PPEditor: 한국어 의존구조 부착을 위한 반자동 말뭉치 구축 도구

김재훈,박은진,Kim Jae-Hoon,Park Eun-Jin 한국정보처리학회 2006 정보처리학회논문지B Vol.13 No.1

말뭉치(corpus)는 많은 언어 정보를 포함하고 있으며, 언어처리 및 계산언어학 분야에서 다양한 용도로 사용되고 있다. 그러나 말뭉치에 언어 정보를 부착하는 데는 많은 시간과 인력이 소요된다. 이 문제를 완화시키기 위해서 말뭉치 구축 도구가 반드시 요구된다. 본 논문에서는 한국어 의존구조 부착을 위한 말뭉치 구축 도구의 설계 및 구현에 관해서 기술한다. 가장 이상적인 방법은 주석자가 전혀 개입하지 않고, 말뭉치를 구축하는 것이나 이것은 사실상 불가능하다. 따라서 대부분의 말뭉치 구축 도구는 반자동으로 구성되어 있으며, 본 논문에서 제안된 도구도 반자동이다. 제안된 도구는 언어 분석기의 분석 결과에 내포된 오류를 효과적으로 수정할 수 있고, 또한 가능한 한 반복적인 작업을 피할 수 있으며 쉽게 사용할 수 있도록 인터페이스를 설계하였다. 제안된 시스템을 이용해서 20어절 이상의 1만 문장에 의존구조를 부착해 보았다. 잘 훈련된 8명의 주석자들이 매일 4시간씩 2개월 동안 구축하였으며, 그 결과는 정확하고 일관성 있는 말뭉치를 구축할 수 있었으며, 작업 시간과 인력도 크게 줄일 수 있었다. In general, a corpus contains lots of linguistic information and is widely used in the field of natural language processing and computational linguistics. The creation of such the corpus, however, is an expensive, labor-intensive and time-consuming work. To alleviate this problem, annotation tools to build corpora with much linguistic information is indispensable. In this paper, we design and implement an annotation tool for establishing a Korean dependency tree-tagged corpus. The most ideal way is to fully automatically create the corpus without annotators' interventions, but as a matter of fact, it is impossible. The proposed tool is semi-automatic like most other annotation tools and is designed to edit errors, which are generated by basic analyzers like part-of-speech tagger and (partial) parser. We also design it to avoid repetitive works while editing the errors and to use it easily and friendly. Using the proposed annotation tool, 10,000 Korean sentences containing over 20 words are annotated with dependency structures. For 2 months, eight annotators have worked every 4 hours a day. We are confident that we can have accurate and consistent annotations as well as reduced labor and time.

자질 확장에 따른 용어 클러스터링의 성능 향상

박은진(Eun-Jin Park),김재훈(Jae-Hoon Kim),옥철영(Cheol-Young Ock) 한국정보과학회 2005 한국정보과학회 학술발표논문집 Vol.32 No.2

이 논문에서는 용어 클러스터링의 성능에 직접적인 영향을 주는 자질 확장에 따른 시스템의 성능 변화를 보았다. 객관적인 성능 비교를 위하여 용어 클러스터링 결과와 한국어 의미 계층망에서 추출한 클러스터를 비교하였다. 실험 결과, 용어의 뜻 풀이말을 자질로 사용한 경우보다 자질을 확장한 방법(Bigram, Case)이 성능이 좋게 나왔으며, 자질확장 시에 사용되는 말뭉치의 추출방법에 따라 다른 성능을 보였는데, 단순히 Bigram 정보를 사용하여 확장한 것 보다는 동사의 격 관계(Case)정보를 이용한 것이 성능이 좋게 나왔다.

