http://chineseinput.net/에서 pinyin(병음)방식으로 중국어를 변환할 수 있습니다.
변환된 중국어를 복사하여 사용하시면 됩니다.
확장된 다중인자 차원축소 (E-MDR) 알고리즘에 기반한 유전자 상호작용 효과 규명
이제영,이호근,이용원,Lee, Jea-Young,Lee, Ho-Guen,Lee, Yong-Won 한국통계학회 2009 응용통계연구 Vol.22 No.6
Study the gene about economical characteristic of human disease or domestic animal is a matter of grave interest, preserve and elevation of gene of Korea cattle is key subject. Studies have been done on the gene of Korea cattle using EST based SNP map, but it is based on statistical model, therefore there are difference between real position and statistical position. These problems are solved using both EST_based SNP map and Gene on sequence by Lee et al. (2009b). We have used multifactor dimensionality reduction(MDR) method to study interaction effect of statistical model in general. But MDR method cannot be applied in all cases. It can be applied to the only case-control data. So, method is suggested E-MDR method using CART algorithm. Also we identified interaction effects of single nucleotide polymorphisms(SNPs) responsible for average daily gain(ADG) and marbling score(MS) using E-MDR method. 인간의 질병 또는 가축의 경제적인 특성에 관한 유전자의 규명은 매우 중요한 관심사이며, 우리나라 축산업을 대표하는 한우의 유전자원 보존과 능력향상은 매우 중요한 과제이다. 이를 연구하기 위해 기존 EST_based SNP 연관지도를 사용하여 발굴한 유전자로 연구되어왔으나 이는 통계학적 모델에 기반한 연관지도 작성법으로 실제 위치와는 차이가 있을 수 있다. 따라서 Lee (2009)에 의해 EST_based SNP 연관지도와 염기서열 분석으로 작성되어지는 Gene on sequence를 함께 고려하여 한우의 경제형질 연관 후보 DNA marker들이 발견되었다. 한편, 통계모형의 상호작용 효과를 고려할 때, 유전자와 같은 범주형 data에서 범주가 많을 경우 상호작용의 조합이 많아지므로 종종 모수들의 상호작용에 대한 해석과 모형을 결정하는 것이 어려울 수 있다. 그래서 비모수적인 방법으로 다중인자 차원축소방법 (MDR)을 사용해왔으며, 사례_대조 데이터에만 적용가능 MDR방법을 연속형 데이터에도 적용하기 위해 CART알고리즘을 적용한 확장된 다중인자 차원축소방법(E-MDR)이 제안되었다. 본 연구에서는 새롭게 발견된 단일염기다형성 (SNP)으로부터 E-MDR방법을 적용하여 한우의 경제형질(일당중체량, 근내지방도)에 영향을 주는 우수 유전자 단일염기다형성을 규명하였다.
더미(dummy) 변수를 활용한 다중인자 차원 축소(MDR) 방법
이제영,이호근,Lee, Jea-Young,Lee, Ho-Guen 한국통계학회 2009 응용통계연구 Vol.22 No.2
통계모형의 상호작용 효과를 분석하기 위해 비모수적인 방법인 다중인자 차원 축소(MDR) 방법을 사용해왔다. MDR 방법은 사례-대조 데이터에만 적용 할 수 있다. 본 논문에서는 연속형 데이터에도 적용 할 수 있는 더미(dummy) 변수를 활용한 MDR방법을 소개한다. 아울러 이를 통해 한우의 주요 경제형질인 등심단면적 (longissimus muscle dorsi area: LMA), 도체중(carcass cold weight: CWT), 일당증체량(average daily gain: ADC)에 영향을 주는 우수 유전자 단일염기다형성(SNP)을 규명한다. Multiple genes interacting is a difficult due to the limitations of parametric statistical method like as logistic regression for detection of gene effects that are dependent solely on interactions with other genes and with environmental exposures. Multifactor dimensionality reduction(MDR) statistical method by dummy variables was applied to identify interaction effects of single nucleotide polymorphisms(SNPs) responsible for longissimus mulcle dorsi area(LMA), carcass cold weight(CWT) and average daily gain(ADG) in a Hanwoo beef cattle population.
이제영,이호근,Lee, Jea-Young,Lee, Ho-Guen 한국통계학회 2009 Communications for statistical applications and me Vol.16 No.4
통계모형의 상호작용 효과를 분석하기위해 비모수적인 방법인 다중인자 차원 축소(MDR)방법을 사용해 왔다. MDR 방법은 사례-대조 데이터에만 적용 할 수 있다. 본 논문에서는 Regression tree 알고리즘과 더미 변수를 활용한 회귀분석 알고리즘을 사용하여 다중 범주를 High 범주와 Low범주로 분류함으로써, MDR방법에서 연속형 데이터에 적용 할 수 없는 문제를 해결하는 방법으로 제시된 Expanded MDR방법과 Dummy MDR방법을 한우의 주요 경제형질(longissimus muscle dorsi area: LMA, carcass cold weight: CWT, average daily gain: ADG)데이터에 적용하여 한우의 경제형질에 영향을 주는 주요 SNPs 마커를 규명하고, Permutation test를 통해 그 결과를 비교한다. We have used multifactor dimensionality reduction(MDR) method to study interaction effect of statistical model in general. But MDR method cannot be applied in all cases. It can be applied to the only case-control data. So, two methods are suggested E-MDR and D-MDR method using regression tree algorithm and dummy variables. We applied the methods on the identify interaction effects of single nucleotide polymorphisms(SNPs) responsible for longissimus mulcle dorsi area(LMA), carcass cold weight(CWT) and average daily gain(ADG) in a Hanwoo beef cattle population. Finally, we compare the results using permutation test.
