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- 저자 : 이학진(Lee Hak Jin) (검색결과 11 건)
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ErmSF에서 특이적으로 발견되는 N-terminal End Region의 점차적인 제거에 의한 활성에 중요한 아미노산의 규명
이학진,진형종,Lee Hak Jin,Jin Hyung Jong 한국미생물학회 2004 미생물학회지 Vol.40 No.4
ErmSF는 235 rRNA에 존재하는 $A_{2058}$에 이중메틸화(dimethylation)시킴으로써 항생제가 부착되는 것을 억제하여 미생물에게 MLS (macrolide-lincosamide-streptogramin B)항생제에 대하여 내성을 나타내게 하는 ERM계열 단백질(Erm family protein)중의 하나이다. 다른 ERM 단백질과는 달리 ErmSF는 상당히 긴 N-말단부위 (N-terminal end region, NTER)를 가지고 있고 이겻은 RNA와 잘 결합하는 것으로 알려진 arginine이 약 $25\%$를 구성 하고 있다. ErmSF로부터 점차적으로 NTER을 절단하면서 절단된 단백질의 활성을in vivo에서 검색하였다. 다른 변이단백질과는 달리 R60번째까지 제거된 변이단백질은 활성이 많이 소실된 것을 in vivo상에서 관찰하였다. 이 단백질을 대량생산하여 정제하고 in vivo상에서 그 활성을 검색한 결과 wild type 단백질에 비해 약 $98\%$의 활성이 소실된 것을 밝혔다. 이러한 사실은 R60이 메틸화되는 아데닌 (methylatable adenine)의 근처에 존재하는 RNA와 작용하여 메틸화되는 아데닌이 활성화부위에 적절히 위치하도록 하는 역할을 담당한다는 것을 암시하고 있다. ErmSF is one of the ERM proteins which transfer the methyl group to A2058 in 23S rRNA to confer the resistance to MLS (macrolide-lincosamide-streptogramin B) antibiotics on microorganism. Unlike other ERM proteins, ErmSF contains long N-terminal end region (NTER), of which $25\%$ is composed of arginine that is known to interact with RNA well. Gradual deletion of NTER leaded us to the point where mutant protein lost much of activity in vivo. Overexpressed and purified mutant protein showed much reduced activity in vitro: $2\%$ activity relative to that of wild type protein. This fact suggests that this amino acid interact with RNA close to methylatable adenine to locate it at an active site properly.
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MLS<sub>B</sub> 항생제 내성인자인 ErmSF의 N-terminal 38개 아미노산 제거가 항생제 내성 효소활성에 미치는 영향
이학진,진형종,Lee, Hak Jin,Jin, Hyung Jong 한국미생물학회 2014 미생물학회지 Vol.50 No.3
ErmSF is one of the four antibiotic resistance factor proteins expressed by Streptomyces fradiae, antibiotic tylosin producer, which renders $MLS_B$ (macrolide-lincosamide-streptogramin B) antibiotic resistance through dimethylating A2058 of 23S rRNA, thereby reducing the affinity of antibiotic to ribosome. Unlike other Erm proteins, ErmSF harbors long N-terminal end region. To investigate its role in enzyme activity, mutant ErmSF deleted of 1-38 amino acids was overexpressed and activity in vivo and in vitro was observed. In vitro enzymatic assay showed that mutant protein exhibited reduced activity by 20% compared to the wild type enzyme. Due to the reduced activity of the mutant protein, cells expressing mutant protein showed weaker resistance to erythromycin than cells with wild type enzyme. Presumably, the decrease in enzyme activity was caused by the hindrance in substrate binding and (or) product release, not by defect in the methyl group transfer occurred in active site. ErmSF는 macrolide 항생물질인 tylosin을 생성하는 Streptomyces fradiae가 보유한 4개의 항생제 내성인자 단백질 중 하나로 23S rRNA의 $A_{2058}$에 dimethylation 시킴으로써 항생제가 부착되는 것을 막음으로써 그 내성을 일으킨다. ErmSF는 다른 Erm 단백질과는 달리 긴 N-terminal end region을 가지고 있어서 그 역할을 알아보기 위해 1-38번째의 아미노산을 제거한 결손변이 단백질을 고안하고 대장균에서 발현하여 그 활성을 in vivo와 in vitro에서 관찰하였다. 결손변이 단백질을 발현하는 대장균은 결손에 의한 활성저하에 기인하여 야생형 단백질을 발현하는 대장균에 비하여 항생제에 대한 내성이 손상된 것을 관찰하였다. 세포 외 in vitro에서의 활성은 야생형 ErmSF에 비하여 약 20%가 손상된 것으로 나타났다. 이렇게 관찰된 활성의 저하는 결손 변이에 의한 활성화 부위에서 일어난 결손에 의한 것이라기 보다는 기질의 부착 또는 생성물의 효소에서의 이탈 과정이 손상되어서 나타나는 것으로 사료된다.
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이학진(Hak-Jin Lee),한철희(Cheol-Heui Han),조진수(Jin-Soo Cho) 대한기계학회 2005 대한기계학회 춘추학술대회 Vol.2005 No.11
A numerical study on the propulsive characteristics of a fish is done by developing an unsteady linearly-varying strength vortex method. The fish is represented as a deforming foil with a tail fin. A new boundary condition is imposed by considering the relative rotational velocity, which has not been included in the previous published literature. Thrust and propulsion efficiency are investigated for the several undulation modes of fish tail fins. It is found that the undulation amplitude increase the thrust with both maximum thickness and maximum camber stepping down the thrust.