용어 클러스터링의 성능 평가

박은진(Eun-Jin Park),김재훈(Jae-Hoon Kim),옥철영(Cheol-Young Ock) 한국정보과학회 언어공학연구회 2005 한국정보과학회 언어공학연구회 학술발표 논문집 Vol.2005 No.10

이 논문에서는 전자 사전의 뜻 풀이말을 이용하여 용어를 자동 분류하는 용어 클러스터링 시스템을 설계하였다. 클러스터링 성능에 영향을 미치는 요소로 자질 선택, 자질 표현 그리고 유사도 측정 등이 있다. 이 논문에서는 이러한 요소들이 용어 클러스터링에 미치는 영향을 평가해보았다. 클러스터링 결과를 객관적으로 비교하기 위해서 용어 클러스터링 결과와 한국어 의미 계층망에서 추출한 정답 클러스터를 비교하였다. 실험 결과, 용어의 뜻 풀이말만 자질로 사용한 방법보다는 뜻 풀이말 자질을 확장하는 방법이 훨씬 더 좋은 결과를 보였다.

온톨로지를 이용한 단어 군집화 성능 개선

박은진,김재훈,옥철영,Park Eun-Jin,Kim Jae-Hoon,Ock Cheol-Young 한국정보처리학회 2006 정보처리학회논문지B Vol.13 No.3

이 논문은 사전의 뜻 풀이말을 이용하여 단어 군집화 시스템을 설계하고 구현한다. 군집화를 위해서는 다양한 형태의 자질이 요구되며 어떤 자질을 사용하느냐에 따라 군집화의 성능이 좌우된다. 뜻 풀이말은 표제어를 자세히 설명하고 있기는 하지만, 뜻 풀이말에 사용된 단어가 너무 함축적이거나 추상적이어서 뜻 풀이말이 그다지 길지 않다. 뜻 풀이말로부터 추출된 자질을 그대로 군집화에 이용할 경우에는 다수의 작은 군집이 형성된다. 뜻 풀이말을 이용하여 보다 더 좋은 군집화 결과를 얻기 위해서는 뜻 풀이말의 의미를 크게 손상하지 않는 범위에서 보다 더 일반적인 단어로 바꾸어 군집화에 필요한 자질을 확장할 필요가 있다. 이 논문에서 추상적인 말을 온톨로지 상에서 한 단계 위의 단어로 확장하거나 온톨로지 상에서 고정 높이에 해당하는 단어로 확장함으로써 단어 군집화 성능을 향상시키는 방법을 제안한다. 실험을 통해서 온톨로지를 이용해서 자질을 확장할 경우 단어 군집화 성능이 크게 개선되었으며, 전체적으로 보면 온톨로지 상에서 고정 높이에 해당하는 단어로 확장할 경우가 더 좋은 성능을 보였다. 또한 단어 군집화를 위한 자질로 동사가 매우 유용함을 관찰할 수 있었다. In this paper, we describe the design and the implementation of word clustering system using a definition of an entry word in the dictionary, called a dictionary definition. Generally word clustering needs various features like words and the performance of a system for the word clustering depends on using some kinds of features. Dictionary definition describes the meaning of an entry in detail, but words in the dictionary definition are implicative or abstractive, and then its length is not long. The word clustering using only features extracted from the dictionary definition results in a lots of small-size clusters. In order to make large-size clusters and improve the performance, we need to transform the features into more general words with keeping the original meaning of the dictionary definition as intact as possible. In this paper, we propose two methods for extending the dictionary definition using ontology. One is to extend the dictionary definition to parent words on the ontology and the other is to extend the dictionary definition to some words in fixed depth from the root of the ontology. Through our experiments, we have observed that the proposed systems outperform that without extending features, and the latter's extending method overtakes the former's extending method in performance. We have also observed that verbs are very useful in extending features in the case of word clustering.

