양송이배지로부터 분리한 두 Burkholderia 속 세균에 의한 인산가용화 효과

오종훈,김영준,윤민호,Oh, Jong-Hoon,Kim, Young-Jun,Yoon, Min-Ho 한국버섯학회 2020 한국버섯학회지 Vol.18 No.3

Burkholderia contaminans PSB-A and Burkholderia ambifaria PSB-B were isolated from button mushroom bed to estimate their phosphate solubility. The phosphate-solubilizing abilities of these strains were assessed by measuring the phosphorus content in a single and co-inoculation medium for 7 days. The co-inoculation of these two strains released the highest content of soluble phosphorus (166.3 ㎍ mL^-1) into the medium, followed by single inoculation of B. contaminans PSB-A (143.73 ㎍ mL^-1) and B. ambifaria PSB-B (127.1 ㎍ mL^-1). The highest pH reduction, organic acid production, and glucose consumption were also observed in the co-inoculation medium. According to the plant growth promotion bioassay, co-inoculation enhanced the growth of romaine lettuce much more than the single inoculation (20.4% for leaf widths and 16.6% for root lengths). Although no significant difference was noted between single and co-inoculation of bacterial strains in terms of phosphorous release and plant growth, co-inoculation of PSB may have a beneficial effect on crop growth due to a synergistic effect between the strains. 양송이배지로부터 분리한 인산가용화균 Burkholderia contaminans PSB-A와 Burkholderia ambifaria PSB-B의 단일접종 및 동시접종에 따른 인산가용화 능력의 시너지 효과 및 상추생육효과를 조사하였다. 인산캄슘이 함유된 NBRIP 액체배지에 분리균을 접종하고 해리된 가용인산(soluble phosphorus)함량을 HPLC에 의해 분석하여 인산가용화능을 측정한 결과, 배양 3일차에 동시접종구 166.3 ㎍ mL^-1, B. contaminans 143.7 ㎍ mL^-1, B. ambifaria 127.1 ㎍ mL^-1의 순으로 나타나 두 종의 인산가용화세균간의 동시접종에 의한 시너지효과가 다소 관찰되었다. 배지 내 pH 와 잔류 glucose 함량 변화도 모든 접종구에서 배양 1 - 3일 후 pH 7.0에서 pH 4.0 수준으로 감소하였으며, glucose 함량은 초기 10 mg mL^-1 에서 4.3 mg mL^-1 수준으로 검출되어 인산가용화능과 거의 유사한 경향을 보였다. 배양여액의 유기산 분석결과 gluconic acid 약 12.3 mg mL^-1 와 malic acid 약 7.9 mg mL^-1 수준으로 가장 높게 검출되었으며, 결과적으로 두 세균이 분비하는 유기산이 배지의 pH를 감소시키고, 인산 가용화를 유도하는 주요 원인임을 확인할 수 있었다. 접종 4주 후 상추 생육차이를 조사한 결과, TCP를 첨가하지 않은 B. contaminans 접종구, B. ambifaria 접종구 와 동시 접종구에 비해 TCA 첨가한 모든 처리구에서 약 7-9% 수준의 생육증진효과가 보였으나, 단일접종과 동시접종구간에 유의수준의 차이를 확인할 수 없었다.

항정자항체가 일반적 체외수정 방법 및 정자직접 주입법(ICSI)에 미치는 영향에 관한 연구

오종훈,엄기붕,최동희,정미경,한세열,차광열,정길생,Oh, Jong-Hoon,Oum, Ki-Boong,Choi, Dong-Hee,Chung, Mi-Kyung,Han, Sei-Yul,Cha, Kwang-Yul,Chung, Kil-Saeng 대한생식의학회 1997 Clinical and Experimental Reproductive Medicine Vol.24 No.3

The purpose of this study was to examine the effects of anti-sperm antibody (ASA) on the fertilization processes using conventional IVF and ICSI procedure in human and hamster oocytes. In human IVF, we have observed restricted fertilization with sperm testing positive for ASA. ($23{\sim}90%$ IgA, 60-97 % IgG). However, if ICSI was perform in the next IVF cycle with the same patients, we could successfully fertilize the oocytes (37%; p<0.001), thus achieving pregnancy and delivery. When the sperm were cocultured in medium containing ASA, there were binding of ASA to sperm surface. In addition, the mean rate of the acrosomal reaction in an in vitro acrosome reaction test was lower for Ab-bound sperm (43.5%) than for Ab-free sperm group (51.3%, p<0.05). We used human sperm and hamster oocytes to confirm the negative effects of the ASA on fertilization. The sperm and/or oocytes have been expose to medium containing ASA before IVF and ICSI. In this experiment, the ASA was bound to the oocyte and sperm surface. The following results were obtain by using various combinations of ASA free or ASA bound sperm with ASA free or ASA bound oocytes for IVF. When ASA free sperm were inseminate with ASA free and ASA bound hamster oocytes, the fertilization rates are 89.6% and 74.3% respectively. However, when ASA bound human sperm were use the results were 62.5% and 55.6% respectively. These shows the fertilization rate was significantly decreased in both ASA bound and ASA free oocytes when using ASA bound sperm. No difference found when ASA are present on the oocyte surface. When the hamster oocytes was treated by ICSI with ASA free or ASA bound human spermatozoa, no significant difference was found. These results showed that ICSI is the most promising method for couples who fertilization was not possible by conventional IVF because of ASA.