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배기민(Gi-Min Bae),이학진(Hak-Jin Lee),김세옥(Sei-Ok Kim),이장형(Jang-Hyong Lee) 한국컴퓨터정보학회 2024 한국컴퓨터정보학회 학술발표논문집 Vol.32 No.1
본 논문에서는 온 디바이스 국방 AI를 위한 효율적인 학습 방법을 제안한다. 제안하는 방법은 모델 전체를 재학습하는 대신 필요한 부분만 세밀하게 조정하여 계산 비용과 시간을 대폭 줄이는 PEFT 기법의 LoRa를 적용하였다. LoRa는 기존의 신경망 가중치를 직접 수정하지 않고 추가적인 낮은 랭크의 매트릭스를 학습하는 방식으로 기존 모델의 구조를 크게 변경하지 않으면서도, 효율적으로 새로운 작업에 적응할 수 있다. 또한 학습 파라미터 및 연산 입출력에 데이터에 대하여 32비트의 부동소수점(FP32) 대신 부동소수점(FP16, FP8) 또는 정수형(INT8)을 활용하는 경량화 기법인 양자화도 적용하였다. 적용 결과 학습시 요구되는 GPU의 사용량이 32GB에서 5.7GB로 82.19% 감소함을 확인하였다. 동일한 조건에서 동일한 데이터로 모델의 성능을 평가한 결과 동일 학습 횟수에선 LoRa와 양자화가 적용된 모델의 오류가 기본 모델보다 53.34% 증가함을 확인하였다. 모델 성능의 감소를 줄이기 위해서는 학습 횟수를 더 증가시킨 결과 오류 증가율이 29.29%로 동일 학습 횟수보다 더 줄어듬을 확인하였다.
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항공기 낙뢰 시험을 위한 Component A 축소 파형 도식화 방법
조재현(Jae-Hyeon Jo),김윤곤(Yun-Gon Kim),김동현(Dong-Hyeon Kim),이학진(Hak-Jin Lee),명노신(Rho-Shin Myong) 한국항공우주학회 2021 韓國航空宇宙學會誌 Vol.49 No.9
낙뢰는 짧은 시간 동안 다량의 에너지를 항공기에 전달하여 치명적인 결과를 초래할 수 있다. 특히 낙뢰는 고온의 열과 전류를 동반하여 항공기 표면 손상과 내부 전자장비에 영향을 미쳐 비행의 안전에 심각한 영향을 미칠 수 있다. 이를 분석하기 위한 낙뢰 시험에는 미항공우주원고서 SAE ARP 5412B에 규정된 최대전류 200kA인 Component A 파형이 사용된다. 하지만 실제 낙뢰크기는 대부분 35kA 내외로 발생하며 전기체 대상으로 하는 낙뢰 간접 시험에서 내부 전자장비 손상 예방을 위해 파형을 축소하여 시험을 진행한다. 본 연구에서는 기존 Component A 축소파형을 도식화하는 방법을 알아보고 그 한계를 분석하였다. 나아가 항공기 낙뢰 Component A 파형의 보정계수를 조절하는 방식의 신규 축소 파형 도식 방법을 제안한다. 마지막으로 전자기 해석 소프트웨어 EMA3D를 활용하여 EC-155B 헬리콥터 내부 케이블 하네스의 파형 감소비에 따른 내부유도 전류 크기 감소비를 비교하였다. Lightning can deliver large amounts of energy to the aircraft in a short period of time, resulting in catastrophic consequence. In particular, lightning strikes accompanied by high temperature heat and current can damage aircraft surface and internal electronic equipment, seriously affecting flight safety. Lightning experiments to analyze this effect use a Component A waveform with a maximum current of 200 kA as specified in SAE ARP 5412B. However, the actual lightning occurs mostly below 35kA and lightning indirect tests are conducted by reducing waveforms to prevent damage to internal electronic equipment. In this study, we examine previous methods to plot the Component A reduced waveform and identify their limitations. We then propose a new method to plot the reduced waveform based on adjusting the correction factor of the aircraft lightning Component A waveform. Finally, the electromagnetic analysis software EMA3D was used to compare the internal induced current size reduction ratio of the internal cable harness of the EC-155B helicopter.
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박민준(Min Jun Park),박수형(Soo Hyung Park),이학진(Hak Jin Lee),이덕주(Duck Joo Lee) 한국항공우주학회 2016 한국항공우주학회 학술발표회 논문집 Vol.2016 No.4
군용 및 민간 헬기에 대한 소음 규제로 인하여 헬기 설계에 있어서 저소음 로터 설계 기술이 필수적이다. 효과적으로 볼륨소음원에 의한 원거리 소음을 예측하기 위해 Ffowcs Williams and Hawkings 방적식에 Kirchhoff 접근법을 적용하여 볼륨 적분 없이 표면적분만으로 와류 소음을 예측할 있는 투과면 음향상사법을 개발하였다. 개발된 코드는 KFLOW의 고차 수치기법과 연계하여 UH-1H 제자리 비행에서의 High-Speed Impulsive 소음을 예측 및 검증하였다. 본 연구에서 개발된 전산유동소음코드를 통해 향후 다양한 조건에서의 유동과 소음이 연계된 해석이 가능할 것으로 기대된다. The rotor design with low noise is necessary as the noise can severely restrict the rotorcraft usage in both civilian and military operations. In order to predict efficiently the noise caused by volume noise sources in far-field, acoustic analogy code with permeable surface was developed as Kirchhoff approach was applied to Ffowcs Williams and Hawkings equation. Vortex noises can be predicted by using only surface integration of this manner without volume integration. High-Speed Impulsive noise of UH-1H in hover was predicted and validated using the developed code coupled with KFLOW with high-order scheme. This study anticipates that coupled analysis with fluid and noise can be possible in various conditions of rotorcraft through the developed acoustic code with KFLOW.
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