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ア ァ カ サ ザ タ ダ ナ ハ バ パ マ ヤ ャ ラ ワ ヮ ン イ ィ キ ギ シ ジ チ ヂ ニ ヒ ビ ピ ミ リ ウ ゥ ク グ ス ズ ツ ヅ ッ ヌ フ ブ プ ム ユ ュ ル エ ェ ケ ゲ セ ゼ テ デ ヘ ベ ペ メ レ オ ォ コ ゴ ソ ゾ ト ド ノ ホ ボ ポ モ ヨ ョ ロ ヲ ―

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      저자 : 배석철(Suk-Cheol Bae) (검색결과 1 건)
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        마이크로어레이 데이터의 게놈수준 분석을 위한 퍼지 패턴 매칭에 의한 유전자 필터링

        이선아(Sun A Lee),이건명(Keon Myung Lee),이승주(Lee Seung-Joo),김원재(Wun-Jea Kim),김용준(Yong-June Kim),배석철(Suk-Cheol Bae) 한국지능시스템학회 2008 한국지능시스템학회논문지 Vol.18 No.4

        생명과학분야에서 마이크로어레이 기술은 세포에서의 RNA 발현 프로파일을 관찰할 수 있도록 함으로써 생명현상의 규명 및 약물개발 등에서 분자수준의 생명현상에 대한 관찰과 분석이 가능해지고 있다. 마이크로어레이 데이터분석에서는 특정한 처리나 과정에서 현저한 특성을 보이는 유전자를 식별하기 위한 분석뿐만 아니라 유전자 전체인 게놈수준에서의 분석도 이루어진다. 약물반응 실험에서는 약물에 대한 게놈수준의 발현 프로파일을 관찰하는 것도 많은 정보를 제공할 수 있다. 약물실험에서는 대조군과 실험군들간에 관심있는 상대적인 발현특성을 갖는 유전자군을 전체적으로 추출하는 것이 필요한 경우가 있다. 예를 들면 정상군은 두개의 실험군에 대해서 중간정도의 발현정도를 갖는 유전자군을 식별하는 분석을 하는 경우, 생물학적인 데이터의 특성상 절대값을 비교하는 방법으로는 유용한 유전자들을 효과적으로 식별해 낼 수 없다. 이 논문에서는 정상군과 실험군들의 발현정도값의 경향을 판단하기 위해서 각 유전자에 대해서 집단별 대표값을 선정하여 퍼지집합으로 집단의 값의 범위를 결정하고, 이를 이용하여 특정 패턴을 갖는 유전자들을 식별해내는 방법을 제안하고, 실제 데이터를 통해서 실험한 결과를 보인다. Microarray technology in biological science enables molecular level observations and analyses on the biological phenomina by allowing to measure the RNA expression profiles in cells. Microarray data analysis is applied in various purposes such as identifying significant genes which react to drug treatment, understanding the genome scale phenomina. In drug response experiments, the microarray-based gene expression analysis could provide meaningful information. It is sometimes needed to identify the genes which shows different expression behavior for treatment group and normal group each other. When the normal group shows the medium level expression, it is not easy to discriminate the group just by expression level comparison. This paper proposes a method which selects group-wise representative values for each gene and sets the value range of the groups in order to filter out the genes with specific pattern. It also shows some experiment results.

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