녹농균(Pseudomonas aeruginosa)의 쿼럼 센싱 수용체인 QscR의 활성에 영향을 미치는 아미노산 잔기 분석

박수진,김수경,이준희,Park, Su-Jin,Kim, Soo-Kyoung,Lee, Joon-Hee 한국미생물학회 2012 미생물학회지 Vol.48 No.3

그람 음성균인 녹농균(Pseudomonas aeruginosa)은 다양한 환경에 존재하는 기회감염성 병원균으로, 병원성의 발현에 쿼럼센싱(QS) 기전이 중요한 역할을 담당한다. 녹농균의 여러 QS 신호물질 수용체들 중 하나인 QscR은 다른 QS 수용체들과는 구분되는 특별한 특성들을 가진다. 본 연구에서는 이러한 특성들 중 특히 넓은 신호물질 특이성을 QscR에 부여해 주는 아미노산 잔기가 무엇인지 알아보기 위해, QscR의 72번째 threonine, 132번째 arginine, 140번째 threonine 잔기가 각각 isoleucine, methionine, isoleucine 잔기로 치환된 돌연변이 QscR들($QscR_{T72I}$, $QscR_{R132M}$, $QscR_{T140I}$)을 제조하였다. 이들의 활성을 측정해 보았을 때 $QscR_{R132M}$은 N-3-oxododecanoyl homoserine lactone (3OC12-HSL)에 대한 반응성이 사라졌고, $QscR_{T72I}$와 $QscR_{T140I}$는 민감성이 많이 감소하기는 하였으나 여전히 3OC12-HSL에 대한 반응성을 가지고 있었다. 이들 돌연변이 QscR들에 다양한 구조의 acyl-HSL을 처리해 보았을 때, $QscR_{T72I}$와 $QscR_{T140I}$는 야생형 QscR처럼 자기 자신의 신호물질인 3OC12-HSL 보다 N-decanoyl HSL (C10-HSL)이나 N-dodecanoyl HSL (C12-HSL)처럼 10개 혹은 12개의 탄소 사슬을 가지면서 3번째 탄소에 oxo-moiety가 없는 acyl-HSL에 대해 더 높은 반응성을 보였으며, $QscR_{R132M}$은 3OC12-HSL 뿐만 아니라 본 연구에서 사용된 어떤 acyl-HSL에도 반응성을 보이지 않았다. 또한 $QscR_{T72I}$와 $QscR_{T140I}$는 QscR 억제제인 5f에 의해 야생형 QscR과 비슷한 수준으로 활성이 억제되었다. 이러한 결과들은 130번째 arginine의 경우 QscR의 활성과 acyl-HSL들과의 결합에 중요한 역할을 하는 반면, 72번째와 140번째 threonine들의 경우 QscR의 활성에는 중요하지만, 다른 구조의 acyl-HSL들에 대한 선택적 결합이나, 경쟁적 억제자들의 결합 간섭에는 영향을 주지 않음을 시사하는 것이다. Pseudomonas aeruginosa, a Gram-negative bacterium, is an ubiquitous and opportunistic human pathogen, which expresses many virulence factors through quorum sensing (QS) regulation. QscR, one of the QS signal receptors of P. aeruginosa, has unique features that make it possible to distinguish QscR from other QS receptors. In the present study, we focused on amino acid residues responsible for such a broad signal specificity of QscR. Thus we constructed mutant QscRs: $QscR_{T72I}$, $QscR_{R132M}$, and $QscR_{T140I}$ by substituting $72^{nd}$ threonine, $132^{nd}$ arginine, and $140^{th}$ threonine residues with isoleucine, methionine, and isoleucine, respectively by site-directed mutagenesis. When we examined the activity of these mutant QscRs, $QscR_{R132M}$ failed to respond to N-3-oxododecanoyl homoserine lactone (3OC12-HSL), but $QscR_{T72I}$ and $QscR_{T140I}$ remained the ability to respond to 3OC12-HSL despite much reduction of the sensitivity. When we treated a variety of acyl-HSLs with different structure, $QscR_{T72I}$ and $QscR_{T140I}$ showed better responsiveness to N-decanoyl HSL (C10-HSL) or N-dodecanoyl HSL (C12-HSL) that has no oxo-moiety at $3^{rd}$ carbon of acyl group than to 3OC12-HSL, and $QscR_{R132M}$ showed no responsiveness to any acyl-HSLs tested here. In addition, $QscR_{T72I}$ and $QscR_{T140I}$ were inhibited by 5f, a QscR inhibitor as similarly as wild type QscR was. These results suggest that while the $130^{th}$ arginine is crucial in both activity and acyl-HSL binding of QscR, the $72^{nd}$ and $140^{th}$ threonines are important in the activity, but they are little responsible for the discrimination of acyl-HSLs or competitive inhibitor.