Synthesis of 1-[3-(Propylthio)butyryl]-2,6,6-trimethylcyclohexene

오종훈,김경태,김용태,Jong Hoon Oh,Kyong Tae Kim,Yong Tae Kim Korean Chemical Society 1985 대한화학회지 Vol.29 No.3

2,6,6-trimethylcyclohex-l-en-1-yllithium (9)과 3-propylthiobutyraldehyde (16)의 반응으로 부터 1-[3-(Propylthio)butyryl]-2,6,6-trimethylcyclohexene (18)을 합성하였다. 이 방법을 이용하여 강력한 향료로 알려진 1-[3-(methylthio)butyryl]-2,6,6-trimethylcyclohexene (1)을 합성할 것이다. 1-[3-(Propylthio)butyryl]-2,6,6-trimethylcyclohexene (18) was synthesized from the reaction of 2,6,6-trimethylcyclohex-l-en-1-yllithium (9) with 3-propylthiobutyraldehyde (16). This method will be employed to prepare 1-[3-(methylthio)butyryl]-2,6,6-trimethylcyclohexene (1) which is known as one of the powerful flavors and fragrances.

순환 신경망의 하드웨어 구현

김정욱(Cheong-Wook Kim),오종훈(Jong-Hoon Oh) 한국정보과학회 2001 한국정보과학회 학술발표논문집 Vol.28 No.1B

최근에는 순환 신경망의 생성모델이 비교사 학습에 관련하여 활발히 연구되고 있다. 이러한 형태의 신경망은 형태 추출이나 인식에 효과적으로 사용될 수 있는 반면 반복 loop를 사용하므로 대단히 많은 계산이 필요하다. 본 논문에서는 Oh와 Seung에 의해 제안된 상향전파(Up-propagation) network이라는 순환 신경망을 FPGA를 이용해서 구현하였다. 단층 신경망은 9개의 상층 neuron과 256개의 하층 neuron으로 구성되 있으며 4만 게이트의 FPGA 하나로 효과적으로 구현할 수 있다. pipeline된 곱셈기로 계산 속도를 향상시켰고 sigmoid 전달함수는 유한 정밀도의 2차 다항식으로 근사될 수 있다. 구현된 하드웨어는 hand-written 숫자 영상인 USPS data를 재생하는데 사용되었으며 좋은 결과를 얻었다.

분야간 유사도와 통계기법을 이용한 전문용어의 자동 추출

오종훈(Jong-Hoon Oh),이경순(Kyung-Soon Lee),최기선(Key-Sun Choi) 한국정보과학회 2002 정보과학회논문지 : 소프트웨어 및 응용 Vol.29 No.3·4

지금까지 전문용어를 자동으로 추출 (Automatic Term Recognition: ATR)하기 위한 많은 연구들이 있어 왔다. 이들 연구들은 주로 문서 내의 용어의 빈도수와 같은 단순한 통계정보를 이용하여 전문용어를 추출하였다. 하지만 전문분야의 기계가독형 사전의 구축으로 인하여 전문용어를 추출하는 데 있어 전문분야 사전의 사용이 가능하게 되었다. 본 논문에서는 이러한 기계가독형 전문분야 사전들을 이용하여 사전 간의 계층관계를 구축하고 이를 이용하여 전문용어를 추출하는 방법을 제시한다. 또한 전문용어 사전에서 나타나지 않는 전문용어를 추출하기 위하여 용어의 빈도수, 외래어 및 외국어, 내포관계 등을 포함한 통계기법을 이용한다. 본 논문에서 제안하는 기법은 기존의 방법에 비해 좋은 성능을 나타내었다. There have been many studies of automatic term recognition (ATR) and they have achieved good results. However, there are scopes to improve the performance of extracting terms still further by using the additional technical dictionaries. This paper focuses on the method for extracting terms using the hierarchy among technical dictionaries. Moreover, a statistical method based on frequencies, foreign words, and nested relations assists extracting terms which do not appear in dictionaries. Our method produces relatively good results for this task.

