Fusarium 속내의 rDNA ITS region의 RFLP 분석

민병례,이영미 상명대학교 자연과학연구소 1998 自然科學硏究 Vol.5 No.-

Fusarium section Discolor와 Roseum에 속하는 8개의 균주간의 유전적 변이를 조사하기 위하여 rDNA의 ITS 부위를 PCR을 이용하여 증폭한 후에 16개의 제한효소를 처리하여, RFLP patterns를 분석하였다. PCR 생산물의 크기는 대략 560 - 610bp로 다양하게 나타났다. 사용한 제한효소 중에서 7개만이 조사된 균주에서 절단 부위를 가지고 있었다. EcoRI와 SphI으로 처리된 band pattern은 모든 strain에서 거의 같은 양상을 나타내었다. 그러나 AluI, MspI, HaeIII, PstI 그리고 SmaI으로 처리한 후 나타난 밴드 양상은 각 균주에서 서로 다른 patterns를 보여주었다. RFLP 분석의 결과에서, Fusarium 균주의 ITS 부분은 종간과 종내 변이를 나타내었다. To investigate the genetic variation among 8 strains belonged to Fusarium Section Discolor and Roseum, after the ITS regions of the rDNA were amplified using the PCR and digested with 16 restriction enzymes, RFLP patterns were analyzed. The size of PCR products varied approximately 560-610 bp. Among these restriction endonuclease tested, seven enzymes had restriction sites in the ITS region of Fusarium species. Band patterns digested with EcoRI and SphI appeared almost same in all straines, but those with AluI, MspI, HaeIII, PstI and SmaI showed different from each other. As the result of RFLP analysis, the ITS region of the Fusarium species showed intraand interspecific variation.

Rhizopus stolonifer에서 미토콘드리아 DNA의 제한효소 인지서열 비교

민병례 상명대학교 기초과학연구소 1997 기초과학연구 Vol.10 No.-

Mitochondrial DNA of Rhizopus stolonifer was isolated by fractionated mitochondria, and then digested with restriction enzymes, EcoRⅠ, HindⅢ, XbaⅠ, and PuuⅡ. As a results, 6 fragments by EcoRⅠ digestion, 11 by HindⅢ digestion, 8 by XbaⅠ digestion, 3 by PuuⅡ digestion were separated on 1% agarose gel electrophoresis. Using A HindⅡ digest marker and ΦX-174 HaeⅢ digest marker as the size marker, the size of mitochondria1 DNA might be estimated about 25 kb.

線蟲 捕獲菌類(Nematode-trapping Fungi)의 染色體에 關한 硏究

閔丙禮 상명대학교 논문집 1985 상명대학교논문집 Vol.15 No.-

Five species of nematode-trapping fungi belonged to 3 genus were cultured on corn meal agar and on PDYA medium for studying their nuclear behavior and for seizing the proper stage of chromosome count. The haploid chromosome number of these species are as follows; the number of 3 species (Arthrobotrys conoides, A. oligospora, and A. musiforms) are 8, the others are 10(Dactylaria brochopaga) and l2(Monacrosporium cystosporium), respectively. Up to the present studies, it is believed that the basic chromosome number of each genus are might be related in phylogeny.

Rhizopus 속내의 2종에 대한 단백질 분석

민병례,이주향 상명대학교 기초과학연구소 1996 기초과학연구 Vol.9 No.-

산업적, 공업적, 경제적, 의학적으로 중요한 균종중의 하나인 Rhizopus에 속하는 2 균종중 phylogeny상 유연관계가 상당히 먼 2종 R acidus 와 R. stolonifer를 택하여 이들의 유전자 발현 산물인 단백질 patterns을 관찰한 결과 SDS-PAGE로 분리한 단백질 patterns은 분자량 14,400 daltons에서 97,400 daltons사이에 30개 이상의 polypeptide bands를 볼 수 있었고, 2종간의 bands에서는 큰 차이를 볼 수 없었다. 등전점을 이용한 IEF-gel에서는 pH 3.5~10의 ampholine을 사용하였으나, 주로 pH6~pH8 사이에서 6~9개의 bands를 보았다. 전체적으로 R.stolonifer의 pH가 R.acidus의 pH보다 낮았는데, 이는 최적 생장 pH가 R.acidus가 더 높은 것과 일치하는 결과였다. The paper reports on soluble-protein patterns using SDS-PAGE and IEF-gel for two species, R, acidus and R stolonifer, in the genus Rhizopus. There are over 30 polypeptide bands ranged from molecular weight 14,400 ddtons to 97,400 daltons on SDS-PAGE and no obvious differences between two species. On IEF-gel using ampholine pH 3.5-10 as canier ampholytes, all of polypeptide bands are over pH 6, ranged from pH 6.5 to pH 7.9. Polypeptide bands of R. acidus are slightly more basic than in R. stolonifer. This result coincides with optimum pH of growth.