한국 폐경여성에서 골밀도와 Osteoprotegerin 유전자 A163G, T950C 다형성 연구

권동진 ( Dong Jin Kwon ),유영옥 ( Young Oak You ),김대훈 ( Dai Hoon Kim ),김재훈 ( Jae Hoon Kim ),박동춘 ( Dong Choon Park ),이희중 ( Hee Joong Lee ),김은중 ( Eun Jung Kim ),김진홍 ( Jin Hong Kim ) 대한폐경학회 2003 대한폐경학회지 Vol.9 No.3

골밀도가 감소하는 질환인 골다공증의 발생에는 여러 가지 다양한 요인들이 관여하는 것으로 지금까지 알려져 왔다. 특히 폐경기 여성에서 골다공증의 발생에는 파골세포에 의한골흡수가 증가하여 발생하는데 Osteoprotegerin(OPG) 유전자가 중요한 역할을 한다. 이에 저자들은 가톨릭대학교 의과대학 성빈센트병원 산부인과 폐경기 크리닉을 방문한 229명의 자연 폐경여성을 대상으로 요추, 대퇴골경부, Ward 삼각주, 되퇴돌기의 골밀도를 측정하여 정상군, 골감소증군과 골다공증군으로 분류하고 골다공증 발생에 있어서 중요한 역할을 하는 것으로 알려지 OPG 유전자의 A^(163)G, T^(950)C 다형성을 PCR-RELP 방법을 이용하여 관찰하고, 이러한 유전자형의 다형성이 골밀도와 어떤 연관성이 있는가를 알아보고자 본 연구를 시도 하였다. 저자들의 연구결과에서 대상 폐경기 여성의 A^(163)G, T^(950)C 유전자형 분포 양상은 AA 54.6%, AG 37.1%, GG 8.3%; TT 17.5%, TC 44.1%, CC 38.4%를 보였고, 전체 폐경여성에서 A^(163)G은 요추 부위에서 골밀도와 유의한 상관 관계를 보였다. A163G 유전자형의 다형성은 요추 부위에서는 정상군과 골다공증군, 대퇴골경부와 Ward 삼각주에서는 정상군에서 골밀도와 유의한 상관 관계를 보였다. T^(950)C 유전자형의 다형성은 大퇴골경부에서는 정상군과 골감소증군, Ward 삼각주에서 정상군에서만 골밀도와 유의한 상관 관계를 보였다. 이상의 결과로 한국인 폐경여성에서 OPG 유전자의 다형성은 골밀도 변화에 중요한 역할을 하는 것을 알 수 있었다. Objective: To examine the relationship between Osteoprotegerin gene polymorphisms, and bone mineral density(BMD). Methods: Restriction fragment length polymorphisms at the Osteoprotegerin A163G(promoter), T950C(promoter) gene site, and BMD at the lumbar spine and proximal femur were analyzed in 229 postmenopausal Korean women (81 normal, I I I osteopenic and 37 osteoporotic patients). BMDs were measured by DEXA. Results: The distribution of A163G and T950V polymorphisms in all postmenopausal women was as follows: AA 54.6%, AG 37.1%, GG 8.3%;TT 17.5%, TC 44.1%, CC 38.4%, respectively. After adjusting for potential confounding factors such as age, BMI and menopause duration, A163G polymorphism was significantly associated with BMD at the lumbar spine in all postmenopausal women. A163G polymorphism was significantly associated with BMD at the lumbar spine in normal and osteoporotic patients, and BMD at the femur neck and ward`s triangle in normal patients. T950C polymophism was significantly associated with BMD at the femur neck in normal and osteopenic patients, and BMD at the ward`s triangle in normal patients. Conclusion: These findings suggest that osteoprotegerin gene polymorphisms may be an important contributor to the variation of BMD among postmenopausal Korean women.

자궁경부의 Adenoid basal carcinoma 1례

박동춘(Dong Choon Park),김재훈(Jae Hoon Kim),이형근(Hyung Gun Lee),정대영(Dae Young Chung),김진우(Jin Woo Kim),유영옥(Young Ok Lew),김대훈(Dae Hoon Kim),남궁성은(Sung Eun NamKoong) 대한산부인과학회 1999 Obstetrics & Gynecology Science Vol.42 No.8

