법과학 현장시료에서 Yfiler^® PLUS PCR Amplification Kit의 민감도 연구

정주연,김경숙,박선화,임시근,이동섭,이양한,Jung, Ju Yeon,Kim, Kyoung Sook,Park, Sun Wha,Lim, Si Keun,Lee, Dong Sub,Lee, Yang Han 한국분석과학회 2016 분석과학 Vol.29 No.1

A variety of Y-STR analysis kits have been developed and used in the forensic field. Prior to the forensic application of a new kit, laboratory validation and sensitivity tests are essential processes in selecting suitable alternatives and for assuring that standard operating procedures are followed. In this paper, we have performed a sensitivity study of a new commercial kit, the Yfiler^® PLUS PCR Amplification Kit (Yfiler plus kit, released in 2014) by comparing it with the AmpF/STR^® Yfiler^TM PCR Amplification Kit (Yfiler kit, released in 2004). The Yfiler plus kit includes the 17 Y-STR loci of the Yfiler kit and has been supplemented with 10 new Y-STR loci. First, we analyzed the sensitivity difference between the two kits using commercial control DNA 2800M and 007. In addition, we compared the detection rate between the two kits from the 16 selected forensic casework samples of less than 0.5 ng concentrations. The results show that the sensitivity and detection rate of the Yfiler plus kit are higher than the corresponding rates of the Yfiler kit. In addition, we were able to obtain more Y-STR profiles with the use of the new kit. Thus, we suggest that Yfiler plus kit is a more effective forensic tool to detect Y-STR profiles from forensic casework samples of low concentrations. 법과학 분야에서 다양한 Y-STR 분석 키트가 개발되어 사용되고 있고, 새로운 키트의 법과학적 적용에 앞서 DNA 감정에 적절한 분석 키트들의 선정과 표준작업절차서의 작성을 위해 실험실 내의 내부적 유효성 검증 및 민감도 시험은 필수적인 과정이다. 본 논문에서는 새로운 상업용 키트인 Yfiler^® PLUS PCR Amplification Kit (Yfiler plus 키트, 2014년 출시)를 AmpF/STR^® Yfiler^TM PCR Amplification Kit (Yfiler 키트, 2004년 출시)와 비교함으로써 민감도에 대한 연구를 수행하였다. Yfiler plus 키트는 Yfiler 키트의 17 개 Y-STR 좌위를 포함하면서 새로운 10 개의 Y-STR 좌위가 추가되었다. 먼저, 표준 DNA 시료인 2800M, 007을 이용하여 두 키트 간의 민감도 차이를 분석하였고, 선별된 0.5 ng 미만의 법과학 현장시료 16 개로부터 검출률을 비교하였다. 그 결과, Yfiler 키트보다 Yfiler plus 키트가 높은 민감도와 검출률을 보였고, 더 많은 좌위에서 Y-STR 프로필을 얻을 수 있었다. 이러한 결과들로부터 낮은 농도의 법과학 현장시료에서 Yfiler plus 키트가 Y-STR 프로필을 검출하는데 더욱 효과적인 분석키트임이 확인되었다.

법과학 현장시료에서 Yfiler<SUP>®</SUP> PLUS PCR Amplification Kit의 민감도 연구

정주연(Ju Yeon Jung),김경숙(Kyoung Sook Kim),박선화(Sun Wha Park),임시근(Si Keun Lim),이동섭(Dong Sub Lee),이양한(Yang Han Lee) 한국분석과학회 2016 분석과학 Vol.29 No.1

미취학 아동을 위한 VR 교육 콘텐츠 개발 연구

정주연(Ju-Yeon Jung),김승채(Seung-Chae Kim),우탁(Tack Woo) 한국디지털콘텐츠학회 2022 한국디지털콘텐츠학회논문지 Vol.23 No.11

Todays children born after mid-2010 are very familiar with VR and can easily experience virtual environments anywhere. The education of todays preschoolers, who are the generation more familiar with VR than anyone else, needs to be provided with an advanced digital environment, but there are not many continuously usable VR educational contents that are actually distributed to children in early childhood. Therefore, for preschoolers who are accustomed to digital culture, a VR education program that breaks away from the existing analog method is needed. In this paper, a VR storybook was produced for preschool childrens reading education. Unlike existing VR programs, this storybook is designed with an emphasis on interaction and is expected to lead children to immerse themselves in reading.

