Establishment of a Binding Assay System for Screening of the Inhibitors of $p56^{lck}$ SH2 Domain

Kim, Jyn-Ho,Hur, Eun-Mi,Yun, Yung-Dae Korean Society for Biochemistry and Molecular Biol 1998 Journal of biochemistry and molecular biology Vol.31 No.4

Src-Homology 2 (SH2) domains have a capacity to bind phosphotyrosine-containing sequence context and play essential roles in various cellular signaling pathways. Due to the specific nature of the binding between SH2 domains and their counterpart proteins, inhibitors of SID domain binding have drawn extensive attention as a potential candidate for therapeutic agents. Here, we describe the binding assay system to screen for the ligands or blockers of the SH2 domains with an emphasis on the $p56^{lck}$ SH2 domain. In our assay system, SID domains expressed and purified as fusion proteins to Glutathione-S-transferase (GST) were covalently attached to 96-well microtitre plates through amide bond formation, which were subsequently allowed to bind the biotinylated phosphotyrosine (pY)containing synthetic pep tides. The binding of biotinylated pY peptides was detected by the horseradish peroxidase (HRP)-conjugated streptavidin. Using the various combinations of SH2 domain-pY peptides, we observed that: (1) The binding of pY-peptides to its counterpart SH2 domain is concentration-dependent and saturable; (2) The binding is highly specific for a particular combination of SH2 domain-pY peptide pair; and (3) The binding of Lck SH2-cognate pY-peptides is specifically competed by the nonbiotinylated peptides with expected relative affinity. These results indicate that the established assay system detects the SH2-pY peptide interaction with reproducible sensitivity and specificity and is suitable for screening the specific inhibitors of $p56^{lck}$ SH2 function.

데이터 스트림 저장을 위한 순환버퍼 기법

신재진 ( Jae-jyn Shin ),유병섭 ( Byeong-seob You ),어상훈 ( Sang-hun Eo ),이동욱 ( Dong-wook Lee ),배해영 ( Hea-young Bae ) 한국정보처리학회 2007 한국정보처리학회 학술대회논문집 Vol.14 No.1

본 논문은 데이터 스트림의 저장을 위한 순환버퍼 기법을 제안한다. 빠르고 많은 입력을 가지는 데이터 스트림의 처리를 위해 DSMS(Data Stream Management System)란 새로운 시스템에 대한 연구가 활발히 진행되고 있다. 현재 입력되고 있는 데이터 스트림과 과거에 발생했던 데이터 스트림을 동시에 검색하는 하이브리드 질의를 위해서는 데이터 스트림이 디스크에 저장되어야 한다. 그러나 데이터 스트림의 빠른 입력 속도와 메모리와 디스크 공간의 한계 때문에 저장된 데이터 스트림에 대한 질의보다는, 현재 입력되고 있는 데이터 스트림에 대한 질의에 대한 연구들이 주로 이루어졌다. 본 논문에서는 제안하는 순환버퍼는 데이터 스트림의 입력과 출력을 비동기적으로 빠르게 실행할 수 있다. 또한 입력되는 네트워크 패킷의 감소와 출력 시 디스크 I/O의 감소를 위하여 순환버퍼에서는 데이터 스트림의 묶음 단위로 입출력이 진행된다. 실험을 통하여 기술이 대량으로 입력되는 데이터 스트림을 빠르게 저장시킬 수 있다는 것을 보인다.

하이브리드 질의를 위한 데이터 스트림 저장 기술

신재진(Jae-Jyn Shin),유병섭(Byeong-Seob You),어상훈(Sang-Hun Eo),이동욱(Dong-Wook Lee),배해영(Hae-Young Bae) 한국멀티미디어학회 2007 멀티미디어학회논문지 Vol.10 No.11

