CheckMATE 2: From the model to the limit

Dercks, Daniel,Desai, Nishita,Kim, Jong Soo,Rolbiecki, Krzysztof,Tattersall, Jamie,Weber, Torsten Elsevier 2017 Computer physics communications Vol.221 No.-

<P><B>Abstract</B></P> <P>We present the latest developments to the CheckMATE program that allows models of new physics to be easily tested against the recent LHC data. To achieve this goal, the core of CheckMATE now contains over 60 LHC analyses of which 12 are from the 13 TeV run. The main new feature is that CheckMATE 2 now integrates the Monte Carlo event generation via MadGraph5_aMC@NLO and Pythia 8. This allows users to go directly from a SLHA file or UFO model to the result of whether a model is allowed or not. In addition, the integration of the event generation leads to a significant increase in the speed of the program. Many other improvements have also been made, including the possibility to now combine signal regions to give a total likelihood for a model.</P> <P><B>Program summary</B></P> <P> <I>Program Title:</I> CheckMATE</P> <P> <I>Program Files doi:</I> http://dx.doi.org/10.17632/k4pnk5wrfm.1 </P> <P> <I>Licensing provisions:</I> GPLv3</P> <P> <I>Programming language:</I> C++, Python</P> <P> <I>External routines/libraries:</I> ROOT, Python, HepMC (optional) Pythia 8 (optional), Madgraph5_aMC@NLO (optional)</P> <P> <I>Subprograms used:</I> Delphes</P> <P> <I>Nature of problem:</I> The LHC experiments have performed a huge number of searches for new physics in the past few years. However the results can only be given for a few benchmark models out of the huge number that exist in the literature.</P> <P> <I>Solution method:</I> CheckMATE is a program that automatically calculates limits for new physics models. The original version required the user to generate Monte Carlo events themselves before CheckMATE could be run but the new version now integrates this step. The simplest output of CheckMATE is whether the model is ruled out at 95% CLs or not. However, more complicated statistical metrics are also available, including the combination of many signal regions.</P> <P> <I>Restrictions:</I> Only a subset of available experimental results have been implemented.</P> <P> <I>Additional comments:</I> </P> <P> <UL> <LI> CheckMATE is built upon the tools and hard work of many people. If CheckMATE is used in your publication it is extremely important that all of the following citations are included, <UL> <LI> Delphes 3 [1]. https://cp3.irmp.ucl.ac.be/projects/delphes </LI> <LI> FastJet [2,3]. http://fastjet.fr/ </LI> <LI> Anti- <SUB> k t </SUB> jet algorithm [4]. </LI> <LI> CL <SUB> S </SUB> prescription [5]. </LI> <LI> All experimental analyses that were used to set limits in the study and if the analysis was implemented by non- CheckMATE authors, the relevant implementation reference. </LI> <LI> MadGraph5_aMC@NLO [6] if it is used to calculate the hard matrix element from within CheckMATE. https://launchpad.net/mg5amcnlo </LI> <LI> Pythia 8.2 [7] if showering or matching is done from within CheckMATE. http://home.thep.lu.se/~torbjorn/Pythia.html </LI> <LI> The Monte Carlo event generator that was used if .hepmc or .lhe files were generated externally. </LI> <LI> In analyses that use the <SUB> m T 2 </SUB> kinematical discriminant [8,9] we use the mt2_bisect library [10]. We also include the M T 2 b ℓ and M T 2 W derivatives [11]. http://particle.physics.ucdavis.edu/hefti/projects/doku.php?id=wimpmass https://sites.google.com/a/ucdavis.edu/mass/ </LI> <LI> In analyses that use the <SUB> M C T </SUB> family of kinematical discriminants we use the MctLib library that includes the following variables, <SUB> M C T </SUB> [12], <SUB> M C T </SUB> corrected [13], <SUB> M C T </SUB> parallel and perpendicular [14]. https://mctlib.hepforge.org/ </LI> <LI> In analyses that use topness variable we use the topness library [15]. https://github.com/michaelgraesser/topness </LI> <LI> Super-Razor [16] in analyses that use this variable. </LI> </UL> </ce:para> </ce:list-item> </ce:list> </P> <P>[1] J. de Favereau et al. [DELPHES 3 Coll