폴리카보네이트 용융중합 초기의 촉매기반 에스터 교환반응 동력학

정주연(Ju Yeon Jung),이지목(Ji Mok Lee),홍성권(Sung Kwon Hong),이진국(Jin Kuk Lee),정현민(Hyun Min Jung),김용석(Yong Seok Kim) 한국고분자학회 2015 폴리머 Vol.39 No.2

본 연구에서는 디올 단량체로서 바이오 유래 isosorbide 및 bisphenol A가 적용된 폴리카보네이트의 단일 및 공중합체를 얻기 위한 촉매로서 LiOH, Cu(acac)2 및 n-butyltin hydroxide oxide hydrate를 각각 적용하여 용융중합 초기 단계에서 에스터 교환반응의 동력학 분석을 실시하여 촉매활성도를 비교하였다. 단일 중합의 경우, Cu(acac)2가 가장 큰 촉매활성도를 나타내었으나, 서로 다른 두 가지 디올 단량체가 적용된 용융 공중합의 경우에는 촉매의 적용 메커니즘 및 단량체의 화학구조에 의존하여 LiOH의 촉매활성이 가장 큼을 확인하였다. 이러한 연구결과는 최근 관심이 집중된 바이오 유래 친환경 폴리카보네이트용 촉매선정에 활용 가능함을 제시한다. In this work, we evaluated catalytic activity of LiOH, Cu(acac)2 and n-butyltin hydroxide oxide hydrate in the early stage of the melt transesterification of isosorbide and bisphenol A as diol monomers and diphenylcarbonate for the melt polymerizaiton of polycarbonate. Cu(acac)2 proved to be the most active catalyst for homopolymerization process, while the catalytic activity of LiOH was higher than the others in case of melt copolymerization depending on the catalytic mechanism and chemical structure of catalyst. We suggested that evaluation of catalytic activity can be used for selection of catalyst system in bio-based copolymerization of polycarbonate.

Genetic diversity of Panax species revealed by comparison of the entire intergenic regions of chloroplast genome and practical application of developed DNA markers

Ju-Yeon Jung(정주연),Jun Ha Kim,Nam-Hoon Kim,Hong-Il Choi,Jee Young Park,Jonghoon Lee,In-Ok Ahn,Tae-Jin Yang 고려인삼학회 2010 고려인삼학회 학술대회 Vol.2010 No.12

DNA 데이터베이스의 좌위 확장에 의한 해결 사례 보고

정주연(Jung, Ju Yeon),류가희(Ryu, Ga Hee),김주영(Kim, Joo Young),안으리(Ahn, Eu Ree),문서현(Moon, Seo Hyun),강필원(Kang, Pil Won),최동호(Choi, Dong Ho) 경찰대학 경찰학연구편집위원회 2020 경찰학연구 Vol.20 No.4

2010년 7월 제정된 「디엔에이신원확인정보의 이용 및 보호에 관한 법률」에 의해 구속피의자, 수형인 및 사건현장에서 확보된 DNA 신원확인정보 관리 목적의 데이터베이스가 구축되었다. 미국 FBI(Federal Bureau of Investigation)의 CODIS(Combined DNA Index System) 중심 좌위(Core loci)가 확장됨에 따라 대한민국의 DNA 데이터베이스 좌위도 2018년부터 13개에서 20개로 확장되었다. 본 논문에서는 2018년 1년간 의뢰된 구속피의자 DNA 프로필이 좌위 확장에 의해 DNA 데이터베이스 수록 기준에 도달한 현장증거물과 일치함으로써 사건 해결에 기여한 사례를 보고하고자 한다. 2018년 1년간 수록된 구속피의자 4,947건 중에 28건이 이러한 경우에 해당하였고, 이와 일치된 현장증거물의 약 86%가 미량(Low Copy Number, LCN) 시료인 접촉증거물로부터 검출된 것으로 분석되었다. 지속적으로 접촉증거물의 의뢰가 증가함에 따라 좌위 확장에 의한 해결 사례가 증가할 것으로 판단되었으며, 혼합된 DNA 프로필로부터 1인의 DNA 프로필 분리 가능성도 증가됨으로써 성범죄 등의 강력범죄 해결에도 도움이 될 것으로 사료되었다. Under the ‘Act on the Use and Protection of DNA Identification Information’ enacted in July 2010, a DNA identification database was constructed for the purpose of managing DNA information obtained from detained suspects (arrestees), prisoners, and crime scenes. As the Federal Bureau of Investigation (FBI) Combined DNA Index System (CODIS) core loci has expanded, the Korea DNA identification database loci have also expanded, from 13 to 20 in 2018. Here, we report the information that contributed to case resolution by matching arrestees to the DNA profile obtained from crime scene evidence, and the criteria was reached by loci expansion. Of the 4,947 arrestees whose DNA was uploaded in 2018, 28 cases were included. In addition, we found that approximately 86% of the crime scene evidence that corresponded to these cases were extracted from touched-evidence, which are low copy number (LCN) samples. As the number of requests for touched-evidence continues to increase, the number of cases that are resolved by loci expansion are expected to increase steadily as well. Furthermore, as the possibility of separating a single DNA profile from a mixture also increases, loci expansion will have additional utility in resolving violent crimes, including sex crimes, as well.

