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Identification of differentially expressed proteins at four growing stages in chicken liver
K. C. Jung(정기철),K. Y. Lee,B. G. Jang,K. D. Choi,J. T. Jeon,J. H. Lee 한국가금학회 2007 한국가금학회 정기총회 및 학술발표회 Vol.24 No.-
닭은 지방대사와 성장 관계 연구에 좋은 모델이다. 본 연구에서는 닭의 성장 단계별 간에서 다르게 발현된 단백질을 연구하였다. 2-DE 방법을 이용하여 간의 단백질을 이미지화 하였고 MALDI-TOF MS에 의하여 13개의 성장단계별 다르게 발현된 단백질을 동정할 수 있었으며 이중 12개의 단백질은 기존에 존재하는 닭의 database와 일치하였다. 동정된 단백질 중 fatty acid synthase(FASN)과 malic enzyme(ME1)은 지방대사와 관련이 있는 것으로 추정이 되었으며 이 두 단백질들은 다른 성장단계보다 32주령에 있어 가장 많은 발현양을 보였다. western blotting을 실시하여 2-DE 이미지상에서 다르게 발현된 FASN의 발현양의 차이를 확인할 수 있었다. 본 실험에서 동정된 단백질들은 닭의 지방대사 연구에 좋은 기초자료가 될 것으로 사료된다.
한국 재래닭의 경제형질 개량을 위한 apoVLDL-II 유전자의 유전자형 분석
정기철,이유주,장병귀,최강덕,이준헌,Jung, K.C.,Lee, Y.J.,Bhuiyan, M.S.A.,Jang, B.K.,Choi, K.D.,Lee, J.H. 한국가금학회 2009 韓國家禽學會誌 Vol.35 No.4
The very low density apolipoprotein-II (apoVLDL-II) gene is closely related with the constitution of the lipoprotein in various tissues. The apoVLDL-II gene have main functions for reducing fat elements from tissues and muscles. Previous results indicated that the polymorphisms in apoVLDL-II gene were positively related with growth and body composition traits in chicken. In this study, we analyzed previously identified apoVLDL-II gene polymorphisms using the PCR-RFLP method and investigated allele and genotype frequencies in three chicken breeds. Data indicated that Korean native chicken and Korean Oge chicken have similar B and F gene frequencies, indicating that this marker can be used for the improvement of growth and body composition traits in those breeds and can be used as marker assisted selection with further verifications. 초저밀도 아포지단백(Very Low Density Apolipoprotein-II)은 조직의 지방단백질 분비 조성과 밀접한 관련이 있다고 알려진 유전자로서 최근 닭에서 성장 및 체구성과 매우 높은 연관이 있다고 알려져 있다. 본 연구는 닭의 3품종에서 PCR-RFLP 방법을 통해 apoVLDL-II 유전자의 유전자형을 분석하고 Broiler 형(B)과 Fayoumi 형(F)을 결정하였다. 각 품종간 유전자형 빈도는 한국 재래계에서 BB가 0.37, BF가 0.43, FF가 0.2로 검출되었고, 오계에서 BB가 0.2, BF가 0.6, FF가 0.2로 검출되었으며, 백색레그혼에서 BB가 0.16, BF가 0.84로 검출되었다. Broiler 형은 성장이나 체구성을 높이는 방향으로 작용한다는 기존의 보고를 바탕으로 본 연구에서 나타난 집단내 다양한 유전자형 분포는 재검증 작업을 거쳐 육종에 의해 이 형질들을 개량할 수 있음을 의미한다.
효소복합체가 양돈슬러리 및 돈사 악취발생에 미치는 영향
정기한,한정철,곽석준,정재두,이진우,김두환,Jung, K.H.,Han, J.C.,Kwack, S.J.,Jung, J.D.,Lee, J.W.,Kim, D.H. 한국축산환경학회 2008 축산시설환경학회지 Vol.14 No.1
본 연구는 효소복합체 처리가 양돈분뇨의 액비화 과정의 악취제어 가능성을 조사하기 위하여 액비저장 탱크에 4주간 저장하면서 효소복합체 처리, 폭기 처리, 효소와 폭기 동시 처리 및 대조구로 나누어 비교하였다. 또한 효소복합체를 돈사에 살포하여 돈사내 공기의 질과 양돈장 부지경계선에서의 복합악취농도를 조사하였는데, 그 결과를 요약하면 다음과 같다. 효소복합체와 폭기 처리는 양돈분뇨의 액비화 과정의 암모니아와 황화수소 농도에 영향을 미치는 것으로 조사되었으며, 암모니아와 황화수소 농도는 4주간의 액비화 과정 동안 지속적으로 감소되었다. 효소복합체의 일정 수준 처리는 양돈분뇨 액비화 과정의 악취저감을 위한 효율적인 수단이 될 수 있을 것으로 판단된다. 효소복합체와 폭기 처리는 양돈분뇨의 액비화 과정의 총질소, 총인 및 암모니아성 질소 농도에 영향을 미치는 것으로 조사되었으며, 효소복합체 처리는 양돈분뇨 액비의 품질 유지와 악취저감을 위한 하나의 기술적 대안으로 충분한 것으로 보인다. 효소복합체 살포는 돈사내 공기의 질을 개선하고 양돈장의 부지경계선에서의 복합악취 저감에도 효과적으로 작용하는 것으로 나타났다. 이상의 결과를 요약하면, 효소복합체 처리는 양돈분뇨 액비화 과정의 악취제어와 고품질 액비제조 가능성이 인정되며, 돈사 내부 및 양돈장 환경개선과 악취저감 효과가 있는 것으로 판단된다. This study was carried out to investigate the effect of enzyme complex on odor emission from swine slurry and the process of making swine liquid manure. Ammonia and hydrogen sulfide concentrations were significantly decreased by using the enzyme complex of liter per ton level of liquid swine slurry in the manure storage tank according to the time. Characteristics of liquid swine slurry were affected by the enzyme complex, total nitrogen and ammonia nitrogen contents were reduced compare with control. Ammonia and hydrogen sulfide concentrations in the finishing pig building and offensive odor compound on the boundary line of swine farm were significantly decreased by spraying in swine finishing building. In conclusion, the results obtained from this study suggest that using the enzyme complex of liter per ton level of liquid swine slurry for making liquid swine manure may improve the quality of swine liquid fertilizer and reduce odor emission. Also farm scale enzyme complex treatment may improve air quality in finishing pig building and deduce offensive odor compound of swine farm.