RAPD 분석을 이용한 Fusarium 속(Genus)내 13종간의 분류학적 위치 규명

민병례,류지숙 상명대학교 기초과학연구소 1998 기초과학연구 Vol.11 No.-

Fusarium 13종의 분류학적 위치를 규명하기 위하여 arbitrary decamer primers를 사용하여 polymerase chain reaction-random amplified polymorphic DNA (RAPD) 방법을 사용하여 유전적인 다양성을 조사하였고, 증폭된 DNA의 PCR band patterns를 기초로 하여 UPGMA 방법으로 dendrogram을 그려 각 종간의 유사도를 구하였다. 선별한 8개의 primer에서는 평균적으로 1-9개의 bands가 0.1-3.0kb의 범위에서 나타나는 양상을 보였다. 13종간의 계통 분류학적 유사도는 0.58-0.85 사이로 나타났고, 가장 높은 유사도는 0.85로 section Elegans에 속하는 F. oxysporum과 section Liseola에 속하는 F.subglutinans 간에서 관찰되었다. To clarify the taxonomical classification of the genus Fusarium 13 species, genetic variation among them was assessed by RAPD using 8 arbitrary decamer primers. Similarity values were calculated from PCR patterns and based on these values a dendrogram was constructed by UPGMA method. We confirmed that the use of the RAPD procedure make it possible to distinguish among different species. The range of genetic similarity value among selected 13 species is 0.58 - 0.85, and the highest clustered value was 0.85 between F. subglutinans and F. oxysporum, which were belonged to different section.

Nonsteroidal Antiinflammatory Drugs (NSAIDs)와 암예방

박민선,민병례,남명진 대한암예방학회 1999 Journal of cancer prevention Vol.4 No.4

남조분해 균류의 분리와 동정

최영길,민병례 한양대학교 자연과학연구소 2001 自然科學論文集 Vol.20 No.-

부영양화 수역의 4개 저수지로부터 곰팡이 12균주를 분리하였으며, 이들 분리 곰팡이들 중 남조류의 생장억제 능력이 우수한 HCLF-34와 HCLF-21을 왕송저수지로부터 분리하였다. 형태적인 특징에 따라 Penicillium sp.(HCLF-34)와 Acremonium sp.(HCLF-21)로 동정하였다. 두 개의 분리 곰팡이중 Penicillum sp.(HCLF-34)만이 Anabaena cylindrical lawn과 M.luteus agar p;ate에서 균체, 배양상등액 및 멸균된 배양상등액에서 plaque를 형성하였다. A.cylindrica와 Penicillium sp.(HCLF-34)의 혼합배양시 배양 3일 후 남조류의 분절 및 sheath의 손상이 관찰되었고, A.cylindrica와 Penicillium sp.(HCLF-34) 혼합배양시 배양 10분 후부터 남조류의 분절 및 sheath의 손상이 관찰되었다. The fungi that hydrolyze the blue green algae were isolated from Wangsong reservoir shown in eutrophication and identified as the genera Acremoniwm sp., and Penicillium sp. By morphological characters. The Penicillium. sp.generally showed less lytic activity than the Acremonium sp. on the Anabaena cylindrical agar lawn, but the cultured supermatant of Penicillium sp. Exhibited greater activity than those of the Acremonium sp. On Micrococcus luteus. In the mixed culture of bule green algae(Anabaena cylindrical) and the fungi(HCLF-34), the blue green algae was segmented and lysed in 3 days. In addition, the blue green algae(Anabaena cylindrical) was segmented and the width sheath of Anabaena cylindrical was appeared as lysed on the scanning electron microscopy, in mixed culture between the algae and fungi.