화제의 컨설턴트 소개-차상란 가람감정평가법인 이사

박수진,Park, Su-Jin 한국경영기술컨설턴트협회 2004 컨설턴트 Vol.21 No.-

한국경제신문에서 매주 1회 발행하는 비즈니스 전문지“한경비지니스”에서는 2004년 9월 20일자(제459호) “피플:프로의 세계”코너를 통해 차상란 경영지도사 프로필을 특집으로 소개했다.차상란 지도사는 본회 대외협력분과위원과 APEC CBC 평가위원으로 활동하면서 여성지도사회 부회장과 개인지도사 사무소“아트경영자문”도 운영하고 있다. 한경비지니스 459호에 게재된 차상란지도사 특집기사 전문은 다음과 같다.

강원도 기후변화 적응대책 세부시행계획 수립 현황

박수진,한대건,Park, Su-Jin,Han, Dae-Geon 한국수자원학회 2020 물과 미래(한국수자원학회지) Vol.53 No.9

나노 채널 구조를 가진 산화 주석 박막 전극 제조 및 전기화학적 특성 평가

박수진,신헌철,Park, Su-Jin,Shin, Heon-Cheol 한국재료학회 2012 한국재료학회지 Vol.22 No.1

Thin film electrode consisting purely of porous anodic tin oxide with well-defined nano-channeled structure was fabricated for the first time and its electrochemical properties were investigated for application to an anode in a rechargeable lithium battery. To prepare the thin film electrode, first, a bi-layer of porous anodic tin oxides with well-defined nano-channels and discrete nano-channels with lots of lateral micro-cracks was prepared by pulsed and continuous anodization processes, respectively. Subsequent to the Cu coating on the layer, well-defined nano-channeled tin oxide was mechanically separated from the specimen, leading to an electrode comprised of porous tin oxide and a Cu current collector. The porous tin oxide nearly maintained its initial nano-structured character in spite of there being a series of fabrication steps. The resulting tin oxide film electrode reacted reversibly with lithium as an anode in a rechargeable lithium battery. Moreover, the tin oxide showed far more enhanced cycling stability than that of powders obtained from anodic tin oxides, strongly indicating that this thin film electrode is mechanically more stable against cycling-induced internal stress. In spite of the enhanced cycling stability, however, the reduction in the initial irreversible capacity and additional improvement of cycling stability are still needed to allow for practical use.

실시간 e-mail 대응 침입시도탐지 관리시스템의 설계 및 구현

박수진,박명찬,이새롬,최용락,Park, Su-Jin,Park, Myeong-Chan,Lee, Sae-Sae,Choe, Yong-Rak 한국정보처리학회 2002 정보처리학회논문지 C : 정보통신,정보보안 Vol.9 No.3

Nowadays, the hacking techniques are developed increasingly with wide use of internet. The recent type of scanning attack is appeared in against with multiple target systems on the large scaled domain rather than single network of an organization. The development of scan detection management system which can detect and analyze scan activities is necessary to prevent effectively those attacking at the central system. The scan detection management system is useful for effective utilization of various detection information that received from scan detection agents. Real time scan detection management system that can do the integrated analysis of high lever more that having suitable construction in environment of large scale network is developed. 인터넷의 발전과 더불어 해킹기법 또한 함께 발전하고 있다. 최근의 검색공격 형태는 한 기관의 네트워크를 대상으로 하기보다는 상위 도메인을 대상으로 대규모적인 공격 형태를 지니고 있다. 실질적으로 대응하기 위해서는 중앙시스템에서 취약점 검색공격을 탐지, 분석하고 조치할 수 있는 시스템이 있어야 한다. 침입시도탐지 관리시스템은 현재 국내 주요기관들에 설치된 다수의 침입시도탐지 시스템들로부터 받은 여러 탐지 정보를 실시간으로 수집 분석하여 효과적으로 이용하는데 유용하다. 대규모 네트워크의 환경에 적절한 구조를 갖으며 보다 고수준의 통합된 분석을 할 수 있는 실시간 침입시도탐지 관리시스템을 개발하였다.

