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김재수,김민호,Kim, Jaisoo,Kim, Min-Ho 한국미생물학회 2019 미생물학회지 Vol.55 No.2
대부분의 만성창상(chronic wounds)은 생물막으로 인해 상처 치유시 염증단계를 지속시킨다. 생물막은 항생제(antibiotics)에 대한 저항성을 가지며 침투력을 저하시키고 살균제(biocides)에 대한 내성을 지니며 국소면역반응을 약화시킨다. 또한 생물막은 주변의 조직에 단단히 붙어 있어 제거하는 작업이 매우 어렵다. 그러므로 주변 조직을 손상시키지 않으면서 단단한 생물막을 제거하는 전략은 매우 중요하다. 그 중에 하나가 분산기작을 이용한 생물막의 해체이며 지금까지 많은 연구가 수행되어 왔다. 본 고찰논문에서는 특별히 화학주성, 파지요법, 다당류, 다양한 효소(당분해효소, 단백질분해효소, DNA 분해효소), 계면활성제, 분산신호, 자기유도인자, 조절인자, 억제제 등이 소개되었으며 더 나아가 항생제 치료 및 다른 치료와의 병행을 통한 병합요법도 소개되었다. 앞으로 본 논문에서 제시된 생물막의 분산기작의 지식을 이용하여 만성 창상 감염치료의 가능성이 더 높아지길 기대한다. Most chronic wounds persist in the inflammatory phase during wound healing due to the biofilm. Biofilms are resistant to antibiotics, weakening penetration, resistance to biocides and weakening local immune responses. The biofilm is firmly attached to the surrounding tissues and is very difficult to remove. Therefore, strategies to remove hard biofilms without damaging surrounding tissue are very important. One of possible strategies is dispersal. So many studies have been done to develop new strategies using dispersal mechanisms. In this review paper, especially chemotaxis, phage therapy, polysaccharides, various enzymes (glycosidases, proteases, and deoxyribonucleases), surfactants, dispersion signals, autoinducers, inhibitors were introduced. Combination therapies with other therapies such as antibiotic therapy were also introduced. It is expected that the possibility of treatment of chronic wound infection using the knowledge of the biofilm dispersal mechanisms presented in this paper will be higher.
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매립지 침출수로 오염된 지하수의 미생물 군집 구조 특성
김재수(Jaisoo KIM),윤다희(Da Hee YUN),이정희(Jung Hee LEE),조윤성(Yoon Sung CHO),이상돈(Sang Don LEE),조경숙(Kyung Suk CHO),고동찬(Dong Chan KOH),고경석(Kyung Seok KO) 한국생태공학회 2010 한국생태공학회지 Vol.1 No.1
The microbial community properties of groundwater samples contaminated with landfill leachate were examined by two methods: (1) Ecoplate including 31 sole carbon sources and (2) DGGE method using PCR (polymerase chain reaction) products of 16S rDNA. The samples were contaminated groundwater (KB01~03, KB05~09, KSG07, 11), uncontaminated ground water (KB10), leachate (LA), and treated leachate (NMW01). Average well color development (AWCD) analysis demonstrated that the potential activity on 31 substrates was highest in KB10, which was farthest (except KSG11) from the landfill and lowest in KB02 and KSG07, which were closest to the landfill. Principal component analysis (PCA) on similarity between samples did not show a specific grouping but NMW01 was much different from the others, coinciding with lack of nutrients probably due to treatment. Shannon index showed that the microbial diversities were similar among the samples, except KSG07 assuming high contamination. In the comparison of DGGE fingerprint patterns, the similarity was highest between KB05 and KB08 (53.8%), probably due to close site location and lowest between NMW01 and KB03 (10.0%), assumingly due to different contamination levels.
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실비아 그리스티안토,김재수,Kristyanto, Sylvia,Kim, Jaisoo The Microbiological Society of Korea 2016 미생물학회지 Vol.52 No.1
본 연구는 식물성플랑크톤의 대량증식 조절과 관련된 해양성 살조능이 있는 박테리아의 분리와 유해조류에 대한 분리 균주의 살조능 특성에 주로 초점을 맞추고 있다. 해수 표면에서 자연적으로 발생하는 유해조류번성(HAB)은 전세계적으로 많은 환경문제를 일으키고 있다. 본 연구에서는 유해조류 성장을 억제하는 능력을 가진 40개의 박테리아 균주를 마산만, 진해만, 돌섬, 거제도, 통영 앞바다에서 분리하였다. 분리된 균주들은 다양한 유해조류인 Cochlodinium polykrikoides, Chattonella marina, Skeletonema costatum, Heterosigma akashiwo, Heterocapsa triquetra, Prorocentrum minimum, Scrippsiella trochoidea에 대한 살조특성을 추가로 조사하였다. 살조균주의 선별은 이중층 아가배지와 현미경 계수법을 이용하여 진행하였고 Pseudomonas, Vibrio, Bacillus, Pseudoalteromonas, Ruegeria, Joostella, Marinomonas, Stakelama, Porphyrobacter, Albirhodobacter의 속들에 속하는 균주들이었다. 가장 중요한 유해조류인 Co. polykrikoides에 대한 가장 강력한 살조능은 10% 배양상등액으로 6시간 처리했을 때 94%를 보이는 균주였다. 이 연구를 통해 살조효과를 보이는 새로운 속으로 Marinomonas sp. M Jin 1-8, Stakelama sp. ZB Yeonmyeong 1-11 & 1-13, Porphyrobacter sp. M Yeonmyeong 2-22, Albirhodobacter sp. 6-R Jin 6-1를 새롭게 찾았다. 결론적으로 이들 해양박테리아를 이용하면 식물성플랑크톤 번성을 제어하는데 중요한 역할을 할 것으로 예상된다. This study mainly focused on isolation of marine algicidal bacteria associated with phytoplankton blooms and characterization of algicidal activity against harmful algae. Harmful algal blooms (HABs) found naturally in surface waters have caused many environmental problems worldwide. In this study, forty bacterial strains that have capability of inhibiting harmful algal growth were isolated from Masan Bay, Jinhae Bay, Dol Island, Jangmok Bay, and the Tongyeong Sea, Republic of Korea. The bacteria were screened furthermore for the characteristics on algicidal activities against Cochlodinium polykrikoides, Chattonella marina, Skeletonema costatum, Heterosigma akashiwo, Heterocapsa triquetra, Prorocentrum minimum, and Scrippsiella trochoidea. As a result, the algicidal bacteria that were screened from double over layer agar and microscopic counts tests belonged to genera Pseudomonas, Vibrio, Bacillus, Pseudoalteromonas, Ruegeria, Joostella, Marinomonas, Stakelama, Porphyrobacter, and Albirhodobacter. One of the most important HAB species is Co. polykrikoides and the strongest algicidal activity against the dinoflagellate was 94.00% after 6 h treatment with 10% bacterial culture filtrate. In this study, Marinomonas sp. M Jin 1-8, Stakelama sp. ZB Yeonmyeong 1-11 & 1-13, Porphyrobacter sp. M Yeonmyeong 2-22, and Albirhodobacter sp. 6-R Jin 6-1 were found to be as new genera of bacteria having anti-algal activity. These results suggest that these bacteria might play an important role in controlling phytoplankton blooms.
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