결명자 종실의 볶음조건에 따른 향기성분 변화

김종국(Jong-Kuk Kim),허우덕(Woo-Derck Hawer),하재호(Jae-Ho Ha),문광덕(Kwang-Deok Moon),정신교(Shin-Kyo Chung) 한국식품과학회 1995 한국식품과학회지 Vol.27 No.5

한국 전통죽의 영양소에 관한 연구

윤숙자(Sook-Ja Yoon),허우덕(Woo-Derck Hawer) 한국식품영양과학회 2008 한국식품영양과학회지 Vol.37 No.7

죽의 1회분량 당 총 열량은 148.8(대추죽)~294.1 ㎉(잣죽)의 넓은 범위를 나타냈다. 음식별로 열량 함량을 보았을 때 잣죽이 294.1 ㎉로 KDRI 한끼 기준량의 33.3%를 제공하여 잣죽의 열량이 가장 높았으며, 팥죽(285 ㎉, 31.7%), 닭죽(249.5 ㎉, 27.7%), 호박죽(243.8 ㎉, 27.1%)의 순으로 열량이 높았다. 대추죽은 148.8 ㎉로 가장 열량이 낮았다. 죽류의 1회분량 당 탄수화물 함량은 23.0(닭죽)~52.1 g(팥죽)의 범위의 수준이었으며, 평균 34.7±9.1 g로 KDRI 한끼 탄수화물 권장량의 24.4%를 공급하였다. 죽류의 1회 분량 당 탄수화물 함량을 분석한 결과를 보았을 때 팥죽의 탄수화물 함량이 가장 많아 1회분량 당 탄수화물 함량이 52.1 g으로 KDRI 한끼 기준량에 36.7%를 제공하였으며, 다음으로 호박죽이 51.4 g으로 KDRI 한끼 기준량에 36.2%를 제공하였다. 1회분량 당 탄수화물 함량이 가장 작은 음식은 닭죽(23.0 g, 16.2%)으로 탄수화물 함량이 가장 낮았다. 음식별 탄수화물 영양밀도는 대추죽이 INQ 1.4로 가장 높아 다른 죽류보다 열량이 가장 낮은 반면 탄수화물 공급이 우수하였다. 그 다음으로 흰죽(INQ 1.3)과 호박죽(INQ 1.3) 순으로 탄수화물 영양밀도가 우수하였다. 반면 잣죽(INQ 0.6)과 닭죽(INQ 0.6)은 탄수화물 영양밀도가 낮아 다른 죽 종류보다 열량은 높은 반면 탄수화물의 함량이 낮았다. 죽류의 단백질함량은 2.3(흰죽)~22.3 g(닭죽)의 범위 수준으로, 평균 8.2±4.9 g로 KDRI 한끼 단백질 권장량의 25.6%를 공급하였다. 분석한 죽류 중 닭죽이 단백질 함량이 22.3±0.03 g으로 가장 높았고, KDRI 한끼 단백질 권장량에 69.7%로 팥죽 (12.6±0.14 g, 39.4%)과 콩죽(11.0±0.11 g, 34.4%) 등 두류를 첨가된 죽의 단백질 함량이 높았다. 단백질의 영양밀도가 가장 높은 음식 역시 닭죽(INQ 2.5)이 가장 높았고, 굴죽(INQ 1.5), 콩죽(INQ 1.3) 순으로 단백질 영양밀도가 우수하였고, 굴죽이 열량은 낮은 반면 단백질을 섭취할 수 있는 우수한 급원 음식임을 알 수 있다. 죽류의 지방 함량은 0.3(대추죽)~17.8 g(잣죽)의 범위였고, 평균 4.8±4.5 g로 KDRI 한끼 지방 권장량의 21.1%를 공급하였다. 분석한 죽 중 지방함량이 가장 높은 음식은 잣죽으로 지방 함량이 17.8±0.12g으로 가장 높았고, KDRI 한끼 지방 권장량에 77.4%이었다. 콩죽(9.0±1.0 g, 39.1%)과 닭죽(7.6±0.17 g, 33.0%)의 지방함량이 높았다. 죽류 중 1회 분량 당 지방 함량이 가장 낮은 음식은 대추죽(0.3±0.01 g)으로 KDRI 한끼 지방 권장량에 1.3%를 공급하였다. 지방의 영양밀도는 잣죽(INQ 2.4), 흑임자죽(INQ 1.5), 콩죽(INQ 1.5) 순으로 지방 영양밀도가 우수하였다. 