새로운 루미놀 기반 혈흔 탐지 시약이 디엔에이에 미치는 영향에 대한 연구

정주연(Ju Yeon Jung),오유리(Yu-Li Oh),이지원(Jee Won Lee),임승(Seung Lim),김정목(Jung-mok Kim),이양한(Yang Han Lee),임시근(Si-Keun Lim) 한국분석과학회 2018 분석과학 Vol.31 No.2

법과학 DNA 감정에서 접촉 감정물로부터 DNA 시료 탐지능 향상을 위한 4-Dimethylaminocinnamaldehyde 적용

정주연(Jung, Ju Yeon),임승(Lim, Seung),이민지(Lee, Minji),오복(Oh, Bok),오송이(Oh, Song Lee),강필원(Kang, Pil-Won),임시근(Lim, Si-Keun),김응수(Kim, Eungsoo) 경찰대학 경찰학연구편집위원회 2020 경찰학연구 Vol.20 No.3

본 연구에서는 접촉 감정물에 묻어있는 피부세포 혹은 땀과 소량의 타액 얼룩을 효율적으로 탐지하고자 잠재지문 현출 시약인 4-Dimethylaminocinnamaldehyde (DMAC)를 이용하였다. Ethyl acetate와 HFE-7100을 용매로 사용하여 0.01% DMAC solution을 제조하였다. DMAC solution을 타액 및 땀이 전사된 면봉에 처리 후 2시간 건조하여, 505 nm 출력파장의 법광원과 주황색 차폐필터로 관찰한 결과 생체시료의 탐지능이 향상되는 결과가 관찰되었다. 또한, 0.001~0.05%의 DMAC solution이 인체분비물(타액, 혈액 및 정액) 판정에 미치는 영향을 연구하였고, DMAC solution이 인체분비물 예비 및 확증검사에 영향을 미치지 않는 것으로 관찰되었다. 더불어 DMAC solution이 타액 DNA의 추출, 반응 시간에 의한 DNA 농도, 분해 지수 및 DNA 프로필 분석에 미치는 영향을 시험하였다. 비록 밀폐된 튜브에서 타액 시료와 DMAC solution을 1시간 반응시킨 군에서 DNA의 농도가 감소되었지만, DNA 분리와 DNA 프로필 분석에 안정적이었고, 모든 군에서 DNA 분해지수는 1 미만으로 검출되었다. 따라서, DMAC solution이 증거물에 반응하는 시간을 최소화하기 위해 적정량을 분사하고, 완벽히 건조하는 것이 DNA 수율에 중요한 요인이 될 것으로 사료되었다. 이러한 조건 하에, DMAC는 법과학 DNA 감정에서 LCN(Low copy number) 시료 채취에 매우 유용하게 사용될 수 있을 것으로 제안한다. In this study, 4-dimethylaminocinnamaldehyde (DMAC), often used to visualise latent fingerprints, was used to efficiently detect touch DNA and small amounts of saliva stains on evidence. Ethyl acetate and HFE-7100 were used as solvents to prepare a 0.01% DMAC solution. This solution was used to immerse a cotton swab that had been used to collect sweat and saliva, and then the swab was dried for 2 hours. We observed that fluorescence of the area that the biological samples had been collected from was increased under a forensic light source with an orange filter at an excitation wavelength of 505 nm. In addition, we studied the effect of 0.001 0.05% DMAC solutions on the identification of body fluids (saliva, blood, and semen), and we found that they did not affect preliminary and confirmatory tests. Furthermore, we tested whether DMAC solutions affected saliva DNA extraction, DNA concentration and degradation (by reaction time), and data analysis. Although the concentration of DNA was slightly decreased in tests where DMAC and the sample were reacted in a sealed tube for 1 hour, DMAC solutions were stable for DNA extraction and DNA profiling, and the degradation index was less than 1 in all groups. Therefore, in order to minimise the time that the evidence is exposed to DMAC solutions, it is likely that the proper amount of spraying, and a complete drying process would be important to maintain DNA yields. We suggest that DMAC could be very useful for collecting LCN (low copy number) samples in forensic DNA analysis.