We report a rare case of adenoid basal carcinoma in uterine cervix. The patient was a 43-year-old Korean female. She received neoadjuvant chemotherapy with Quick Cis-VP16 (cisplatin and VP16 with 7-10 days interval), three times and radical hysterectomy with pelvic lymph nodes dissection under the diagnosis of cervical cancer stage IIa. After the neoadjuvant chemotherapy, the mass size was 3 x 2.5 Cm and which was protruded in exocervical region. Microscopically, scattered small nests of uniformed small cells with dark nuclei and scant cytoplasm were observed. Peripheral palisading as well as the formation of gland-like or acinar structures were noted. There were also foci of squamous differentiation in same portion of the small nests. The epithelial surface in other portions showed squamous cell carcinoma, large cell non-keratinizing cell type. Distribution between adenoid basal carcinoma of the cervix and other disease, such as adenoid cystic carcinoma and squamous cell carcinoma with basaloid features, is important for clinical management because the clinical behavior of adenoid basal carcinoma is less malignant than adenoid cystic carcinoma.

PPeditor: 한국어 의존구조 말뭉치 구축 도구

박은진 ( Jae-hoon Kim ),김재훈 ( Eun-jin Park ),김강민 ( Kang-min Kim ),김창현 ( Chang-hyun Kim ) 한국정보처리학회 2005 한국정보처리학회 학술대회논문집 Vol.12 No.1

효과적인 언어처리 시스템을 개발하기 위해서는 언어정보가 부착된 대량의 말뭉치가 필요하다. 그러나, 대량의 말뭉치를 구축하기 위해서는 많은 시간과 노력이 필요하다. 이와 같은 시간과 노력을 절약하기 위해서 일반적으로 말뭉치 구축 도구를 사용한다. 본 논문에서는 한국어 의존구조 말뭉치를 구축하기 위한 도구를 설계하고 구현하였다. 본 논문에서 개발된 구축 도구는 여러 가지 특징을 가지고 있다. 1) 특정 응용분야에 관계없이 두루 사용할 수 있다. 2) 분석 단계와 분석오류를 연계하여 작업의 집중도를 높였다. 3) 가능한 한 오류는 축적되지 않도록 하여 구축된 말뭉치의 질을 크게 개선할 수 있었다. 4) 구축된 정보는 서로 공유할 수 있도록 하여 작업의 일관성을 극대화하였다. 5) 초보자로 사용자가 쉽게 도구를 사용할 수 있도록 인터페이스를 설계하였다. 본 논문에서 개발된 구축 도구를 이용하여 8 명의 연구원이 약 2 개월 (하루에 평균 4 시간)에 걸쳐서 10,000 문장의 의존구조 말뭉치를 구축할 수 있었다. 구축된 말뭉치에는 형태소 정보, 구묶음 정보, 의존구조 정보가 부착되어 있다.

사용자의 행동과 점진적 기계학습을 이용한 쓰레기 편지 여과 시스템의 설계

김강민 ( Kang-min Kim ),박은진 ( Eun-jin Park ),김재훈 ( Jae-hoon Kim ) 한국정보처리학회 2005 한국정보처리학회 학술대회논문집 Vol.12 No.1

본 논문은 쓰레기 편지를 여과하기 위해 대상 편지에 따른 사용자들의 행동(reaction)을 묵시적(implicitly)으로 수집한 후 이를 점진적(incrementally) 기계학습기의 자질(feature)로 사용하여 편지 여과 작업의 증거가 되는 단어들을 지속적으로 학습하면서 최적의 편지 여과 결과를 제공하는 기법과 시스템 구조를 제안한다. 사용자 개인의 컴퓨터에 행동 정보와 학습 데이터를 저장하도록 설계하여 묵시적 정보 수집에서 자주 제기되는 개인 프라이버시 문제를 해결하였으며, 점진적 기계학습 기법을 사용하여 개인 정보를 포함하는 대량의 편지 학습 데이터를 모으기 힘들다는 문제를 해결하였다. 또 향후 제안하는 시스템을 이용하여 여러 종류의 기계학습 기법 중 쓰레기 편지여과 작업을 가장 효과적으로 수행할 수 있는 기법을 선택하는 작업을 수행할 계획이다.