본 연구 결과를 통해 얻어진 한국 전통죽의 영양소함량에 대한 자료가 국내외 한식당, 학교 및 산업체 급식등 단체급식장에서 널리 활용되어 한국전통음식의 보급이 확대되는 기틀이 되기를 기대한다. 또한, 한국음식의 영양 성분에 대한 평균적인 data를 도출하기 위해서는 보다 확장해서 연구하고, 이에 대한 영양정보 제공 등이 필요하다고 본다. This study was conducted to analyze 15 traditional Korean gruels for nutrient density using the Index of Nutrient Quality (INQ). The calorie of the gruels ranged from 148.8 (Daechujuk) to 294.1 kcal (Jatjuk) per serving size. The calorie in 'Jatjuk' was the highest, covering 33.3% of Dietary Reference Intakes for Koreans (KDRI) per meal. The carbohydrate content was between 23.0 g (Dakjuk) and 52.1 g (Patjuk) per serving size. The average content of carbohydrate in gruels was 34.7±9.1 g per serving size which covers 24.4% of KDRI per meal. Among the 15 gruels, Patjuk contained the highest carbohydrate content (52.1 g per serving size, 36.7% of KDRI per meal). The highest nutrient density (INQ) of carbohydrate in gruels was Dachujuk (INQ 1.4). The protein content of the gruels was between 2.3 (Huinjuk) and 22.3 g (Dakjuk) per serving size. The average content of protein in gruels was 25.6% of KDRI per meal. Dakjuk contained the highest protein content (8.2±4.9 g per serving size) and followed by Dakjuk (INQ 2.5), Guljuk (INQ 1.5) and Kongjuk (INQ 1.3) in nutrient density (INQ) of protein. The fat content of the gruels were between 0.3 (Daechujuk) and 17.8 g (Jatjuk) per serving size. The average content of fat in gruels was 17.8±0.12 g per serving size which showed 21.1% of KDRI per meal. Among the gruels, Jatjuk contained the highest fat (17.8±0.12 g per serving size, 77.4% of KDRI per meal). In order of the high nutrient density (INQ) of protein, Jatjuk (INQ 2.4) wasfollowed by Heugimjajuk (INQ 1.5) and Kongjuk (INQ 1.5).