Rhizopus nigricans Ehrenberg의 Histones에 관한 연구

이은영,민병례 상명대학교 기초과학연구소 1989 기초과학연구 Vol.3 No.-

하등한 진핵생물인 Rhizopus nigricans Ehrenberg로 부터 basic chromosomal protein을 분리하여 고등한 진핵생물의 histones 과 비교하였다. 대수기의 균사체로부터 핵을 분리하였으며 sucrose density gradient centrifugation의 방법으로 purify하였다. Chromatin으로부터 basic protein의 추출을 위하여 0.2N HCl과 최종농도 0.4N의 H2SO4와 6부피의 acetone을 사용하였다. 15% acrylamide acetic acid-urea gel electrophoresis 결과 calf thymus histones과 동일한 mobility를 나타내는 4개의 band가 나타났다. Band Ⅰ protein은 다른 진핵생물의 histones처럼 heterogenetiy를 나타냈으며, Band Ⅱ와 Ⅲ는 calf thymus H2A, H2B 그리고 H3와 동일한 mobility를 보여주었다. Band Ⅳ 역시 calf thymus histone H4와 동일한 mobility를 나타내었다. 이러한 실험결과를 근거로 하여 볼때 Rhizopus nigricans는 고등 진핵생물과 매우 유사한 basic histone proteins을 포함하고 있다고 추정 할 수 있었다. From Rhizopus nigricuns Ehrenberg, the lower eukaryote, basic chromosomal proteins were isolated and compared with higher eukaryotic histones. Nuclei were isolated from mycelia at exponential stage and purified with low RCF and sucrose density gradient centrifugation. For the extraction of basic proteins from chromatin, 0.2N HCl, H₂SO₄, of which final concentration is 0.4N, and 6 volumes of acetone were used. As a results of 15% acrylamide acetic acid - urea gel electrophoresis of fungal basic proteins, there appeared 4 bands showing identical mobility to those of calf thymus histones. Band I protein exhibited heterogeneity as any other eukaryotes did. Band Ⅱ and m showed the patterns identical or similar to those of calf thymus histone H2A, H2B and H3. And the mobility of Band Ⅳ is identical to calf thymus histone H4. On the basis of the results obtained through this experiment, it may be stated that Rhizopus nigricuns contains basic histone proteins which are very similar to higher eukaryotic histones.

Rhizopus nigricans Histones 의 SDS-Polyacrylamide Gel Electrophoresis 에 의한 분리

이은영,민병례 상명대학교 기초과학연구소 1990 기초과학연구 Vol.4 No.-

Rhizopus nigricans의 균사체로부터 핵을 분리하고 핵내에 포함되어 있는 basic chromosomal proteins을 정제하였으며, 고등진핵생물 histones과의 유사성을 알아보기 위하여 sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophresis를 실시하였다. Proteins의 electrophoretic mobility와 분자량의 기준으로 calf thymus histones을 사용하였으며 그들이 가장 선명하게 분리되는 조건과 동일한 조건으로 R. nigricans로부터 분리한 proteins을 전기영동하였다. 그 결과, 균류중에서도 하등한 R. nigricans로부터 분리된 basic proteins이 고등진핵생물 histones의 5 fractions중 H2A, H2B, H3, H4와 mobility가 동일하거나 매우 유사한 basic histone proteins을 포함하는 것을 확인하였다. H1으로 간주되는 protein은 3개의 bands로 나타나 heterogeneity가 큰 것으로 사료되나 이를 확인할 수 있는 연구는 계속 진행되어야 할 것이다. Basic chromosomal proteins were purified from Rhizopus nigricans. Sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis was achieved to compare the similarity between purfied proteins and higher eukaryotic histones. Calf thymus histones were used as a standard for electrophoretic mobility and molecular weight of histones. Electrophoresis of proteins from R. nigricans was carried out with the same condition as standard can be separated clearly. On the basis of these comparisons, it appeared that ,R. nigricans contains basic histone proteins which are identical or very similar with higher eukaryotic histone H2A, H2B, H3 and H4. And the proteins regarded as H1 are thought to be very heterogeneous as any other eukaryotes. But heterogeneity of H1 is remained to be discussed.

자외선 살균효과에 미치는 옥수(玉水)와 옥분말(玉粉末)의 영향

최영길,민병례 한양대학교 자연과학연구소 2001 自然科學論文集 Vol.20 No.-

생체에 대한 옥수와 옥분말의 자외선 차단효과를 알아보기 위하여 동물의 피부 생태계와 연관있는 미생물들(Gram+, Gram-, 및 Eucaryotic yeast)을 대상으로 실험한 결과 다음과 같은 결과를 얻었다. 1.자외선 조사후 생존한 미생물 개체수의 측정결과로 분석해 볼 때 옥수첨가 액체배지에서 보다 옥분말 첨가 액체배지에서 자외선 차단효과가 높게 나타났다. 2.자외선 차단효과는 Escherichia coli, Saccharomyces cerevisiae, Bacillus subtilis의 배양체의 순으로 확인되었다. This experiment was designed to elucidate the effect of jade product (jade powder and jade water) on the sterilization by ultraviolet ray as the ecological model of animal skin. The microorganisms(Gram+, Gram-, and Eucaryote) which are closely related to animal skin were cultured in broth medium with jade powder and jade water, illuminated by ultraviolet ray to count viable number of microorganism, and evaluated the effect of jade product on the strength of ultraviolet ray. The results of this experiment are summarized as the followings. 1.The survival number of microbes illuminated by UV light were higher in the cultures of jade powder than those in the jade water, It could be evaluated that jade powder has an effect to interrupt the sterilization of UV light. 2.The sterilization by ultraviolet ray was decreased in order of the cultures as the Escherichia coli, Saccharomyces cerevisiae, and Bacillus subtilis.