본 논문은 데이터 스트림의 하이브리드 질의를 위한 빠른 저장 방법을 제안한다. 빠르고 많은 입력을 가지는 데이터 스트림의 처리를 위해 DSMS(Data Stream Management System)란 새로운 시스템에 대한 연구가 활발히 진행되고 있다. 현재 입력되고 있는 데이터 스트림과 과거에 발생했던 데이터 스트림를 동시에 검색하는 하이브리드 질의를 위해서는 데이터 스트림이 디스크에 저장되어져야 한다. 그러나 데이터 스트림의 빠른 입력 속도와 메모리와 디스크 공간의 한계 때문에 저장된 데이터 스트림에 대한 질의보다는, 현재 입력되고 있는 데이터 스트림에 대한 질의에 대한 연구들이 주로 이루어졌다. 본 논문에서는 데이터 스트림의 입력을 받을 때 순환버퍼를 이용하여 메모리 이용률을 최대화하고 블록킹 없는 데이터 스트림의 입력을 가능하게 한다. 또한 최대한 많은 양의 데이터를 디스크에 저장하기 위하여 디스크에 있는 데이터를 압축한다. 실험을 통하여 제안되는 기술이 대량으로 입력되는 데이터 스트림을 빠르게 저장시킬 수 있다는 것을 보인다. This paper proposes fast storage techniques for hybrid query of data streams. DSMS(Data Stream Management System) have been researched for processing data streams that have busting income. To process hybrid query that retrieve both current incoming data streams and past data streams data streams have to be stored into disk. But due to fast input speed of data stream and memory and disk space limitation, the main research is not about querying to stored data streams but about querying to current incoming data streams. Proposed techniques of this paper use circular buffer for maximizing memory utility and for make non blocking insertion possible. Data in a disk is compressed to maximize the number of data in the disk. Through experiences, proposed technique show that bursting insertion is stored fast.

외국인 근로자 고용제도와 한국어 교육의 과제

최혜진 ( Hye Jyn Choi ) 한말연구학회 2009 한말연구 Vol.- No.25

顔面外傷에 隨伴되는 急激한 視力喪失

Ann Jye Jyn(安宰瑨),Chang Se Hong(張世洪) 대한구강악안면외과학회 1982 대한구강악안면외과학회지 Vol.8 No.1

Blindness following blunt facial trauma may occur without overt damage to the eye. In most cases the optic nerve is injured at the optic canal level and the optic atrophy ensus 4 or 6 Wks. afterwards. This article deals with our experience in observing 3 patients who had sudden visual loss following frontal head and facial trauma. The literatures were reviewed to describe the cause of the posttraumatic indirect optic injury and the treatment as well as the megadose corticosteroids therapy which was suggested to be effective in reversing blindness.

RSP-DS: 데이터 스트림에서의 실시간 순차 패턴 분석

신재진(Jae-Jyn Shin),김호석(Ho-Seok Kim),김경배(Kyoung-Bae Kim),배해영(Hae-Young Bae) 한국멀티미디어학회 2006 멀티미디어학회논문지 Vol.9 No.9

데이터 스트림에 대한 기존의 패턴 분석 알고리즘은 대부분 속도 향상과 효율적인 메모리 사용에 대하여 연구되어 왔다. 그러나 기존의 연구들은 새로운 패턴을 가진 데이터 스트림이 입력되었을 경우, 이 전에 분석된 패턴을 버리고 다시 패턴을 분석하여야 한다. 이러한 방법은 데이터의 실시간적인 패턴 분석을 필요로 하는 실제 환경에서는 많은 속도와 계산 비용이 소모된다. 본 논문에서는 끊임없이 입력되는 데이터 스트림의 패턴을 실시간으로 분석하는 방법을 제안한다. 이 것은 먼저 빠르게 패턴을 분석하고 그 다음부터는 이전에 분석된 패턴을 효율적으로 갱신하여 실시간적인 패턴을 얻어내는 방법이다. 데이터 스트림이 입력되면 시간 기반 윈도우로 나누어 여러 개의 순차들을 생성한다. 그리고 생성된 순차들의 정보는 해시 테이블에 입력되어 정해진 개수의 순차가 해시 테이블에 채워질 때마다 해시 테이블에서 패턴을 분석해 낸다. 이렇게 분석된 패턴은 패턴 트리를 형성하게 되고, 이 후에 새로 분석된 패턴들은 이 패턴 트리 안의 패턴 별로 갱신하여 현재 패턴을 유지하게 된다. 새로운 패턴 추가를 위해 패턴을 분석할 때 이전에 이미 발견된 패턴이 Suffix로 나올 수 있다. 그러면 패턴 트리에서 이 전 패턴으로의 포인터를 생성하여 중복되는 패턴 분석으로 인한 계산 시간의 낭비를 방지한다. 그리고 FIFO방법을 사용하여 오랫동안 입력이 안 된 패턴을 손쉽게 제거한다. 패턴이 조금씩 바뀌는 데이터 스트림 환경에서 RSP-DS가 기존의 알고리즘보다 우수하다는 것을 성능 평가를 통하여 증명하였다. 또한 패턴 분석을 수행할 데이터 순차의 개수와 자주 등장하는 데이터를 판별하는 기준을 조절하여 성능의 변화를 살펴보았다. Existed pattern analysis algorithms in data streams environment have researched performance improvement and effective memory usage. But when new data streams come, existed pattern analysis algorithms have to analyze patterns again and have to generate pattern tree again. This approach needs many calculations in real situation that needs real time pattern analysis. This paper proposes a method that continuously analyzes patterns of incoming data streams in real time. This method analyzes patterns fast, and thereafter obtains real time patterns by updating previously analyzed patterns. The incoming data streams are divided into several sequences based on time based window. Informations of the sequences are inputted into a hash table. When the number of the sequences are over predefined bound, patterns are analyzed from the hash table. The patterns form a pattern tree, and later created new patterns update the pattern tree. In this way, real time patterns are always maintained in the pattern tree. During pattern analysis, suffixes of both new pattern and existed pattern in the tree can be same. Then a pointer is created from the new pattern to the existed pattern. This method reduce calculation time during duplicated pattern analysis. And old patterns in the tree are deleted easily by FIFO method. The advantage of our algorithm is proved by performance comparison with existed method, MILE, in a condition that pattern is changed continuously. And we look around performance variation by changing several variable in the algorithm.