Cisplatin 내성 난소암 세포주 Clone의 DNA Mismatch Repair 유전자 변이및 Taxol, Topotecan의 민감도

김흥기(Heung Ki Kim),손우석(Woo Seok Son),박태철(Tae Chul Park),김태응(Tae Eung Kim),고영미(Young Me Koh),송지민(Ji Min Song),박기영(Ki Young Park),김재훈(Jae Hoon Kim),유기성(Ki Seong Ryu),김진우(Jin Woo Kim),남궁성은(Sung Eun NamKoo 대한산부인과학회 1999 Obstetrics & Gynecology Science Vol.42 No.11

목적: 부인 종양에서 가장 심각한 문제중 하나인 난소암은 항암화학요법에 비교적 민감하게 반응하는 고형 종양이나 다양한 노력에도 불구하고 사망률은 큰 변화가 없는 실정이다. Cisplatin은 이들 항암제의 중심이며 가장 효과적인 약제이지만, Cisplatin에 대한 약제내성의 출현은 치료 실패의 중요한 원인이 되고 있고, 최근 Hereditary nonpolyposis colorectal cancer에서 입증된 DNA 부정합 보수 유전자의 변이가 여러 약제에 대하여 약제내성을 초래한다는 사실이 밝혀지고 있다. 이에 따라 Cisplatin 내성을 갖는 난소암 세포주에서 DNA 부정합 보수 유전자인 hMLH1과 hMSH2의 돌연변이와 Microsatellite instability 여부를 알아보고, 약제내성을 갖는 난소암 세포주에서 얻은 단일 세포의 clone들중 부정합 보수 유전자에 변이가 있는 clone과 정상인 clone을 분류하여, 이들에서 난소암의 2차 약제로 많이 쓰이는 Taxol, Topotecan의 항암제 민감도에 차이가 있는지 밝히고자 연구를 시행하였다. 연구방법: 상피성 난소암 세포주 2008과 이 세포주에 Cisplatin의 농도를 반복적으로 증가시켜 만들어진 2008/C13*5.25 세포주에서 추출한 cell clone으로 hMLH1과 hMSH2 단백질로 immunoblot을 시행하고 각각의 clone에 대하여 taxol 및 topotecan의 colony forming assay를 이용하여 항암제 민감도 검사를 시행하였다. 결과: 1. 2008 세포주와 2008/C13*5.25 세포주에서 hMLH1과 hMSH2에 대한 항체를 이용하여 immunoblot을 시행한 결과 각각의 세포주에서 모두 hMLH1과 hMSH2 단백질의 발현을 확인 할 수 있었다. 2. 2008 세포주에서 hMLH1(+)인 clone은 78개, hMLH1(-)인 clone은 22개 였고, 2008/C13*5.25 세포주에서는 hMLH1(+)인 clone은 73개, hMLH1(-)인 clone은 27개로, hMLH1(-)로의 변이는 2008/C13*5.25에서 약간 많았지만 통계적으로 유의한 차이는 없었다. 3. 2008과 2008/C13*5.25 세포주에서는 Taxol에 대한 민감도에 차이가 없었다. 그러나 2008/C13*5.25 hMLH1(-)의 clone들이 hMLH1(+)인 경우 보다 유의하게 Taxol에 민감하였고(P=0.049), 2008 hMLH1(+)인 clone들은 hMLH1(-) clone보다 유의하게 Taxol에 민감하였다(P=0.003). 4. 2008과 2008/C13*5.25 세포주에서는 Topotecan에 대한 민감도에 차이가 없었고. 2008/C13*5.25 hMLH1(-)의 clone들이 hMLH1(+)보다 유의하지는 않았지만 Topotecan에 약간 민감하였고, 2008 세포주에서는 hMLH1(-) clone들이 hMLH1(+)보다 유의하게 Topotecan에 민감하였다(P=0.001). 또한 2008과 2008/C13*5.25 두 세포주에서 hMLH1(-)인 clone들은 cisplatin 내성에 관계없이 유의하게 Topotecan에 민감하였다(P=0.001). 5. BAT25, BAT26, BAT34 primer에 대한 2008 hMLH1(+), hMLH1(-) clone과 2008/C13*5.25 hMLH1(+), hMLH1(-) clone의 microsatellite instability 결과는 모두 정상의 allele 소견으로 microsatellite instability를 나타내지 않았다. 결론: 이상의 연구 결과로 미루어 난소암에서 DNA 부정합 보수 유전자의 변이와 Cisplatin의 약제내성 사이에는 뚜렷한 관련이 없어 보이고, 난소암에서 hMLH1의 소실이 있는 경우는 오히려 Taxol이나 Topotecan에 민감한 것으로 나타났으며, 이러한 결과는 난소암 치료에서 1차 및 2차 약제의 선택에 도움을 줄 것으로 사료된다. Objective: Ovarian cancer represents a relatively chemosensitive solid tumor, with responsiveness to a range of agents. Cisplatin is the mainstay of drug treatment and is one of the most active single agent. However, the overall outcome for patients