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Sorangium cellulosum 균주들의 에포틸론 생합성 유전자 보존
현혜숙,윤진권,조경연,Hyun, Hye-Sook,Youn, Jin-Kwon,Cho, Kung-Yun 한국미생물학회 2011 미생물학회지 Vol.47 No.2
국내에서 분리된 에포틸론 생산 점액세균 Sorangium cellulosum KYC3013의 에포틸론 생합성 유전자군(epoA~F, epoK)을 클로닝하였다. 이 유전자들이 암호화하고 있는 단백질들의 아미노산 서열을 다른 대륙 또는 나라에서 분리된 S. cellulosum SMP44, S. cellulosum So ce90, S. cellulosum So0157-2의 단백질들과 비교한 결과 서로 97.4-99.8% 동일하였다. 이러한 결과는 에포틸론 생합성 유전자들이 S. cellulosum 균주들 사이에서 잘 보존되어 있음을 보여주었다. The epothilone biosynthetic gene cluster (epoA~F, epoK) of Sorangium cellulosum KYC3013, an epothilone producing myxobacterium isolated in Korea, was cloned. When the amino acid sequences of the encoded proteins were compared with those from S. cellulosum SMP44, S. cellulosum So ce90, and S. cellulosum So0157-2, which were isolated in other continents or country, the proteins from different strains were 97.4-99.8% identical each other. This suggested that the epothilone-biosynthetic gene clusters are well conserved in S. cellulosum strains.
Corallococcus와 Myxococcus 속 점액세균 균주들에 의한 항균 물질의 생산
신혜진 ( Hye Jin Shin ),윤진권 ( Jin Kwon Youn ),안동주 ( Dong Ju An ),조경연 ( Kyung Yun Cho ) 한국미생물생명공학회(구 한국산업미생물학회) 2013 한국미생물·생명공학회지 Vol.41 No.1
국내 토양시료에서 분리한 174 Corallococcus 속 균주와 207 Myxococcus 속 균주들의 배양추출물을 제조하고 Candida albicans, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus에 대한 항균 활성을 비교하였다. 항진균 활성을 보이는 균주의 비율은 Corallococcus가 7.5%(174균주 중 13균주)로 51.7%(207균주 중 107균주)를 보인 Myxococcus에 비해 낮았다. 하지만, 항세균 활성을 보인 균주의 비율은 Corallococcus가 12.1%(21균주)로 1%(2균주)를 보인 Myxococcus에 비해 상대적으로 높았다. Corallococcus 균주 중 P. aeruginosa, S. aureus에 모두 활성을 보이는 6 C. coralloides 균주들은 자실체 형성에서는 차이를 보였지만 항세균 활성을 나타내는 배양추출물의 HPLC 크로마토그램은 유사하였는데, 이들이 생산하는 항세균 물질의 생산은 CYS 배지에서 6일 이상 배양할 때 가장 높았다. We prepared culture extracts of 174 Corallococcus and 207 Myxococcus strains isolated in Korea, and compared their antimicrobial activity against Candida albicans, Pseudomonas aeruginosa, and Staphylococcus aureus. The percentage of strains showing antifungal activity was lower in Corallococcus (7.5% [13 of the 174 strains]) than in Myxococcus (51.7% [107 of the 207 strains]). However, the percentage of strains exhibiting antibacterial activity was higher in Corallococcus (12.1% [21 strains]) than in Myxococcus (1% [2 strains]). The culture extracts of 6 Corallococcus strains inhibited both P. aeruginosa and S. aureus and displayed similar high-performance liquid chromatography chromatograms, although the shapes of their fruiting bodies were dissimilar. The rate of production of antibacterial substances was the highest when the strains were cultured in CYS medium for more than 6 days.
Cellulase 유전자 염기서열에 기초한 Sorangium cellulosum 균주들의 계통분류
이한빛 ( Han Bit Lee ),윤진권 ( Jin Kwon Youn ),조경연 ( Kyung Yun Cho ) 한국미생물생명공학회(구 한국산업미생물학회) 2011 한국미생물·생명공학회지 Vol.39 No.1
두 개의 cellulase 유전자 xynB1, bglA2과 groEL1 유전자 염기서열에 기초하여 국내에서 분리한 34균주의 Sorangium cellulosum 균주들을 계통 분석한 결과, 점액세균 중 가장 많은 생리활성물질이 발견된 종인 S. cellulosum 내에는 최소한 5그룹의 소그룹이 존재함을 보였다. 이 분석은 또한 S.cellulosum 균주들의 다양성을 보여주어 분석한 34균주 중 30균주가 서로 다른 균주인 것으로 나타났다. Phylogenetic analysis of two cellulase genes, xynB1 and bglA2, and the groEL1 gene from 34 Sorangium cellulosum strains isolated in Korea suggested that there are at least five subgroups in S. ellulosum, which is the most proficient producer of secondary metabolites among myxobacteria. This analysis also revealed diversity among the isolated S. cellulosum. It appeared that at least 30 out of 34 strains are different each other.
셀룰로오스 분해성 점액세균 Sorangium cellulosum의 분리
현혜숙,정진우,이한빛,윤진권,이차율,김도희,조경연,Hyun, Hye-Sook,Chung, Jin-Woo,Lee, Han-Bit,Youn, Jin-Kwon,Lee, Cha-Yul,Kim, Do-Hee,Cho, Kyung-Yun 한국미생물학회 2009 미생물학회지 Vol.45 No.1
한국의 여러 지역에서 채취한 토양으로부터 셀룰로오스를 유일한 탄소원으로 이용하여 자라는 591균주의 점액 세균을 순수 분리하였다. 세포, 집락, 그리고 자실체의 모양과 같은 형태적인 특징과 16S rRNA 염기서열은 이들 균주들이 모두 Sorangium cellulosum임을 나타내었다. 그리고 생리활성조사는 114균주 중 최소한 20균주가 Candida albicans의 성장을 저해하는 항진균물질을 생산함을 보여주었다. 591 strains of myxobacteria that grew on cellulose as a sole carbon source were isolated from soils collected from various locations in Korea. Morphological characteristics such as the shape of cells, colonies and fruiting bodies and 16S rRNA sequences of the isolates suggested that all the isolates are Sorangium cellulosum. An antifungal assay has indicated that at least 20 strains among the 114 isolates tested produce antifungal substances inhibiting growth of Candida albicans.