깍두기의 발효숙성온도가 유리당, 유기산 및 향기성분에 미치는 영향

김성단(Sung-Dan Kim),허우덕(Woo-Derck Hawer),장명숙(Myung-Sook Jang) 한국식품영양과학회 1998 한국식품영양과학회지 Vol.27 No.1

깍두기의 발효숙성온도가 깍두기의 유리당, 유기산 및 향기성분에 미치는 영향을 알아본 결과는 다음과 같다. 20℃에서 12시간(A), 24시간(B), 36시간(C) 숙성시킨 후 4℃에서 발효숙성시킨 것, 10℃(D)에서 담금즉시부터 계속 발효숙성시킨 것, 실온(20℃, E)에서 담금즉시부터 계속 발효숙성시킨 것을 실험처리구로 하였다. 유리당은 초기 발효숙성 중 α-glucose, β-glucose, fructose, mannose, α-galactose, β-galactose, mannitol 순이었다. Mannitol은 전보(11)에서 관능검사 결과 맛이 좋아지는 시기에 증가하여, 초기 발효숙성온도가 높고 실온에서 숙성 시간이 긴 처리구 C가 증가시기가 빠르며 증가량이 많았다. 비휘발성 유기산은 발효숙성 초기에 lactic acid, oxalic acid, malonic acid, fumaric acid, levulinic acid, succinic acid, malic acid, citric acid, pyroglutamic acid가 발견되던 것이, 발효숙성 후기에는 lactic acid, succinic acid, pyroglutamic acid만이 잔존하였다. Lactic acid는 초기에 소량 존재하다가 관능검사결과 맛이 좋아지는 시기에 6~31배로 급상승하며, succinic acid 또한 발효가 진행됨에 따라 증가하였다. Malic acid는 담금 직후 55.1%로 가장 많은 비율을 차지하나, 관능검사결과 맛이 좋아지는 시기에 malic acid는 급격히 감소하며, 그 시기는 초기 발효숙성온도가 높고 실온에서 숙성 시간이 긴 C 처리구 일수록 빨라졌다. 휘발성 향기성분은 GC로 분석하여 약 60여개의 peak가 분리되었으며, 그 중 37개의 성분이 mass spectrometer(MS)로 확인되었는데, acetaldehyde, ethanol, allyl mercaptane, formic acid ethyl ester, methyl allyl sulfide, dimethyl disulfide, methyl allyl disulfide, diallyl disulfide 등이 많이 존재하였다. 특히 sulfide 계통의 변화가 두드러졌는데, 이들 중 dimethyl disulfide와 methyl allyl disulfide는 발효숙성온도가 낮고 시간이 짧을수록 많은 양이 생성되었고, methyl allyl sulfide는 관능적 특성 중 냄새(aroma)의 관능검사 결과와 높은 상관관계를 나타내었다. 따라서 본 실험의 조건에서는 발효 57일까지 적당한 발효상태를 유지하였던 처리구 A, B와 C 중에서 맛이 좋은 시기에 처리구 C가 유리당과 비휘발성 유기산의 함량이 다소 높게 나타나, 담금 즉시 20℃에서 36시간 숙성시킨 후 4℃에서 발효시키는 처리구 C가 다소 좋은 것으로 보여진다. 또한 mannitol, malic acid, methyl allyl sulfide를 발효 숙성의 지표물질로 삼을 수 있다고 생각된다. Effect of Fermentation temperature on the changes of chemical components in Kakdugi during fermentation was investigated by measuring free sugar, organic acid and volatile compounds up to 57 days at several temperatures. The mannitol was increased in palatable period in contrast with those of other free sugars. The higher the initial fermentation temperature was and the longer the initial fermentation time at 20℃ was, the faster the second increasing period was and the less the increasing contents was. Lactic acid was increased 6~31 times from a little amount at the initial period. The higher the initial fermentation temperature was and the longer the initial fermentation time at 20℃ was, the faster the increasing period was and the more the increasing content was. But malic acid which was abundant(55.1% of total nonvolatile organic acid) in the initial fermentation period was remarkably decreased in the palatable period. The change of the sulfides among the volatile compounds was remarkable. Methyl allyl sulfide which was a little in the initial fermentation period was remarkably increased in the final fermentation period, and the correlation coefficients between the content of methyl allyl sulfide and aroma in sensory evaluation were high. It could be suggested that the fermentation temperature should be set to 4℃ after fermentating at 20℃ for 36 hours in the view point of keeping the Kakdugi taste and quality well because of high content of free sugar and nonvolatile organic acids.

참기름의 진위판별에 있어서 지방산조성의 이용

황경철,허우덕,남영중,민병용 한국농화학회 1983 Applied Biological Chemistry (Appl Biol Chem) Vol.26 No.3

An attempt was made to use the fatty acid composition as a basis for the detection of sesame oil adulteration. The ratios of oleic to linoleic acid content(O/L ratios) In six kinds of sesame oil were in the range of 0.74∼0.91. Meanwhile, those of soybean, corn, rapeseed, and cottonseed oils were 0.41, 0.38, 1.05 and 0.29, respectively. The changes on the O/L ratio due to the adulteration up to 20% of with other oil were not noticeable. The adulteration with cottonseed and corn oils, identification was nearly impossible with O/L ratio alone. However, linolenic acid from soybean oil and erueic acid from rapeseed oil were good indication of the sesame oil adulteration. with these oils. The detection limits for adulteration in sesame oil were 5% for rapeseed oil and 10% for soybean oil. Application of this detection method on the 22 samples from market revealed the adultered sesame oil; five with rapeseed and 12 with soybean oil.