A Case of Kabuki Syndrome Confirmed by Genetic Analysis: A Novel Frameshift Mutation in the KMT2D Gene

박수진,안문배,장우리,조원경,채효진,김명신,서병규,Park, Su Jin,Ahn, Moon Bae,Jang, Woori,Cho, Won Kyung,Chae, Hyo Jin,Kim, Myung Shin,Suh, Byung Kyu The Korean Society of Inherited Metabolic Disease 2017 대한유전성대사질환학회지 Vol.17 No.3

가부키 증후군(Kabuki syndrome)은 특징적인 얼굴(아치형의 넓은 눈썹, 낮은 코끝, 큰 귓바퀴, 아래 외측 안검 외전), 골격계 이상, 출생 후 성장 지연, 그리고 경도의 정신 지체를 특징으로 나타내는 선천성 이상 질환이다. 또한, 선천성 심장기형, 비뇨생식기 기형, 구개구순열을 포함한 위장관 기형, 안검 하수 등의 증상이 동반되기도 한다. 감염과 면역질환, 경련, 내분비 문제, 청력 손실이 나타날 수 있다. 가부키 증후군의 대부분은 12번 염색체의 장완에 위치한 KMT2D 유전자의 돌연변이에 의해 발병된다. KMT2D 유전자의 돌연변이로 생성된 비정상적인 KMT2D 단백질로 인해 신체의 여러 장기와 조직의 특정 유전자의 활성이 정상적으로 이뤄지지 못하여, 결과적으로 가부키 증후군의 특징적인 외형과 기능장애가 나타난다. 출생시 선천성 심장 기형, 갑상선 기능 저하 및 일과성 저혈당 과거력이 있던 환아가 만 4세경 성장 지연, 아치형 눈썹, 낮은 코끝, 아래 외측 안검 외전, 큰 귓바퀴 등의 얼굴 생김새를 보여 시행한 분자유전학적 검사에서 KMT2D의 exon 15에서 새로운 frameshift mutation이 발견되어 증례를 보고하는 바이다. 가부키 증후군은 성장 지연 뿐 아니라, 발달 장애 및 행동 장애, 사춘기 여아의 경우 조기 가슴 발육을 포함한 내분비적 문제, 사시, 안검하수 등의 안과적 문제, 만성 중이염, 청력 손실, 감염, 경련 등 다양한 증상을 나타낼 수 있기 때문에 조기에 질환을 진단하고, 임상증상에 따라 적절한 중재를 할 수 있도록, 정기적으로 신장, 몸무게, 머리둘레, 발달상태, 청각과 시각상태를 확인하는 것이 중요하다. 따라서 여러 장기의 선천 기형을 보이는 환아의 경우, 임상의는 출생 당시에는 두드러지지 않을 수 있는 특징적인 얼굴 생김새, 성장 지연, 정신 지체 등의 이상에 대해 유의하여야 한다. 분자유전학적 검사는 임상적으로 가부키 증후군이 의심되는 환아를 조기에 진단할 수 유용한 방법이며, 앞으로도 가부키 증후군과 연관된 유전자 변이에 대한 연구가 더욱 필요할 것으로 사료된다. Kabuki syndrome is a rare congenital disorder that causes multiple birth defects and mental retardation. Mutation of the lysine methyltransferase 2D (KMT2D) gene is the primary cause of Kabuki syndrome. We report a 4-year-old Korean girl diagnosed with Kabuki syndrome based on distinctive facial features (eversion of the lower lateral eyelid, arched eyebrows, depressed nasal tip, prominent ears), skeletal anomalies, short stature, and molecular analysis, which revealed a novel frameshift mutation in the KMT2D gene. A 4-year-old patient had a past history of congenital cardiac malformations (coarctation of the aorta, ventricular septal defect, atrial septal defect, patent ductus arteriosus), subclinical hypothyroidism and dysmorphic features at birth including webbed neck, short fingers, high arched palate, micrognathia and horseshoe kidney. She showed unique facial features such as a long palpebral fissure, long eyelashes, arched eyebrows with sparseness of the lateral third, broad nasal root, anteverted ears, and small mouth. Her facial features suggested Kabuki syndrome, and genetic analysis discovered a novel heterozygous frameshift mutation (c.4379dup, p.Leu1461Thrfs*30) in exon 15 of the KMT2D gene. The diagnosis of our 4-year-old patient was made through thorough physical examination and history taking, and genetic testing. It is challenging to diagnose patients with Kabuki syndrome at birth, since the characteristic facial features are expressed gradually during growth. Clinical suspicion aroused by regular follow-ups may lead to earlier diagnosis and interventions.