폐암 억제유전자 RRM1의 단일염기다형성 검사를 위한 PCR-RFLP법과 Real-Time PCR법의 유용성 비교

정주연 ( Ju Yeon Jeong ),김미란 ( Mi Ran Kim ),손준광 ( Jun Gwang Son ),정종필 ( Jong Pil Jung ),오인재 ( In Jae Oh ),김규식 ( Kyu Sik Kim ),김영철 ( Young Chul Kim ) 대한결핵 및 호흡기학회 2007 Tuberculosis and Respiratory Diseases Vol.62 No.5

연구배경: 단일염기다형성(Single nucleotide polymorphism, SNP)은 인간의 유전자 서열 1000염기에 1개 빈도로 발견되어 인간은 대략 300만개의 유전자 다형성을 가지고 있다. 이 유전자 다형성의 조합결과로 인간의 개체 간 특성들이 결정되는 것으로 이해되고 있다. 이러한 다형성들의 조합양상에 따라 특이 질환에 대한 유전자 감수성 또한 달라지게 되므로 최근에는 많은 질환들과 유전자 다형성들과의 상관관계를 보는 연구들도 활발하게 진행되고 있다. 이러한 SNP분석은 큰 집단을 대상으로 진행되어지므로 적은 비용으로 정확하게 그리고 대용량으로 분석할 수 있는 방법이 필요하다. 방법: 대상 환자 89명의 genomic DNA를 가지고서 promotor상에 위치한 -37과 -524 염기부위에서 유전자 다형성을 보이는 것으로 보고되어져 있는 RRM1 (ribonucleotide reductase M1) 유전자를 대상으로 PCR-RFLP(polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism)와 real-time PCR(RT- PCR, TaqMan probe assay)을 동시에 시행한 후 각각의 결과를 비교 분석하였다. 결과: 대상 DNA 89예 중 -37에서는 2예(2.17%), -524에서는 15예(16.26%)가 서로 다른 양상을 보였다. 결과 차이를 보인 샘플 17예를 대상으로 직접 염기서열 분석을 시행하여 본 결과, 17예 모두 RT-PCR에서 확인되었던 결과와 일치함을 확인할 수 있었다. 추가 샘플 138예를 대상으로 RT-PCR을 2회 연속 실행하여 genotyping을 해 본 결과 98%이상의 높은 일치율을 보였으며, 그 중 10예를 무작위로 골라 직접 염기서열 분석을 시행하여 본 결과, 역시 100%일치, 높은 정확도를 보였고 이는 in-tube assay 방식으로 샘플의 오염을 최소화 할 수 있었으며 72 well based system(Corbett Research)을 이용함으로 1회 유전자 증폭반응을 통해 많은 검체를 한 번에 확인할 수 있어 매우 빠른 검사방법 이었다. 결론: 큰 집단을 대상으로 다량의 SNP를 분석하기 위한 실험 방법으로는 RT-PCR이 신속하면서도 정확한 결과를 얻을 수 있는 방법으로 사료된다. Background: Single nucleotide polymorphisms (SNPs), which consist of a substitution of a single nucleotide pair, are the most abundant form of genetic variations occurring with a frequency of approximately 1 per 1000 base pairs. SNPs by themselves do not cause disease but can predispose humans to disease, modify the extent or severity of the disease or influence the drug response and treatment efficacy. Single nucleotide polymorphisms (SNPs), particularly those within the regulatory regions of the genes often influence the expression levels and can modify the disease. Studies examining the associations between SNP and the disease outcome have provided valuable insight into the disease etiology and potential therapeutic intervention. Traditionally, the genotyping of SNPs has been carried out using polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism(PCR-RFLP), which is a low throughput technique not amenable for use in large-scale SNP studies. Recently, TaqMan real-time PCR chemistry was adapted for use in allelic discrimination assays. This study validated the accuracy and utility of real-time PCR technology for SNPs genotyping Methods: The SNPs in promoter sequence (-37 and -524) of lung cancer suppressor gene, RRM1 (ribonucleotide reductase M1 subunit) with the genomic DNA samples of 89 subjects were genotyped using both real-time PCR and PCR-RFLP. Results: The discordance rates were 2.2% (2 mismatches) in -37 and 16.3% (15 mismatches) in -524. Auto-direct sequencing of all the mismatched samples(17 cases) were in accord with the genotypes read by real-time PCR. In addition, 138 genomic DNAs were genotyped using real-time PCR in a duplicate manner (two separated assays). Ninety-eight percent of the samples showed concordance between the two assays. Conclusion: Real-time PCR allelic discrimination assays are amenable to high-throughput genotyping and overcome many of the problematic features associated with PCR-RFLP. (Tuberc Respir Dis 2007; 62: 406-416)

우리나라의 압화 현황과 발전방향

백진주(Jin-Ju Baek),박윤점(Yun-Jum Park),허북구(Buk-Gu Hue),정주연(Ju-Yeon Chung),이중기(Jung-Gi Lee),이미정(Mi-Jung Lee) 한국원예학회 2000 원예과학기술지 Vol.18 No.5