더미 다중인자 차원축소법에 의한 검증력과 주요 유전자 규명
여정수,라부미,이호근,이성원,이제영,Yeo, Jungsou,La, Boomi,Lee, Ho-Guen,Lee, Seong-Won,Lee, Jea-Young 한국데이터정보과학회 2013 한국데이터정보과학회지 Vol.24 No.2
광범위 유전자 관련 연구에서는 유전자-유전자 상호작용을 규명하는 것은 매우 중요하다. 최근 유전자-유전자 상호작용을 규명하는데에 대한 많은 연구가 진행되고 있다. 그 중 하나로 더미 다중인자 차원축소법이다. 이 연구의 목적은 모의실험을 통해 유전자-유전자 상호작용 파악하기 위한 더미 다중인자 차원축소의 검증력을 평가하는 것이다. 또한 이 방법을 적용하여 한우모집단에서 경제형질을 위한 단일 염기 다형성의 상호작용 효과를 확인하였다. It is important to detect the gene-gene interaction in GWAS (genome-wide association study). There have been many studies on detecting gene-gene interaction. The one is D-MDR (dummy multifoactor dimensionality reduction) method. The goal of this study is to evaluate the power of D-MDR for identifying gene-gene interaction by simulation. Also we applied the method on the identify interaction effects of single nucleotide polymorphisms (SNPs) responsible for economic traits in a Korean cattle population (real data).
CART 알고리즘을 활용한 확장된 다중인자 차원축소방법의 검정력 평가
이제영,이종형,이호근,Lee, Jea-Young,Lee, Jong-Hyeong,Lee, Ho-Guen 한국통계학회 2010 Communications for statistical applications and me Vol.17 No.5
인간의 유전자 상호작용을 분석하기 위해 제시된 다중인자 차원축소방법은 연속형자료에는 적용할 수 없다. 그래서 이를 보완한 CART 알고리즘을 활용한 확장된 다중인자 차원축소방법이 제안되었다. 하지만 CART 알고리즘을 활용한 확장된 다중인자 차원축소방법의 검정력이 밝혀지지 않았다. 따라서 본 연구에서는 모의실험을 통하여 CART 알고리즘을 활용한 확장된 다중인자 차원축소방법의 우수한 검정력을 평가하고, 확인된 검정력을 바탕으로 실제 한우 데이터에 적용하여 한우의 경제형질에 영향을 주는 우수 유전자조합을 규명하였다. It is important to detect the gene-gene interaction in GWAS(Genome-Wide Association Study). There are many studies about detecting gene-gene interaction. The one is Multifactor dimensionality reduction method. But MDR method is not applied continuous data and expanded multifactor dimensionality reduction(E-MDR) method is suggested. The goal of this study is to evaluate the power of E-MDR for identifying gene-gene interaction by simulation. Also we applied the method on the identify interaction e ects of single nucleotid polymorphisms(SNPs) responsible for economic traits in a Korean cattle population (real data).
MR 댐퍼를 장착한 1/4차량의 타이어 공기압에 따른 성능분석
성금길(Sung, Kum-Gil),이호근(Lee, Ho-Guen),최승복(Choi, Seung-Bok),박민규(Park, Min-Kyu),박명규(Park, Myung-Kyu) 한국소음진동공학회 2010 한국소음진동공학회 논문집 Vol.20 No.3
This paper presents performance analysis of a quarter-vehicle magneto-rheological(MR) suspension system with respect to different tire pressure. As a first step, MR damper is designed and manufactured based on the optimized damping force levels and mechanical dimensions required for a commercial mid-sized passenger vehicle. After experimentally evaluating dynamic characteristics of the manufactured MR damper, the quarter-vehicle MR suspension system consisting of sprung mass, spring, tire and the MR damper is constructed in order to investigate the ride comfort. After deriving the equations of the motion for the proposed quarter-vehicle MR suspension system, vertical tire stiffness with respect to different tire pressure is experimentally identified. The skyhook controller is then implemented for the realization of quarter-vehicle MR suspension system. Ride comfort characteristics such as vertical acceleration RMS and weighted RMS of sprung mass are evaluated under various road conditions.
황대석(Daeseok Hwang),이호근(Ho-Guen Lee),이영우(Young-Woo Lee) 한국정보기술학회 2005 Proceedings of KIIT Conference Vol.2005 No.-
광위상변조기를 이용하여 OCT용 초고속 광지연단을 설계하고 수치해석을 수행하였다. 수치해석은 electro-optic 위상 변조기에 1310㎚, 10㎰의 펄스폭을 갖는 레이저 광원을 적용하여 수행하였다. 수치해석결과로 500㎒의 변조 주파수일때 19㎰의 시간 지연을 얻었으며, 이는 기존의 기계적 검출 방식(수십㎑)의 OCT장치에 비해 1000배이상 빠른 검출이 가능할 것으로 예상된다. In this paper, We present the system design and numerical analysis of the ultrafast optical delay line using by optical phase modulator. The numerical analysis carried out with 1310㎚, 10㎰ laser and electro-optic phase modulator. The result of simulation we show an optical delay line we show a record scanning rate of 0.5 ㎓ and a delay range of 19.0㎰. Compare with mechanical delay line, the optical delay line has a high scanning speed and a high repetition rate.