은닉 마르코프 모델을 이용한 음차표기된 외래어의 자동인식 및 추출 기법

오종훈(Jong-Hoon Oh),최기선(Key-Sun Choi) 한국인지과학회 2001 인지과학 Vol.12 No.3

기계학습에 기반한 생의학분야 전문용어의 자동 인식

오종훈(Jong-Hoon Oh),최기선(Key-Sun Choi) 한국정보과학회 2006 정보과학회논문지 : 소프트웨어 및 응용 Vol.33 No.8

일정 분야의 문서들에서 그 분야 특징을 반영하는 전문용어를 자동으로 인식하는 연구에 대한 관심이 증가하고 있다. ‘전문용어 인식’은 문서에서 전문용어가 될 수 있는 언어적 단위를 파악하는 ‘용어추출’과정과 ‘용어추출’과정에서 얻어진 용어목록 중 해당분야의 전문용어를 고르는 ‘전문용어 선택’ 과정으로 구성된다. ‘전문용어 선택’과정은 용어목록을 전문용어의 특징에 따라 순위화한 후 타당한 전문용어를 파악하는 작업으로 정의된다. 따라서 전문용어 선택 문제는 용어목록의 순위화 작업과 순위화된 목록에서 전문용어와 비전문용어 간의 경계를 인식하는 작업으로 정의된다. 기존의 전문용어 선택 기법은 주로 용어의 빈도수 등과 같은 통계적 특징만을 이용하였다. 하지만 통계적 특징만으로는 효과적으로 전문용어를 선택하기 어렵다. 본 논문의 논제는 전문용어 선택에서 다양한 전문용어의 특징을 고려하고 이들 중 전문용어 선택에서 효과적인 특징을 찾으려는 것이다. 순위화 문제는 다양한 전문용어 특징을 도출하고 이들을 기계학습방법으로 통합하여 해결한다. 경계인식 문제는 전문용어와 비전문용어의 이진 분류 문제로 정의하고 기계학습방법으로 해결한다. 본 논문의 기법은 경계인식측면에서 78~86%의 정확률과 87%~90%의 재현율을 나타내었으며, 순위화 측면에서 89%~92%의 11포인트 평균정확률을 나타내었다. 또한 기존 연구보다 최고 26%의 성능향상을 보였다. There has been increasing interest in automatic term recognition (ATR), which recognizes technical terms for given domain specific texts. ATR is composed of ‘term extraction’, which extracts candidates of technical terms and ‘term selection’ which decides whether terms in a term list derived from ‘term extraction’ are technical terms or not. ‘term selection’ is a process to rank a term list depending on features of technical term and to find the boundary between technical term and general term. The previous works just use statistical features of terms for ‘term selection’. However, there are limitations on effectively selecting technical terms among a term list using the statistical feature. The objective of this paper is to find effective features for ‘term selection’ by considering various aspects of technical terms. In order to solve the ranking problem, we derive various features of technical terms and combine the features using machine-learning algorithms. For solving the boundary finding problem, we define it as a binary classification problem which classifies a term in a term list into technical term and general term. Experiments show that our method records 78~86% precision and 87%~90% recall in boundary finding, and 89%~92% 11-point precision in ranking. Moreover, our method shows higher performance than the previous work’s about 26% in maximum.

정보통합을 통한 생물/의학 분야 전문용어의 자동 추출

오종훈(Jong-Hoon Oh),최기선(Key-Sun Choi) 한국정보과학회 2004 한국정보과학회 학술발표논문집 Vol.31 No.2Ⅰ

전문용어란 전문분야의 개념이 언어적으로 표현된 형태이다. 전문분야마다 분야 특성적인 개념이 사용되므로, 전문용어는 전문분야를 특성화하는 단위로 사용된다. 따라서 전문분야문서에 대한 자연언어처리에서 전문용어를 효과적으로 처리하는 것은 매우 중요하다. 전문용어 추출은 분야 특성적인 전문용어를 해당 분야 문서에서 파악하는 작업을 말한다. 본 논문에서는 기계학습방법을 이용한 전문용어 자동 추출 기법을 제안한다. 본 논문의 기법은 전문분야 사전 과 전문분야 문서를 이용하여 문서에서 나타나는 전문용어의 특성을 파악하고 이를 이용하여 전문용어를 추출한다. 본 논문의 기법은 GENIA 2.01 문서에 대하여 86%의 정확률과 90%의 재현율을 나타내었다. 또한 기존연구보다 최고 21% 의 성능향상을 나타내었다.

은닉마르코프 모델(HMM)을 이용한 과학기술 문서에서의 외래어 추출 모델

오종훈(Jong Hoon Oh),최기선(Key Sun Choi) 한국정보과학회 언어공학연구회 1999 한국정보과학회 언어공학연구회 학술발표 논문집 Vol.1999 No.10

비행체 원격측정을 위한 차세대 계측시스템 연구

오종훈(Jong-Hoon Oh),김건식(Keon-Sik Kim),최종욱(Jong-Ug Choi),윤한수(Han-Soo Yun) 한국항공우주학회 2016 한국항공우주학회 학술발표회 논문집 Vol.2016 No.11