기후변화와 강원도 밭작물의 봄철 가뭄

박수진,Park, Su-Jin 한국수자원학회 2020 물과 미래(한국수자원학회지) Vol.53 No.3

우리나라 해양관광산업 육성을 위한 정책 개선방향에 관한 고찰

박수진,홍장원,Park, Su-Jin,Hong, Jang-Won 해양환경안전학회 2012 해양환경안전학회지 Vol.18 No.2

관광산업은 단일산업으로는 세계 최대의 산업이며, 동시에 높은 고용효과를 가져오는 산업으로 평가되고 있다. 특히, 해양레저스포츠, 크루즈관광 등 해양관광산업은 고부가가치를 창출할 수 있는 산업으로 그 중요성이 더욱 강조되고 있다. 우리나라는 3천여 개의 도서와 약 12,000 km의 해안선, 드넓은 갯벌, 수려한 해양경관 등 천혜의 해양관광자원을 갖추고 있으며, 주 5일 근무제 정착, 교통수단의 발달로 해양관광에 대한 국민의 정책수요가 지속적으로 증가하고 있는 상황이다. 그러나 현재 우리나라는 해양관광산업을 신성장동력으로 육성하기 정책적 제도적 기반이 미흡하고, 관광자원을 충분히 활용하고 있지 못한 상황이다. 본 논문에서는 국내 해양관광산업의 현황과 제약요인을 고찰하고, 현행 국내 해양관광 관련 법제도의 한계를 분석해 보고자 한다. 이를 통해 향후 해양관광산업을 육성하기 위한 정책적 개선방향을 제시하였다. The tourism industry is considered as the world largest industry and it is assessed as the most effective way to create employment. In particular, the marine tourism industry such as marine leisure sports, cruise can create high added value so that its significance has been more emphasized. Korea has natural tourist attractions such as more than 3,000 islands, about 12,000km lengths coastline, wide wetlands and beautiful seascape. In addition, the establishment of the five-day workweek and the development of means of transportation make the policy demand of the public for marine tourism increase continuously. However, Korea currently lacks policy and system for revitalizing marine tourism industry as the new growth engine and has not made good use of its retained tourist resource. Accordingly, this study explores the current situation and challenges of Korean marine tourism industry and further analyses the limits of the national legal systems for marine tourism. Lastly, it suggests policy recommendation for promoting marine tourism industry.

기자칼럼-의료법 유감

박수진,Park, Su-Jin 대한병원협회 2007 대한병원협회지 Vol.36 No.2

In vitro에서 Edwardsiella tarda와 Streptococcus iniae에 대한 항균제와 천연 유래 항균물질의 병용효과

박수진,강봉조,박관하,Bak, Su-Jin,Kang, Bong-Jo,Park, Kwan Ha 한국어병학회 2015 한국어병학회지 Vol.28 No.1

The purpose of this study is to explore the possibility of essential oils and flavonoids improving the performance of antibiotics, proving a higher efficacy in the presence of natural substances against Edwardsiella tarda and Streptococcus iniae. Increased efficacy was observed in several cases: both essential oils and flavonoids increased antibacterial efficacy of oxytetracycline and flumequine against E. tarda by 2-fold; essential oils and flavonoids increased antibacterial efficacy of nalidixic acid against E. tarda by 4-fold; flavonoids increased antibacterial efficacy of josamycin against S. iniae by 4-fold. The results obtained in this study suggest that essential oils and flavonoids might be especially useful in increasing the antimicrobial activity of nalidixic acid and josamycin against E. tarda and S. iniae in fish. Natural compounds examined in this study could also be useful to help decrease the overuse of antibiotics in fish.