remains unsatisfactory and the emergence of drug resistance is a major factor in treatment failure. Loss of DNA mismatch repair is a common finding in many types of sporadic cancer as well as in patients with hereditary nonpolyposis colon cancer. Cells that lack DNA mismatch repair are resistant to commonly used chemotherapeutic agents. Selection of cells for resistance to cisplatin, a well-recognized mutagen, could result in mutation in genes involved in DNA mismatch repair. Methods: This study evaluated the mutation of hMLH1 and hMSH2, and its relation to the Taxol and Topotecan chemosensitivity in the clones from the ovarian cancer cell line 2008 and cisplatin-resistant cell line 2008/ C13*5.25. Results: 1. Cells from 2008 and 2008/C13*5.25 expressed both hMLH1 and hMSH2 when analysed with immunoblotting. 2. Twenty two out of 100 single-cell clones from 2008 and 27 of clones from 2008/C13*5.25 expressed no hMLH1. hMSH2 was expressed in all clones. 3. There was no difference of Taxol chemosensitivity between 2008 and 2008/C13*5.25 cell lines. In the 2008/C13*5.25 cell line, the hMLH1-deficient clones were more sensitive to Taxol than the hMLH1-proficient clones(P=0.049), but in 2008 cell lines hMLH1-proficient clones were more sesitive to Taxol(P=0.003). 4. There was no difference in Topotecan chemosensitivity between 2008 and 2008/C13*5.25 cell lines. In the 2008/C13*5.25 cell line, the hMLH1- deficient clones were not more sensitive to Topotecan than the hMLH1-proficient clones. In the 2008 cell lines hMLH1-deficient clones were more sesitive to Topotecan(P=0.001). Overall, hMLH1-deficient clones from both 2008 and 2008/C13*5.25 cell lines were significantly more sensitive to Topotecan(P=0.001). 5. Microsatellite instability was not demonstrated in all 4 types of single-cell clones from 2008 and 2008/C13*5.25 cell lines. Conclusions: The present results indicate that there is no relation between mutation of mismatch repair gene and cisplatin resistance. But hMLH1-deficient ovarian cancer cells are more sensitive to Taxol or Topotecan in this study. The latter finding mandates the examination to assess the mutation of hMLH1 in tumor cells before treatment or at the time clinical resistance to cisplatin develops in ovarian cancer.

혈청 CA-125, 초음파 및 양전자방출단층촬영술을 통한 골반 종물의 감별진단

구자성 ( Ja Seong Koo ),김영태 ( Young Tae Kim ),김성훈 ( Sung Hoon Kim ),김재욱 ( Jae Wook Kim ),김재훈 ( Jae Hoon Kim ),박용원 ( Yong Won Park ),김복자 ( Bok Ja Kim ),남은지 ( Eun Ji Nam ),윤미진 ( Mi Jin Yun ) 대한산부인과학회 2005 Obstetrics & Gynecology Science Vol.48 No.8