일부 지역 여성들의 일반적 특성에 따른 피부관리실 이용 실태 및 만족도에 관한 연구

손현진 ( Hyun Jyn Son ),김주덕 ( Ju Duck Kim ),김은주 ( Eun Ju Kim ) 한국미용학회 2009 한국미용학회지 Vol.15 No.1

The purpose of this study was to analyze their sociodemographic characteristics and skin conditions, determine actual profile of skin care conditions in female customer group, and analyze possible correlations among their preference for skin care, consumers` sentiment and customer satisfaction, so that it could obtain useful data for domestic skin care industry. The results of this study can be outlined as follows: First, for general sociodemographic characteristics of our respondents, it was found that most of them belonged to married housewife group at age 30-39 and graduated from 4-year university course. And 27% respondents answered that their monthly household income ranged from ￦ 2 to 3 million. Second, overall, our respondents didn`t have so much good skin and physical health conditions. 34.6% respondents belonged to dry skin type and 41.6% respondents had skin problems like wrinkle and lower elasticity. It was found that most respondents had many interests in skin care and relied on skin care service for ca. 1-1 hour 30 minutes once a week at the cost of ￦ 50,000 to 70,000. Third, it was found that most respondents obtained information on skin care shop from their friends or family members, and 58.2% respondents had experiences in using skin care services. Most respondents relied on skin care shop for their skin beauty and preferred meridian massage for healthcare more than anything else, but didn`t show so high intentions to keep relying on skin care shop due to financial limitation. Forth, it was found that most of our respondents valued skin trouble improvement for customer satisfaction, but were dissatisfied with service cost. Their turnover to other shops came primarily from push marketing of beauty care products and the unfledged professionalism of skin care staffs, while most of our respondents wanted lasting care and skin care counseling as a part of after-sales services.

고려인 신문 《레닌기치》의 어휘 소개란 「독자사전」 연구

최혜진(Choi, Hye Jyn) 한국학중앙연구원 2021 한국학 Vol.44 No.3

Computer Software Reliability - Software Engineering

박용운(Park Yong Jyn) 한국정보과학회 1979 정보과학회논문지 Vol.6 No.1

Establishment of a Binding Assay System for Screening of the Inhibitors of p56lck SH2 Domain

Hur, Eun Mi,Kim, Jyn Ho,Yun, Yung Dae 생화학분자생물학회 1999 BMB Reports Vol.31 No.4

Src-Homology 2 (SH2) domains have a capacity to bind phosphotyrosine-containing sequence context and play essential roles in various cellular signaling pathways. Due to the specific nature of the binding between SH2 domains and their counterpart proteins, inhibitors of SH2 domain binding have drawn extensive attention as a potential candidate for therapeutic agents. Here, we describe the binding assay system to screen for the ligands or blockers of the SH2 domains with an emphasis on the p56^(lck) SH2 domain. In our assay system, SH2 domains expressed and purified as fusion proteins to Glutathione-S-transferase (GST) were covalently attached to 96-well microtitre plates through amide bond formation, which were subsequently allowed to bind the biotinylated phosphotyrosine (pY)-containing synthetic peptides. The binding of biotinylated pY peptides was detected by the horseradish peroxidase (HRP)-conjugated streptavidin. Using the various combinations of SH2 domain-pY peptides, we observed that: (1) The binding of pY-peptides to its counterpart SH2 domain is concentration-dependent and saturable; (2) The binding is highly specific for a particular combination of SH2 domain-pY peptide pair; and (3) The binding of Lck SH2-cognate pY peptides is specifically competed by the nonbiotinylated peptides with expected relative affinity. These results indicate that the established assay system detects the SH2-pY peptide interaction with reproducible sensitivity and specificity and is suitable for screening the specific inhibitors of p56^(lck) SH2 function.