알긴산의 적정 에스테르화 조건

신동화,하재호,허우덕 한국수산학회 1987 한국수산과학회지 Vol.20 No.3

알긴산에 propylene oxide를 가하여 PGA를 제조할 때의 에스테르화 조건을 구하고 이때 제조한 제품의 이화학적인 특성을 조사하였다. 1. 알긴산에 대하여 propylene oxide을 4몰 가할 때까지 에스테르화가 증가하였으나 그 후는 큰 변화가 없었다. 2. 에스테르화가 잘 일어나는 알긴산의 함수량은 30% 이상이었으며 수분함량이 70% 이상인 경우는 제품의 탈수가 제대로 되지 않았으므로 수분함량을 30∼70%로 하는 것이 좋았다. 3. 구분함량이 44.15%인 알긴산에 대하여 propylene oxide를 4몰 가하고 1시간 동안 반응시켰을 때 반응이 최대로 일어나는 온도는 70℃이었다. 4. 수분함량이 50.05%인 알긴산에 propylene oxide를 4몰 가하고 70℃에서 반응시킬 때 반응시간 1시간까지 에스테르화율이 급격히 증가하였으나 그 후는 큰 차이가 없었다. 5. 2% 및 3% PGA 용액의 pH에 대한 안정성을 검토한 결과 pH 3.0까지 점도의 저하가 거의 없었고 그 이하에서는 감소하였으며, 1%, 2%, 3% 및 5%의 PGA 용액은 의가소성유체의 특성을 보였고 pH를 변화시킨 경우에도 의가소성유체의 특성은 유지되었다. Esterifying conditions to produce propylene glycol alginate (PGA) with alginic acid and propylene oxide were determined, and physico-chemical properties of the PGA were also determined. The rate of esterification increased with the content of propylene oxide up to 4 mole. Alginic acid containing 30% of water showed maximum esterification, however, it was difficult to remove the surplus moisture in the alginic acid when it cotained the moisture above 70%. Maximum esterification was taken place when alginic acid with 44.15% of water was reacted with 4mole of propylene oxide at 70℃. The rate of esterification of alginic acid with 50.05% of water increased up to 1 hour at 70℃, followed by no significant increase with reaction time. No significant decrease in the viscosity of 2-3% PGA solution occurred, up to pH 3.0. Pseudoplastic characteristics were kept in case of 1%, 2%, 3% and 5% of PGA solution in the pH of 1.0-5.0.

Aflatoxin B_1의 검출을 위한 효소면역측정법의 개발

손동화,박애란,서병철,김진철,이인원,남영중,허우덕 한국산업미생물학회 1992 한국미생물·생명공학회지 Vol.20 No.2

효소면역측정법에 의한 aflatoxin B_1(AFB_1)의 정량법을 개발하기 위하여, 항체를 생산 정제하여 분석법을 확립하고 직접법과 간접법(direct/indirect competitive ELISA)의 특성 및 문제점을 비교·검토하였다. Bovine serum albumin(BSA)을 carrier protein으로 한 AFB_1-1-(0-carboxymethyl)oxime-BSA를 토끼에 면역하여 항AFB_1항혈청을 생산하였다. 정량 침강반응에 의하여 항혈청으로부터 항BSA항체를 제거하고 황산암모늄 침전법 및 DEAE-Sephadex A-50 이온교환 크로마토그래피를 통하여 순도 높은 IgG항체를 정제하여 항AFB_l항체로 사용하였다. 이 항체는 2×10^6이상의 높은 항체가를 갖고 있었으며, AEB_1의 유사독소인 G_2, B_2, G_1에 대하여는 3∼34%의 낮은 교차반응성을 보여 특이성이 비교적 높았다. 직접법 및 간접법의 분석조건을 확립한 후, AFB_1 표준품에 대하여 작성한 표준곡선으로부터 각 방법에 의한 AFB_1의 검출농도는 각각 0.2∼20 및 1∼10,000 ng/㎖(ppb)로 나타나, 직접법이 간접법보다 검출농도의 범위는 좁으나 감도가 더 높았다. 직접법은 분석의 안정성, 간편성, 신속성 등의 면에서 간접법보다 실용화에 적합한 것으로 나타났다. In order to develop an enzyme-linked immunosorbent assay(ELISA) for detecting aflatoxin B_1(AFB_1), we produced and purified antibodies, thereafter established and evaluated methods of direct and indirect competitive ELISA. Anti-AFB_1 antisera, produced by immunizing rabbits with AFB_1-1-(0-carboxymethyl)oxime-bovine serum albumin conjugate(AFB_1-BSA), were removed of anti-BSA antibodies by quantitative precipitation reaction and further purified by ammonium sulfate precipitation and DEAE-Sephadex A-50 ion exchange chromatography. Purified IgG fractions were used as anti-AFB_1 antibodies. The antibodies, whose titer was determined extremely high above 2×10^6, showed low cross-reactivity of 3∼34% against AFB_1 analogues such as G2, B2, and Gl. From the standard curves of direct and indirect competitive ELISA for AFB_1, the detection ranges were found 0.2∼20 and 1∼10,000 ng/㎖(ppb) respectively. In their sensitivity, stability, simplicity, and rapidity, the direct method was more suitable than the indirect method for practical use.