( Kyung Kim ),배재근 ( Chaegun Phae ) 한국폐기물자원순환학회 2022 한국폐기물자원순환학회 춘계학술발표논문집 Vol.2022 No.-