추백리가 감염된 닭의 간에서 발현이 증가하는 APOA1 단백질의 확인
정기철,이유주,유성란,이준헌,장병귀,구용범,소현경,최강덕,Jung K. C.,Lee Y. J.,Yu S. L.,Lee J. H.,Jang B. K.,Koo Y. B.,So H. K.,Choi K. D. 한국가금학회 2005 韓國家禽學會誌 Vol.32 No.1
가금 추백리와 밀접한 관계가 있는 단백질을 동정하기 위하여 인위적으로 추백리를 유도한 개체와 정상인 개체의 간에서 단백질을 추출하였으며, 2차원 전기영동(2DE)과 mass spectrometry(MS)를 이용하여 차등 발현되는 단백질을 조사하였다. 총 300여개의 단백질 spot들이 관찰되었으며, 이중 발현양에 현저한 차이를 보이는 spot을 MALDI-TOF MS와 protein database search를 통해 분석한 결과, 가금 APOAI (Apolipoprotein A1)으로 확인되었다. 추백리가 감염된 닭의 간에서 APOA1 단백질의 증가는 손상된 혈관의 재생과 밀접한 관계가 있으며 추백리의 감염 여부를 나타내 주는 Bio-marker로서 활용될 수 있을 것으로 사료된다. The aim of this study was to investigate differentially expressed proteins between normal chicken liver and chicken liver inffeted by Salmonella pullorum. 2-dimensional electrophoresis (2DE) and mass spectrometry (MS) were used to identify the proteins. More than 300 protein spots were detected on silver stained 2DE gels using pH 3$\~$10 gradients. The most outstanding protein spot was further analyzed by MALDI-TOF MS and protein database using the Mascot search engine. The protein was finally identified as APOAI (Apolipoprotein AI). Based on the known function of the APOAI, this gene acts protective action against the accumulation of platelet thrombin at the site of vascular damage for the pullorum disease. Therefore APOAI protein, identified in this study, can be a valuable biomarker in relation to the pullorum disease in chicken.
황갈색 재래닭의 간에서 성장 단계별 차등 발현 유전자 분석
이경연,유성란,정기철,장병귀,최강덕,이준헌,Lee, K.Y.,Yu, S.L.,Jung, K.C.,Jang, B.K.,Choi, K.D.,Lee, J.H. 한국가금학회 2007 韓國家禽學會誌 Vol.34 No.2
한국 재래닭에서 성장에 따른 유전자들의 발현 변화를 알아보고 성장 촉진, 대사 및 면역 관련 유전자를 발굴하기 위하여 주령별로 닭의 간에서 RNA를 추출하였으며 10개의 arbitrary ACPs를 이용하여 차등 발현되는 유전자를 조사하였다. 발현량에 현저한 차이를 보이는 5개의 유전자들이 선별되었으며, 이 중 3개의 유전자들은 BLAST search 결과 이미 기능이 알려진 FTH1, SAA와 HSP90B1으로 밝혀졌다. 그러나 2개의 유전자들은 닭의 genome sequence가 끝났음에도 불구하고 기능이 밝혀져 있지 않아 앞으로 이 유전자들의 기능에 대한 연구가 지속되어야 함을 의미한다. 본 연구에서 닭의 간에서 성장 단계별로 발현 차이를 보이는 유전자들은 앞으로 다른 유전자와 단백질들과의 관계를 통하여 닭의 성장 및 지방 대사를 이해하는데 도움을 줄 것으로 사료된다. The chicken liver has been involved in various biological functions including detoxification, glycogen storage and plasma protein synthesis. The aim of this study was to investigate differentially expressed genes in chicken liver in four different growing stages. Using 10 arbitrary Annealing Control Primers (ACPs), five differentially expressed genes have been identified. Based on the Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) search results, three of them were matched with previously known genes, and the other two were matched with unknown EST sequence and a hypothetical protein, respectively. In order to confirm the expression results, quantitative real-time PCR was also performed. The high similarities between the expression data using arbitrary ACPs and quantitative real-time PCR indicate that the identified genes are the real differentially expressed genes in different growing stages. The genes identified in this study can be used as valuable biomarkers in chicken with further investigation of the functions.